Doublet Group distance statistics: 54374

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 7, 11, 22, 7, 4, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.011, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.021, 0.045, 0.069, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.045 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.028, 0.058, 0.089, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.058 std_dev=0.031
O4'	A	0, -0.028, 0.105, 0.237, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.105 std_dev=0.132
C2'	A	0, -0.030, 0.105, 0.240, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.105 std_dev=0.135
O5'	A	0, 0.165, 0.357, 0.550, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.357 std_dev=0.192
C4'	A	0, 0.006, 0.203, 0.399, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.203 std_dev=0.196
P	A	0, 0.224, 0.423, 0.621, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.423 std_dev=0.199
N9	B	0, 0.321, 0.520, 0.718, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.520 std_dev=0.199
C4	B	0, 0.249, 0.448, 0.648, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.448 std_dev=0.199
C1'	B	0, 0.323, 0.529, 0.734, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.529 std_dev=0.205
C5	B	0, 0.275, 0.487, 0.699, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.487 std_dev=0.212
N3	B	0, 0.191, 0.412, 0.632, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.412 std_dev=0.221
C8	B	0, 0.398, 0.622, 0.845, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.622 std_dev=0.223
C6	B	0, 0.212, 0.438, 0.664, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.438 std_dev=0.226
O2'	A	0, -0.058, 0.169, 0.396, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.169 std_dev=0.227
N1	B	0, 0.170, 0.397, 0.625, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.397 std_dev=0.227
C2	B	0, 0.177, 0.405, 0.633, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.405 std_dev=0.228
C3'	A	0, -0.059, 0.173, 0.406, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.173 std_dev=0.232
C5'	A	0, 0.106, 0.342, 0.577, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.342 std_dev=0.235
N7	B	0, 0.373, 0.611, 0.849, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.611 std_dev=0.238
N6	B	0, 0.233, 0.485, 0.738, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.485 std_dev=0.253
O4'	B	0, 0.423, 0.687, 0.950, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.687 std_dev=0.264
C2'	B	0, 0.300, 0.600, 0.900, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.600 std_dev=0.300
C3'	B	0, 0.411, 0.767, 1.123, 2.315 max_d=2.315 avg_d=0.767 std_dev=0.356
C4'	B	0, 0.441, 0.803, 1.165, 2.599 max_d=2.599 avg_d=0.803 std_dev=0.362
O3'	A	0, -0.126, 0.249, 0.625, 2.700 max_d=2.700 avg_d=0.249 std_dev=0.375
O2'	B	0, 0.215, 0.607, 0.999, 2.271 max_d=2.271 avg_d=0.607 std_dev=0.392
OP2	A	0, 0.084, 0.503, 0.923, 3.327 max_d=3.327 avg_d=0.503 std_dev=0.420
OP1	A	0, 0.184, 0.633, 1.082, 3.698 max_d=3.698 avg_d=0.633 std_dev=0.449
O3'	B	0, 0.385, 0.845, 1.305, 3.232 max_d=3.232 avg_d=0.845 std_dev=0.460
C5'	B	0, 0.498, 1.014, 1.529, 3.357 max_d=3.357 avg_d=1.014 std_dev=0.516
O5'	B	0, 0.427, 1.021, 1.615, 4.145 max_d=4.145 avg_d=1.021 std_dev=0.594
P	B	0, 0.341, 1.088, 1.835, 5.628 max_d=5.628 avg_d=1.088 std_dev=0.747
OP1	B	0, 0.425, 1.237, 2.049, 6.136 max_d=6.136 avg_d=1.237 std_dev=0.812
