Doublet Group distance statistics: 54385

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C5	A	0, -0.003, 0.018, 0.039, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.018 std_dev=0.021
C4	A	0, -0.003, 0.031, 0.064, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.031 std_dev=0.033
O6	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N1	A	0, -0.019, 0.026, 0.070, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.026 std_dev=0.044
N9	A	0, -0.015, 0.030, 0.075, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.030 std_dev=0.045
N7	A	0, 0.001, 0.047, 0.093, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.047 std_dev=0.046
N3	A	0, -0.004, 0.043, 0.089, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.043 std_dev=0.047
N2	A	0, 0.010, 0.061, 0.111, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.061 std_dev=0.050
C1'	A	0, -0.022, 0.029, 0.080, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.029 std_dev=0.051
C2	A	0, -0.024, 0.028, 0.081, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.028 std_dev=0.052
C8	A	0, -0.013, 0.045, 0.103, 0.212 max_d=0.212 avg_d=0.045 std_dev=0.058
O3'	A	0, -0.091, 0.187, 0.464, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.187 std_dev=0.278
N9	B	0, 0.162, 0.538, 0.914, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.538 std_dev=0.376
C4	B	0, 0.101, 0.498, 0.896, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.498 std_dev=0.397
N7	B	0, 0.201, 0.612, 1.023, 1.870 max_d=1.870 avg_d=0.612 std_dev=0.411
O4'	A	0, -0.192, 0.229, 0.649, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.229 std_dev=0.420
C8	B	0, 0.218, 0.651, 1.085, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.651 std_dev=0.434
O2'	B	0, 0.030, 0.470, 0.911, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.470 std_dev=0.441
C5	B	0, 0.137, 0.588, 1.038, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.588 std_dev=0.450
C1'	B	0, 0.103, 0.583, 1.063, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.583 std_dev=0.480
C2'	B	0, 0.090, 0.608, 1.125, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.608 std_dev=0.517
C2'	A	0, -0.253, 0.265, 0.784, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.265 std_dev=0.519
N3	B	0, -0.067, 0.483, 1.033, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.483 std_dev=0.550
C3'	A	0, -0.267, 0.309, 0.885, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.309 std_dev=0.576
P	A	0, -0.194, 0.462, 1.119, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.462 std_dev=0.657
OP2	A	0, -0.088, 0.593, 1.273, 2.018 max_d=2.018 avg_d=0.593 std_dev=0.681
C4'	A	0, -0.349, 0.375, 1.099, 2.316 max_d=2.316 avg_d=0.375 std_dev=0.724
C6	B	0, -0.027, 0.704, 1.435, 2.503 max_d=2.503 avg_d=0.704 std_dev=0.731
O2'	A	0, -0.333, 0.410, 1.153, 2.218 max_d=2.218 avg_d=0.410 std_dev=0.743
O5'	A	0, -0.278, 0.481, 1.240, 2.535 max_d=2.535 avg_d=0.481 std_dev=0.759
O6	B	0, -0.042, 0.810, 1.661, 2.907 max_d=2.907 avg_d=0.810 std_dev=0.852
C2	B	0, -0.273, 0.590, 1.453, 2.778 max_d=2.778 avg_d=0.590 std_dev=0.863
O4'	B	0, -0.111, 0.826, 1.763, 3.073 max_d=3.073 avg_d=0.826 std_dev=0.937
