Doublet Group distance statistics: 54337

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C6	A	0, -0.001, 0.006, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.007
N1	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, -0.002, 0.014, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.001, 0.020, 0.038, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.019
O4'	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N4	A	0, -0.004, 0.035, 0.073, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.035 std_dev=0.038
C2'	A	0, -0.032, 0.124, 0.279, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.124 std_dev=0.156
O4'	B	0, 0.110, 0.378, 0.645, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.378 std_dev=0.267
P	A	0, -0.039, 0.239, 0.516, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.239 std_dev=0.277
C4'	A	0, -0.094, 0.253, 0.601, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.253 std_dev=0.348
C4	B	0, 0.016, 0.379, 0.742, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.379 std_dev=0.363
O4	B	0, 0.003, 0.367, 0.732, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.367 std_dev=0.365
OP2	A	0, 0.003, 0.386, 0.769, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.386 std_dev=0.383
N3	B	0, -0.003, 0.447, 0.897, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.447 std_dev=0.450
C6	B	0, 0.039, 0.512, 0.984, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.512 std_dev=0.473
O5'	A	0, -0.128, 0.359, 0.846, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.359 std_dev=0.487
N1	B	0, 0.041, 0.530, 1.019, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.530 std_dev=0.489
C5	B	0, 0.010, 0.500, 0.991, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.500 std_dev=0.491
C5'	A	0, -0.149, 0.399, 0.947, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.399 std_dev=0.548
C4'	B	0, 0.106, 0.668, 1.229, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.668 std_dev=0.561
C2	B	0, -0.004, 0.570, 1.143, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.570 std_dev=0.574
O2'	A	0, -0.137, 0.471, 1.079, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.471 std_dev=0.608
OP1	A	0, -0.156, 0.501, 1.158, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.501 std_dev=0.657
C1'	B	0, 0.031, 0.688, 1.346, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.688 std_dev=0.658
C3'	A	0, -0.222, 0.566, 1.354, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.566 std_dev=0.788
O2	B	0, -0.063, 0.764, 1.592, 1.915 max_d=1.915 avg_d=0.764 std_dev=0.828
C5'	B	0, 0.041, 0.931, 1.821, 2.130 max_d=2.130 avg_d=0.931 std_dev=0.890
C3'	B	0, -0.046, 1.094, 2.233, 2.666 max_d=2.666 avg_d=1.094 std_dev=1.140
C2'	B	0, -0.091, 1.122, 2.335, 2.806 max_d=2.806 avg_d=1.122 std_dev=1.213
O5'	B	0, -0.118, 1.132, 2.382, 2.874 max_d=2.874 avg_d=1.132 std_dev=1.250
O3'	A	0, -0.407, 1.049, 2.505, 3.108 max_d=3.108 avg_d=1.049 std_dev=1.456
O3'	B	0, -0.087, 1.372, 2.830, 3.392 max_d=3.392 avg_d=1.372 std_dev=1.458
O2'	B	0, -0.135, 1.359, 2.854, 3.440 max_d=3.440 avg_d=1.359 std_dev=1.494
P	B	0, -0.292, 1.539, 3.370, 4.112 max_d=4.112 avg_d=1.539 std_dev=1.831
OP2	B	0, -0.329, 1.557, 3.442, 4.210 max_d=4.210 avg_d=1.557 std_dev=1.886
OP1	B	0, -0.390, 2.119, 4.629, 5.644 max_d=5.644 avg_d=2.119 std_dev=2.509

