Doublet Group distance statistics: 54312

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 5, 29, 10, 4, 1, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.011 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.026 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.002, 0.044, 0.085, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.044 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.025, 0.105, 0.186, 0.320 max_d=0.320 avg_d=0.105 std_dev=0.080
C2'	A	0, 0.010, 0.109, 0.208, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.109 std_dev=0.099
C4'	A	0, 0.040, 0.147, 0.254, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.147 std_dev=0.107
N1	B	0, 0.177, 0.297, 0.418, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.297 std_dev=0.120
C2	B	0, 0.164, 0.304, 0.444, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.304 std_dev=0.140
C3'	A	0, 0.018, 0.164, 0.310, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.164 std_dev=0.146
O2'	A	0, 0.016, 0.169, 0.321, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.169 std_dev=0.153
C6	B	0, 0.135, 0.295, 0.455, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.295 std_dev=0.160
C4	B	0, 0.082, 0.248, 0.415, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.248 std_dev=0.167
C5	B	0, 0.103, 0.271, 0.440, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.271 std_dev=0.168
N3	B	0, 0.103, 0.273, 0.442, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.273 std_dev=0.170
P	A	0, 0.088, 0.274, 0.459, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.274 std_dev=0.186
C5'	A	0, 0.066, 0.258, 0.449, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.258 std_dev=0.192
C1'	B	0, 0.129, 0.337, 0.544, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.337 std_dev=0.208
O3'	A	0, 0.040, 0.254, 0.467, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.254 std_dev=0.214
O5'	A	0, 0.049, 0.266, 0.484, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.266 std_dev=0.218
O2	B	0, 0.142, 0.375, 0.607, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.375 std_dev=0.232
O4	B	0, 0.007, 0.264, 0.522, 1.816 max_d=1.816 avg_d=0.264 std_dev=0.258
O4'	B	0, 0.086, 0.353, 0.621, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.353 std_dev=0.267
OP2	A	0, 0.037, 0.340, 0.643, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.340 std_dev=0.303
O5'	B	0, 0.113, 0.447, 0.780, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.447 std_dev=0.333
C3'	B	0, 0.071, 0.408, 0.746, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.408 std_dev=0.337
OP2	B	0, 0.100, 0.442, 0.785, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.442 std_dev=0.343
C2'	B	0, 0.043, 0.389, 0.736, 2.074 max_d=2.074 avg_d=0.389 std_dev=0.347
C4'	B	0, 0.056, 0.423, 0.791, 2.207 max_d=2.207 avg_d=0.423 std_dev=0.368
OP1	A	0, -0.026, 0.345, 0.716, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.345 std_dev=0.371
O2'	B	0, 0.050, 0.438, 0.825, 2.412 max_d=2.412 avg_d=0.438 std_dev=0.388
C5'	B	0, 0.037, 0.467, 0.898, 2.552 max_d=2.552 avg_d=0.467 std_dev=0.430
P	B	0, -0.002, 0.444, 0.889, 3.011 max_d=3.011 avg_d=0.444 std_dev=0.446
O3'	B	0, 0.005, 0.453, 0.900, 2.617 max_d=2.617 avg_d=0.453 std_dev=0.448
OP1	B	0, -0.223, 0.572, 1.368, 5.257 max_d=5.257 avg_d=0.572 std_dev=0.796

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.14	0.27	0.11
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.06	0.23	0.19	0.10
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.08	0.18	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.04	0.04	0.08	0.01	0.01	0.08	0.01	0.04	0.10	0.11	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00	0.02	0.12	0.29	0.12	0.08
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.06	0.00	0.01	0.07	0.20	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.02	0.15	0.27	0.13	0.09
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.10	0.00	0.12	0.00	0.11	0.05	0.06	0.03	0.03	0.03	0.11	0.01	0.01	0.12	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.02	0.13	0.23	0.18	0.09
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.07	0.20	0.22	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.01	0.08	0.27	0.15	0.09
O2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.10	0.01	0.02	0.06	0.22	0.21	0.11
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.07	0.11	0.00	0.03	0.05	0.03	0.03	0.08	0.20	0.06
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.02	0.11	0.03	0.10	0.04	0.05	0.10	0.03	0.00	0.08	0.01	0.06	0.20	0.09	0.08
O4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.02	0.13	0.30	0.12	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.14	0.34	0.15
