Doublet Group distance statistics: 54325

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 4, 0, 1, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.003, 0.019, 0.036, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C6	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.002, 0.019, 0.037, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.003, 0.021, 0.039, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.021 std_dev=0.018
C2'	A	0, 0.043, 0.085, 0.127, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.085 std_dev=0.042
O2	A	0, -0.001, 0.043, 0.088, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.043 std_dev=0.044
N4	A	0, 0.005, 0.059, 0.113, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.059 std_dev=0.054
O4'	A	0, 0.027, 0.083, 0.140, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.083 std_dev=0.056
C3'	A	0, 0.033, 0.140, 0.247, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.140 std_dev=0.107
C4'	A	0, 0.051, 0.180, 0.310, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.180 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.011, 0.178, 0.345, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.178 std_dev=0.167
P	B	0, 0.076, 0.254, 0.432, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.254 std_dev=0.178
C4	B	0, 0.148, 0.341, 0.534, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.341 std_dev=0.193
C5'	A	0, 0.072, 0.275, 0.478, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.275 std_dev=0.203
C2'	B	0, 0.177, 0.385, 0.593, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.385 std_dev=0.208
C6	B	0, 0.148, 0.361, 0.574, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.361 std_dev=0.213
C5	B	0, 0.125, 0.344, 0.563, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.344 std_dev=0.219
C1'	B	0, 0.155, 0.376, 0.596, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.376 std_dev=0.221
O4'	B	0, 0.168, 0.393, 0.617, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.393 std_dev=0.225
N9	B	0, 0.130, 0.359, 0.587, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.359 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.134, 0.364, 0.593, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.364 std_dev=0.229
O5'	A	0, 0.114, 0.345, 0.576, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.345 std_dev=0.231
O5'	B	0, 0.105, 0.337, 0.569, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.337 std_dev=0.232
C3'	B	0, 0.087, 0.326, 0.565, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.326 std_dev=0.239
N1	B	0, 0.145, 0.385, 0.625, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.385 std_dev=0.240
N6	B	0, 0.133, 0.378, 0.623, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.378 std_dev=0.245
O2'	B	0, 0.210, 0.471, 0.731, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.471 std_dev=0.260
C4'	B	0, 0.089, 0.354, 0.618, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.354 std_dev=0.264
C8	B	0, 0.125, 0.392, 0.660, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.392 std_dev=0.267
C2	B	0, 0.117, 0.385, 0.653, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.385 std_dev=0.268
N7	B	0, 0.118, 0.388, 0.659, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.388 std_dev=0.270
P	A	0, 0.151, 0.453, 0.754, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.453 std_dev=0.302
OP1	A	0, 0.153, 0.457, 0.761, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.457 std_dev=0.304
O3'	B	0, 0.055, 0.383, 0.710, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.383 std_dev=0.328
OP1	B	0, 0.070, 0.405, 0.740, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.405 std_dev=0.335
