Doublet Group distance statistics: 54319

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
O4	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C2'	B	0, 0.000, 0.247, 0.494, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.247 std_dev=0.247
C2'	A	0, 0.000, 0.349, 0.698, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.349 std_dev=0.349
O4'	A	0, 0.000, 0.385, 0.771, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.385 std_dev=0.385
O2'	A	0, 0.000, 0.439, 0.878, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.439 std_dev=0.439
C4'	A	0, 0.000, 0.495, 0.990, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.495 std_dev=0.495
C3'	A	0, 0.000, 0.542, 1.085, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.542 std_dev=0.542
C1'	B	0, 0.000, 0.550, 1.100, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.550 std_dev=0.550
C2	B	0, 0.000, 0.586, 1.171, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.586 std_dev=0.586
N3	B	0, 0.000, 0.589, 1.177, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.589 std_dev=0.589
N1	B	0, 0.000, 0.615, 1.229, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.615 std_dev=0.615
O2	B	0, 0.000, 0.618, 1.237, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.618 std_dev=0.618
C4	B	0, 0.000, 0.668, 1.336, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.668 std_dev=0.668
O4	B	0, 0.000, 0.675, 1.350, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.675 std_dev=0.675
OP2	B	0, 0.000, 0.708, 1.417, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.708 std_dev=0.708
C6	B	0, 0.000, 0.723, 1.446, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.723 std_dev=0.723
O3'	A	0, 0.000, 0.749, 1.498, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.749 std_dev=0.749
C5	B	0, 0.000, 0.772, 1.544, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.772 std_dev=0.772
O5'	B	0, 0.000, 0.788, 1.575, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.788 std_dev=0.788
P	B	0, 0.000, 0.833, 1.665, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.833 std_dev=0.833
O4'	B	0, 0.000, 0.888, 1.776, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.888 std_dev=0.888
C5'	A	0, 0.000, 0.911, 1.822, 1.822 max_d=1.822 avg_d=0.911 std_dev=0.911
O5'	A	0, 0.000, 1.005, 2.010, 2.010 max_d=2.010 avg_d=1.005 std_dev=1.005
C3'	B	0, 0.000, 1.015, 2.031, 2.031 max_d=2.031 avg_d=1.015 std_dev=1.015
O2'	B	0, 0.000, 1.071, 2.142, 2.142 max_d=2.142 avg_d=1.071 std_dev=1.071
OP1	B	0, 0.000, 1.082, 2.164, 2.164 max_d=2.164 avg_d=1.082 std_dev=1.082
C4'	B	0, 0.000, 1.158, 2.315, 2.315 max_d=2.315 avg_d=1.158 std_dev=1.158
C5'	B	0, 0.000, 1.346, 2.691, 2.691 max_d=2.691 avg_d=1.346 std_dev=1.346
P	A	0, 0.000, 1.396, 2.791, 2.791 max_d=2.791 avg_d=1.396 std_dev=1.396
OP2	A	0, 0.000, 1.454, 2.909, 2.909 max_d=2.909 avg_d=1.454 std_dev=1.454
OP1	A	0, 0.000, 1.579, 3.158, 3.158 max_d=3.158 avg_d=1.579 std_dev=1.579
O3'	B	0, 0.000, 1.707, 3.413, 3.413 max_d=3.413 avg_d=1.707 std_dev=1.707

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02
C2	0.00	0.00	0.09	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.10	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.15	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.09	0.01	0.06	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00
C4	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.05	0.02	0.03	0.05
C4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01
C5	0.03	0.01	0.05	0.07	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.09	0.01	0.10	0.03	0.01	0.00	0.04
C5'	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
C6	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.10	0.01	0.11	0.01	0.02	0.02	0.02
N1	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01
N3	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.02	0.01	0.05	0.03	0.02	0.04
O2	0.02	0.00	0.15	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.17	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00
O2'	0.03	0.08	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.06	0.13	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.08	0.17	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01
O4	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.06	0.05	0.02	0.03	0.05
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.11	0.03	0.01	0.08	0.02	0.02	0.06	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03
O5'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.13	0.13	0.02	0.05	0.08	0.03	0.23	0.05	0.08	0.10	0.18	0.03	0.11	0.02	0.02	0.09	0.00	0.04	0.04
