Doublet Group distance statistics: 54313

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 0, 3, 4, 3, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.018 std_dev=0.014
O4	A	0, 0.042, 0.074, 0.105, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.074 std_dev=0.031
O2	A	0, 0.003, 0.041, 0.078, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.041 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.056, 0.126, 0.196, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.126 std_dev=0.070
O4'	A	0, 0.020, 0.106, 0.192, 0.346 max_d=0.346 avg_d=0.106 std_dev=0.086
O2'	A	0, 0.066, 0.188, 0.310, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.188 std_dev=0.122
C3'	A	0, 0.080, 0.212, 0.343, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.212 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.059, 0.200, 0.341, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.200 std_dev=0.141
O3'	A	0, 0.129, 0.325, 0.522, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.325 std_dev=0.197
C5'	A	0, 0.113, 0.347, 0.582, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.347 std_dev=0.234
N1	B	0, 0.313, 0.560, 0.806, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.560 std_dev=0.247
O5'	A	0, 0.205, 0.453, 0.701, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.453 std_dev=0.248
C2	B	0, 0.358, 0.617, 0.876, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.617 std_dev=0.259
C6	B	0, 0.300, 0.562, 0.825, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.562 std_dev=0.263
N3	B	0, 0.324, 0.612, 0.900, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.612 std_dev=0.288
C2'	B	0, 0.385, 0.675, 0.966, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.675 std_dev=0.291
C5	B	0, 0.310, 0.602, 0.894, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.602 std_dev=0.292
P	A	0, 0.383, 0.679, 0.975, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.679 std_dev=0.296
C1'	B	0, 0.346, 0.642, 0.938, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.642 std_dev=0.296
C4	B	0, 0.304, 0.612, 0.920, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.612 std_dev=0.308
O2'	B	0, 0.389, 0.704, 1.018, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.704 std_dev=0.315
O5'	B	0, 0.271, 0.594, 0.918, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.594 std_dev=0.324
P	B	0, 0.240, 0.568, 0.897, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.568 std_dev=0.328
O2	B	0, 0.420, 0.764, 1.107, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.764 std_dev=0.344
OP2	A	0, 0.410, 0.762, 1.114, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.762 std_dev=0.352
C3'	B	0, 0.452, 0.832, 1.212, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.832 std_dev=0.380
O3'	B	0, 0.509, 0.894, 1.280, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.894 std_dev=0.386
O4	B	0, 0.334, 0.720, 1.107, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.720 std_dev=0.387
OP1	A	0, 0.546, 0.943, 1.341, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.943 std_dev=0.397
O4'	B	0, 0.363, 0.778, 1.193, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.778 std_dev=0.415
OP1	B	0, 0.310, 0.754, 1.198, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.754 std_dev=0.444
C4'	B	0, 0.424, 0.877, 1.330, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.877 std_dev=0.453