OP2	A	0, 0.244, 0.609, 0.974, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.609 std_dev=0.365
C5'	B	0, 0.053, 0.418, 0.784, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.418 std_dev=0.365
OP2	B	0, 0.004, 0.383, 0.761, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.383 std_dev=0.378
O3'	A	0, -0.113, 0.272, 0.656, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.272 std_dev=0.384

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.20	0.01	0.04	0.22	0.04	0.09
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.25	0.02	0.08	0.25	0.10	0.11
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.08	0.05	0.02	0.03	0.05	0.04	0.00	0.07	0.02	0.13	0.25	0.11	0.16
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.02	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.05	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.15	0.05	0.18	0.31	0.22	0.21
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.03	0.03	0.08	0.06	0.01	0.05	0.00	0.01	0.13	0.04	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.07	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.12	0.08	0.05	0.21	0.32	0.24	0.23
C5'	0.03	0.04	0.08	0.02	0.13	0.01	0.16	0.00	0.13	0.06	0.08	0.15	0.05	0.06	0.06	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.05	0.16	0.28	0.17	0.17
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.17	0.02	0.08	0.24	0.09	0.11
N3	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.22	0.03	0.13	0.27	0.16	0.16
N4	0.01	0.02	0.05	0.05	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.14	0.15	0.06	0.21	0.34	0.27	0.25
O2	0.03	0.00	0.04	0.06	0.02	0.06	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.32	0.05	0.06	0.24	0.06	0.10
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.11	0.01	0.12	0.06	0.09	0.04	0.08	0.14	0.07	0.00	0.07	0.02	0.16	0.28	0.14	0.20
O3'	0.20	0.25	0.07	0.00	0.15	0.05	0.08	0.06	0.07	0.17	0.22	0.15	0.32	0.07	0.00	0.15	0.05	0.12	0.17	0.10
O4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.15	0.00	0.04	0.18	0.04	0.06
O5'	0.04	0.08	0.13	0.06	0.18	0.01	0.21	0.01	0.16	0.08	0.13	0.21	0.06	0.16	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.22	0.25	0.25	0.14	0.31	0.13	0.32	0.09	0.28	0.24	0.27	0.34	0.24	0.28	0.12	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.10	0.11	0.05	0.22	0.04	0.24	0.05	0.17	0.09	0.16	0.27	0.06	0.14	0.17	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.11	0.16	0.05	0.21	0.03	0.23	0.02	0.17	0.11	0.16	0.25	0.10	0.20	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.12	0.18	0.24	0.13	0.22	0.12	0.26	0.10	0.15	0.11	0.13	0.10	0.14	0.15	0.19	0.26	0.14	0.22	0.21	0.28	0.05
C2	0.11	0.08	0.13	0.18	0.10	0.19	0.10	0.23	0.08	0.11	0.08	0.09	0.08	0.11	0.11	0.13	0.20	0.12	0.19	0.18	0.33	0.06
C2'	0.15	0.11	0.21	0.26	0.12	0.23	0.10	0.25	0.09	0.13	0.09	0.12	0.08	0.11	0.14	0.22	0.30	0.13	0.24	0.17	0.30	0.09
C3'	0.07	0.05	0.11	0.17	0.06	0.15	0.06	0.19	0.06	0.09	0.05	0.05	0.08	0.09	0.07	0.13	0.22	0.07	0.16	0.27	0.11	0.01
C4	0.13	0.12	0.14	0.20	0.11	0.22	0.11	0.28	0.10	0.12	0.11	0.11	0.10	0.12	0.12	0.14	0.21	0.15	0.22	0.23	0.31	0.05
C4'	0.09	0.09	0.12	0.18	0.07	0.18	0.07	0.25	0.06	0.12	0.08	0.09	0.07	0.12	0.09	0.14	0.23	0.10	0.17	0.37	0.08	0.07
C5	0.15	0.13	0.17	0.23	0.13	0.24	0.12	0.30	0.11	0.15	0.12	0.13	0.11	0.14	0.14	0.17	0.25	0.17	0.24	0.25	0.29	0.07
C5'	0.09	0.13	0.12	0.17	0.09	0.18	0.08	0.25	0.09	0.13	0.12	0.12	0.10	0.13	0.09	0.14	0.22	0.10	0.15	0.47	0.05	0.10
C6	0.16	0.13	0.19	0.24	0.14	0.24	0.14	0.29	0.12	0.16	0.12	0.13	0.11	0.16	0.16	0.19	0.27	0.17	0.24	0.25	0.29	0.08
N1	0.15	0.11	0.17	0.22	0.13	0.22	0.13	0.26	0.11	0.15	0.11	0.12	0.11	0.15	0.14	0.17	0.24	0.15	0.22	0.21	0.30	0.05
