Doublet Group distance statistics: 54343

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 8, 7, 5, 0, 2, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N4	A	0, 0.016, 0.035, 0.053, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.004, 0.023, 0.042, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.023 std_dev=0.019
C2'	A	0, 0.027, 0.090, 0.153, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.090 std_dev=0.063
O4'	A	0, 0.008, 0.082, 0.155, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.082 std_dev=0.074
O2'	A	0, -0.026, 0.140, 0.306, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.140 std_dev=0.166
C3'	A	0, -0.012, 0.167, 0.346, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.167 std_dev=0.179
C6	B	0, 0.178, 0.360, 0.542, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.360 std_dev=0.182
N6	B	0, 0.117, 0.302, 0.486, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.302 std_dev=0.184
C4'	A	0, -0.026, 0.161, 0.347, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.161 std_dev=0.186
C5	B	0, 0.165, 0.372, 0.580, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.372 std_dev=0.208
N1	B	0, 0.232, 0.469, 0.707, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.469 std_dev=0.238
C4	B	0, 0.207, 0.475, 0.743, 1.561 max_d=1.561 avg_d=0.475 std_dev=0.268
N7	B	0, 0.065, 0.343, 0.621, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.343 std_dev=0.278
C2	B	0, 0.270, 0.550, 0.830, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.550 std_dev=0.280
O3'	A	0, -0.041, 0.255, 0.551, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.255 std_dev=0.296
N3	B	0, 0.267, 0.564, 0.861, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.564 std_dev=0.297
C5'	A	0, -0.055, 0.258, 0.571, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.258 std_dev=0.313
N9	B	0, 0.153, 0.499, 0.844, 2.145 max_d=2.145 avg_d=0.499 std_dev=0.346
C8	B	0, 0.067, 0.428, 0.790, 2.243 max_d=2.243 avg_d=0.428 std_dev=0.362
C1'	B	0, 0.151, 0.576, 1.001, 2.624 max_d=2.624 avg_d=0.576 std_dev=0.425
O4'	B	0, 0.077, 0.548, 1.018, 2.898 max_d=2.898 avg_d=0.548 std_dev=0.471
O5'	A	0, -0.318, 0.335, 0.987, 3.915 max_d=3.915 avg_d=0.335 std_dev=0.653
P	A	0, -0.348, 0.424, 1.196, 4.642 max_d=4.642 avg_d=0.424 std_dev=0.772
C4'	B	0, -0.119, 0.685, 1.489, 4.969 max_d=4.969 avg_d=0.685 std_dev=0.804
OP2	A	0, -0.344, 0.472, 1.289, 4.781 max_d=4.781 avg_d=0.472 std_dev=0.816
C2'	B	0, -0.093, 0.735, 1.562, 5.131 max_d=5.131 avg_d=0.735 std_dev=0.828
C3'	B	0, -0.161, 0.768, 1.697, 5.654 max_d=5.654 avg_d=0.768 std_dev=0.929
OP1	A	0, -0.393, 0.537, 1.468, 4.844 max_d=4.844 avg_d=0.537 std_dev=0.930
O2'	B	0, -0.109, 0.842, 1.793, 5.783 max_d=5.783 avg_d=0.842 std_dev=0.951
O5'	B	0, -0.358, 0.681, 1.720, 6.333 max_d=6.333 avg_d=0.681 std_dev=1.039
O3'	B	0, -0.197, 0.851, 1.898, 6.195 max_d=6.195 avg_d=0.851 std_dev=1.047
C5'	B	0, -0.360, 0.721, 1.803, 6.534 max_d=6.534 avg_d=0.721 std_dev=1.082
OP1	B	0, -0.601, 0.746, 2.094, 8.133 max_d=8.133 avg_d=0.746 std_dev=1.348
P	B	0, -0.719, 0.729, 2.177, 8.788 max_d=8.788 avg_d=0.729 std_dev=1.448
OP2	B	0, -0.971, 0.728, 2.428, 10.259 max_d=10.259 avg_d=0.728 std_dev=1.699

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.09	0.14	0.15	0.08
C2	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.05	0.02	0.20	0.35	0.16	0.19
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.08	0.00	0.02	0.01	0.13	0.16	0.10	0.11
