Doublet Group distance statistics: 54330

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.012, 0.030, 0.047, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.030 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.032 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.033 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.032, 0.078, 0.125, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.078 std_dev=0.047
O2	A	0, 0.030, 0.084, 0.138, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.084 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.087, 0.285, 0.484, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.285 std_dev=0.199
O3'	A	0, 0.120, 0.338, 0.557, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.338 std_dev=0.218
O4'	A	0, 0.127, 0.346, 0.565, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.346 std_dev=0.219
C3'	A	0, 0.101, 0.326, 0.551, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.326 std_dev=0.225
O5'	B	0, 0.135, 0.372, 0.609, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.372 std_dev=0.237
C4'	A	0, 0.167, 0.410, 0.653, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.410 std_dev=0.243
N7	B	0, 0.138, 0.413, 0.688, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.413 std_dev=0.275
C5	B	0, 0.185, 0.478, 0.772, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.478 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.212, 0.521, 0.830, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.521 std_dev=0.309
N9	B	0, 0.204, 0.515, 0.827, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.515 std_dev=0.311
C8	B	0, 0.154, 0.466, 0.779, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.466 std_dev=0.312
N6	B	0, 0.190, 0.519, 0.847, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.519 std_dev=0.328
C3'	B	0, 0.236, 0.565, 0.894, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.565 std_dev=0.329
O2'	A	0, 0.194, 0.525, 0.855, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.525 std_dev=0.330
P	B	0, 0.168, 0.508, 0.849, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.508 std_dev=0.341
O4'	B	0, 0.236, 0.577, 0.918, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.577 std_dev=0.341
C1'	B	0, 0.250, 0.598, 0.946, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.598 std_dev=0.348
O3'	B	0, 0.194, 0.575, 0.957, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.575 std_dev=0.381
C4	B	0, 0.174, 0.558, 0.942, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.558 std_dev=0.384
C2'	B	0, 0.257, 0.651, 1.044, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.651 std_dev=0.394
C6	B	0, 0.176, 0.571, 0.966, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.571 std_dev=0.395
C5'	A	0, 0.285, 0.763, 1.242, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.763 std_dev=0.478
O2'	B	0, 0.302, 0.799, 1.296, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.799 std_dev=0.497
C5'	B	0, -0.013, 0.582, 1.176, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.582 std_dev=0.595
N3	B	0, 0.094, 0.710, 1.327, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.710 std_dev=0.616
N1	B	0, 0.105, 0.750, 1.395, 1.761 max_d=1.761 avg_d=0.750 std_dev=0.645
OP1	B	0, 0.236, 0.914, 1.592, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.914 std_dev=0.678
OP2	B	0, 0.330, 1.015, 1.700, 1.894 max_d=1.894 avg_d=1.015 std_dev=0.685
C2	B	0, 0.062, 0.804, 1.546, 2.010 max_d=2.010 avg_d=0.804 std_dev=0.742
O5'	A	0, 0.039, 1.431, 2.824, 3.737 max_d=3.737 avg_d=1.431 std_dev=1.392
OP1	A	0, -0.006, 1.493, 2.992, 3.987 max_d=3.987 avg_d=1.493 std_dev=1.499
P	A	0, -0.030, 1.630, 3.290, 4.406 max_d=4.406 avg_d=1.630 std_dev=1.660
OP2	A	0, 0.028, 1.742, 3.456, 4.587 max_d=4.587 avg_d=1.742 std_dev=1.714

