Doublet Group distance statistics: 54382

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 8, 9, 12, 11, 4, 6, 2, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.002, 0.013, 0.025, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.013 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.015, 0.041, 0.066, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.041 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.009, 0.044, 0.078, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.044 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.039, 0.105, 0.171, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.105 std_dev=0.066
O4'	A	0, 0.034, 0.111, 0.188, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.111 std_dev=0.077
O2'	A	0, 0.047, 0.126, 0.206, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.126 std_dev=0.080
C4'	A	0, 0.069, 0.176, 0.284, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.176 std_dev=0.107
C3'	A	0, 0.054, 0.168, 0.283, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.168 std_dev=0.115
O3'	A	0, 0.049, 0.221, 0.392, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.221 std_dev=0.172
C5'	A	0, 0.131, 0.307, 0.482, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.307 std_dev=0.176
O5'	A	0, 0.140, 0.320, 0.500, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.320 std_dev=0.180
O2	B	0, 0.118, 0.302, 0.487, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.302 std_dev=0.184
N3	B	0, 0.134, 0.324, 0.513, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.324 std_dev=0.190
C2	B	0, 0.130, 0.327, 0.524, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.327 std_dev=0.197
C4	B	0, 0.161, 0.375, 0.588, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.375 std_dev=0.214
O4	B	0, 0.225, 0.439, 0.654, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.439 std_dev=0.215
OP2	A	0, 0.136, 0.360, 0.585, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.360 std_dev=0.224
P	A	0, 0.179, 0.403, 0.628, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.403 std_dev=0.224
N1	B	0, 0.160, 0.388, 0.617, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.388 std_dev=0.229
C1'	B	0, 0.205, 0.449, 0.693, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.449 std_dev=0.244
C5	B	0, 0.166, 0.417, 0.669, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.417 std_dev=0.252
C6	B	0, 0.166, 0.422, 0.678, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.422 std_dev=0.256
OP1	A	0, 0.231, 0.522, 0.813, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.522 std_dev=0.291
O4'	B	0, 0.131, 0.512, 0.893, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.512 std_dev=0.381
C4'	B	0, 0.100, 0.510, 0.921, 2.316 max_d=2.316 avg_d=0.510 std_dev=0.411
C2'	B	0, 0.124, 0.541, 0.958, 2.466 max_d=2.466 avg_d=0.541 std_dev=0.417
C3'	B	0, 0.049, 0.553, 1.057, 3.002 max_d=3.002 avg_d=0.553 std_dev=0.504
O2'	B	0, -0.057, 0.614, 1.285, 4.133 max_d=4.133 avg_d=0.614 std_dev=0.671
O3'	B	0, -0.108, 0.566, 1.240, 3.966 max_d=3.966 avg_d=0.566 std_dev=0.674
C5'	B	0, -0.224, 0.641, 1.506, 5.111 max_d=5.111 avg_d=0.641 std_dev=0.865
O5'	B	0, -0.279, 0.653, 1.584, 5.409 max_d=5.409 avg_d=0.653 std_dev=0.932
P	B	0, -0.308, 0.853, 2.015, 6.821 max_d=6.821 avg_d=0.853 std_dev=1.162
OP2	B	0, -0.339, 0.866, 2.071, 7.107 max_d=7.107 avg_d=0.866 std_dev=1.205
OP1	B	0, -0.380, 0.937, 2.254, 7.754 max_d=7.754 avg_d=0.937 std_dev=1.317

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.04	0.05	0.10	0.07
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.07	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.07	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.06	0.08	0.13	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.06	0.08	0.13	0.10
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.06	0.06	0.10	0.08
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.09	0.07
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.05	0.07	0.12	0.09
N4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.07	0.09	0.13	0.10
O2	0.03	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.03	0.04	0.05	0.10	0.07
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.00	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.05	0.03	0.06	0.08	0.08	0.03	0.00	0.02	0.05	0.09	0.08	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.00	0.04	0.06	0.07	0.06