OP2	B	0, 0.133, 1.186, 2.239, 6.602 max_d=6.602 avg_d=1.186 std_dev=1.053

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.00	0.09	0.26	0.05	0.09
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.09	0.04	0.10	0.34	0.14	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.06	0.01	0.05	0.04	0.10	0.00	0.02	0.01	0.16	0.26	0.12	0.18
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.09	0.06	0.10	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.05	0.11	0.08	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.07	0.02	0.13	0.40	0.23	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	0.09	0.02	0.00	0.01	0.11	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.03	0.14	0.41	0.22	0.11
C5'	0.04	0.06	0.08	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.08	0.06	0.08	0.09	0.06	0.04	0.07	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.05	0.14	0.37	0.15	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.11	0.33	0.11	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.04	0.12	0.37	0.19	0.10
N4	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.08	0.03	0.14	0.40	0.27	0.11
O2	0.02	0.00	0.10	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.14	0.07	0.09	0.31	0.11	0.09
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.10	0.09	0.10	0.04	0.09	0.06	0.10	0.11	0.10	0.00	0.04	0.07	0.13	0.23	0.13	0.17
O3'	0.11	0.09	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.07	0.04	0.06	0.08	0.08	0.14	0.04	0.00	0.09	0.09	0.18	0.11	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.07	0.07	0.09	0.00	0.06	0.22	0.08	0.08
O5'	0.09	0.10	0.16	0.05	0.13	0.01	0.14	0.01	0.14	0.11	0.12	0.14	0.09	0.13	0.09	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.26	0.34	0.26	0.11	0.40	0.11	0.41	0.07	0.37	0.33	0.37	0.40	0.31	0.23	0.18	0.22	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.14	0.12	0.08	0.23	0.07	0.22	0.12	0.15	0.11	0.19	0.27	0.11	0.13	0.11	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.09	0.18	0.05	0.10	0.02	0.11	0.01	0.10	0.10	0.10	0.11	0.09	0.17	0.10	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.15	0.10	0.13	0.09	0.07	0.08	0.17	0.08	0.10	0.13	0.13	0.08	0.11	0.08	0.21	0.09	0.09	0.30	0.43	0.62	0.41
C2	0.09	0.16	0.10	0.13	0.09	0.07	0.08	0.17	0.08	0.10	0.14	0.13	0.08	0.11	0.08	0.21	0.08	0.09	0.29	0.43	0.62	0.41
C2'	0.13	0.18	0.12	0.08	0.13	0.07	0.11	0.15	0.12	0.10	0.16	0.16	0.11	0.10	0.11	0.27	0.09	0.13	0.25	0.46	0.58	0.38
C3'	0.14	0.22	0.13	0.08	0.15	0.10	0.13	0.16	0.14	0.11	0.20	0.19	0.13	0.11	0.13	0.29	0.14	0.15	0.25	0.47	0.56	0.37
C4	0.10	0.13	0.12	0.16	0.10	0.09	0.12	0.16	0.11	0.13	0.11	0.12	0.16	0.15	0.10	0.22	0.11	0.11	0.31	0.44	0.66	0.44
C4'	0.09	0.14	0.10	0.14	0.09	0.08	0.08	0.18	0.08	0.11	0.12	0.12	0.08	0.11	0.09	0.19	0.10	0.10	0.30	0.44	0.60	0.40
C5	0.11	0.14	0.13	0.16	0.11	0.09	0.12	0.16	0.12	0.13	0.11	0.13	0.15	0.15	0.11	0.22	0.13	0.12	0.31	0.44	0.68	0.44
C5'	0.11	0.12	0.13	0.19	0.11	0.12	0.12	0.21	0.11	0.14	0.11	0.12	0.12	0.15	0.12	0.17	0.13	0.11	0.34	0.45	0.66	0.44
C6	0.10	0.14	0.12	0.15	0.09	0.07	0.09	0.16	0.09	0.11	0.11	0.12	0.11	0.13	0.09	0.22	0.11	0.10	0.30	0.44	0.66	0.43
N1	0.09	0.15	0.10	0.13	0.08	0.06	0.08	0.16	0.07	0.10	0.12	0.12	0.08	0.11	0.08	0.21	0.09	0.09	0.30	0.43	0.63	0.42
N3	0.09	0.15	0.10	0.14	0.08	0.07	0.08	0.16	0.07	0.11	0.12	0.12	0.10	0.12	0.08	0.22	0.09	0.09	0.30	0.44	0.64	0.43
N4	0.12	0.14	0.14	0.18	0.13	0.11	0.16	0.18	0.17	0.16	0.14	0.13	0.22	0.18	0.13	0.23	0.13	0.13	0.33	0.44	0.68	0.45