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.12	0.07	0.10	0.12	0.07	0.02	0.00	0.01	0.16	0.16	0.09	0.14
C4	0.01	0.00	0.02	0.12	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.10	0.02	0.34	0.53	0.29	0.35
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.09	0.04	0.04	0.08	0.04	0.07	0.01	0.00	0.01	0.07	0.17	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.13	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.03	0.40	0.53	0.32	0.39
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.16	0.00	0.19	0.00	0.16	0.09	0.11	0.17	0.05	0.06	0.03	0.01	0.00	0.14	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.35	0.40	0.22	0.31
N1	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.04	0.01	0.22	0.30	0.14	0.19
N3	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.07	0.02	0.26	0.45	0.22	0.27
N4	0.01	0.00	0.03	0.12	0.00	0.08	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.11	0.02	0.37	0.59	0.35	0.40
O2	0.02	0.01	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.08	0.03	0.12	0.29	0.14	0.14
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.09	0.07	0.06	0.06	0.04	0.05	0.11	0.10	0.13	0.00	0.04	0.06	0.10	0.14	0.10	0.09
O3'	0.03	0.05	0.02	0.00	0.10	0.01	0.13	0.03	0.11	0.04	0.07	0.11	0.08	0.04	0.00	0.02	0.13	0.24	0.12	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.02	0.00	0.06	0.06	0.25	0.07
O5'	0.09	0.20	0.13	0.16	0.34	0.01	0.40	0.00	0.35	0.22	0.26	0.37	0.12	0.10	0.13	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.14	0.35	0.16	0.16	0.53	0.07	0.53	0.14	0.40	0.30	0.45	0.59	0.29	0.14	0.24	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.16	0.10	0.09	0.29	0.17	0.32	0.18	0.22	0.14	0.22	0.35	0.14	0.10	0.12	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.19	0.11	0.14	0.35	0.02	0.39	0.01	0.31	0.19	0.27	0.40	0.14	0.09	0.16	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.12	0.31	0.17	0.15	0.24	0.15	0.44	0.12	0.23	0.12	0.13	0.12	0.21	0.20	0.45	0.16	0.21	0.34	0.45	0.95	0.58
C2	0.23	0.11	0.35	0.20	0.17	0.25	0.16	0.43	0.11	0.25	0.10	0.14	0.10	0.22	0.22	0.47	0.20	0.21	0.32	0.40	0.88	0.53
C2'	0.23	0.09	0.32	0.22	0.16	0.32	0.16	0.54	0.10	0.27	0.09	0.12	0.09	0.24	0.22	0.42	0.21	0.27	0.44	0.58	1.08	0.72
C3'	0.30	0.08	0.41	0.32	0.19	0.41	0.19	0.64	0.10	0.33	0.08	0.13	0.09	0.29	0.28	0.50	0.29	0.33	0.56	0.74	1.26	0.87
C4	0.30	0.14	0.53	0.36	0.21	0.31	0.18	0.45	0.12	0.29	0.12	0.19	0.11	0.23	0.27	0.65	0.35	0.22	0.34	0.42	0.93	0.55
C4'	0.22	0.11	0.33	0.19	0.13	0.28	0.13	0.48	0.10	0.25	0.13	0.10	0.12	0.21	0.20	0.46	0.17	0.23	0.41	0.59	1.09	0.70
C5	0.30	0.13	0.54	0.37	0.20	0.32	0.17	0.46	0.11	0.29	0.11	0.18	0.11	0.23	0.27	0.68	0.36	0.22	0.37	0.47	1.01	0.60
C5'	0.30	0.13	0.43	0.29	0.19	0.35	0.18	0.53	0.13	0.32	0.14	0.15	0.13	0.27	0.27	0.58	0.25	0.30	0.51	0.70	1.21	0.80
C6	0.27	0.12	0.47	0.30	0.19	0.30	0.16	0.46	0.11	0.27	0.10	0.16	0.11	0.22	0.25	0.61	0.29	0.22	0.37	0.49	1.02	0.61
N1	0.24	0.11	0.38	0.23	0.17	0.27	0.16	0.45	0.11	0.25	0.11	0.14	0.11	0.22	0.22	0.51	0.22	0.22	0.34	0.45	0.96	0.58
N3	0.26	0.13	0.43	0.26	0.19	0.27	0.17	0.43	0.11	0.27	0.11	0.17	0.11	0.23	0.24	0.55	0.27	0.21	0.32	0.38	0.87	0.51
N4	0.34	0.17	0.62	0.44	0.23	0.34	0.19	0.45	0.13	0.31	0.14	0.22	0.12	0.22	0.30	0.74	0.44	0.23	0.35	0.40	0.90	0.53
O2	0.19	0.11	0.25	0.13	0.15	0.22	0.15	0.41	0.11	0.21	0.10	0.13	0.10	0.21	0.19	0.37	0.16	0.21	0.30	0.37	0.81	0.50
O2'	0.10	0.18	0.12	0.08	0.10	0.16	0.09	0.40	0.13	0.13	0.19	0.14	0.14	0.11	0.10	0.23	0.11	0.16	0.29	0.41	0.88	0.54