N1	B	0, -0.258, 0.705, 1.668, 3.116 max_d=3.116 avg_d=0.705 std_dev=0.963
C3'	B	0, -0.119, 0.874, 1.866, 3.364 max_d=3.364 avg_d=0.874 std_dev=0.992
N2	B	0, -0.466, 0.658, 1.782, 3.492 max_d=3.492 avg_d=0.658 std_dev=1.124
C4'	B	0, -0.246, 0.928, 2.103, 3.883 max_d=3.883 avg_d=0.928 std_dev=1.175
C5'	A	0, -0.600, 0.641, 1.882, 3.915 max_d=3.915 avg_d=0.641 std_dev=1.241
O3'	B	0, -0.239, 1.036, 2.311, 4.265 max_d=4.265 avg_d=1.036 std_dev=1.275
OP1	A	0, -0.573, 0.807, 2.187, 4.169 max_d=4.169 avg_d=0.807 std_dev=1.380
C5'	B	0, -0.486, 1.195, 2.877, 5.400 max_d=5.400 avg_d=1.195 std_dev=1.682
O5'	B	0, -0.588, 1.101, 2.791, 5.332 max_d=5.332 avg_d=1.101 std_dev=1.690
OP2	B	0, -0.355, 1.607, 3.570, 6.591 max_d=6.591 avg_d=1.607 std_dev=1.962
P	B	0, -0.773, 1.562, 3.897, 7.468 max_d=7.468 avg_d=1.562 std_dev=2.335
OP1	B	0, -1.063, 1.872, 4.808, 9.232 max_d=9.232 avg_d=1.872 std_dev=2.936

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.11	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.10	0.05	0.03	0.09	0.10	0.10	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.05	0.24	0.49	0.20
C2	0.11	0.00	0.36	0.20	0.04	0.07	0.02	0.12	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.52	0.16	0.18	0.10	0.01	0.28	0.25	0.12
C2'	0.01	0.36	0.00	0.00	0.16	0.02	0.08	0.08	0.17	0.17	0.29	0.41	0.33	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.25	0.13	0.57	1.00	0.57
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.12	0.03	0.18	0.21	0.18	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.22	0.11	0.66	0.80	0.50
C4	0.03	0.04	0.16	0.09	0.00	0.03	0.00	0.18	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.02	0.19	0.06	0.11	0.12	0.03	0.26	0.29	0.10
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.05	0.17	0.05	0.11	0.06	0.13	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.29	0.26	0.11
C5	0.03	0.02	0.08	0.08	0.00	0.07	0.00	0.26	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.05	0.06	0.18	0.02	0.45	0.22	0.15
C5'	0.10	0.12	0.08	0.02	0.18	0.01	0.26	0.00	0.22	0.39	0.17	0.09	0.12	0.35	0.23	0.07	0.03	0.01	0.01	0.24	0.11	0.08	0.02
C6	0.05	0.01	0.17	0.12	0.02	0.05	0.02	0.22	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.21	0.08	0.10	0.16	0.01	0.50	0.21	0.18
C8	0.03	0.06	0.17	0.03	0.02	0.17	0.03	0.39	0.05	0.00	0.07	0.05	0.04	0.00	0.01	0.28	0.04	0.11	0.28	0.04	0.39	0.29	0.15
N1	0.09	0.00	0.29	0.18	0.05	0.05	0.03	0.17	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.40	0.14	0.15	0.13	0.01	0.41	0.22	0.15
N2	0.10	0.01	0.41	0.21	0.03	0.11	0.01	0.09	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.65	0.17	0.23	0.09	0.01	0.22	0.26	0.12
N3	0.10	0.01	0.33	0.18	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.47	0.14	0.17	0.10	0.01	0.21	0.29	0.11
N7	0.03	0.02	0.10	0.03	0.02	0.13	0.00	0.35	0.03	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.19	0.03	0.04	0.26	0.03	0.55	0.21	0.21
N9	0.00	0.07	0.02	0.03	0.02	0.08	0.02	0.23	0.04	0.01	0.07	0.06	0.06	0.02	0.00	0.06	0.02	0.01	0.13	0.04	0.19	0.36	0.10
O2'	0.02	0.52	0.00	0.01	0.19	0.01	0.08	0.07	0.21	0.28	0.40	0.65	0.47	0.19	0.06	0.00	0.03	0.02	0.26	0.16	0.67	1.14	0.64
O3'	0.02	0.16	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.08	0.04	0.14	0.17	0.14	0.03	0.02	0.03	0.00	0.07	0.14	0.08	0.69	0.68	0.40