O2	0.10	0.18	0.11	0.12	0.11	0.08	0.09	0.18	0.11	0.11	0.17	0.14	0.11	0.11	0.09	0.22	0.09	0.10	0.29	0.43	0.58	0.40
O2'	0.15	0.16	0.18	0.18	0.14	0.09	0.14	0.16	0.14	0.16	0.15	0.15	0.14	0.16	0.14	0.28	0.11	0.12	0.30	0.40	0.67	0.43
O3'	0.17	0.20	0.17	0.16	0.16	0.13	0.16	0.17	0.16	0.17	0.19	0.18	0.15	0.17	0.17	0.28	0.13	0.17	0.28	0.44	0.61	0.41
O4'	0.10	0.13	0.13	0.17	0.09	0.10	0.10	0.19	0.08	0.14	0.10	0.11	0.11	0.15	0.10	0.17	0.10	0.09	0.32	0.43	0.63	0.42
O5'	0.15	0.16	0.16	0.19	0.14	0.14	0.16	0.20	0.15	0.17	0.14	0.15	0.17	0.18	0.15	0.24	0.16	0.16	0.33	0.46	0.69	0.46
OP1	0.40	0.39	0.47	0.51	0.41	0.42	0.42	0.45	0.42	0.43	0.41	0.39	0.42	0.44	0.41	0.38	0.39	0.37	0.57	0.43	0.95	0.65
OP2	0.28	0.31	0.24	0.21	0.26	0.25	0.23	0.23	0.22	0.22	0.27	0.31	0.19	0.21	0.26	0.41	0.33	0.30	0.27	0.53	0.54	0.39
P	0.12	0.12	0.16	0.19	0.12	0.11	0.14	0.17	0.14	0.15	0.12	0.11	0.17	0.17	0.12	0.22	0.12	0.11	0.33	0.41	0.73	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.05	0.20	0.12	0.11
C2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.07	0.18	0.31	0.41	0.24
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.06	0.06	0.07	0.10	0.13	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.28	0.08	0.13
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.15	0.10	0.15	0.12	0.17	0.12	0.08	0.02	0.01	0.01	0.06	0.23	0.10	0.08
C4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.03	0.17	0.31	0.34	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.06	0.10	0.04	0.05	0.08	0.10	0.05	0.10	0.01	0.00	0.01	0.09	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.11	0.07	0.01	0.24	0.38	0.44	0.31
C5'	0.03	0.07	0.06	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.15	0.18	0.11	0.05	0.19	0.20	0.10	0.05	0.07	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02
C6	0.02	0.00	0.06	0.15	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.08	0.02	0.26	0.39	0.50	0.34
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.11	0.08	0.05	0.21	0.37	0.30	0.28
N1	0.03	0.00	0.10	0.15	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.05	0.23	0.36	0.48	0.30
N3	0.04	0.00	0.13	0.12	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.07	0.14	0.28	0.33	0.19
N6	0.02	0.01	0.05	0.17	0.01	0.08	0.02	0.19	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.13	0.10	0.02	0.30	0.44	0.57	0.39
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.12	0.09	0.03	0.26	0.43	0.42	0.34
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.05	0.01	0.14	0.28	0.25	0.19
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.09	0.10	0.11	0.05	0.13	0.11	0.13	0.12	0.13	0.12	0.07	0.00	0.04	0.09	0.10	0.27	0.08	0.13
O3'	0.09	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.07	0.08	0.08	0.09	0.09	0.10	0.09	0.05	0.04	0.00	0.07	0.12	0.33	0.16	0.15
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.07	0.02	0.03	0.01	0.09	0.07	0.00	0.05	0.16	0.13	0.14
O5'	0.05	0.18	0.12	0.06	0.17	0.01	0.24	0.01	0.26	0.21	0.23	0.14	0.30	0.26	0.14	0.10	0.12	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.20	0.31	0.28	0.23	0.31	0.09	0.38	0.05	0.39	0.37	0.36	0.28	0.44	0.43	0.28	0.27	0.33	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.41	0.08	0.10	0.34	0.05	0.44	0.09	0.50	0.30	0.48	0.33	0.57	0.42	0.25	0.08	0.16	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.24	0.13	0.08	0.23	0.03	0.31	0.02	0.34	0.28	0.30	0.19	0.39	0.34	0.19	0.13	0.15	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00