Doublet Group distance statistics: 54311

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 27, 19, 5, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.011, 0.017, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.025, 0.038, 0.051, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.038 std_dev=0.013
O4	A	0, 0.010, 0.063, 0.117, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.063 std_dev=0.054
O4'	A	0, 0.058, 0.126, 0.194, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.126 std_dev=0.068
C2'	A	0, 0.068, 0.145, 0.222, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.145 std_dev=0.077
C4'	A	0, 0.252, 0.360, 0.468, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.360 std_dev=0.108
C3'	A	0, 0.215, 0.326, 0.438, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.326 std_dev=0.111
O2'	A	0, 0.245, 0.362, 0.478, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.362 std_dev=0.116
O3'	A	0, 0.385, 0.553, 0.722, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.553 std_dev=0.168
N1	B	0, 0.320, 0.496, 0.672, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.496 std_dev=0.176
C5'	A	0, 0.450, 0.630, 0.809, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.630 std_dev=0.179
C6	B	0, 0.503, 0.699, 0.895, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.699 std_dev=0.196
C5	B	0, 0.686, 0.884, 1.081, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.884 std_dev=0.197
O5'	A	0, 0.567, 0.769, 0.971, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.769 std_dev=0.202
C1'	B	0, 0.611, 0.852, 1.093, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.852 std_dev=0.241
C4	B	0, 0.656, 0.923, 1.190, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.923 std_dev=0.267
P	B	0, 0.785, 1.055, 1.325, 1.544 max_d=1.544 avg_d=1.055 std_dev=0.270
P	A	0, 0.791, 1.071, 1.351, 1.521 max_d=1.521 avg_d=1.071 std_dev=0.280
OP1	B	0, 0.865, 1.155, 1.445, 1.673 max_d=1.673 avg_d=1.155 std_dev=0.290
C2	B	0, 0.272, 0.562, 0.852, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.562 std_dev=0.290
O5'	B	0, 0.848, 1.141, 1.434, 1.629 max_d=1.629 avg_d=1.141 std_dev=0.293
N3	B	0, 0.486, 0.786, 1.086, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.786 std_dev=0.300
O4'	B	0, 0.753, 1.059, 1.366, 1.597 max_d=1.597 avg_d=1.059 std_dev=0.307
C2'	B	0, 0.904, 1.213, 1.521, 1.682 max_d=1.682 avg_d=1.213 std_dev=0.309
OP1	A	0, 0.998, 1.320, 1.641, 1.856 max_d=1.856 avg_d=1.320 std_dev=0.321
O2	B	0, 0.576, 0.917, 1.259, 2.143 max_d=2.143 avg_d=0.917 std_dev=0.341
OP2	A	0, 0.991, 1.333, 1.675, 2.055 max_d=2.055 avg_d=1.333 std_dev=0.342
O2'	B	0, 1.006, 1.356, 1.706, 1.985 max_d=1.985 avg_d=1.356 std_dev=0.350
O4	B	0, 0.951, 1.325, 1.699, 2.359 max_d=2.359 avg_d=1.325 std_dev=0.374
C4'	B	0, 1.066, 1.470, 1.874, 2.091 max_d=2.091 avg_d=1.470 std_dev=0.404
C3'	B	0, 1.148, 1.552, 1.956, 2.124 max_d=2.124 avg_d=1.552 std_dev=0.404
OP2	B	0, 1.174, 1.581, 1.988, 2.079 max_d=2.079 avg_d=1.581 std_dev=0.407
O3'	B	0, 1.203, 1.671, 2.139, 2.785 max_d=2.785 avg_d=1.671 std_dev=0.468
C5'	B	0, 1.237, 1.712, 2.187, 2.349 max_d=2.349 avg_d=1.712 std_dev=0.475

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.07	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.09	0.09	0.13	0.10
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.09	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.06	0.06	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.05	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.08	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.14	0.15	0.19	0.15
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.02	0.14	0.15	0.18	0.15
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.10	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.12	0.11	0.13	0.11
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.08	0.08	0.11	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.12	0.12	0.16	0.13
O2	0.02	0.00	0.09	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.09	0.01	0.05	0.07	0.07	0.11	0.09
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.10	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.06	0.05	0.04
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.07	0.03	0.06	0.09	0.02	0.00	0.07	0.01	0.08	0.13	0.11	0.09
O4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.15	0.18	0.21	0.17
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.06	0.09	0.08
