Doublet Group distance statistics: 54352

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.000, 0.038, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.038
C6	A	0, 0.000, 0.046, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.046 std_dev=0.046
C4	A	0, 0.000, 0.051, 0.102, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.051 std_dev=0.051
C2	A	0, 0.000, 0.052, 0.104, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.052 std_dev=0.052
C1'	A	0, 0.000, 0.065, 0.130, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.065 std_dev=0.065
N1	A	0, 0.000, 0.067, 0.134, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.067 std_dev=0.067
O2	A	0, 0.000, 0.119, 0.238, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.119 std_dev=0.119
N4	A	0, 0.000, 0.122, 0.244, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.122 std_dev=0.122
O4'	B	0, 0.000, 0.388, 0.776, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.388 std_dev=0.388
C4	B	0, 0.000, 0.418, 0.836, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.418 std_dev=0.418
C5	B	0, 0.000, 0.459, 0.919, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.459 std_dev=0.459
C8	B	0, 0.000, 0.479, 0.958, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.479 std_dev=0.479
N9	B	0, 0.000, 0.514, 1.027, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.514 std_dev=0.514
N7	B	0, 0.000, 0.539, 1.077, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.539 std_dev=0.539
C2'	A	0, 0.000, 0.624, 1.248, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.624 std_dev=0.624
C4'	B	0, 0.000, 0.629, 1.259, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.629 std_dev=0.629
O4'	A	0, 0.000, 0.632, 1.264, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.632 std_dev=0.632
N3	B	0, 0.000, 0.773, 1.545, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.773 std_dev=0.773
C4'	A	0, 0.000, 0.791, 1.582, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.791 std_dev=0.791
O2'	A	0, 0.000, 0.828, 1.656, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.828 std_dev=0.828
C6	B	0, 0.000, 0.875, 1.751, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.875 std_dev=0.875
C3'	A	0, 0.000, 0.900, 1.801, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.900 std_dev=0.900
C2	B	0, 0.000, 0.956, 1.911, 1.911 max_d=1.911 avg_d=0.956 std_dev=0.956
N1	B	0, 0.000, 1.044, 2.088, 2.088 max_d=2.088 avg_d=1.044 std_dev=1.044
C5'	B	0, 0.000, 1.102, 2.204, 2.204 max_d=2.204 avg_d=1.102 std_dev=1.102
C1'	B	0, 0.000, 1.107, 2.214, 2.214 max_d=2.214 avg_d=1.107 std_dev=1.107
N6	B	0, 0.000, 1.167, 2.333, 2.333 max_d=2.333 avg_d=1.167 std_dev=1.167
O3'	A	0, 0.000, 1.223, 2.446, 2.446 max_d=2.446 avg_d=1.223 std_dev=1.223
O5'	A	0, 0.000, 1.255, 2.510, 2.510 max_d=2.510 avg_d=1.255 std_dev=1.255
C5'	A	0, 0.000, 1.611, 3.222, 3.222 max_d=3.222 avg_d=1.611 std_dev=1.611
C3'	B	0, 0.000, 1.669, 3.339, 3.339 max_d=3.339 avg_d=1.669 std_dev=1.669
O5'	B	0, 0.000, 1.788, 3.576, 3.576 max_d=3.576 avg_d=1.788 std_dev=1.788
OP1	A	0, 0.000, 1.879, 3.758, 3.758 max_d=3.758 avg_d=1.879 std_dev=1.879
O3'	B	0, 0.000, 1.941, 3.882, 3.882 max_d=3.882 avg_d=1.941 std_dev=1.941
C2'	B	0, 0.000, 2.048, 4.096, 4.096 max_d=4.096 avg_d=2.048 std_dev=2.048
P	A	0, 0.000, 2.123, 4.247, 4.247 max_d=4.247 avg_d=2.123 std_dev=2.123
P	B	0, 0.000, 2.551, 5.103, 5.103 max_d=5.103 avg_d=2.551 std_dev=2.551
OP1	B	0, 0.000, 2.620, 5.239, 5.239 max_d=5.239 avg_d=2.620 std_dev=2.620
OP2	A	0, 0.000, 2.861, 5.722, 5.722 max_d=5.722 avg_d=2.861 std_dev=2.861
OP2	B	0, 0.000, 3.129, 6.258, 6.258 max_d=6.258 avg_d=3.129 std_dev=3.129
O2'	B	0, 0.000, 3.136, 6.271, 6.271 max_d=6.271 avg_d=3.136 std_dev=3.136