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.03	0.07	0.03	0.05	0.01	0.13	0.56	0.65	0.03
C2	0.04	0.00	0.07	0.05	0.02	0.09	0.03	0.23	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.21	0.12	0.15	0.22	0.50	1.24	0.38
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.02	0.08	0.07	0.10	0.01	0.05	0.02	0.13	0.00	0.03	0.03	0.49	0.60	0.34	0.35
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.03	0.04	0.11	0.02	0.01	0.01	0.40	0.31	0.08	0.27
C4	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.08	0.01	0.26	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.07	0.04	0.18	0.68	1.38	0.33
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.04	0.05	0.10	0.09	0.13	0.02	0.01	0.00	0.02	0.19	0.20	0.03
C5	0.02	0.03	0.08	0.08	0.01	0.06	0.00	0.21	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.10	0.07	0.08	0.21	0.86	1.17	0.16
C5'	0.06	0.23	0.07	0.01	0.26	0.00	0.21	0.00	0.16	0.17	0.27	0.28	0.24	0.05	0.05	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01
C6	0.00	0.02	0.10	0.08	0.01	0.04	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.08	0.12	0.27	0.87	0.96	0.16
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.11	0.64	1.00	0.14
N3	0.04	0.01	0.05	0.03	0.01	0.10	0.02	0.27	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.18	0.11	0.12	0.26	0.53	1.41	0.44
N4	0.03	0.03	0.02	0.04	0.00	0.09	0.01	0.28	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.09	0.07	0.05	0.21	0.67	1.46	0.38
O2	0.07	0.01	0.13	0.11	0.03	0.13	0.04	0.24	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.33	0.21	0.25	0.32	0.37	1.19	0.47
O2'	0.03	0.21	0.00	0.02	0.09	0.02	0.10	0.05	0.12	0.06	0.18	0.09	0.33	0.00	0.08	0.03	0.54	0.66	0.33	0.44
O3'	0.05	0.12	0.03	0.01	0.07	0.01	0.07	0.05	0.08	0.05	0.11	0.07	0.21	0.08	0.00	0.06	0.25	0.24	0.07	0.18
O4'	0.01	0.15	0.03	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.12	0.05	0.25	0.03	0.06	0.00	0.16	0.47	0.57	0.17
O5'	0.13	0.22	0.49	0.40	0.18	0.02	0.21	0.01	0.27	0.11	0.26	0.21	0.32	0.54	0.25	0.16	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.56	0.50	0.60	0.31	0.68	0.19	0.86	0.05	0.87	0.64	0.53	0.67	0.37	0.66	0.24	0.47	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.65	1.24	0.34	0.08	1.38	0.20	1.17	0.06	0.96	1.00	1.41	1.46	1.19	0.33	0.07	0.57	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.38	0.35	0.27	0.33	0.03	0.16	0.01	0.16	0.14	0.44	0.38	0.47	0.44	0.18	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.11	0.18	0.20	0.14	0.18	0.12	0.50	0.09	0.19	0.09	0.13	0.06	0.16	0.17	0.15	0.24	0.23	0.19	0.11	0.08	0.06
C2	0.15	0.08	0.17	0.20	0.12	0.20	0.13	0.55	0.08	0.18	0.07	0.10	0.07	0.18	0.15	0.16	0.23	0.20	0.21	0.12	0.25	0.05
C2'	0.07	0.05	0.10	0.18	0.05	0.19	0.06	0.43	0.07	0.06	0.06	0.05	0.10	0.08	0.06	0.09	0.22	0.18	0.09	0.06	0.08	0.01
C3'	0.11	0.10	0.03	0.13	0.08	0.17	0.08	0.35	0.10	0.07	0.10	0.10	0.11	0.08	0.08	0.05	0.19	0.22	0.06	0.04	0.06	0.02
C4	0.14	0.06	0.15	0.19	0.10	0.18	0.10	0.52	0.05	0.18	0.05	0.08	0.04	0.17	0.14	0.14	0.22	0.20	0.21	0.14	0.15	0.06
C4'	0.23	0.16	0.16	0.16	0.17	0.14	0.14	0.37	0.11	0.25	0.13	0.17	0.07	0.19	0.21	0.13	0.20	0.30	0.16	0.27	0.10	0.13
C5	0.15	0.06	0.16	0.19	0.10	0.18	0.10	0.49	0.05	0.19	0.04	0.08	0.04	0.17	0.15	0.15	0.23	0.21	0.19	0.15	0.05	0.09
C5'	0.23	0.20	0.14	0.17	0.21	0.18	0.22	0.35	0.19	0.30	0.19	0.20	0.18	0.28	0.24	0.11	0.25	0.27	0.18	0.23	0.13	0.10
C6	0.16	0.06	0.18	0.20	0.11	0.18	0.11	0.48	0.07	0.20	0.05	0.09	0.06	0.18	0.16	0.16	0.25	0.22	0.18	0.15	0.05	0.10
N1	0.16	0.08	0.18	0.21	0.13	0.20	0.13	0.52	0.08	0.20	0.07	0.10	0.07	0.18	0.16	0.16	0.25	0.21	0.20	0.13	0.11	0.05
N3	0.14	0.07	0.15	0.19	0.10	0.19	0.11	0.55	0.06	0.17	0.05	0.09	0.05	0.16	0.14	0.14	0.22	0.19	0.22	0.13	0.25	0.06
N4	0.14	0.07	0.15	0.18	0.09	0.17	0.09	0.53	0.04	0.17	0.06	0.07	0.02	0.16	0.13	0.14	0.21	0.20	0.21	0.15	0.16	0.06