O5'	0.04	0.09	0.03	0.05	0.14	0.01	0.14	0.01	0.12	0.08	0.12	0.07	0.03	0.08	0.15	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.09	0.06	0.08	0.15	0.04	0.15	0.04	0.11	0.08	0.12	0.07	0.06	0.13	0.18	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.13	0.06	0.07	0.19	0.03	0.18	0.01	0.13	0.11	0.16	0.11	0.05	0.11	0.21	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.10	0.04	0.06	0.15	0.02	0.15	0.01	0.11	0.09	0.13	0.09	0.04	0.09	0.17	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.16	0.13	0.10	0.20	0.08	0.24	0.07	0.19	0.13	0.17	0.19	0.22	0.11	0.23	0.10	0.08	0.15	0.04	0.04
C2	0.15	0.20	0.15	0.12	0.17	0.11	0.17	0.09	0.15	0.16	0.21	0.24	0.23	0.14	0.18	0.13	0.11	0.23	0.09	0.10
C2'	0.09	0.15	0.12	0.09	0.22	0.07	0.24	0.07	0.19	0.13	0.18	0.16	0.19	0.11	0.25	0.10	0.09	0.17	0.06	0.07
C3'	0.08	0.12	0.11	0.09	0.18	0.06	0.22	0.06	0.18	0.10	0.14	0.14	0.18	0.13	0.20	0.10	0.06	0.08	0.03	0.01
C4	0.17	0.18	0.18	0.18	0.11	0.16	0.16	0.14	0.16	0.15	0.15	0.25	0.25	0.20	0.14	0.15	0.15	0.22	0.09	0.10
C4'	0.10	0.13	0.13	0.11	0.17	0.11	0.22	0.11	0.19	0.11	0.14	0.17	0.21	0.16	0.20	0.12	0.10	0.05	0.11	0.04
C5	0.16	0.13	0.18	0.18	0.12	0.17	0.20	0.17	0.20	0.14	0.11	0.22	0.24	0.18	0.14	0.16	0.17	0.18	0.11	0.10
C5'	0.12	0.12	0.14	0.15	0.15	0.16	0.21	0.18	0.19	0.12	0.12	0.18	0.20	0.20	0.17	0.16	0.16	0.05	0.17	0.09
C6	0.13	0.13	0.14	0.14	0.13	0.14	0.23	0.15	0.22	0.13	0.12	0.20	0.22	0.13	0.13	0.14	0.15	0.15	0.10	0.09
N1	0.12	0.16	0.13	0.11	0.16	0.10	0.21	0.09	0.18	0.13	0.16	0.21	0.22	0.11	0.17	0.11	0.11	0.17	0.05	0.05
N3	0.17	0.21	0.17	0.15	0.13	0.14	0.16	0.11	0.15	0.16	0.21	0.26	0.24	0.17	0.12	0.15	0.13	0.25	0.10	0.11
O2	0.16	0.22	0.15	0.12	0.22	0.12	0.19	0.11	0.16	0.17	0.25	0.25	0.22	0.14	0.26	0.15	0.12	0.26	0.13	0.13
O2'	0.10	0.16	0.12	0.10	0.24	0.08	0.25	0.09	0.18	0.13	0.20	0.16	0.18	0.13	0.29	0.10	0.09	0.21	0.11	0.11
O3'	0.06	0.10	0.12	0.10	0.19	0.03	0.21	0.02	0.16	0.09	0.14	0.11	0.17	0.16	0.22	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00
O4	0.18	0.20	0.20	0.20	0.18	0.17	0.18	0.15	0.16	0.16	0.20	0.27	0.27	0.24	0.23	0.16	0.16	0.25	0.10	0.12
O4'	0.12	0.15	0.15	0.13	0.16	0.11	0.22	0.10	0.18	0.12	0.15	0.21	0.24	0.16	0.19	0.12	0.09	0.10	0.08	0.02
O5'	0.10	0.12	0.13	0.14	0.12	0.13	0.18	0.15	0.17	0.10	0.10	0.19	0.21	0.18	0.14	0.12	0.12	0.11	0.12	0.07
OP1	0.13	0.14	0.14	0.15	0.12	0.16	0.18	0.19	0.17	0.12	0.12	0.22	0.19	0.21	0.13	0.15	0.15	0.12	0.20	0.12
OP2	0.11	0.15	0.11	0.14	0.11	0.13	0.15	0.15	0.15	0.10	0.14	0.25	0.18	0.17	0.13	0.11	0.11	0.15	0.14	0.10
P	0.10	0.13	0.11	0.13	0.10	0.13	0.16	0.16	0.16	0.09	0.11	0.22	0.19	0.18	0.12	0.12	0.12	0.11	0.15	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.05	0.18	0.06	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.15	0.01	0.03	0.09	0.19	0.09	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.02	0.05	0.10	0.00	0.03	0.04	0.01	0.09	0.22	0.08	0.13
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.13	0.06	0.07
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.00	0.03	0.16	0.19	0.14	0.13
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.11	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.04	0.18	0.19	0.14	0.14
C5'	0.02	0.04	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.04	0.03	0.06	0.08	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.04	0.16	0.19	0.12	0.12
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.01	0.01	0.10	0.19	0.09	0.09
N3	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.13	0.01	0.03	0.12	0.19	0.11	0.11
O2	0.03	0.00	0.10	0.07	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.17	0.19	0.03	0.05	0.07	0.19	0.08	0.09
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.08	0.05	0.10	0.17	0.00	0.04	0.09	0.01	0.10	0.25	0.09	0.15
O3'	0.11	0.15	0.03	0.01	0.09	0.02	0.06	0.06	0.06	0.10	0.13	0.19	0.04	0.00	0.09	0.08	0.07	0.12	0.14	0.10
O4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.09	0.00	0.03	0.18	0.20	0.15	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.05	0.01	0.08	0.03	0.00	0.06	0.16	0.07	0.08
O5'	0.05	0.09	0.09	0.06	0.16	0.01	0.18	0.01	0.16	0.10	0.12	0.07	0.10	0.07	0.18	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.19	0.22	0.13	0.19	0.11	0.19	0.07	0.19	0.19	0.19	0.19	0.25	0.12	0.20	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.09	0.08	0.06	0.14	0.04	0.14	0.05	0.12	0.09	0.11	0.08	0.09	0.14	0.15	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.09	0.13	0.07	0.13	0.03	0.14	0.01	0.12	0.09	0.11	0.09	0.15	0.10	0.15	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00