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.05	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.06	0.12	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.14	0.15
C2	0.07	0.00	0.07	0.08	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.09	0.10	0.18	0.18	0.37	0.31
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.11	0.02	0.18	0.00	0.19	0.04	0.02	0.12	0.19	0.01	0.00	0.02	0.18	0.10	0.10	0.18
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.20	0.04	0.06	0.05	0.16	0.04	0.00	0.02	0.26	0.20	0.02	0.20
C4	0.05	0.03	0.11	0.05	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.12	0.10	0.01	0.14	0.17	0.47	0.27
C4'	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.08	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.00
C5	0.00	0.02	0.18	0.16	0.00	0.05	0.00	0.17	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.16	0.23	0.11	0.10	0.11	0.46	0.21
C5'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.14	0.00	0.17	0.00	0.12	0.04	0.10	0.16	0.05	0.07	0.00	0.01	0.01	0.20	0.31	0.02
C6	0.02	0.00	0.19	0.20	0.01	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.25	0.14	0.12	0.11	0.41	0.22
N1	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.01	0.16	0.14	0.35	0.26
N3	0.06	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.05	0.06	0.16	0.19	0.42	0.30
N4	0.06	0.05	0.12	0.05	0.01	0.03	0.00	0.16	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.15	0.11	0.00	0.13	0.17	0.49	0.26
O2	0.12	0.00	0.19	0.16	0.02	0.08	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.21	0.22	0.22	0.23	0.34	0.35
O2'	0.02	0.02	0.01	0.04	0.12	0.08	0.16	0.07	0.14	0.04	0.03	0.15	0.10	0.00	0.00	0.04	0.11	0.01	0.00	0.10
O3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.10	0.02	0.23	0.00	0.25	0.05	0.05	0.11	0.21	0.00	0.00	0.01	0.23	0.16	0.10	0.13
O4'	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.11	0.01	0.14	0.01	0.06	0.00	0.22	0.04	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03	0.07
O5'	0.07	0.18	0.18	0.26	0.14	0.00	0.10	0.01	0.12	0.16	0.16	0.13	0.22	0.11	0.23	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.02	0.18	0.10	0.20	0.17	0.00	0.11	0.20	0.11	0.14	0.19	0.17	0.23	0.01	0.16	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.37	0.10	0.02	0.47	0.18	0.46	0.31	0.41	0.35	0.42	0.49	0.34	0.00	0.10	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.31	0.18	0.20	0.27	0.00	0.21	0.02	0.22	0.26	0.30	0.26	0.35	0.10	0.13	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.56	0.77	0.52	0.17	0.26	0.22	0.23	0.52	0.27	0.68	0.33	0.59	0.09	0.11	1.13	0.64	0.07	0.32	0.36	0.41	0.24
C2	0.17	0.62	0.63	0.37	0.23	0.18	0.28	0.14	0.60	0.25	0.75	0.39	0.70	0.07	0.06	0.99	0.50	0.04	0.19	0.20	0.19	0.08
C2'	0.16	0.73	0.70	0.53	0.26	0.33	0.28	0.41	0.62	0.26	0.83	0.47	0.67	0.08	0.05	0.96	0.62	0.10	0.55	0.70	0.80	0.59
C3'	0.05	0.87	0.69	0.54	0.39	0.25	0.42	0.34	0.74	0.14	0.96	0.61	0.78	0.05	0.07	0.94	0.63	0.04	0.53	0.76	0.91	0.62
C4	0.24	0.48	0.78	0.47	0.18	0.21	0.31	0.12	0.58	0.21	0.64	0.28	0.70	0.05	0.09	1.14	0.59	0.05	0.17	0.18	0.15	0.03
C4'	0.07	0.73	0.73	0.50	0.34	0.14	0.37	0.13	0.66	0.11	0.83	0.51	0.69	0.07	0.05	1.07	0.63	0.12	0.29	0.42	0.54	0.28
C5	0.30	0.46	0.95	0.65	0.16	0.30	0.30	0.21	0.56	0.19	0.61	0.25	0.68	0.08	0.11	1.30	0.75	0.07	0.30	0.35	0.40	0.20
C5'	0.09	0.88	0.64	0.42	0.50	0.04	0.54	0.08	0.81	0.07	0.97	0.67	0.83	0.26	0.23	1.01	0.56	0.35	0.11	0.30	0.44	0.12
C6	0.27	0.53	0.91	0.63	0.19	0.29	0.31	0.22	0.59	0.20	0.68	0.31	0.71	0.05	0.09	1.26	0.74	0.05	0.32	0.40	0.46	0.25
N1	0.22	0.59	0.78	0.51	0.21	0.25	0.28	0.20	0.59	0.23	0.73	0.36	0.69	0.03	0.08	1.14	0.64	0.05	0.28	0.33	0.36	0.19
N3	0.18	0.57	0.62	0.33	0.21	0.16	0.29	0.10	0.61	0.24	0.72	0.35	0.73	0.05	0.07	0.97	0.47	0.04	0.12	0.12	0.07	0.01
N4	0.28	0.37	0.80	0.44	0.13	0.19	0.29	0.07	0.51	0.20	0.52	0.20	0.60	0.09	0.12	1.15	0.57	0.06	0.08	0.06	0.02	0.10