C2	0.03	0.06	0.17	0.08	0.12	0.21	0.12	0.29	0.10	0.09	0.08	0.04	0.13	0.30	0.12	0.19	0.09	0.08	0.02	0.06
C2'	0.08	0.17	0.18	0.06	0.07	0.09	0.02	0.24	0.02	0.06	0.14	0.25	0.01	0.11	0.07	0.02	0.13	0.03	0.12	0.08
C3'	0.09	0.05	0.44	0.21	0.03	0.16	0.03	0.27	0.06	0.05	0.08	0.11	0.30	0.16	0.06	0.06	0.02	0.02	0.03	0.01
C4	0.01	0.03	0.16	0.09	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.04	0.34	0.12	0.06	0.09	0.03	0.04	0.13	0.05
C4'	0.04	0.02	0.40	0.20	0.01	0.15	0.04	0.29	0.05	0.04	0.02	0.05	0.24	0.16	0.00	0.03	0.00	0.07	0.17	0.07
C5	0.07	0.09	0.16	0.16	0.11	0.06	0.09	0.05	0.09	0.07	0.11	0.08	0.32	0.02	0.09	0.03	0.06	0.14	0.20	0.14
C5'	0.16	0.09	0.57	0.29	0.07	0.20	0.10	0.30	0.12	0.13	0.06	0.09	0.48	0.21	0.05	0.10	0.12	0.12	0.32	0.15
C6	0.10	0.15	0.16	0.13	0.12	0.06	0.09	0.01	0.10	0.10	0.15	0.15	0.22	0.02	0.09	0.06	0.10	0.14	0.19	0.15
N1	0.06	0.07	0.17	0.00	0.02	0.09	0.00	0.18	0.02	0.03	0.06	0.09	0.12	0.14	0.00	0.05	0.02	0.01	0.07	0.03
N3	0.05	0.10	0.17	0.02	0.15	0.17	0.13	0.21	0.10	0.10	0.13	0.09	0.25	0.27	0.17	0.19	0.10	0.05	0.05	0.04
O2	0.09	0.12	0.17	0.19	0.20	0.35	0.23	0.44	0.20	0.17	0.15	0.08	0.04	0.45	0.19	0.31	0.15	0.17	0.04	0.13
O2'	0.26	0.27	0.05	0.04	0.12	0.01	0.09	0.23	0.11	0.19	0.21	0.36	0.37	0.01	0.10	0.17	0.29	0.05	0.13	0.12
O3'	0.12	0.07	0.48	0.28	0.05	0.18	0.03	0.30	0.07	0.06	0.10	0.14	0.29	0.15	0.08	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00
O4	0.04	0.07	0.16	0.10	0.07	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.09	0.09	0.41	0.12	0.11	0.11	0.06	0.04	0.14	0.04
O4'	0.04	0.03	0.28	0.11	0.02	0.12	0.03	0.27	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.14	0.04	0.01	0.03	0.05	0.11	0.04
O5'	0.23	0.17	0.65	0.29	0.11	0.20	0.13	0.24	0.17	0.20	0.13	0.18	0.67	0.23	0.08	0.15	0.17	0.08	0.28	0.13
OP1	0.30	0.20	0.79	0.36	0.10	0.20	0.14	0.19	0.19	0.23	0.14	0.23	0.88	0.22	0.05	0.15	0.22	0.10	0.37	0.17
OP2	0.33	0.28	0.77	0.30	0.17	0.20	0.18	0.16	0.23	0.28	0.23	0.32	0.96	0.26	0.13	0.19	0.24	0.06	0.25	0.13
P	0.29	0.23	0.75	0.33	0.15	0.21	0.17	0.21	0.20	0.24	0.18	0.26	0.84	0.25	0.11	0.17	0.22	0.10	0.33	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.29	0.04	0.01	0.13	0.12	0.01	0.09
C2	0.04	0.00	0.24	0.19	0.02	0.17	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.51	0.00	0.02	0.08	0.02	0.12	0.24	0.13
C2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.06	0.00	0.09	0.16	0.14	0.02	0.19	0.40	0.01	0.04	0.07	0.03	0.52	0.50	0.43	0.50
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.27	0.01	0.25	0.00	0.20	0.17	0.24	0.13	0.01	0.00	0.29	0.02	0.28	0.27	0.00	0.20
C4	0.04	0.02	0.06	0.27	0.00	0.12	0.01	0.20	0.01	0.02	0.00	0.03	0.48	0.00	0.00	0.03	0.01	0.15	0.30	0.14
C4'	0.02	0.17	0.00	0.01	0.12	0.00	0.06	0.01	0.02	0.07	0.17	0.23	0.23	0.01	0.14	0.00	0.01	0.05	0.16	0.01
C5	0.02	0.01	0.09	0.25	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.03	0.29	0.09	0.00	0.09	0.04	0.06	0.24	0.07
C5'	0.05	0.23	0.16	0.00	0.20	0.01	0.11	0.00	0.05	0.08	0.25	0.30	0.06	0.18	0.23	0.02	0.01	0.04	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.14	0.20	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.17	0.16	0.00	0.10	0.07	0.00	0.17	0.02
N1	0.02	0.01	0.02	0.17	0.02	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.26	0.12	0.01	0.03	0.06	0.00	0.15	0.02
N3	0.04	0.01	0.19	0.24	0.00	0.17	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.02	0.57	0.04	0.01	0.04	0.04	0.18	0.30	0.17
O2	0.05	0.01	0.40	0.13	0.03	0.23	0.03	0.30	0.03	0.02	0.02	0.00	0.57	0.04	0.03	0.17	0.08	0.17	0.24	0.18
O2'	0.01	0.51	0.01	0.01	0.48	0.23	0.29	0.06	0.17	0.26	0.57	0.57	0.00	0.04	0.52	0.17	0.32	0.35	0.46	0.38
O3'	0.29	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.09	0.18	0.16	0.12	0.04	0.04	0.04	0.00	0.04	0.15	0.09	0.01	0.18	0.00
O4	0.04	0.02	0.07	0.29	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.03	0.52	0.04	0.00	0.02	0.02	0.19	0.33	0.17
O4'	0.01	0.08	0.03	0.02	0.03	0.00	0.09	0.02	0.10	0.03	0.04	0.17	0.17	0.15	0.02	0.00	0.09	0.05	0.19	0.08
O5'	0.13	0.02	0.52	0.28	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	0.06	0.04	0.08	0.32	0.09	0.02	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.12	0.12	0.50	0.27	0.15	0.05	0.06	0.04	0.00	0.00	0.18	0.17	0.35	0.01	0.19	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01
OP2	0.01	0.24	0.43	0.00	0.30	0.16	0.24	0.22	0.17	0.15	0.30	0.24	0.46	0.18	0.33	0.19	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.13	0.50	0.20	0.14	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.17	0.18	0.38	0.00	0.17	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00