N3	0.11	0.09	0.12	0.17	0.09	0.19	0.09	0.25	0.08	0.10	0.09	0.09	0.08	0.10	0.10	0.11	0.18	0.12	0.19	0.20	0.32	0.06
N4	0.12	0.13	0.13	0.19	0.11	0.22	0.11	0.28	0.11	0.11	0.13	0.12	0.10	0.11	0.11	0.13	0.20	0.15	0.22	0.23	0.30	0.05
O2	0.09	0.06	0.10	0.15	0.07	0.15	0.07	0.19	0.06	0.09	0.06	0.06	0.06	0.09	0.08	0.10	0.16	0.09	0.16	0.16	0.36	0.09
O2'	0.27	0.17	0.33	0.38	0.20	0.33	0.16	0.32	0.12	0.24	0.13	0.20	0.09	0.18	0.24	0.34	0.41	0.24	0.33	0.07	0.47	0.22
O3'	0.26	0.36	0.18	0.08	0.36	0.05	0.39	0.06	0.39	0.38	0.38	0.34	0.40	0.41	0.34	0.11	0.10	0.23	0.02	0.02	0.02	0.00
O4'	0.15	0.14	0.18	0.22	0.14	0.22	0.13	0.28	0.12	0.18	0.13	0.14	0.11	0.18	0.16	0.18	0.25	0.15	0.20	0.30	0.18	0.04
O5'	0.09	0.14	0.10	0.15	0.10	0.16	0.11	0.21	0.12	0.13	0.14	0.12	0.14	0.14	0.10	0.12	0.19	0.09	0.14	0.49	0.06	0.12
OP1	0.15	0.21	0.15	0.17	0.18	0.16	0.22	0.21	0.23	0.22	0.22	0.18	0.27	0.25	0.18	0.14	0.19	0.14	0.15	0.51	0.09	0.16
OP2	0.13	0.21	0.16	0.21	0.13	0.24	0.12	0.28	0.16	0.12	0.20	0.18	0.17	0.13	0.11	0.21	0.26	0.15	0.18	0.49	0.14	0.13
P	0.09	0.14	0.11	0.16	0.10	0.17	0.11	0.23	0.13	0.13	0.14	0.12	0.16	0.15	0.09	0.13	0.21	0.10	0.14	0.48	0.06	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.12	0.15	0.04
C2	0.02	0.00	0.13	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.18	0.11	0.10	0.05	0.06	0.21	0.07
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.07	0.10	0.13	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.30	0.20	0.11
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.11	0.04	0.07	0.04	0.09	0.04	0.01	0.00	0.01	0.06	0.38	0.18	0.16
C4	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.04	0.06	0.05	0.05	0.21	0.06
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.07	0.06	0.04	0.09	0.08	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.24	0.09	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.04	0.07	0.09	0.25	0.08
C5'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.13	0.07	0.13	0.08	0.15	0.11	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.12	0.15	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.02	0.07	0.09	0.11	0.26	0.09
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.12	0.04	0.06	0.07	0.26	0.07
N1	0.02	0.00	0.10	0.04	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.07	0.09	0.08	0.08	0.24	0.08
N3	0.02	0.00	0.13	0.07	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.11	0.09	0.04	0.06	0.19	0.06
N6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.04	0.06	0.11	0.15	0.29	0.11
N7	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.10	0.02	0.08	0.12	0.28	0.09
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.20	0.06
O2'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.09	0.03	0.06	0.03	0.09	0.05	0.15	0.17	0.07	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.03	0.39	0.19	0.14
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.12	0.07	0.11	0.04	0.10	0.03	0.02	0.00	0.02	0.09	0.58	0.18	0.25
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.02	0.07	0.04	0.09	0.09	0.06	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.07	0.11	0.08
O5'	0.06	0.05	0.03	0.06	0.05	0.01	0.07	0.01	0.09	0.06	0.08	0.04	0.11	0.08	0.04	0.03	0.09	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.12	0.06	0.30	0.38	0.05	0.24	0.09	0.12	0.11	0.07	0.08	0.06	0.15	0.12	0.06	0.39	0.58	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.21	0.20	0.18	0.21	0.09	0.25	0.15	0.26	0.26	0.24	0.19	0.29	0.28	0.20	0.19	0.18	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.11	0.16	0.06	0.06	0.08	0.01	0.09	0.07	0.08	0.06	0.11	0.09	0.06	0.14	0.25	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00