O4'	0.01	0.18	0.01	0.02	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.11	0.15	0.23	0.17	0.04	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.09	0.15	0.20	0.09
O5'	0.05	0.10	0.25	0.22	0.12	0.02	0.18	0.01	0.16	0.28	0.13	0.09	0.10	0.26	0.13	0.26	0.14	0.08	0.00	0.18	0.02	0.02	0.01
O6	0.05	0.01	0.13	0.11	0.03	0.06	0.02	0.24	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.16	0.08	0.09	0.18	0.00	0.60	0.22	0.22
OP1	0.24	0.28	0.57	0.66	0.26	0.29	0.45	0.11	0.50	0.39	0.41	0.22	0.21	0.55	0.19	0.67	0.69	0.15	0.02	0.60	0.00	0.02	0.01
OP2	0.49	0.25	1.00	0.80	0.29	0.26	0.22	0.08	0.21	0.29	0.22	0.26	0.29	0.21	0.36	1.14	0.68	0.20	0.02	0.22	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.12	0.57	0.50	0.10	0.11	0.15	0.02	0.18	0.15	0.15	0.12	0.11	0.21	0.10	0.64	0.40	0.09	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.09	0.04	0.10	0.17	0.17	0.13	0.14	0.08	0.22	0.07	0.08	0.15	0.17	0.24	0.05	0.26	0.38	0.15	0.07	0.50	0.06	0.08
C2	0.41	0.14	0.07	0.09	0.27	0.27	0.22	0.28	0.15	0.32	0.12	0.13	0.23	0.26	0.35	0.11	0.22	0.49	0.30	0.12	0.35	0.19	0.15
C2'	0.07	0.28	0.30	0.34	0.17	0.11	0.20	0.11	0.26	0.11	0.30	0.32	0.21	0.16	0.10	0.28	0.45	0.10	0.11	0.28	0.63	0.23	0.26
C3'	0.15	0.09	0.08	0.14	0.06	0.07	0.05	0.06	0.08	0.11	0.10	0.12	0.06	0.07	0.12	0.06	0.23	0.22	0.07	0.09	0.50	0.09	0.14
C4	0.38	0.10	0.04	0.09	0.22	0.25	0.16	0.25	0.09	0.28	0.07	0.07	0.19	0.21	0.30	0.06	0.26	0.49	0.26	0.07	0.41	0.12	0.09
C4'	0.46	0.31	0.24	0.15	0.38	0.32	0.34	0.27	0.30	0.41	0.28	0.28	0.36	0.37	0.43	0.29	0.08	0.50	0.31	0.27	0.37	0.17	0.08
C5	0.40	0.10	0.07	0.12	0.23	0.28	0.16	0.30	0.09	0.28	0.08	0.09	0.21	0.21	0.32	0.07	0.30	0.53	0.30	0.08	0.40	0.15	0.13
C5'	0.38	0.24	0.17	0.08	0.30	0.24	0.26	0.20	0.22	0.33	0.21	0.22	0.28	0.29	0.34	0.21	0.08	0.42	0.24	0.20	0.45	0.13	0.08
C6	0.40	0.10	0.12	0.15	0.24	0.28	0.17	0.32	0.10	0.29	0.10	0.11	0.21	0.22	0.32	0.10	0.32	0.54	0.32	0.10	0.37	0.19	0.18
C8	0.37	0.09	0.06	0.12	0.20	0.25	0.14	0.26	0.08	0.26	0.08	0.09	0.18	0.18	0.29	0.05	0.31	0.51	0.25	0.09	0.45	0.11	0.08
N1	0.41	0.10	0.11	0.14	0.26	0.28	0.20	0.31	0.11	0.32	0.08	0.12	0.23	0.24	0.34	0.12	0.29	0.52	0.33	0.09	0.35	0.22	0.19
N2	0.38	0.18	0.10	0.11	0.25	0.26	0.22	0.26	0.18	0.32	0.17	0.21	0.21	0.27	0.33	0.15	0.19	0.44	0.29	0.17	0.34	0.20	0.16
N3	0.40	0.15	0.07	0.05	0.26	0.26	0.22	0.25	0.15	0.32	0.12	0.11	0.23	0.26	0.34	0.10	0.19	0.48	0.27	0.13	0.38	0.16	0.11
N7	0.40	0.11	0.07	0.12	0.22	0.29	0.15	0.31	0.10	0.28	0.10	0.10	0.20	0.20	0.31	0.06	0.31	0.55	0.30	0.11	0.41	0.14	0.13
N9	0.35	0.09	0.04	0.10	0.20	0.23	0.14	0.22	0.08	0.25	0.07	0.07	0.17	0.18	0.28	0.06	0.28	0.46	0.22	0.06	0.46	0.09	0.06
O2'	0.30	0.54	0.54	0.55	0.43	0.31	0.45	0.29	0.51	0.34	0.55	0.59	0.49	0.39	0.35	0.55	0.64	0.17	0.30	0.52	0.73	0.40	0.42
O3'	0.19	0.08	0.08	0.10	0.10	0.12	0.09	0.10	0.07	0.16	0.08	0.10	0.08	0.12	0.16	0.07	0.18	0.25	0.10	0.08	0.46	0.07	0.13
O4'	0.57	0.45	0.30	0.17	0.50	0.37	0.46	0.32	0.42	0.51	0.41	0.43	0.50	0.48	0.54	0.35	0.08	0.60	0.35	0.39	0.38	0.20	0.11
O5'	0.37	0.24	0.08	0.06	0.28	0.21	0.23	0.17	0.19	0.29	0.19	0.24	0.28	0.24	0.32	0.14	0.22	0.43	0.19	0.16	0.56	0.07	0.08
