Doublet Group distance statistics: 54306

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 3, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.014, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.013, 0.024, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.011
O4	A	0, 0.010, 0.041, 0.072, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.041 std_dev=0.031
O2'	A	0, 0.078, 0.179, 0.281, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.179 std_dev=0.102
O4'	A	0, 0.012, 0.126, 0.240, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.126 std_dev=0.114
C2'	A	0, 0.013, 0.131, 0.249, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.131 std_dev=0.118
N1	B	0, 0.174, 0.329, 0.484, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.329 std_dev=0.155
C5	B	0, 0.232, 0.400, 0.568, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.400 std_dev=0.168
C6	B	0, 0.187, 0.363, 0.540, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.363 std_dev=0.176
C4	B	0, 0.167, 0.374, 0.580, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.374 std_dev=0.207
C2	B	0, 0.107, 0.317, 0.527, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.317 std_dev=0.210
N7	B	0, 0.279, 0.500, 0.721, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.500 std_dev=0.221
O4'	B	0, 0.235, 0.462, 0.690, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.462 std_dev=0.227
C3'	A	0, 0.011, 0.242, 0.472, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.242 std_dev=0.230
N3	B	0, 0.103, 0.343, 0.584, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.343 std_dev=0.240
O3'	A	0, 0.058, 0.311, 0.564, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.311 std_dev=0.253
O5'	A	0, 0.171, 0.433, 0.696, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.433 std_dev=0.262
C8	B	0, 0.260, 0.523, 0.785, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.523 std_dev=0.263
O6	B	0, 0.148, 0.412, 0.676, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.412 std_dev=0.264
N2	B	0, 0.112, 0.379, 0.646, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.379 std_dev=0.267
N9	B	0, 0.185, 0.458, 0.731, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.458 std_dev=0.273
C4'	A	0, -0.018, 0.263, 0.545, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.263 std_dev=0.281
P	A	0, 0.182, 0.504, 0.827, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.504 std_dev=0.323
C1'	B	0, 0.202, 0.537, 0.873, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.537 std_dev=0.336
C4'	B	0, 0.284, 0.623, 0.961, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.623 std_dev=0.339
OP1	A	0, 0.267, 0.617, 0.967, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.617 std_dev=0.350
C5'	B	0, 0.381, 0.820, 1.259, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.820 std_dev=0.439
OP2	A	0, 0.223, 0.677, 1.130, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.677 std_dev=0.453
O5'	B	0, 0.431, 0.887, 1.343, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.887 std_dev=0.456
C3'	B	0, 0.225, 0.683, 1.141, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.683 std_dev=0.458
O3'	B	0, 0.304, 0.766, 1.228, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.766 std_dev=0.462
P	B	0, 0.454, 0.939, 1.424, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.939 std_dev=0.485
C2'	B	0, 0.224, 0.790, 1.355, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.790 std_dev=0.566
C5'	A	0, -0.052, 0.514, 1.080, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.514 std_dev=0.566
OP2	B	0, 0.753, 1.412, 2.070, 2.368 max_d=2.368 avg_d=1.412 std_dev=0.659
OP1	B	0, 0.561, 1.433, 2.305, 3.062 max_d=3.062 avg_d=1.433 std_dev=0.872
O2'	B	0, 0.050, 1.053, 2.055, 3.260 max_d=3.260 avg_d=1.053 std_dev=1.002