O5'	0.03	0.06	0.03	0.04	0.12	0.01	0.15	0.01	0.13	0.07	0.08	0.06	0.03	0.06	0.13	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.14	0.23	0.08	0.10	0.29	0.07	0.27	0.12	0.23	0.20	0.27	0.22	0.08	0.20	0.30	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.19	0.18	0.11	0.12	0.20	0.13	0.13	0.18	0.22	0.15	0.21	0.20	0.09	0.12	0.34	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.10	0.06	0.05	0.08	0.05	0.09	0.01	0.09	0.10	0.09	0.11	0.06	0.08	0.09	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.08	0.12	0.15	0.07	0.08	0.12	0.14	0.12	0.08	0.09	0.10	0.27	0.16	0.10	0.10	0.29	0.57	0.21	0.34
C2	0.09	0.07	0.12	0.21	0.08	0.10	0.13	0.10	0.12	0.08	0.06	0.08	0.24	0.20	0.11	0.09	0.22	0.42	0.24	0.25
C2'	0.08	0.11	0.11	0.17	0.08	0.07	0.10	0.11	0.10	0.08	0.13	0.14	0.21	0.14	0.10	0.09	0.23	0.54	0.26	0.26
C3'	0.06	0.10	0.09	0.13	0.09	0.07	0.07	0.15	0.08	0.06	0.13	0.12	0.21	0.11	0.14	0.09	0.23	0.59	0.28	0.28
C4	0.09	0.09	0.12	0.20	0.06	0.11	0.10	0.12	0.10	0.07	0.09	0.13	0.33	0.22	0.09	0.08	0.20	0.30	0.23	0.21
C4'	0.09	0.08	0.13	0.11	0.09	0.10	0.09	0.19	0.11	0.08	0.11	0.10	0.27	0.13	0.14	0.13	0.29	0.64	0.21	0.36
C5	0.12	0.10	0.18	0.14	0.11	0.09	0.10	0.13	0.10	0.10	0.11	0.12	0.37	0.18	0.15	0.11	0.27	0.41	0.20	0.30
C5'	0.11	0.09	0.16	0.10	0.11	0.12	0.09	0.22	0.11	0.09	0.12	0.10	0.28	0.13	0.18	0.15	0.30	0.67	0.19	0.38
C6	0.12	0.09	0.17	0.13	0.11	0.09	0.10	0.15	0.11	0.09	0.10	0.10	0.34	0.16	0.16	0.12	0.29	0.51	0.20	0.34
N1	0.09	0.07	0.12	0.16	0.06	0.08	0.11	0.12	0.11	0.08	0.08	0.08	0.28	0.17	0.10	0.10	0.27	0.50	0.21	0.31
N3	0.09	0.07	0.12	0.24	0.08	0.13	0.12	0.11	0.12	0.08	0.08	0.09	0.25	0.23	0.11	0.09	0.19	0.33	0.24	0.20
O2	0.11	0.09	0.14	0.23	0.13	0.12	0.16	0.11	0.13	0.10	0.08	0.11	0.20	0.21	0.18	0.10	0.21	0.42	0.24	0.23
O2'	0.11	0.15	0.13	0.19	0.10	0.09	0.11	0.11	0.11	0.11	0.15	0.18	0.21	0.16	0.11	0.09	0.23	0.54	0.26	0.26
O3'	0.05	0.12	0.07	0.15	0.10	0.06	0.06	0.13	0.06	0.06	0.15	0.16	0.17	0.11	0.14	0.07	0.19	0.57	0.34	0.24
O4	0.11	0.14	0.13	0.24	0.08	0.16	0.13	0.16	0.13	0.10	0.13	0.18	0.36	0.27	0.10	0.11	0.16	0.19	0.24	0.15
O4'	0.13	0.07	0.17	0.13	0.08	0.13	0.13	0.21	0.15	0.11	0.09	0.08	0.31	0.15	0.12	0.16	0.35	0.65	0.19	0.42
O5'	0.14	0.10	0.19	0.09	0.13	0.15	0.10	0.24	0.13	0.11	0.13	0.10	0.30	0.11	0.20	0.18	0.31	0.69	0.21	0.38
OP1	0.54	0.36	0.64	0.46	0.24	0.59	0.36	0.67	0.47	0.46	0.27	0.36	0.71	0.41	0.17	0.58	0.71	1.08	0.33	0.77
OP2	0.12	0.15	0.20	0.18	0.21	0.12	0.18	0.14	0.14	0.13	0.19	0.14	0.31	0.24	0.26	0.11	0.19	0.41	0.29	0.23
P	0.22	0.13	0.31	0.12	0.13	0.23	0.14	0.31	0.19	0.18	0.13	0.13	0.41	0.10	0.19	0.24	0.39	0.72	0.13	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.01	0.00	0.11	0.24	0.15	0.10
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.12	0.01	0.03	0.11	0.30	0.24	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.06	0.01	0.04	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01	0.25	0.26	0.18	0.24
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.14	0.00	0.17	0.02	0.16	0.09	0.10	0.06	0.02	0.01	0.15	0.01	0.11	0.09	0.12	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.05	0.00	0.02	0.11	0.36	0.36	0.10
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.03	0.02	0.13	0.02	0.04	0.00	0.01	0.09	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.11	0.01	0.04	0.11	0.37	0.37	0.10
C5'	0.03	0.03	0.08	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.04	0.02	0.05	0.10	0.05	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.01	0.04	0.11	0.34	0.31	0.10
N1	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.01	0.01	0.11	0.29	0.23	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.07	0.01	0.03	0.11	0.33	0.30	0.09
O2	0.02	0.00	0.09	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.22	0.01	0.05	0.11	0.27	0.20	0.09
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.16	0.13	0.14	0.05	0.12	0.10	0.16	0.15	0.00	0.04	0.17	0.08	0.16	0.16	0.19	0.18
O3'	0.14	0.12	0.02	0.01	0.05	0.02	0.11	0.10	0.10	0.06	0.07	0.22	0.04	0.00	0.05	0.10	0.11	0.23	0.15	0.14
O4	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.05	0.00	0.03	0.11	0.37	0.39	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.05	0.08	0.10	0.03	0.00	0.06	0.20	0.19	0.08
O5'	0.11	0.11	0.25	0.11	0.11	0.01	0.11	0.01	0.11	0.11	0.11	0.11	0.16	0.11	0.11	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.24	0.30	0.26	0.09	0.36	0.09	0.37	0.06	0.34	0.29	0.33	0.27	0.16	0.23	0.37	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.24	0.18	0.12	0.36	0.11	0.37	0.10	0.31	0.23	0.30	0.20	0.19	0.15	0.39	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.09	0.24	0.08	0.10	0.02	0.10	0.01	0.10	0.09	0.09	0.09	0.18	0.14	0.10	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00