O2	0.09	0.70	0.48	0.24	0.27	0.12	0.28	0.10	0.61	0.23	0.81	0.46	0.67	0.10	0.02	0.83	0.38	0.01	0.13	0.14	0.12	0.04
O2'	0.21	0.63	0.69	0.51	0.17	0.37	0.18	0.45	0.49	0.33	0.72	0.38	0.53	0.18	0.12	0.94	0.60	0.18	0.57	0.67	0.75	0.58
O3'	0.06	0.90	0.69	0.59	0.39	0.33	0.39	0.49	0.73	0.18	0.98	0.63	0.75	0.01	0.05	0.89	0.66	0.02	0.71	0.99	1.16	0.85
O4'	0.19	0.57	0.81	0.53	0.21	0.18	0.27	0.10	0.54	0.20	0.68	0.35	0.60	0.01	0.06	1.21	0.68	0.04	0.20	0.25	0.31	0.10
O5'	0.33	0.50	1.10	0.85	0.13	0.35	0.22	0.26	0.50	0.26	0.63	0.27	0.58	0.03	0.15	1.50	0.99	0.03	0.42	0.58	0.69	0.39
OP1	0.44	0.43	1.26	1.01	0.06	0.45	0.17	0.31	0.46	0.32	0.58	0.19	0.55	0.07	0.24	1.71	1.19	0.10	0.46	0.64	0.72	0.42
OP2	0.70	0.24	1.59	1.40	0.17	0.76	0.06	0.66	0.25	0.58	0.39	0.02	0.34	0.32	0.48	1.99	1.57	0.35	0.86	1.14	1.25	0.88
P	0.49	0.35	1.32	1.06	0.01	0.47	0.09	0.33	0.37	0.38	0.49	0.12	0.45	0.15	0.29	1.76	1.23	0.13	0.50	0.67	0.78	0.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.10	0.10	0.03	0.03	0.00	0.01	0.21	0.01	0.02	0.12	0.03	0.02
C2	0.11	0.00	0.49	0.34	0.04	0.11	0.00	0.21	0.03	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.50	0.13	0.28	0.01	0.02	0.31	0.10
C2'	0.00	0.49	0.00	0.00	0.22	0.00	0.06	0.08	0.16	0.27	0.38	0.48	0.03	0.18	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.41	0.31	0.28
C3'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.23	0.01	0.22	0.03	0.26	0.11	0.34	0.30	0.20	0.16	0.15	0.01	0.00	0.01	0.06	0.27	0.05	0.09
C4	0.03	0.04	0.22	0.23	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.00	0.18	0.09	0.09	0.32	0.19
C4'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.21	0.04	0.11	0.01	0.16	0.07	0.17	0.01	0.00	0.01	0.14	0.01	0.04
C5	0.00	0.00	0.06	0.22	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.03	0.03	0.00	0.00	0.14	0.01	0.08	0.21	0.27	0.49	0.37
C5'	0.00	0.21	0.08	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.35	0.11	0.20	0.02	0.28	0.10	0.07	0.15	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01
C6	0.03	0.03	0.16	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.16	0.25	0.50	0.33
C8	0.03	0.03	0.27	0.11	0.00	0.21	0.00	0.35	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.54	0.07	0.20	0.43	0.38	0.51	0.53
N1	0.10	0.00	0.38	0.34	0.06	0.04	0.03	0.11	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.30	0.13	0.20	0.08	0.15	0.43	0.22
N3	0.10	0.01	0.48	0.30	0.00	0.11	0.03	0.20	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.50	0.08	0.29	0.02	0.03	0.24	0.06
N6	0.03	0.02	0.03	0.20	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.04	0.20	0.02	0.12	0.18	0.31	0.55	0.38
N7	0.03	0.00	0.18	0.16	0.01	0.16	0.00	0.28	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.02	0.47	0.03	0.10	0.40	0.45	0.63	0.57
N9	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.06	0.04	0.04	0.02	0.00	0.16	0.08	0.00	0.19	0.12	0.29	0.25
O2'	0.01	0.50	0.01	0.01	0.10	0.17	0.14	0.07	0.01	0.54	0.30	0.50	0.20	0.47	0.16	0.00	0.03	0.11	0.11	0.41	0.40	0.28
O3'	0.21	0.13	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.06	0.07	0.13	0.08	0.02	0.03	0.08	0.03	0.00	0.12	0.19	0.06	0.10	0.07
O4'	0.01	0.28	0.02	0.01	0.18	0.00	0.08	0.00	0.14	0.20	0.20	0.29	0.12	0.10	0.00	0.11	0.12	0.00	0.02	0.03	0.07	0.07
O5'	0.02	0.01	0.17	0.06	0.09	0.01	0.21	0.01	0.16	0.43	0.08	0.02	0.18	0.40	0.19	0.11	0.19	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.12	0.02	0.41	0.27	0.09	0.14	0.27	0.02	0.25	0.38	0.15	0.03	0.31	0.45	0.12	0.41	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.31	0.31	0.05	0.32	0.01	0.49	0.01	0.50	0.51	0.43	0.24	0.55	0.63	0.29	0.40	0.10	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.10	0.28	0.09	0.19	0.04	0.37	0.01	0.33	0.53	0.22	0.06	0.38	0.57	0.25	0.28	0.07	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00