OP2	B	0, 0.336, 0.861, 1.385, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.861 std_dev=0.525
C5'	B	0, 0.386, 0.964, 1.543, 2.102 max_d=2.102 avg_d=0.964 std_dev=0.579

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.04	0.16	0.11
C2	0.03	0.00	0.06	0.07	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.04	0.11	0.12	0.26	0.18
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.03	0.05	0.10	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.12	0.11	0.06
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.11	0.07	0.09	0.08	0.02	0.01	0.11	0.01	0.08	0.18	0.11	0.10
C4	0.02	0.02	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.12	0.01	0.02	0.19	0.25	0.35	0.26
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.06	0.07	0.02	0.09	0.00	0.02	0.08	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.01	0.02	0.21	0.26	0.34	0.26
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.15	0.01	0.17	0.00	0.14	0.08	0.11	0.06	0.07	0.04	0.16	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.12	0.02	0.03	0.17	0.17	0.26	0.20
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.07	0.02	0.02	0.10	0.11	0.23	0.16
N3	0.03	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.10	0.02	0.03	0.16	0.20	0.32	0.23
O2	0.06	0.01	0.10	0.08	0.03	0.06	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.15	0.11	0.04	0.08	0.09	0.09	0.24	0.16
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.06	0.07	0.04	0.07	0.04	0.04	0.09	0.15	0.00	0.02	0.07	0.06	0.05	0.18	0.08	0.06
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.04	0.12	0.07	0.10	0.11	0.02	0.00	0.14	0.02	0.11	0.31	0.19	0.19
O4	0.03	0.03	0.05	0.11	0.01	0.09	0.01	0.16	0.02	0.02	0.02	0.04	0.07	0.14	0.00	0.03	0.21	0.29	0.38	0.29
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.08	0.06	0.02	0.03	0.00	0.08	0.10	0.17	0.14
O5'	0.05	0.11	0.05	0.08	0.19	0.02	0.21	0.01	0.17	0.10	0.16	0.09	0.05	0.11	0.21	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.04	0.12	0.12	0.18	0.25	0.08	0.26	0.07	0.17	0.11	0.20	0.09	0.18	0.31	0.29	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.26	0.11	0.11	0.35	0.05	0.34	0.03	0.26	0.23	0.32	0.24	0.08	0.19	0.38	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.18	0.06	0.10	0.26	0.02	0.26	0.01	0.20	0.16	0.23	0.16	0.06	0.19	0.29	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.23	0.15	0.10	0.27	0.15	0.32	0.18	0.27	0.17	0.27	0.27	0.32	0.13	0.31	0.20	0.12	0.31	0.09	0.10
C2	0.11	0.22	0.09	0.09	0.19	0.11	0.28	0.14	0.24	0.14	0.25	0.30	0.20	0.10	0.20	0.14	0.12	0.43	0.18	0.19
C2'	0.15	0.25	0.23	0.17	0.34	0.16	0.34	0.20	0.28	0.20	0.31	0.25	0.36	0.19	0.38	0.19	0.15	0.34	0.15	0.16
C3'	0.09	0.19	0.23	0.14	0.29	0.12	0.31	0.18	0.25	0.15	0.25	0.18	0.40	0.18	0.32	0.21	0.11	0.13	0.04	0.01
C4	0.14	0.21	0.19	0.20	0.18	0.18	0.27	0.18	0.22	0.13	0.18	0.36	0.20	0.17	0.22	0.14	0.16	0.39	0.16	0.18
C4'	0.11	0.20	0.16	0.09	0.27	0.19	0.30	0.28	0.25	0.16	0.24	0.23	0.39	0.13	0.30	0.26	0.22	0.09	0.19	0.09
C5	0.17	0.21	0.21	0.24	0.12	0.24	0.22	0.26	0.22	0.14	0.17	0.35	0.21	0.17	0.15	0.20	0.21	0.32	0.16	0.17
C5'	0.18	0.24	0.16	0.16	0.26	0.31	0.29	0.44	0.26	0.20	0.26	0.28	0.38	0.15	0.28	0.34	0.37	0.10	0.34	0.21
C6	0.15	0.21	0.14	0.17	0.14	0.22	0.25	0.27	0.25	0.16	0.20	0.31	0.26	0.12	0.15	0.22	0.19	0.29	0.14	0.14
N1	0.12	0.22	0.11	0.10	0.20	0.15	0.29	0.18	0.26	0.15	0.24	0.29	0.26	0.10	0.22	0.17	0.12	0.34	0.11	0.13