O2	0.15	0.11	0.16	0.19	0.14	0.19	0.14	0.56	0.11	0.16	0.10	0.13	0.09	0.17	0.15	0.16	0.21	0.20	0.23	0.10	0.37	0.12
O2'	0.14	0.19	0.24	0.30	0.20	0.31	0.24	0.50	0.23	0.23	0.21	0.19	0.26	0.28	0.19	0.25	0.32	0.06	0.14	0.14	0.17	0.08
O3'	0.17	0.19	0.12	0.16	0.20	0.23	0.23	0.40	0.23	0.25	0.20	0.18	0.24	0.26	0.19	0.13	0.19	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00
O4'	0.41	0.31	0.35	0.28	0.36	0.17	0.34	0.37	0.28	0.47	0.28	0.34	0.23	0.42	0.41	0.33	0.28	0.44	0.28	0.27	0.10	0.17
O5'	0.65	0.57	0.46	0.31	0.62	0.35	0.59	0.30	0.54	0.66	0.54	0.60	0.49	0.62	0.65	0.48	0.25	0.68	0.19	0.09	0.19	0.09
OP1	0.34	0.12	0.24	0.23	0.13	0.29	0.06	0.41	0.12	0.26	0.16	0.12	0.20	0.12	0.25	0.28	0.25	0.44	0.20	0.34	0.05	0.09
OP2	0.61	0.92	0.47	0.29	0.88	0.21	1.03	0.29	1.10	0.91	1.03	0.83	1.22	1.07	0.80	0.40	0.26	0.47	0.20	0.18	0.17	0.08
P	0.65	0.64	0.47	0.31	0.67	0.32	0.68	0.30	0.65	0.71	0.63	0.65	0.63	0.71	0.68	0.48	0.25	0.63	0.18	0.07	0.17	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.30	0.31	0.38	0.19
C2	0.02	0.00	0.22	0.20	0.01	0.08	0.02	0.39	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.25	0.29	0.07	0.30	0.24	0.38	0.15
C2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.13	0.02	0.07	0.06	0.11	0.10	0.18	0.22	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.18	0.10	0.45	0.12
C3'	0.00	0.20	0.01	0.00	0.12	0.01	0.10	0.01	0.12	0.16	0.17	0.19	0.11	0.13	0.07	0.01	0.00	0.02	0.13	0.05	0.41	0.13
C4	0.02	0.01	0.13	0.12	0.00	0.12	0.01	0.42	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.12	0.15	0.03	0.29	0.24	0.42	0.16
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.12	0.00	0.17	0.00	0.16	0.23	0.12	0.07	0.19	0.23	0.14	0.06	0.02	0.01	0.01	0.13	0.26	0.08
C5	0.01	0.02	0.07	0.10	0.01	0.17	0.00	0.53	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.11	0.02	0.26	0.19	0.46	0.16
C5'	0.14	0.39	0.06	0.01	0.42	0.00	0.53	0.00	0.53	0.54	0.47	0.34	0.58	0.59	0.39	0.04	0.12	0.01	0.00	0.25	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.12	0.00	0.16	0.01	0.53	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.13	0.17	0.03	0.26	0.17	0.45	0.16
C8	0.01	0.02	0.10	0.16	0.01	0.23	0.01	0.54	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.15	0.08	0.24	0.21	0.52	0.18
N1	0.02	0.00	0.18	0.17	0.01	0.12	0.02	0.47	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.20	0.25	0.06	0.28	0.20	0.41	0.15
N3	0.03	0.00	0.22	0.19	0.01	0.07	0.02	0.34	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.23	0.25	0.07	0.30	0.26	0.37	0.15
N6	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.19	0.00	0.58	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.14	0.03	0.23	0.13	0.47	0.16
N7	0.00	0.03	0.05	0.13	0.02	0.23	0.01	0.59	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.06	0.22	0.16	0.52	0.18
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.14	0.00	0.39	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.28	0.26	0.44	0.16
O2'	0.02	0.25	0.01	0.01	0.12	0.06	0.07	0.04	0.13	0.07	0.20	0.23	0.10	0.02	0.01	0.00	0.07	0.10	0.11	0.08	0.42	0.11
O3'	0.04	0.29	0.02	0.00	0.15	0.02	0.11	0.12	0.17	0.15	0.25	0.25	0.14	0.10	0.06	0.07	0.00	0.09	0.18	0.19	0.37	0.20
O4'	0.01	0.07	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.06	0.07	0.03	0.06	0.02	0.10	0.09	0.00	0.37	0.46	0.32	0.30
O5'	0.30	0.30	0.18	0.13	0.29	0.01	0.26	0.00	0.26	0.24	0.28	0.30	0.23	0.22	0.28	0.11	0.18	0.37	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.31	0.24	0.10	0.05	0.24	0.13	0.19	0.25	0.17	0.21	0.20	0.26	0.13	0.16	0.26	0.08	0.19	0.46	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.38	0.38	0.45	0.41	0.42	0.26	0.46	0.12	0.45	0.52	0.41	0.37	0.47	0.52	0.44	0.42	0.37	0.32	0.02	0.03	0.00	0.01
P	0.19	0.15	0.12	0.13	0.16	0.08	0.16	0.01	0.16	0.18	0.15	0.15	0.16	0.18	0.16	0.11	0.20	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00