Doublet Group distance statistics: 54355

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 2, 10, 7, 13, 12, 11,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.009, 0.013, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.012, 0.017, 0.023, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.031, 0.039, 0.047, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.039 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.037, 0.045, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.045 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.034, 0.042, 0.051, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.042 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.033, 0.042, 0.051, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.042 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.035, 0.044, 0.053, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.044 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.069, 0.092, 0.115, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.092 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.086, 0.114, 0.141, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.114 std_dev=0.028
O3'	A	0, 0.355, 0.445, 0.535, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.445 std_dev=0.090
C3'	A	0, 0.931, 1.183, 1.436, 1.530 max_d=1.530 avg_d=1.183 std_dev=0.252
C3'	B	0, 0.687, 0.973, 1.259, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.973 std_dev=0.286
O3'	B	0, 0.570, 0.860, 1.151, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.860 std_dev=0.290
C2'	B	0, 0.920, 1.212, 1.503, 2.098 max_d=2.098 avg_d=1.212 std_dev=0.292
N3	B	0, 1.368, 1.670, 1.972, 2.089 max_d=2.089 avg_d=1.670 std_dev=0.302
O4'	A	0, 1.163, 1.468, 1.772, 1.822 max_d=1.822 avg_d=1.468 std_dev=0.304
C2	B	0, 1.390, 1.695, 1.999, 2.062 max_d=2.062 avg_d=1.695 std_dev=0.305
C4	B	0, 1.365, 1.672, 1.978, 2.005 max_d=2.005 avg_d=1.672 std_dev=0.307
O5'	B	0, 1.122, 1.429, 1.736, 1.917 max_d=1.917 avg_d=1.429 std_dev=0.307
N9	B	0, 1.342, 1.653, 1.965, 2.125 max_d=2.125 avg_d=1.653 std_dev=0.311
N2	B	0, 1.390, 1.704, 2.018, 2.154 max_d=2.154 avg_d=1.704 std_dev=0.314
C2'	A	0, 1.307, 1.622, 1.937, 1.960 max_d=1.960 avg_d=1.622 std_dev=0.315
N1	B	0, 1.415, 1.731, 2.046, 2.155 max_d=2.155 avg_d=1.731 std_dev=0.315
C8	B	0, 1.367, 1.684, 2.001, 2.280 max_d=2.280 avg_d=1.684 std_dev=0.317
C5	B	0, 1.393, 1.711, 2.029, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.711 std_dev=0.318
N7	B	0, 1.408, 1.726, 2.044, 2.276 max_d=2.276 avg_d=1.726 std_dev=0.318
O2'	B	0, 1.077, 1.399, 1.721, 2.277 max_d=2.277 avg_d=1.399 std_dev=0.322
C1'	B	0, 1.314, 1.636, 1.959, 2.120 max_d=2.120 avg_d=1.636 std_dev=0.323
C6	B	0, 1.422, 1.751, 2.080, 2.115 max_d=2.115 avg_d=1.751 std_dev=0.329
OP1	B	0, 1.297, 1.632, 1.968, 2.348 max_d=2.348 avg_d=1.632 std_dev=0.336
O6	B	0, 1.462, 1.809, 2.156, 2.221 max_d=2.221 avg_d=1.809 std_dev=0.347
C4'	B	0, 1.149, 1.496, 1.843, 2.052 max_d=2.052 avg_d=1.496 std_dev=0.347
O4'	B	0, 1.400, 1.765, 2.130, 2.277 max_d=2.277 avg_d=1.765 std_dev=0.365
C5'	B	0, 1.302, 1.696, 2.090, 2.272 max_d=2.272 avg_d=1.696 std_dev=0.394
C4'	A	0, 1.654, 2.063, 2.471, 2.418 max_d=2.418 avg_d=2.063 std_dev=0.409
P	A	0, 1.900, 2.319, 2.737, 3.109 max_d=3.109 avg_d=2.319 std_dev=0.419
OP1	A	0, 2.135, 2.584, 3.034, 3.352 max_d=3.352 avg_d=2.584 std_dev=0.450
OP2	A	0, 1.336, 1.813, 2.289, 3.861 max_d=3.861 avg_d=1.813 std_dev=0.476
