Doublet Group distance statistics: 54353

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C5	B	0, 0.000, 0.119, 0.239, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.119 std_dev=0.119
O3'	A	0, 0.000, 0.120, 0.239, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.120 std_dev=0.120
N7	B	0, 0.000, 0.251, 0.502, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.251 std_dev=0.251
C4	B	0, 0.000, 0.263, 0.526, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.263 std_dev=0.263
C3'	A	0, 0.000, 0.297, 0.594, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.297 std_dev=0.297
C2'	A	0, 0.000, 0.349, 0.698, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.349 std_dev=0.349
O4'	A	0, 0.000, 0.364, 0.728, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.364 std_dev=0.364
C8	B	0, 0.000, 0.371, 0.743, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.371 std_dev=0.371
C6	B	0, 0.000, 0.399, 0.799, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.399 std_dev=0.399
C4'	A	0, 0.000, 0.436, 0.871, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.436 std_dev=0.436
N3	B	0, 0.000, 0.452, 0.905, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.452 std_dev=0.452
C2	B	0, 0.000, 0.455, 0.909, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.455 std_dev=0.455
N9	B	0, 0.000, 0.472, 0.943, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.472 std_dev=0.472
N1	B	0, 0.000, 0.482, 0.965, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.482 std_dev=0.482
O2'	A	0, 0.000, 0.564, 1.127, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.564 std_dev=0.564
N6	B	0, 0.000, 0.712, 1.423, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.712 std_dev=0.712
O5'	A	0, 0.000, 0.827, 1.653, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.827 std_dev=0.827
C5'	A	0, 0.000, 0.830, 1.660, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.830 std_dev=0.830
C1'	B	0, 0.000, 0.840, 1.679, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.840 std_dev=0.840
O4'	B	0, 0.000, 0.907, 1.813, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.907 std_dev=0.907
OP1	A	0, 0.000, 1.015, 2.030, 2.030 max_d=2.030 avg_d=1.015 std_dev=1.015
P	A	0, 0.000, 1.114, 2.229, 2.229 max_d=2.229 avg_d=1.114 std_dev=1.114
C2'	B	0, 0.000, 1.121, 2.242, 2.242 max_d=2.242 avg_d=1.121 std_dev=1.121
C4'	B	0, 0.000, 1.219, 2.438, 2.438 max_d=2.438 avg_d=1.219 std_dev=1.219
C5'	B	0, 0.000, 1.226, 2.451, 2.451 max_d=2.451 avg_d=1.226 std_dev=1.226
C3'	B	0, 0.000, 1.257, 2.514, 2.514 max_d=2.514 avg_d=1.257 std_dev=1.257
OP2	A	0, 0.000, 1.331, 2.661, 2.661 max_d=2.661 avg_d=1.331 std_dev=1.331
O5'	B	0, 0.000, 1.395, 2.790, 2.790 max_d=2.790 avg_d=1.395 std_dev=1.395
O2'	B	0, 0.000, 1.406, 2.812, 2.812 max_d=2.812 avg_d=1.406 std_dev=1.406
OP1	B	0, 0.000, 1.487, 2.974, 2.974 max_d=2.974 avg_d=1.487 std_dev=1.487
O3'	B	0, 0.000, 1.632, 3.264, 3.264 max_d=3.264 avg_d=1.632 std_dev=1.632
P	B	0, 0.000, 2.198, 4.396, 4.396 max_d=4.396 avg_d=2.198 std_dev=2.198
OP2	B	0, 0.000, 3.431, 6.862, 6.862 max_d=6.862 avg_d=3.431 std_dev=3.431

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.13	0.06	0.02
C2	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.02	0.09	0.06	0.05	0.18	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.25	0.02	0.08
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.31	0.08	0.16
C4	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.11	0.07	0.25	0.21
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.01	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.05	0.06	0.14	0.10	0.22	0.23
C5'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.00	0.01	0.09	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.05	0.09	0.13	0.04	0.17	0.18
N1	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.08	0.04	0.14	0.11
N3	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.07	0.08	0.01	0.22	0.16
N4	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.12	0.12	0.28	0.25
O2	0.00	0.01	0.12	0.03	0.02	0.10	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.23	0.00	0.14	0.04	0.10	0.17	0.06
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.04	0.01	0.02	0.32	0.02	0.11
O3'	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.05	0.03	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.02	0.06	0.36	0.10	0.18
O4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.07	0.04	0.08	0.06