O6	0.37	0.13	0.16	0.19	0.23	0.27	0.17	0.32	0.14	0.28	0.15	0.16	0.21	0.21	0.31	0.13	0.37	0.53	0.33	0.16	0.38	0.21	0.20
OP1	0.24	0.24	0.12	0.15	0.13	0.24	0.18	0.24	0.30	0.12	0.33	0.29	0.14	0.14	0.14	0.15	0.21	0.36	0.20	0.37	0.51	0.12	0.12
OP2	0.56	0.29	0.21	0.17	0.37	0.45	0.29	0.43	0.23	0.40	0.24	0.29	0.38	0.31	0.45	0.31	0.24	0.69	0.39	0.22	0.46	0.18	0.17
P	0.39	0.18	0.09	0.09	0.24	0.27	0.18	0.25	0.14	0.27	0.14	0.18	0.25	0.20	0.31	0.16	0.22	0.48	0.23	0.13	0.52	0.07	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.26	0.05	0.03
C2	0.04	0.00	0.18	0.17	0.02	0.08	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.17	0.21	0.02	0.08	0.01	0.44	0.11	0.07
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.06	0.14	0.20	0.17	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.08	0.43	0.06	0.12
C3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.11	0.13	0.20	0.15	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.46	0.07	0.17
C4	0.02	0.02	0.09	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02	0.11	0.02	0.32	0.12	0.08
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.07	0.06	0.09	0.07	0.06	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.20	0.04	0.07
C5	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.01	0.15	0.02	0.26	0.18	0.14
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.07	0.14	0.05	0.06	0.04	0.14	0.07	0.03	0.04	0.01	0.02	0.08	0.03	0.02	0.03
C6	0.02	0.00	0.09	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.10	0.01	0.14	0.01	0.30	0.18	0.14
C8	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01	0.20	0.03	0.13	0.19	0.20
N1	0.03	0.00	0.14	0.13	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.14	0.17	0.02	0.11	0.00	0.39	0.14	0.09
N2	0.04	0.00	0.20	0.20	0.02	0.09	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.26	0.03	0.06	0.01	0.49	0.10	0.09
N3	0.03	0.00	0.17	0.15	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.16	0.19	0.02	0.07	0.01	0.41	0.09	0.07
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.21	0.03	0.14	0.24	0.23
N9	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.03	0.24	0.10	0.08
O2'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.08	0.03	0.05	0.03	0.09	0.04	0.14	0.20	0.16	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.08	0.42	0.06	0.13
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.09	0.01	0.06	0.04	0.10	0.10	0.17	0.26	0.19	0.07	0.03	0.04	0.00	0.01	0.04	0.09	0.59	0.13	0.27
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.13	0.06	0.04
O5'	0.05	0.08	0.06	0.06	0.11	0.01	0.15	0.02	0.14	0.20	0.11	0.06	0.07	0.21	0.11	0.03	0.04	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.08	0.07	0.02	0.03	0.02	0.08	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.08	0.09	0.02	0.15	0.00	0.27	0.21	0.16
OP1	0.26	0.44	0.43	0.46	0.32	0.20	0.26	0.03	0.30	0.13	0.39	0.49	0.41	0.14	0.24	0.42	0.59	0.13	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.11	0.06	0.07	0.12	0.04	0.18	0.02	0.18	0.19	0.14	0.10	0.09	0.24	0.10	0.06	0.13	0.06	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.07	0.12	0.17	0.08	0.07	0.14	0.03	0.14	0.20	0.09	0.09	0.07	0.23	0.08	0.13	0.27	0.04	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00