O5'	0.03	0.04	0.03	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.04	0.05	0.07	0.04	0.04	0.05	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.05	0.03	0.05	0.08	0.04	0.08	0.04	0.06	0.05	0.07	0.09	0.05	0.07	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.10	0.07	0.07	0.13	0.03	0.13	0.02	0.10	0.09	0.12	0.13	0.10	0.05	0.08	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.07	0.04	0.04	0.09	0.02	0.10	0.01	0.08	0.07	0.09	0.10	0.07	0.04	0.05	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.07	0.08	0.06	0.08	0.18	0.08	0.36	0.07	0.07	0.06	0.11	0.14	0.07	0.11	0.18	0.33	0.33	0.30	0.31
C2	0.07	0.08	0.09	0.07	0.08	0.18	0.08	0.36	0.06	0.07	0.06	0.12	0.14	0.07	0.12	0.18	0.33	0.33	0.29	0.31
C2'	0.08	0.09	0.07	0.07	0.09	0.17	0.10	0.32	0.09	0.08	0.08	0.11	0.13	0.08	0.11	0.21	0.29	0.28	0.25	0.27
C3'	0.09	0.09	0.07	0.07	0.11	0.22	0.11	0.40	0.11	0.10	0.09	0.11	0.11	0.10	0.13	0.26	0.40	0.40	0.38	0.39
C4	0.08	0.07	0.08	0.08	0.12	0.25	0.10	0.54	0.08	0.07	0.10	0.08	0.11	0.09	0.15	0.23	0.55	0.58	0.55	0.56
C4'	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.21	0.09	0.42	0.08	0.07	0.06	0.10	0.11	0.08	0.11	0.22	0.41	0.43	0.40	0.40
C5	0.08	0.07	0.09	0.08	0.11	0.27	0.09	0.57	0.08	0.07	0.09	0.08	0.13	0.12	0.14	0.24	0.59	0.65	0.62	0.62
C5'	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.23	0.08	0.48	0.07	0.06	0.06	0.10	0.10	0.11	0.11	0.23	0.48	0.54	0.51	0.50
C6	0.07	0.06	0.07	0.07	0.09	0.24	0.08	0.51	0.07	0.06	0.07	0.08	0.09	0.10	0.13	0.22	0.51	0.56	0.52	0.53
N1	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.20	0.08	0.41	0.06	0.06	0.05	0.10	0.11	0.07	0.12	0.20	0.40	0.41	0.37	0.38
N3	0.07	0.06	0.07	0.07	0.10	0.21	0.09	0.42	0.06	0.06	0.06	0.11	0.10	0.07	0.14	0.20	0.41	0.41	0.37	0.39
N4	0.11	0.11	0.11	0.09	0.15	0.28	0.13	0.61	0.11	0.10	0.14	0.10	0.20	0.12	0.17	0.24	0.64	0.69	0.66	0.67
O2	0.09	0.11	0.12	0.08	0.08	0.15	0.08	0.26	0.08	0.09	0.09	0.14	0.21	0.09	0.11	0.16	0.22	0.22	0.21	0.21
O2'	0.08	0.09	0.08	0.10	0.09	0.14	0.10	0.24	0.09	0.08	0.08	0.11	0.16	0.10	0.10	0.17	0.21	0.20	0.19	0.19
O3'	0.12	0.11	0.07	0.07	0.13	0.23	0.14	0.39	0.13	0.12	0.11	0.13	0.12	0.11	0.14	0.29	0.38	0.38	0.37	0.38
O4'	0.07	0.07	0.08	0.06	0.08	0.20	0.08	0.42	0.07	0.06	0.06	0.10	0.12	0.07	0.11	0.19	0.40	0.42	0.37	0.39
O5'	0.08	0.07	0.09	0.07	0.08	0.24	0.07	0.52	0.06	0.07	0.06	0.09	0.13	0.15	0.10	0.24	0.53	0.60	0.57	0.56
OP1	0.11	0.08	0.14	0.09	0.09	0.24	0.08	0.56	0.07	0.08	0.07	0.10	0.21	0.21	0.11	0.23	0.59	0.72	0.69	0.66
OP2	0.17	0.14	0.19	0.12	0.14	0.21	0.14	0.56	0.14	0.14	0.14	0.14	0.28	0.26	0.16	0.19	0.59	0.73	0.69	0.66
P	0.13	0.10	0.14	0.09	0.11	0.21	0.10	0.53	0.09	0.10	0.10	0.11	0.21	0.21	0.13	0.19	0.55	0.67	0.63	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.01	0.10	0.14	0.13	0.11	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.08	0.03	0.02	0.04	0.08	0.00	0.03	0.03	0.01	0.04	0.07	0.09	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.16	0.00	0.21	0.02	0.19	0.09	0.10	0.10	0.02	0.01	0.17	0.01	0.14	0.12	0.20	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.16	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.07	0.00	0.02	0.24	0.30	0.39	0.31
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.19	0.05	0.04	0.20	0.12	0.01	0.10	0.00	0.01	0.08	0.04	0.08
C5	0.02	0.01	0.02	0.21	0.00	0.18	0.00	0.32	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.08	0.01	0.09	0.44	0.48	0.59	0.50
C5'	0.03	0.18	0.08	0.02	0.15	0.00	0.32	0.00	0.32	0.06	0.10	0.39	0.04	0.08	0.16	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.19	0.01	0.19	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.07	0.01	0.12	0.43	0.41	0.48	0.43
N1	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.06	0.01	0.01	0.12	0.11	0.16	0.11
N3	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.06	0.01	0.07	0.09	0.10	0.16	0.12
O2	0.04	0.01	0.08	0.10	0.01	0.20	0.01	0.39	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.11	0.02	0.17	0.37	0.36	0.30	0.35
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.17	0.12	0.19	0.04	0.16	0.10	0.12	0.08	0.00	0.05	0.18	0.09	0.08	0.10	0.11	0.05
O3'	0.14	0.07	0.03	0.01	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.06	0.06	0.11	0.05	0.00	0.08	0.09	0.18	0.21	0.24	0.14
O4	0.01	0.01	0.03	0.17	0.00	0.10	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.08	0.00	0.02	0.25	0.34	0.44	0.35
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.07	0.17	0.09	0.09	0.02	0.00	0.06	0.11	0.13	0.14
O5'	0.04	0.14	0.04	0.14	0.24	0.01	0.44	0.01	0.43	0.12	0.09	0.37	0.08	0.18	0.25	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.13	0.07	0.12	0.30	0.08	0.48	0.04	0.41	0.11	0.10	0.36	0.10	0.21	0.34	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.11	0.09	0.20	0.39	0.04	0.59	0.02	0.48	0.16	0.16	0.30	0.11	0.24	0.44	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.14	0.04	0.10	0.31	0.08	0.50	0.01	0.43	0.11	0.12	0.35	0.05	0.14	0.35	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00