N3	0.12	0.21	0.12	0.13	0.15	0.12	0.29	0.14	0.23	0.13	0.20	0.33	0.16	0.12	0.16	0.13	0.13	0.43	0.19	0.19
O2	0.13	0.23	0.11	0.10	0.24	0.13	0.29	0.17	0.24	0.15	0.28	0.29	0.21	0.12	0.29	0.15	0.15	0.48	0.25	0.23
O2'	0.15	0.27	0.25	0.20	0.40	0.16	0.37	0.21	0.28	0.22	0.35	0.26	0.38	0.21	0.46	0.19	0.17	0.42	0.21	0.21
O3'	0.11	0.18	0.32	0.25	0.31	0.10	0.32	0.14	0.24	0.15	0.25	0.16	0.45	0.26	0.35	0.17	0.03	0.01	0.01	0.01
O4	0.16	0.21	0.25	0.25	0.28	0.19	0.30	0.18	0.22	0.14	0.22	0.38	0.27	0.22	0.36	0.15	0.17	0.40	0.18	0.20
O4'	0.13	0.21	0.15	0.13	0.24	0.20	0.29	0.25	0.25	0.15	0.24	0.28	0.36	0.15	0.27	0.24	0.19	0.19	0.13	0.03
O5'	0.20	0.28	0.20	0.20	0.23	0.31	0.24	0.42	0.22	0.20	0.27	0.34	0.40	0.17	0.25	0.31	0.30	0.16	0.22	0.14
OP1	0.29	0.31	0.33	0.26	0.23	0.25	0.25	0.33	0.25	0.25	0.28	0.41	0.52	0.29	0.24	0.25	0.24	0.23	0.25	0.19
OP2	0.20	0.32	0.18	0.17	0.23	0.22	0.18	0.33	0.19	0.21	0.31	0.43	0.40	0.21	0.24	0.19	0.16	0.19	0.21	0.12
P	0.21	0.30	0.22	0.16	0.22	0.23	0.21	0.35	0.20	0.20	0.29	0.40	0.45	0.18	0.23	0.23	0.20	0.17	0.20	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.12	0.03	0.00	0.08	0.27	0.10	0.12
C2	0.03	0.00	0.09	0.05	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.15	0.02	0.10	0.14	0.27	0.15	0.15
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.10	0.10	0.12	0.02	0.07	0.16	0.00	0.02	0.05	0.01	0.23	0.38	0.23	0.29
C3'	0.03	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.03	0.08	0.02	0.04	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.21	0.27	0.15	0.20
C4	0.03	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.13	0.01	0.03	0.20	0.30	0.20	0.20
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.09	0.02	0.02	0.05	0.00	0.04	0.21	0.05	0.05
C5	0.03	0.01	0.10	0.07	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.15	0.11	0.02	0.05	0.22	0.31	0.21	0.21
C5'	0.05	0.12	0.10	0.03	0.13	0.01	0.12	0.00	0.10	0.10	0.13	0.13	0.08	0.02	0.14	0.02	0.01	0.15	0.04	0.03
C6	0.02	0.01	0.12	0.08	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.11	0.02	0.08	0.20	0.30	0.17	0.18
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.12	0.03	0.01	0.14	0.28	0.14	0.14
N3	0.02	0.00	0.07	0.04	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.14	0.01	0.07	0.17	0.28	0.17	0.18
O2	0.06	0.00	0.16	0.09	0.02	0.09	0.02	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.31	0.17	0.02	0.17	0.12	0.26	0.14	0.14
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.08	0.02	0.15	0.08	0.16	0.04	0.13	0.31	0.00	0.05	0.10	0.02	0.27	0.42	0.29	0.35
O3'	0.12	0.15	0.02	0.01	0.13	0.02	0.11	0.02	0.11	0.12	0.14	0.17	0.05	0.00	0.13	0.10	0.18	0.26	0.12	0.17
O4	0.03	0.02	0.05	0.05	0.01	0.05	0.02	0.14	0.02	0.03	0.01	0.02	0.10	0.13	0.00	0.04	0.22	0.30	0.22	0.22
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.08	0.01	0.07	0.17	0.02	0.10	0.04	0.00	0.13	0.28	0.10	0.15
O5'	0.08	0.14	0.23	0.21	0.20	0.04	0.22	0.01	0.20	0.14	0.17	0.12	0.27	0.18	0.22	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.27	0.27	0.38	0.27	0.30	0.21	0.31	0.15	0.30	0.28	0.28	0.26	0.42	0.26	0.30	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.15	0.23	0.15	0.20	0.05	0.21	0.04	0.17	0.14	0.17	0.14	0.29	0.12	0.22	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.15	0.29	0.20	0.20	0.05	0.21	0.03	0.18	0.14	0.18	0.14	0.35	0.17	0.22	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00