Doublet Group distance statistics: 54379

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
C4	B	0, 0.000, 0.222, 0.445, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.222 std_dev=0.222
N9	B	0, 0.000, 0.228, 0.456, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.228 std_dev=0.228
C8	B	0, 0.000, 0.247, 0.495, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.247 std_dev=0.247
N1	B	0, 0.000, 0.257, 0.515, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.257 std_dev=0.257
C5	B	0, 0.000, 0.316, 0.632, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.316 std_dev=0.316
C2	B	0, 0.000, 0.387, 0.773, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.387 std_dev=0.387
C6	B	0, 0.000, 0.442, 0.883, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.442 std_dev=0.442
N3	B	0, 0.000, 0.497, 0.994, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.497 std_dev=0.497
C2'	B	0, 0.000, 0.513, 1.027, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.513 std_dev=0.513
N7	B	0, 0.000, 0.521, 1.041, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.521 std_dev=0.521
C1'	B	0, 0.000, 0.580, 1.160, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.580 std_dev=0.580
N6	B	0, 0.000, 0.803, 1.607, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.803 std_dev=0.803
O2'	B	0, 0.000, 0.814, 1.628, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.814 std_dev=0.814
O4'	A	0, 0.000, 0.868, 1.736, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.868 std_dev=0.868
C2'	A	0, 0.000, 0.917, 1.834, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.917 std_dev=0.917
C3'	A	0, 0.000, 1.254, 2.508, 2.508 max_d=2.508 avg_d=1.254 std_dev=1.254
O2'	A	0, 0.000, 1.299, 2.598, 2.598 max_d=2.598 avg_d=1.299 std_dev=1.299
C4'	A	0, 0.000, 1.370, 2.740, 2.740 max_d=2.740 avg_d=1.370 std_dev=1.370
C3'	B	0, 0.000, 1.383, 2.767, 2.767 max_d=2.767 avg_d=1.383 std_dev=1.383
O3'	A	0, 0.000, 1.440, 2.880, 2.880 max_d=2.880 avg_d=1.440 std_dev=1.440
O4'	B	0, 0.000, 1.581, 3.162, 3.162 max_d=3.162 avg_d=1.581 std_dev=1.581
C4'	B	0, 0.000, 1.761, 3.523, 3.523 max_d=3.523 avg_d=1.761 std_dev=1.761
O3'	B	0, 0.000, 1.892, 3.785, 3.785 max_d=3.785 avg_d=1.892 std_dev=1.892
C5'	A	0, 0.000, 2.084, 4.167, 4.167 max_d=4.167 avg_d=2.084 std_dev=2.084
C5'	B	0, 0.000, 3.048, 6.096, 6.096 max_d=6.096 avg_d=3.048 std_dev=3.048
O5'	B	0, 0.000, 3.048, 6.097, 6.097 max_d=6.097 avg_d=3.048 std_dev=3.048
O5'	A	0, 0.000, 3.150, 6.300, 6.300 max_d=6.300 avg_d=3.150 std_dev=3.150
P	B	0, 0.000, 3.549, 7.097, 7.097 max_d=7.097 avg_d=3.549 std_dev=3.549
OP2	B	0, 0.000, 3.589, 7.178, 7.178 max_d=7.178 avg_d=3.589 std_dev=3.589
OP1	B	0, 0.000, 3.976, 7.952, 7.952 max_d=7.952 avg_d=3.976 std_dev=3.976
P	A	0, 0.000, 4.029, 8.058, 8.058 max_d=8.058 avg_d=4.029 std_dev=4.029
OP1	A	0, 0.000, 4.104, 8.208, 8.208 max_d=8.208 avg_d=4.104 std_dev=4.104
OP2	A	0, 0.000, 4.927, 9.853, 9.853 max_d=9.853 avg_d=4.927 std_dev=4.927

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.27	0.00	0.09	0.14	0.21	0.11
C2	0.02	0.00	0.24	0.21	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.21	0.03	0.22	0.23	0.10
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.15	0.13	0.04	0.21	0.09	0.36	0.00	0.01	0.02	0.12	0.19	0.23	0.06
C3'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.37	0.00	0.39	0.01	0.34	0.22	0.30	0.39	0.11	0.01	0.01	0.01	0.30	0.11	0.38	0.22