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.25	0.21	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.08	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.01	0.01	0.20	0.20	0.25	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.27	0.17	0.07
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.14	0.00	0.10	0.02	0.08	0.10	0.15	0.16	0.01	0.00	0.14	0.02	0.17	0.30	0.15	0.12
C4	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.14	0.01	0.35	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.00	0.02	0.28	0.14	0.27	0.08
C4'	0.02	0.08	0.02	0.00	0.14	0.00	0.15	0.01	0.13	0.08	0.11	0.05	0.03	0.01	0.14	0.00	0.03	0.24	0.26	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.15	0.00	0.36	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.03	0.30	0.13	0.27	0.08
C5'	0.04	0.21	0.01	0.02	0.35	0.01	0.36	0.00	0.30	0.21	0.28	0.15	0.03	0.02	0.37	0.02	0.01	0.24	0.35	0.01
C6	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.13	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.27	0.16	0.27	0.07
N1	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.20	0.20	0.25	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.15	0.00	0.11	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.01	0.02	0.24	0.18	0.26	0.07
O2	0.02	0.00	0.10	0.16	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.01	0.01	0.15	0.23	0.24	0.05
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.06	0.06	0.00	0.04	0.07	0.07	0.10	0.24	0.25	0.09
O3'	0.01	0.12	0.02	0.00	0.13	0.01	0.11	0.02	0.08	0.07	0.13	0.13	0.04	0.00	0.14	0.01	0.12	0.28	0.17	0.06
O4	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.14	0.01	0.37	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.02	0.30	0.13	0.26	0.08
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.13	0.23	0.21	0.05
O5'	0.14	0.20	0.12	0.17	0.28	0.03	0.30	0.01	0.27	0.20	0.24	0.15	0.10	0.12	0.30	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02
OP1	0.25	0.20	0.27	0.30	0.14	0.24	0.13	0.24	0.16	0.20	0.18	0.23	0.24	0.28	0.13	0.23	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.25	0.17	0.15	0.27	0.26	0.27	0.35	0.27	0.25	0.26	0.24	0.25	0.17	0.26	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.06	0.07	0.12	0.08	0.06	0.08	0.01	0.07	0.06	0.07	0.05	0.09	0.06	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.17	0.18	0.15	0.13	0.13	0.11	0.23	0.11	0.13	0.14	0.21	0.17	0.12	0.14	0.58	0.19	0.14	0.32	0.11	0.69	0.69	0.15
C2	0.18	0.18	0.21	0.17	0.15	0.14	0.14	0.21	0.12	0.16	0.14	0.22	0.18	0.15	0.16	0.49	0.21	0.17	0.25	0.13	0.62	0.58	0.11
C2'	0.17	0.18	0.18	0.15	0.14	0.13	0.13	0.22	0.12	0.14	0.15	0.21	0.17	0.13	0.15	0.54	0.19	0.16	0.31	0.11	0.70	0.68	0.13
C3'	0.18	0.17	0.18	0.11	0.14	0.10	0.12	0.18	0.11	0.14	0.14	0.21	0.16	0.12	0.15	0.56	0.23	0.15	0.34	0.08	0.73	0.75	0.15
C4	0.17	0.18	0.22	0.17	0.17	0.15	0.17	0.19	0.15	0.18	0.15	0.22	0.18	0.18	0.18	0.42	0.23	0.18	0.25	0.15	0.61	0.58	0.11
C4'	0.19	0.20	0.20	0.13	0.16	0.12	0.15	0.21	0.17	0.15	0.19	0.23	0.18	0.14	0.16	0.62	0.22	0.13	0.38	0.18	0.76	0.80	0.19
C5	0.15	0.18	0.17	0.16	0.14	0.13	0.13	0.20	0.12	0.15	0.15	0.21	0.16	0.14	0.14	0.44	0.19	0.15	0.28	0.12	0.67	0.66	0.11
C5'	0.31	0.38	0.27	0.23	0.33	0.22	0.34	0.25	0.38	0.29	0.40	0.40	0.35	0.31	0.30	0.65	0.34	0.24	0.49	0.41	0.78	0.93	0.32
C6	0.15	0.18	0.17	0.15	0.13	0.13	0.11	0.21	0.11	0.13	0.15	0.21	0.16	0.12	0.13	0.51	0.19	0.14	0.31	0.11	0.69	0.70	0.13
N1	0.16	0.17	0.18	0.16	0.14	0.13	0.12	0.22	0.11	0.14	0.14	0.22	0.17	0.13	0.14	0.53	0.19	0.15	0.29	0.11	0.67	0.66	0.12
N3	0.18	0.19	0.24	0.18	0.17	0.15	0.16	0.20	0.14	0.18	0.15	0.22	0.19	0.18	0.18	0.45	0.23	0.18	0.24	0.15	0.60	0.55	0.12
O2	0.18	0.18	0.23	0.18	0.16	0.14	0.15	0.22	0.13	0.17	0.14	0.22	0.18	0.16	0.17	0.51	0.21	0.17	0.24	0.14	0.61	0.55	0.11