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.15	0.00	0.16	0.03	0.10	0.14
C2	0.01	0.00	0.02	0.13	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.35	0.09	0.01	0.13	0.02	0.18	0.15
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.07	0.18	0.08	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.17	0.03	0.07	0.10
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.37	0.00	0.49	0.02	0.47	0.23	0.23	0.40	0.05	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.34	0.02
C4	0.03	0.02	0.03	0.37	0.00	0.16	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.30	0.29	0.01	0.19	0.14	0.22	0.19
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.16	0.00	0.22	0.00	0.21	0.10	0.10	0.17	0.02	0.24	0.01	0.00	0.01	0.08	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.49	0.01	0.22	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.49	0.00	0.23	0.19	0.19	0.20
C5'	0.09	0.06	0.18	0.02	0.17	0.00	0.19	0.00	0.13	0.04	0.12	0.20	0.01	0.06	0.13	0.01	0.01	0.15	0.31	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.47	0.01	0.21	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.44	0.00	0.24	0.15	0.16	0.20
N1	0.01	0.00	0.03	0.23	0.02	0.10	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.18	0.09	0.00	0.19	0.06	0.16	0.17
N3	0.02	0.01	0.01	0.23	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.37	0.05	0.00	0.14	0.06	0.21	0.16
N4	0.04	0.04	0.03	0.40	0.01	0.17	0.01	0.20	0.02	0.03	0.03	0.00	0.04	0.33	0.34	0.02	0.19	0.17	0.25	0.20
O2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.41	0.36	0.01	0.08	0.07	0.17	0.11
O2'	0.02	0.35	0.01	0.01	0.30	0.24	0.17	0.06	0.10	0.18	0.37	0.33	0.41	0.00	0.02	0.17	0.16	0.52	0.37	0.28
O3'	0.15	0.09	0.03	0.00	0.29	0.01	0.49	0.13	0.44	0.09	0.05	0.34	0.36	0.02	0.00	0.13	0.13	0.35	0.63	0.23
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.17	0.13	0.00	0.09	0.06	0.11	0.12
O5'	0.16	0.13	0.17	0.02	0.19	0.01	0.23	0.01	0.24	0.19	0.14	0.19	0.08	0.16	0.13	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.03	0.02	0.03	0.05	0.14	0.08	0.19	0.15	0.15	0.06	0.06	0.17	0.07	0.52	0.35	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.18	0.07	0.34	0.22	0.17	0.19	0.31	0.16	0.16	0.21	0.25	0.17	0.37	0.63	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.15	0.10	0.02	0.19	0.03	0.20	0.02	0.20	0.17	0.16	0.20	0.11	0.28	0.23	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.05	0.04	0.12	0.08	0.15	0.09	0.26	0.08	0.07	0.06	0.02	0.08	0.17	0.09	0.13	0.41	0.19	0.25	0.19
C2	0.11	0.08	0.09	0.18	0.11	0.17	0.12	0.26	0.11	0.11	0.08	0.05	0.04	0.23	0.11	0.14	0.41	0.14	0.21	0.15
C2'	0.09	0.08	0.03	0.09	0.06	0.14	0.07	0.23	0.07	0.09	0.07	0.06	0.05	0.13	0.06	0.14	0.35	0.11	0.17	0.12
C3'	0.37	0.30	0.28	0.43	0.34	0.51	0.40	0.67	0.40	0.37	0.29	0.24	0.20	0.46	0.31	0.49	0.82	0.63	0.71	0.65
C4	0.04	0.03	0.10	0.05	0.03	0.13	0.05	0.28	0.05	0.04	0.03	0.05	0.16	0.07	0.04	0.14	0.41	0.21	0.26	0.22
C4'	0.18	0.13	0.10	0.27	0.20	0.34	0.26	0.53	0.24	0.19	0.14	0.07	0.07	0.31	0.21	0.31	0.69	0.58	0.62	0.56
C5	0.05	0.06	0.21	0.06	0.06	0.10	0.05	0.27	0.05	0.05	0.07	0.09	0.27	0.06	0.06	0.12	0.39	0.25	0.29	0.25
C5'	0.24	0.20	0.14	0.33	0.26	0.43	0.32	0.64	0.31	0.26	0.20	0.13	0.07	0.38	0.27	0.40	0.78	0.73	0.75	0.69
C6	0.04	0.03	0.15	0.04	0.03	0.11	0.04	0.27	0.04	0.04	0.03	0.05	0.22	0.04	0.03	0.12	0.40	0.23	0.28	0.24
N1	0.06	0.04	0.04	0.10	0.07	0.15	0.08	0.26	0.07	0.07	0.05	0.02	0.10	0.14	0.07	0.13	0.41	0.19	0.24	0.19