C4	0.00	0.00	0.08	0.37	0.00	0.14	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.14	0.02	0.51	0.18	0.97	0.66
C4'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.14	0.00	0.29	0.01	0.31	0.09	0.00	0.15	0.24	0.24	0.03	0.00	0.02	0.06	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.07	0.39	0.00	0.29	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.21	0.14	0.84	0.47	1.40	1.01
C5'	0.04	0.09	0.15	0.01	0.19	0.01	0.39	0.00	0.39	0.09	0.01	0.21	0.29	0.08	0.15	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01
C6	0.01	0.01	0.13	0.34	0.00	0.31	0.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.45	0.14	0.20	0.81	0.40	1.20	0.90
N1	0.00	0.01	0.04	0.22	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.05	0.00	0.32	0.01	0.55	0.38
N3	0.01	0.00	0.21	0.30	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.16	0.18	0.11	0.47	0.27
N4	0.00	0.00	0.09	0.39	0.00	0.15	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.18	0.03	0.54	0.23	1.09	0.73
O2	0.03	0.00	0.36	0.11	0.01	0.24	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.35	0.25	0.35	0.31	0.47	0.23	0.27
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.25	0.24	0.44	0.08	0.45	0.16	0.03	0.26	0.35	0.00	0.03	0.16	0.24	0.02	0.30	0.18
O3'	0.27	0.10	0.01	0.01	0.14	0.03	0.21	0.15	0.14	0.05	0.01	0.18	0.25	0.03	0.00	0.18	0.35	0.42	0.40	0.33
O4'	0.00	0.21	0.02	0.01	0.02	0.00	0.14	0.01	0.20	0.00	0.16	0.03	0.35	0.16	0.18	0.00	0.06	0.17	0.01	0.00
O5'	0.09	0.03	0.12	0.30	0.51	0.02	0.84	0.00	0.81	0.32	0.18	0.54	0.31	0.24	0.35	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.14	0.22	0.19	0.11	0.18	0.06	0.47	0.06	0.40	0.01	0.11	0.23	0.47	0.02	0.42	0.17	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.23	0.23	0.38	0.97	0.02	1.40	0.00	1.20	0.55	0.47	1.09	0.23	0.30	0.40	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.10	0.06	0.22	0.66	0.02	1.01	0.01	0.90	0.38	0.27	0.73	0.27	0.18	0.33	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.04	0.11	0.28	0.00	0.13	0.06	0.20	0.13	0.01	0.11	0.02	0.21	0.07	0.03	0.03	0.36	0.01	0.19	0.16	0.14	0.15
C2	0.11	0.02	0.09	0.29	0.03	0.16	0.04	0.25	0.11	0.01	0.10	0.04	0.22	0.04	0.05	0.06	0.37	0.00	0.25	0.23	0.20	0.22
C2'	0.33	0.33	0.44	0.60	0.38	0.54	0.46	0.60	0.48	0.46	0.40	0.32	0.57	0.51	0.39	0.32	0.64	0.44	0.62	0.62	0.61	0.62
C3'	0.24	0.42	0.39	0.58	0.35	0.48	0.40	0.57	0.48	0.32	0.49	0.36	0.54	0.37	0.30	0.24	0.64	0.35	0.62	0.64	0.67	0.62
C4	0.07	0.02	0.06	0.44	0.03	0.43	0.03	0.69	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.04	0.04	0.17	0.50	0.22	0.73	0.74	0.76	0.75
C4'	0.28	0.00	0.06	0.15	0.12	0.02	0.04	0.08	0.08	0.15	0.10	0.11	0.20	0.07	0.19	0.23	0.25	0.20	0.14	0.15	0.21	0.13
C5	0.06	0.03	0.05	0.45	0.03	0.46	0.03	0.75	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.04	0.18	0.52	0.25	0.78	0.82	0.84	0.81
C5'	0.33	0.02	0.10	0.19	0.15	0.02	0.06	0.20	0.08	0.19	0.10	0.14	0.19	0.09	0.23	0.32	0.30	0.21	0.29	0.34	0.45	0.32
C6	0.07	0.03	0.07	0.40	0.02	0.35	0.00	0.58	0.03	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.04	0.14	0.47	0.17	0.60	0.61	0.62	0.61
N1	0.09	0.03	0.08	0.32	0.02	0.22	0.03	0.35	0.09	0.02	0.09	0.02	0.15	0.02	0.04	0.08	0.40	0.05	0.35	0.34	0.33	0.33
N3	0.10	0.02	0.08	0.36	0.03	0.27	0.01	0.43	0.07	0.03	0.09	0.03	0.14	0.01	0.05	0.11	0.43	0.09	0.44	0.43	0.42	0.44
N4	0.05	0.02	0.04	0.52	0.03	0.55	0.06	0.90	0.07	0.05	0.02	0.01	0.12	0.07	0.04	0.22	0.57	0.33	0.95	0.98	1.00	0.99
O2	0.14	0.00	0.09	0.20	0.04	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.12	0.06	0.34	0.08	0.07	0.01	0.29	0.14	0.02	0.07	0.11	0.07