O2'	0.17	0.20	0.18	0.16	0.15	0.13	0.12	0.23	0.12	0.13	0.16	0.25	0.19	0.12	0.14	0.57	0.18	0.15	0.32	0.10	0.69	0.70	0.16
O3'	0.18	0.17	0.18	0.11	0.15	0.10	0.13	0.17	0.12	0.14	0.15	0.20	0.17	0.13	0.16	0.57	0.23	0.15	0.35	0.09	0.73	0.77	0.16
O4	0.20	0.20	0.25	0.18	0.20	0.17	0.20	0.19	0.18	0.21	0.18	0.23	0.21	0.21	0.20	0.39	0.28	0.21	0.24	0.19	0.56	0.56	0.14
O4'	0.18	0.18	0.21	0.15	0.14	0.14	0.12	0.25	0.12	0.13	0.15	0.21	0.17	0.12	0.15	0.64	0.19	0.15	0.35	0.12	0.75	0.74	0.15
O5'	0.20	0.27	0.22	0.33	0.24	0.34	0.25	0.47	0.28	0.24	0.28	0.28	0.24	0.25	0.22	0.50	0.14	0.31	0.33	0.30	0.90	0.83	0.21
OP1	0.20	0.12	0.31	0.09	0.14	0.14	0.14	0.27	0.11	0.20	0.12	0.14	0.13	0.18	0.18	0.72	0.15	0.17	0.39	0.11	0.90	0.90	0.16
OP2	0.40	0.34	0.53	0.26	0.36	0.30	0.36	0.35	0.33	0.39	0.33	0.33	0.35	0.37	0.38	0.90	0.39	0.33	0.42	0.32	0.90	0.90	0.23
P	0.19	0.12	0.32	0.10	0.14	0.15	0.12	0.29	0.10	0.17	0.11	0.14	0.13	0.15	0.17	0.73	0.16	0.16	0.34	0.09	0.87	0.88	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.21	0.01	0.34	0.47	0.14
C2	0.03	0.00	0.16	0.08	0.00	0.10	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.25	0.16	0.21	0.00	0.39	0.55	0.15
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.02	0.12	0.05	0.12	0.11	0.20	0.17	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.39	0.03	0.39	0.62	0.38
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.03	0.15	0.17	0.12	0.06	0.07	0.18	0.11	0.02	0.01	0.01	0.22	0.16	0.20	0.47	0.25
C4	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.16	0.07	0.25	0.01	0.48	0.58	0.13
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.03	0.15	0.05	0.15	0.10	0.13	0.05	0.18	0.01	0.01	0.03	0.06	0.25	0.32	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.09	0.03	0.30	0.01	0.61	0.66	0.13
C5'	0.05	0.12	0.12	0.03	0.08	0.01	0.12	0.00	0.11	0.20	0.09	0.16	0.12	0.20	0.09	0.09	0.15	0.03	0.02	0.13	0.36	0.42	0.03
C6	0.01	0.00	0.05	0.15	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.12	0.04	0.29	0.00	0.61	0.66	0.13
C8	0.02	0.01	0.12	0.17	0.00	0.15	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.05	0.14	0.35	0.01	0.66	0.69	0.15
N1	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.20	0.10	0.25	0.00	0.50	0.60	0.13
N2	0.03	0.00	0.20	0.06	0.01	0.15	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.31	0.20	0.20	0.00	0.31	0.51	0.17
N3	0.03	0.00	0.17	0.07	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.26	0.16	0.21	0.01	0.36	0.53	0.15
N7	0.01	0.01	0.08	0.18	0.00	0.13	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.06	0.11	0.35	0.01	0.72	0.72	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.10	0.03	0.28	0.01	0.49	0.58	0.14
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.12	0.18	0.23	0.09	0.21	0.30	0.14	0.20	0.15	0.32	0.15	0.00	0.03	0.13	0.32	0.27	0.31	0.51	0.30
O3'	0.20	0.25	0.02	0.01	0.16	0.01	0.09	0.15	0.12	0.05	0.20	0.31	0.26	0.06	0.10	0.03	0.00	0.12	0.09	0.10	0.15	0.29	0.05
O4'	0.00	0.16	0.02	0.01	0.07	0.01	0.03	0.03	0.04	0.14	0.10	0.20	0.16	0.11	0.03	0.13	0.12	0.00	0.13	0.04	0.40	0.37	0.08
O5'	0.21	0.21	0.39	0.22	0.25	0.03	0.30	0.02	0.29	0.35	0.25	0.20	0.21	0.35	0.28	0.32	0.09	0.13	0.00	0.31	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.00	0.03	0.16	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.10	0.04	0.31	0.00	0.69	0.70	0.13
OP1	0.34	0.39	0.39	0.20	0.48	0.25	0.61	0.36	0.61	0.66	0.50	0.31	0.36	0.72	0.49	0.31	0.15	0.40	0.02	0.69	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.55	0.62	0.47	0.58	0.32	0.66	0.42	0.66	0.69	0.60	0.51	0.53	0.72	0.58	0.51	0.29	0.37	0.02	0.70	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.15	0.38	0.25	0.13	0.02	0.13	0.03	0.13	0.15	0.13	0.17	0.15	0.15	0.14	0.30	0.05	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00