P	B	0, 1.618, 2.095, 2.572, 2.793 max_d=2.793 avg_d=2.095 std_dev=0.477
O5'	A	0, 2.317, 2.838, 3.359, 3.504 max_d=3.504 avg_d=2.838 std_dev=0.521
O2'	A	0, 2.408, 2.939, 3.469, 3.415 max_d=3.415 avg_d=2.939 std_dev=0.530
OP2	B	0, 2.788, 3.380, 3.972, 3.795 max_d=3.795 avg_d=3.380 std_dev=0.592
C5'	A	0, 3.167, 3.921, 4.675, 4.518 max_d=4.518 avg_d=3.921 std_dev=0.754

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.08	0.14	0.10	0.08
C2	0.02	0.00	0.09	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.06	0.08	0.10	0.11	0.21	0.13
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.07	0.03	0.08	0.05	0.15	0.00	0.02	0.01	0.23	0.33	0.25	0.26
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.17	0.33	0.20	0.24
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.16	0.18	0.33	0.25
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.04	0.04	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.07	0.07	0.20	0.23	0.36	0.30
C5'	0.03	0.06	0.04	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.18	0.07	0.06	0.11	0.12	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.07	0.09	0.19	0.19	0.29	0.25
N1	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.12	0.11	0.20	0.15
N3	0.02	0.00	0.08	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.06	0.06	0.12	0.12	0.27	0.18
N4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.17	0.21	0.37	0.28
O2	0.04	0.00	0.15	0.04	0.01	0.10	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.28	0.06	0.14	0.09	0.14	0.15	0.09
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.04	0.01	0.13	0.03	0.16	0.03	0.12	0.05	0.28	0.00	0.03	0.01	0.24	0.41	0.34	0.31
O3'	0.06	0.06	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.03	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.03	0.00	0.05	0.11	0.34	0.19	0.20
O4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.06	0.02	0.14	0.01	0.05	0.00	0.10	0.05	0.16	0.10
O5'	0.08	0.10	0.23	0.17	0.16	0.01	0.20	0.01	0.19	0.12	0.12	0.17	0.09	0.24	0.11	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.14	0.11	0.33	0.33	0.18	0.12	0.23	0.04	0.19	0.11	0.12	0.21	0.14	0.41	0.34	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.21	0.25	0.20	0.33	0.05	0.36	0.10	0.29	0.20	0.27	0.37	0.15	0.34	0.19	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.13	0.26	0.24	0.25	0.04	0.30	0.01	0.25	0.15	0.18	0.28	0.09	0.31	0.20	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.15	0.21	0.19	0.19	0.19	0.20	0.17	0.17	0.24	0.15	0.15	0.17	0.23	0.21	0.21	0.19	0.21	0.15	0.17	0.28	0.46	0.14
C2	0.21	0.14	0.20	0.19	0.19	0.19	0.21	0.17	0.17	0.24	0.14	0.13	0.16	0.24	0.22	0.21	0.18	0.22	0.15	0.17	0.30	0.43	0.15
C2'	0.21	0.20	0.20	0.19	0.21	0.19	0.21	0.16	0.20	0.23	0.20	0.21	0.20	0.23	0.22	0.21	0.18	0.21	0.14	0.20	0.28	0.48	0.14
C3'	0.21	0.16	0.21	0.19	0.19	0.19	0.20	0.17	0.18	0.23	0.16	0.16	0.17	0.23	0.21	0.21	0.19	0.21	0.15	0.18	0.28	0.49	0.15
C4	0.21	0.12	0.20	0.19	0.17	0.19	0.17	0.17	0.12	0.23	0.12	0.12	0.14	0.22	0.21	0.20	0.18	0.22	0.15	0.12	0.32	0.41	0.15
C4'	0.22	0.16	0.23	0.22	0.20	0.21	0.20	0.19	0.18	0.24	0.16	0.16	0.18	0.24	0.22	0.24	0.23	0.23	0.18	0.17	0.25	0.52	0.18
C5	0.21	0.13	0.21	0.20	0.17	0.20	0.17	0.18	0.13	0.23	0.12	0.12	0.15	0.21	0.21	0.21	0.20	0.22	0.16	0.12	0.30	0.44	0.15
C5'	0.26	0.20	0.28	0.27	0.23	0.26	0.22	0.24	0.19	0.27	0.19	0.20	0.21	0.26	0.25	0.29	0.28	0.27	0.23	0.18	0.27	0.57	0.23
C6	0.22	0.13	0.21	0.21	0.18	0.20	0.18	0.18	0.14	0.24	0.12	0.12	0.16	0.22	0.21	0.22	0.20	0.23	0.16	0.13	0.28	0.46	0.15