O2'	0.19	0.08	0.27	0.35	0.19	0.30	0.26	0.30	0.23	0.32	0.13	0.11	0.30	0.35	0.23	0.20	0.37	0.26	0.27	0.24	0.17	0.25
O3'	0.06	0.17	0.06	0.19	0.05	0.11	0.08	0.16	0.17	0.02	0.22	0.09	0.21	0.02	0.01	0.04	0.24	0.03	0.21	0.22	0.26	0.21
O4'	0.45	0.20	0.20	0.02	0.31	0.18	0.22	0.08	0.10	0.32	0.09	0.30	0.02	0.23	0.36	0.37	0.13	0.38	0.05	0.06	0.03	0.08
O5'	0.31	0.15	0.05	0.30	0.06	0.11	0.03	0.34	0.22	0.16	0.28	0.02	0.34	0.04	0.18	0.32	0.42	0.15	0.48	0.57	0.74	0.54
OP1	0.52	0.13	0.29	0.15	0.28	0.01	0.17	0.35	0.01	0.33	0.02	0.27	0.12	0.21	0.38	0.62	0.27	0.29	0.53	0.71	0.91	0.66
OP2	0.22	0.45	0.10	0.56	0.12	0.33	0.21	0.67	0.45	0.08	0.60	0.22	0.57	0.07	0.06	0.25	0.71	0.02	0.87	1.02	1.26	0.97
P	0.28	0.25	0.01	0.43	0.00	0.22	0.10	0.51	0.30	0.13	0.39	0.06	0.41	0.00	0.14	0.30	0.57	0.09	0.68	0.80	0.99	0.76

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.21	0.04	0.21
C2	0.04	0.00	0.00	0.52	0.00	0.60	0.01	0.94	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.29	0.50	0.41	1.03	1.02	1.03	1.08
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.04	0.21	0.00
C3'	0.01	0.52	0.00	0.00	0.21	0.00	0.03	0.01	0.15	0.34	0.36	0.53	0.06	0.25	0.06	0.01	0.00	0.01	0.18	0.22	0.32	0.16
C4	0.02	0.00	0.00	0.21	0.00	0.25	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.18	0.22	0.33	0.39	0.28	0.43
C4'	0.01	0.60	0.01	0.00	0.25	0.00	0.05	0.00	0.19	0.38	0.42	0.60	0.09	0.27	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.13	0.04	0.14
C5	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.08	0.04	0.01	0.15	0.03
C5'	0.02	0.94	0.01	0.01	0.33	0.00	0.03	0.00	0.26	0.64	0.66	0.89	0.09	0.49	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.01	0.15	0.01	0.19	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.14	0.16	0.23	0.23	0.14	0.27
C8	0.02	0.01	0.01	0.34	0.01	0.38	0.01	0.64	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.31	0.25	0.82	0.62	0.87	0.67
N1	0.04	0.00	0.01	0.36	0.01	0.42	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.35	0.30	0.70	0.70	0.69	0.75
N3	0.04	0.00	0.01	0.53	0.00	0.60	0.00	0.89	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.48	0.42	0.96	0.95	0.91	1.01
N6	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.05	0.10	0.02	0.01	0.14	0.02
N7	0.01	0.01	0.01	0.25	0.00	0.27	0.00	0.49	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.10	0.24	0.15	0.67	0.58	0.85	0.61
N9	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.17	0.01	0.16	0.01
O2'	0.01	0.29	0.00	0.01	0.11	0.02	0.03	0.03	0.10	0.15	0.21	0.27	0.05	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.13	0.08	0.13
O3'	0.00	0.50	0.00	0.00	0.18	0.00	0.02	0.01	0.14	0.31	0.35	0.48	0.05	0.24	0.05	0.02	0.00	0.00	0.19	0.35	0.41	0.25
O4'	0.00	0.41	0.00	0.01	0.22	0.00	0.08	0.00	0.16	0.25	0.30	0.42	0.10	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.36	0.26	0.37
O5'	0.03	1.03	0.13	0.18	0.33	0.00	0.04	0.01	0.23	0.82	0.70	0.96	0.02	0.67	0.17	0.06	0.19	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.21	1.02	0.04	0.22	0.39	0.13	0.01	0.00	0.23	0.62	0.70	0.95	0.01	0.58	0.01	0.13	0.35	0.36	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	1.03	0.21	0.32	0.28	0.04	0.15	0.02	0.14	0.87	0.69	0.91	0.14	0.85	0.16	0.08	0.41	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.21	1.08	0.00	0.16	0.43	0.14	0.03	0.01	0.27	0.67	0.75	1.01	0.02	0.61	0.01	0.13	0.25	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00