Doublet Group distance statistics: 54333

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 6, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.021, 0.040, 0.058, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.040 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.015, 0.041, 0.067, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.041 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.028, 0.124, 0.220, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.124 std_dev=0.096
C2'	A	0, 0.004, 0.128, 0.252, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.128 std_dev=0.124
O2'	A	0, 0.026, 0.197, 0.368, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.197 std_dev=0.171
C3'	A	0, 0.017, 0.199, 0.382, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.199 std_dev=0.182
C4'	A	0, 0.027, 0.227, 0.426, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.227 std_dev=0.200
O3'	A	0, 0.036, 0.281, 0.525, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.281 std_dev=0.245
P	A	0, 0.152, 0.426, 0.699, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.426 std_dev=0.273
N3	B	0, 0.275, 0.553, 0.832, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.553 std_dev=0.279
C4	B	0, 0.274, 0.566, 0.858, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.566 std_dev=0.292
C2	B	0, 0.307, 0.604, 0.901, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.604 std_dev=0.297
C5	B	0, 0.311, 0.615, 0.920, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.615 std_dev=0.304
C6	B	0, 0.308, 0.614, 0.919, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.614 std_dev=0.305
N1	B	0, 0.309, 0.624, 0.940, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.624 std_dev=0.315
O5'	A	0, 0.165, 0.482, 0.799, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.482 std_dev=0.317
N4	B	0, 0.290, 0.611, 0.932, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.611 std_dev=0.321
O2	B	0, 0.325, 0.673, 1.021, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.673 std_dev=0.348
C1'	B	0, 0.352, 0.713, 1.074, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.713 std_dev=0.361
O4'	B	0, 0.339, 0.708, 1.076, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.708 std_dev=0.369
P	B	0, 0.245, 0.622, 1.000, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.622 std_dev=0.377
OP2	A	0, 0.171, 0.560, 0.950, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.560 std_dev=0.390
C5'	A	0, -0.010, 0.391, 0.792, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.391 std_dev=0.401
O5'	B	0, 0.328, 0.733, 1.137, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.733 std_dev=0.404
OP1	A	0, 0.159, 0.564, 0.970, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.564 std_dev=0.405
C2'	B	0, 0.421, 0.839, 1.258, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.839 std_dev=0.419
C4'	B	0, 0.383, 0.802, 1.222, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.802 std_dev=0.419
C5'	B	0, 0.373, 0.799, 1.224, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.799 std_dev=0.426
C3'	B	0, 0.427, 0.864, 1.300, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.864 std_dev=0.436
O2'	B	0, 0.460, 0.928, 1.396, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.928 std_dev=0.468
O3'	B	0, 0.509, 1.002, 1.495, 1.726 max_d=1.726 avg_d=1.002 std_dev=0.493
OP2	B	0, 0.151, 0.809, 1.468, 2.431 max_d=2.431 avg_d=0.809 std_dev=0.659
OP1	B	0, 0.046, 0.812, 1.578, 3.016 max_d=3.016 avg_d=0.812 std_dev=0.766

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.17	0.18	0.09	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.02	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.23	0.20	0.09	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.03	0.10	0.00	0.02	0.01	0.16	0.24	0.04	0.12
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.08	0.04	0.08	0.08	0.10	0.02	0.01	0.02	0.19	0.28	0.03	0.15
C4	0.03	0.01	0.03	0.07	0.00	0.09	0.01	0.24	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.04	0.31	0.25	0.18	0.21
C4'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.09	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.03
C5	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.11	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.09	0.04	0.34	0.27	0.19	0.23
C5'	0.04	0.14	0.02	0.02	0.24	0.01	0.27	0.00	0.23	0.14	0.19	0.26	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.19	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.10	0.00	0.23	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.08	0.04	0.31	0.24	0.13	0.19
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.14	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.24	0.21	0.09	0.14
N3	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.19	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.26	0.22	0.13	0.17
N4	0.03	0.01	0.03	0.08	0.01	0.09	0.02	0.26	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.08	0.04	0.34	0.28	0.23	0.25
O2	0.04	0.01	0.10	0.10	0.02	0.04	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.12	0.04	0.18	0.18	0.07	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.06	0.05	0.10	0.00	0.04	0.04	0.04	0.16	0.11	0.04