N1	0.21	0.14	0.21	0.19	0.19	0.19	0.19	0.17	0.16	0.24	0.13	0.13	0.16	0.23	0.21	0.21	0.19	0.22	0.15	0.15	0.29	0.45	0.14
N3	0.21	0.13	0.20	0.19	0.18	0.19	0.19	0.17	0.15	0.24	0.12	0.12	0.15	0.24	0.21	0.20	0.18	0.22	0.15	0.13	0.32	0.41	0.15
N4	0.21	0.12	0.19	0.19	0.16	0.19	0.15	0.18	0.12	0.23	0.12	0.12	0.14	0.21	0.20	0.20	0.18	0.22	0.16	0.16	0.36	0.39	0.17
O2	0.22	0.16	0.21	0.20	0.21	0.20	0.23	0.18	0.20	0.25	0.17	0.15	0.18	0.26	0.23	0.22	0.19	0.23	0.16	0.22	0.30	0.44	0.15
O2'	0.24	0.30	0.23	0.20	0.26	0.20	0.25	0.17	0.27	0.24	0.30	0.33	0.28	0.24	0.24	0.24	0.19	0.23	0.14	0.26	0.29	0.47	0.14
O3'	0.23	0.18	0.23	0.22	0.22	0.21	0.22	0.18	0.21	0.25	0.18	0.17	0.19	0.25	0.23	0.24	0.21	0.23	0.17	0.21	0.26	0.51	0.16
O4'	0.23	0.18	0.24	0.22	0.21	0.21	0.21	0.19	0.18	0.25	0.17	0.18	0.19	0.24	0.23	0.25	0.22	0.23	0.18	0.18	0.24	0.50	0.17
O5'	0.27	0.18	0.25	0.24	0.23	0.25	0.24	0.24	0.20	0.30	0.17	0.16	0.20	0.28	0.27	0.25	0.22	0.29	0.23	0.19	0.28	0.55	0.23
OP1	0.29	0.19	0.27	0.27	0.25	0.28	0.25	0.29	0.20	0.32	0.18	0.18	0.21	0.30	0.29	0.27	0.25	0.31	0.28	0.19	0.42	0.53	0.29
OP2	0.36	0.27	0.32	0.31	0.33	0.34	0.33	0.35	0.29	0.39	0.27	0.25	0.30	0.38	0.36	0.32	0.29	0.38	0.33	0.28	0.49	0.49	0.34
P	0.31	0.20	0.28	0.27	0.27	0.30	0.27	0.30	0.23	0.35	0.19	0.18	0.23	0.33	0.31	0.28	0.26	0.33	0.29	0.22	0.42	0.53	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.08	0.08	0.04
C2	0.03	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.08	0.01	0.20	0.21	0.11
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.12	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.06	0.07	0.05	0.06	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.11	0.13	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.08	0.01	0.22	0.16	0.10
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.12	0.01	0.30	0.18	0.14
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.09	0.06	0.05	0.04	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.12	0.00	0.32	0.21	0.15
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.12	0.02	0.29	0.14	0.13
N1	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.11	0.01	0.27	0.22	0.13
N2	0.04	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.09	0.04	0.08	0.01	0.18	0.22	0.10
N3	0.03	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.07	0.01	0.17	0.18	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.13	0.02	0.36	0.16	0.16
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.19	0.13	0.08
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.06	0.09	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.04	0.07	0.10	0.04
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.07	0.07	0.09	0.07	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.22	0.17	0.08
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.06	0.04
O5'	0.03	0.08	0.02	0.03	0.08	0.01	0.12	0.01	0.12	0.12	0.11	0.08	0.07	0.13	0.07	0.03	0.05	0.03	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.09	0.02	0.15	0.00	0.38	0.21	0.18
OP1	0.08	0.20	0.04	0.11	0.22	0.09	0.30	0.14	0.32	0.29	0.27	0.18	0.17	0.36	0.19	0.07	0.22	0.08	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.21	0.12	0.13	0.16	0.08	0.18	0.14	0.21	0.14	0.22	0.22	0.18	0.16	0.13	0.10	0.17	0.06	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.11	0.03	0.05	0.10	0.02	0.14	0.01	0.15	0.13	0.13	0.10	0.09	0.16	0.08	0.04	0.08	0.04	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00