O5'	0.04	0.06	0.01	0.05	0.11	0.00	0.14	0.00	0.13	0.08	0.08	0.12	0.04	0.02	0.06	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.13	0.05	0.25	0.31	0.07	0.12	0.10	0.05	0.04	0.04	0.01	0.12	0.10	0.32	0.36	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.18	0.02	0.08	0.25	0.01	0.22	0.01	0.17	0.14	0.22	0.28	0.17	0.02	0.10	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.11	0.08	0.16	0.21	0.05	0.23	0.01	0.18	0.11	0.16	0.25	0.06	0.11	0.18	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.24	0.30	0.39	0.01	0.31	0.02	0.41	0.20	0.20	0.31	0.11	0.29	0.14	0.11	0.26	0.47	0.14	0.76	0.78	2.13	1.39
C2	0.11	0.20	0.25	0.33	0.00	0.25	0.00	0.34	0.18	0.20	0.26	0.09	0.28	0.16	0.11	0.20	0.38	0.11	0.74	0.76	2.03	1.37
C2'	0.17	0.15	0.32	0.40	0.06	0.33	0.05	0.43	0.10	0.24	0.20	0.03	0.17	0.19	0.16	0.28	0.47	0.18	0.82	0.86	2.22	1.46
C3'	0.12	0.26	0.28	0.39	0.02	0.31	0.03	0.42	0.20	0.19	0.32	0.13	0.27	0.13	0.10	0.24	0.47	0.14	0.77	0.83	2.20	1.42
C4	0.21	0.11	0.35	0.42	0.06	0.36	0.00	0.44	0.18	0.24	0.20	0.01	0.34	0.14	0.18	0.31	0.47	0.21	0.82	0.78	2.16	1.42
C4'	0.06	0.42	0.24	0.37	0.14	0.30	0.16	0.43	0.38	0.12	0.51	0.26	0.48	0.03	0.02	0.21	0.47	0.11	0.71	0.76	2.16	1.35
C5	0.26	0.12	0.42	0.50	0.07	0.44	0.01	0.53	0.20	0.25	0.22	0.02	0.37	0.12	0.21	0.38	0.58	0.27	0.86	0.80	2.28	1.44
C5'	0.05	0.49	0.22	0.36	0.19	0.32	0.23	0.46	0.47	0.09	0.59	0.31	0.59	0.03	0.01	0.19	0.46	0.13	0.71	0.77	2.22	1.34
C6	0.23	0.15	0.40	0.49	0.05	0.42	0.01	0.51	0.20	0.25	0.25	0.02	0.36	0.14	0.19	0.36	0.58	0.24	0.84	0.80	2.26	1.44
N1	0.15	0.20	0.32	0.41	0.01	0.32	0.01	0.42	0.20	0.21	0.28	0.07	0.32	0.15	0.13	0.28	0.48	0.16	0.78	0.78	2.15	1.40
N3	0.12	0.15	0.26	0.32	0.02	0.25	0.01	0.33	0.17	0.21	0.22	0.05	0.29	0.16	0.12	0.21	0.36	0.12	0.75	0.75	2.01	1.37
N4	0.23	0.06	0.34	0.40	0.08	0.37	0.01	0.44	0.16	0.23	0.15	0.04	0.32	0.09	0.19	0.31	0.44	0.24	0.84	0.77	2.17	1.43
O2	0.04	0.24	0.18	0.25	0.03	0.17	0.01	0.27	0.15	0.17	0.28	0.14	0.17	0.17	0.06	0.12	0.29	0.05	0.69	0.74	1.91	1.33
O2'	0.21	0.00	0.36	0.42	0.16	0.33	0.18	0.41	0.08	0.31	0.02	0.08	0.06	0.29	0.23	0.31	0.47	0.20	0.86	0.91	2.19	1.50
O3'	0.09	0.25	0.27	0.36	0.02	0.26	0.01	0.37	0.16	0.18	0.29	0.13	0.19	0.14	0.08	0.22	0.45	0.09	0.74	0.78	2.11	1.38
O4'	0.06	0.42	0.25	0.37	0.14	0.29	0.17	0.42	0.40	0.12	0.52	0.26	0.52	0.02	0.02	0.21	0.47	0.10	0.70	0.72	2.12	1.33
O5'	0.22	0.30	0.37	0.50	0.02	0.48	0.07	0.62	0.30	0.24	0.40	0.13	0.44	0.11	0.16	0.35	0.60	0.29	0.88	0.94	2.41	1.51
OP1	0.24	0.37	0.41	0.58	0.04	0.55	0.10	0.72	0.36	0.25	0.48	0.17	0.50	0.10	0.16	0.39	0.71	0.33	0.99	1.05	2.54	1.61
OP2	0.43	0.11	0.54	0.67	0.17	0.69	0.10	0.83	0.13	0.42	0.22	0.07	0.28	0.27	0.35	0.53	0.76	0.52	1.12	1.20	2.68	1.73
P	0.37	0.22	0.52	0.67	0.09	0.66	0.02	0.81	0.23	0.36	0.34	0.03	0.38	0.21	0.28	0.50	0.78	0.46	1.07	1.13	2.63	1.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.26	0.12	0.49	0.48
C2	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.03	0.02	0.35	0.39	0.89	0.78
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.12	0.22	0.16
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.21	0.30	0.14	0.04
C4	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.36	0.34	0.94	0.78
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.02	0.00	0.01	0.22	0.09	0.05
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.39	0.39	1.18	0.89
C5'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.36	0.25	0.00
C6	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.03	0.02	0.39	0.43	1.21	0.92
C8	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.39	0.30	1.18	0.85
N1	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01	0.38	0.43	1.08	0.87
N3	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.03	0.33	0.34	0.78	0.71
N6	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.05	0.38	0.44	1.33	0.95
N7	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.40	0.38	1.34	0.94
N9	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.35	0.27	0.88	0.72
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.05	0.05	0.00	0.07	0.05	0.05	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.15	0.23	0.17	0.06
O3'	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.03	0.04	0.00	0.02	0.50	0.51	0.28	0.40
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.36	0.10	0.44	0.48
O5'	0.26	0.35	0.04	0.21	0.36	0.01	0.39	0.01	0.39	0.39	0.38	0.33	0.38	0.40	0.35	0.15	0.50	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.12	0.39	0.12	0.30	0.34	0.22	0.39	0.36	0.43	0.30	0.43	0.34	0.44	0.38	0.27	0.23	0.51	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.49	0.89	0.22	0.14	0.94	0.09	1.18	0.25	1.21	1.18	1.08	0.78	1.33	1.34	0.88	0.17	0.28	0.44	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.48	0.78	0.16	0.04	0.78	0.05	0.89	0.00	0.92	0.85	0.87	0.71	0.95	0.94	0.72	0.06	0.40	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00