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.01	0.09	0.04	0.08	0.03	0.07	0.08	0.12	0.04	0.00	0.01	0.16	0.26	0.06	0.13
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.16	0.16	0.14	0.07
O5'	0.17	0.23	0.16	0.19	0.31	0.01	0.34	0.01	0.31	0.24	0.26	0.34	0.18	0.04	0.16	0.16	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.20	0.24	0.28	0.25	0.13	0.27	0.19	0.24	0.21	0.22	0.28	0.18	0.16	0.26	0.16	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.09	0.09	0.04	0.03	0.18	0.19	0.19	0.27	0.13	0.09	0.13	0.23	0.07	0.11	0.06	0.14	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.08	0.13	0.12	0.15	0.21	0.03	0.23	0.01	0.19	0.14	0.17	0.25	0.11	0.04	0.13	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.08	0.07	0.08	0.11	0.05	0.11	0.07	0.08	0.06	0.10	0.15	0.09	0.06	0.09	0.05	0.08	0.56	0.45	0.06
C2	0.15	0.14	0.13	0.12	0.13	0.14	0.12	0.15	0.12	0.14	0.14	0.12	0.14	0.14	0.11	0.16	0.19	0.64	0.42	0.19
C2'	0.06	0.05	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.10	0.06	0.05	0.06	0.09	0.06	0.06	0.08	0.07	0.12	0.48	0.37	0.11
C3'	0.06	0.07	0.08	0.09	0.08	0.05	0.08	0.05	0.07	0.06	0.08	0.10	0.08	0.08	0.10	0.06	0.05	0.36	0.31	0.02
C4	0.17	0.17	0.16	0.13	0.14	0.14	0.12	0.13	0.12	0.15	0.16	0.14	0.17	0.17	0.13	0.15	0.16	0.61	0.42	0.15
C4'	0.20	0.21	0.21	0.21	0.21	0.19	0.22	0.18	0.21	0.20	0.21	0.22	0.22	0.21	0.22	0.20	0.15	0.42	0.43	0.13
C5	0.09	0.09	0.07	0.05	0.06	0.06	0.05	0.07	0.04	0.07	0.09	0.06	0.10	0.09	0.05	0.08	0.10	0.55	0.43	0.08
C5'	0.30	0.28	0.29	0.29	0.24	0.30	0.26	0.29	0.28	0.28	0.25	0.23	0.29	0.30	0.29	0.31	0.25	0.44	0.47	0.26
C6	0.06	0.06	0.04	0.05	0.05	0.05	0.06	0.07	0.04	0.04	0.06	0.06	0.07	0.05	0.06	0.06	0.08	0.54	0.44	0.06
N1	0.06	0.06	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.05	0.06	0.07	0.07	0.05	0.04	0.07	0.10	0.58	0.44	0.09
N3	0.20	0.19	0.19	0.17	0.17	0.18	0.16	0.18	0.16	0.18	0.19	0.17	0.19	0.20	0.16	0.19	0.21	0.65	0.41	0.21
N4	0.20	0.20	0.20	0.17	0.17	0.17	0.14	0.15	0.14	0.19	0.21	0.17	0.21	0.22	0.17	0.18	0.19	0.61	0.41	0.17
O2	0.20	0.17	0.17	0.17	0.18	0.20	0.19	0.21	0.18	0.19	0.17	0.18	0.16	0.17	0.16	0.21	0.25	0.70	0.43	0.27
O2'	0.06	0.05	0.07	0.08	0.08	0.08	0.07	0.12	0.07	0.05	0.07	0.14	0.05	0.06	0.09	0.09	0.13	0.54	0.39	0.15
O3'	0.07	0.08	0.08	0.09	0.08	0.05	0.07	0.05	0.08	0.08	0.08	0.10	0.08	0.08	0.10	0.08	0.04	0.25	0.21	0.03
O4'	0.14	0.17	0.16	0.17	0.20	0.14	0.20	0.15	0.18	0.15	0.18	0.22	0.17	0.15	0.18	0.14	0.12	0.51	0.48	0.06
O5'	0.12	0.13	0.14	0.18	0.18	0.17	0.18	0.22	0.15	0.12	0.16	0.23	0.13	0.13	0.19	0.15	0.18	0.43	0.38	0.15
OP1	0.24	0.23	0.27	0.30	0.27	0.28	0.29	0.31	0.27	0.25	0.24	0.29	0.23	0.26	0.32	0.26	0.28	0.32	0.39	0.25
OP2	0.10	0.08	0.11	0.15	0.11	0.16	0.15	0.20	0.13	0.09	0.08	0.14	0.09	0.10	0.17	0.13	0.17	0.39	0.36	0.13
P	0.15	0.14	0.17	0.20	0.18	0.19	0.20	0.23	0.18	0.14	0.16	0.21	0.15	0.16	0.22	0.17	0.18	0.39	0.36	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.09	0.01	0.02	0.00	0.05	0.52	0.33	0.10
C2	0.04	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.09	0.67	0.43	0.12
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.08	0.01	0.02	0.01	0.05	0.32	0.22	0.04
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.06	0.09	0.08	0.02	0.01	0.01	0.06	0.13	0.12	0.04
C4	0.04	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.05	0.13	0.68	0.42	0.11
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.08	0.08	0.03	0.02	0.00	0.02	0.19	0.12	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.09	0.05	0.13	0.65	0.40	0.11
C5'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.08	0.04	0.07	0.11	0.08	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01
C6	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.07	0.05	0.11	0.63	0.39	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.08	0.62	0.40	0.12
N3	0.04	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.04	0.11	0.70	0.44	0.11
N4	0.04	0.01	0.06	0.09	0.00	0.08	0.02	0.11	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.10	0.05	0.14	0.67	0.42	0.11
O2	0.09	0.01	0.08	0.08	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.10	0.08	0.09	0.10	0.66	0.42	0.14
O2'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.05	0.10	0.00	0.03	0.02	0.05	0.31	0.20	0.04
O3'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.03	0.07	0.03	0.06	0.10	0.08	0.03	0.00	0.02	0.08	0.06	0.13	0.07
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.09	0.02	0.02	0.00	0.04	0.48	0.31	0.12
O5'	0.05	0.09	0.05	0.06	0.13	0.02	0.13	0.01	0.11	0.08	0.11	0.14	0.10	0.05	0.08	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.52	0.67	0.32	0.13	0.68	0.19	0.65	0.06	0.63	0.62	0.70	0.67	0.66	0.31	0.06	0.48	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.33	0.43	0.22	0.12	0.42	0.12	0.40	0.06	0.39	0.40	0.44	0.42	0.42	0.20	0.13	0.31	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.12	0.04	0.04	0.11	0.04	0.11	0.01	0.12	0.12	0.11	0.11	0.14	0.04	0.07	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00