N3	0.10	0.07	0.06	0.16	0.08	0.17	0.11	0.26	0.11	0.10	0.06	0.03	0.04	0.20	0.08	0.15	0.42	0.15	0.21	0.16
N4	0.04	0.07	0.16	0.03	0.10	0.12	0.05	0.28	0.04	0.04	0.10	0.09	0.22	0.03	0.16	0.13	0.41	0.23	0.26	0.24
O2	0.16	0.13	0.19	0.26	0.15	0.19	0.16	0.24	0.15	0.15	0.14	0.09	0.14	0.32	0.16	0.14	0.41	0.11	0.17	0.11
O2'	0.30	0.32	0.32	0.26	0.33	0.28	0.32	0.22	0.32	0.31	0.32	0.33	0.35	0.20	0.34	0.30	0.07	0.45	0.31	0.38
O3'	0.23	0.11	0.14	0.33	0.17	0.42	0.29	0.62	0.29	0.22	0.08	0.02	0.06	0.37	0.13	0.38	0.79	0.65	0.74	0.66
O4'	0.07	0.04	0.05	0.16	0.11	0.20	0.14	0.36	0.11	0.08	0.05	0.04	0.14	0.21	0.14	0.16	0.53	0.40	0.43	0.37
O5'	0.13	0.14	0.24	0.06	0.05	0.10	0.05	0.31	0.07	0.10	0.11	0.20	0.38	0.08	0.03	0.07	0.46	0.50	0.47	0.42
OP1	0.18	0.14	0.32	0.14	0.05	0.06	0.07	0.23	0.11	0.13	0.09	0.19	0.46	0.12	0.04	0.06	0.35	0.39	0.36	0.32
OP2	0.43	0.43	0.63	0.33	0.26	0.14	0.20	0.22	0.27	0.37	0.38	0.53	0.82	0.33	0.20	0.16	0.37	0.63	0.55	0.49
P	0.22	0.22	0.35	0.11	0.10	0.07	0.07	0.31	0.11	0.18	0.19	0.31	0.52	0.10	0.06	0.06	0.47	0.60	0.54	0.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.18	0.12
C2	0.05	0.00	0.17	0.16	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.18	0.01	0.05	0.18	0.07	0.16	0.15
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.04	0.14	0.27	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.07	0.26	0.13
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.12	0.00	0.06	0.01	0.04	0.09	0.15	0.21	0.01	0.01	0.12	0.02	0.06	0.12	0.22	0.09
C4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.17	0.00	0.03	0.22	0.11	0.16	0.14
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.04	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.00	0.00	0.06	0.13	0.06
C5	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.03	0.27	0.08	0.13	0.09
C5'	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.16	0.08	0.03	0.01	0.06	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00
C6	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.07	0.01	0.06	0.28	0.09	0.12	0.07
N1	0.00	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.20	0.04	0.14	0.09
N3	0.03	0.00	0.14	0.15	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.19	0.01	0.06	0.19	0.12	0.18	0.18
O2	0.09	0.00	0.27	0.21	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.25	0.23	0.01	0.05	0.16	0.08	0.17	0.16
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.03	0.05	0.05	0.06	0.08	0.01	0.10	0.25	0.00	0.04	0.05	0.06	0.01	0.13	0.22	0.07
O3'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.17	0.02	0.11	0.00	0.07	0.10	0.19	0.23	0.04	0.00	0.18	0.00	0.09	0.24	0.15	0.02
O4	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.04	0.21	0.16	0.17	0.17
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.00	0.06	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.04	0.13	0.10
O5'	0.09	0.18	0.01	0.06	0.22	0.00	0.27	0.00	0.28	0.20	0.19	0.16	0.01	0.09	0.21	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.01	0.07	0.07	0.12	0.11	0.06	0.08	0.05	0.09	0.04	0.12	0.08	0.13	0.24	0.16	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.16	0.26	0.22	0.16	0.13	0.13	0.03	0.12	0.14	0.18	0.17	0.22	0.15	0.17	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.15	0.13	0.09	0.14	0.06	0.09	0.00	0.07	0.09	0.18	0.16	0.07	0.02	0.17	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00