O3'	0.22	0.11	0.31	0.25	0.11	0.38	0.11	0.63	0.07	0.27	0.14	0.07	0.11	0.23	0.20	0.39	0.21	0.30	0.56	0.78	1.27	0.89
O4'	0.21	0.13	0.32	0.16	0.15	0.22	0.14	0.41	0.13	0.22	0.15	0.13	0.14	0.19	0.19	0.48	0.15	0.19	0.32	0.45	0.95	0.56
O5'	0.44	0.16	0.58	0.43	0.29	0.50	0.27	0.66	0.17	0.45	0.15	0.23	0.15	0.38	0.39	0.72	0.38	0.43	0.67	0.90	1.38	0.97
OP1	0.65	0.39	0.75	0.61	0.50	0.68	0.46	0.78	0.37	0.63	0.35	0.46	0.33	0.54	0.60	0.88	0.58	0.69	0.88	1.09	1.57	1.16
OP2	0.48	0.20	0.67	0.53	0.31	0.54	0.27	0.68	0.19	0.45	0.19	0.27	0.19	0.35	0.42	0.82	0.47	0.45	0.72	0.98	1.45	1.03
P	0.47	0.20	0.62	0.46	0.32	0.51	0.28	0.64	0.20	0.46	0.18	0.27	0.18	0.38	0.42	0.78	0.41	0.47	0.70	0.93	1.42	1.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.01	0.11	0.13	0.13	0.10
C2	0.03	0.00	0.20	0.17	0.00	0.10	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.19	0.19	0.14	0.14	0.23	0.17
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.04	0.13	0.08	0.12	0.15	0.20	0.05	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.16	0.21	0.16	0.13
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.14	0.09	0.16	0.15	0.14	0.11	0.08	0.01	0.00	0.01	0.21	0.22	0.17	0.14
C4	0.01	0.00	0.10	0.12	0.00	0.06	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.13	0.10	0.10	0.12	0.24	0.14
C4'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.08	0.09	0.07	0.09	0.05	0.12	0.01	0.00	0.02	0.08	0.16	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.07	0.00	0.27	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.12	0.05	0.10	0.13	0.35	0.18
C5'	0.09	0.25	0.13	0.02	0.23	0.01	0.27	0.00	0.28	0.26	0.27	0.22	0.30	0.29	0.20	0.06	0.11	0.01	0.01	0.15	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.07	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.09	0.11	0.14	0.38	0.21
C8	0.01	0.01	0.12	0.09	0.01	0.09	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.19	0.06	0.10	0.11	0.12	0.33	0.15
N1	0.02	0.00	0.15	0.16	0.00	0.08	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.18	0.15	0.13	0.14	0.31	0.20
N3	0.03	0.00	0.20	0.15	0.00	0.09	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.17	0.19	0.13	0.14	0.19	0.15
N6	0.02	0.01	0.05	0.14	0.01	0.07	0.01	0.30	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.15	0.06	0.11	0.15	0.45	0.24
N7	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.09	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.18	0.08	0.06	0.10	0.13	0.41	0.19
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.08	0.01	0.09	0.11	0.20	0.11
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.09	0.12	0.10	0.06	0.10	0.19	0.14	0.20	0.12	0.18	0.08	0.00	0.03	0.08	0.10	0.14	0.28	0.15
O3'	0.13	0.19	0.02	0.00	0.13	0.01	0.12	0.11	0.15	0.06	0.18	0.17	0.15	0.08	0.08	0.03	0.00	0.12	0.18	0.19	0.30	0.17
O4'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.10	0.15	0.19	0.06	0.06	0.01	0.08	0.12	0.00	0.23	0.24	0.22	0.21
O5'	0.11	0.14	0.16	0.21	0.10	0.02	0.10	0.01	0.11	0.11	0.13	0.13	0.11	0.10	0.09	0.10	0.18	0.23	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.14	0.21	0.22	0.12	0.08	0.13	0.15	0.14	0.12	0.14	0.14	0.15	0.13	0.11	0.14	0.19	0.24	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.23	0.16	0.17	0.24	0.16	0.35	0.13	0.38	0.33	0.31	0.19	0.45	0.41	0.20	0.28	0.30	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.17	0.13	0.14	0.14	0.06	0.18	0.01	0.21	0.15	0.20	0.15	0.24	0.19	0.11	0.15	0.17	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00