Doublet Group distance statistics: 54387

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.011, 0.025, 0.040, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.010, 0.027, 0.043, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.027 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.010, 0.029, 0.049, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.014, 0.034, 0.054, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.034 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.018, 0.046, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.046 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.022, 0.052, 0.082, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.052 std_dev=0.030
N2	A	0, 0.016, 0.053, 0.089, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.053 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.030, 0.072, 0.113, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.072 std_dev=0.042
N9	A	0, 0.030, 0.073, 0.115, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.073 std_dev=0.042
O6	A	0, 0.017, 0.072, 0.127, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.072 std_dev=0.055
N3	B	0, 0.261, 0.620, 0.979, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.620 std_dev=0.359
C2	B	0, 0.316, 0.762, 1.207, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.762 std_dev=0.446
N2	B	0, 0.343, 0.815, 1.288, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.815 std_dev=0.473
C1'	B	0, 0.357, 0.846, 1.334, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.846 std_dev=0.489
C4	B	0, 0.343, 0.842, 1.341, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.842 std_dev=0.499
N9	B	0, 0.385, 0.934, 1.482, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.934 std_dev=0.548
C2'	B	0, 0.407, 0.970, 1.532, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.970 std_dev=0.563
O2'	B	0, 0.428, 1.021, 1.615, 1.469 max_d=1.469 avg_d=1.021 std_dev=0.593
O4'	A	0, 0.451, 1.068, 1.685, 1.446 max_d=1.446 avg_d=1.068 std_dev=0.617
O3'	A	0, 0.474, 1.124, 1.773, 1.527 max_d=1.527 avg_d=1.124 std_dev=0.650
N1	B	0, 0.403, 1.056, 1.709, 1.600 max_d=1.600 avg_d=1.056 std_dev=0.653
C3'	A	0, 0.478, 1.133, 1.788, 1.555 max_d=1.555 avg_d=1.133 std_dev=0.655
O4'	B	0, 0.485, 1.149, 1.813, 1.558 max_d=1.558 avg_d=1.149 std_dev=0.664
C2'	A	0, 0.521, 1.241, 1.961, 1.768 max_d=1.768 avg_d=1.241 std_dev=0.720
C5	B	0, 0.457, 1.200, 1.943, 1.831 max_d=1.831 avg_d=1.200 std_dev=0.743
C8	B	0, 0.515, 1.303, 2.091, 1.961 max_d=1.961 avg_d=1.303 std_dev=0.788
C3'	B	0, 0.580, 1.373, 2.166, 1.845 max_d=1.845 avg_d=1.373 std_dev=0.793
C4'	A	0, 0.603, 1.428, 2.253, 1.926 max_d=1.926 avg_d=1.428 std_dev=0.825
C6	B	0, 0.485, 1.315, 2.145, 2.036 max_d=2.036 avg_d=1.315 std_dev=0.830
C4'	B	0, 0.627, 1.487, 2.347, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.487 std_dev=0.860
N7	B	0, 0.561, 1.470, 2.380, 2.248 max_d=2.248 avg_d=1.470 std_dev=0.909
O3'	B	0, 0.699, 1.654, 2.609, 2.230 max_d=2.230 avg_d=1.654 std_dev=0.955
OP2	A	0, 0.735, 1.741, 2.747, 2.364 max_d=2.364 avg_d=1.741 std_dev=1.006
O6	B	0, 0.605, 1.668, 2.732, 2.621 max_d=2.621 avg_d=1.668 std_dev=1.064
C5'	B	0, 0.822, 1.961, 3.100, 2.722 max_d=2.722 avg_d=1.961 std_dev=1.139
O2'	A	0, 0.970, 2.298, 3.626, 3.166 max_d=3.166 avg_d=2.298 std_dev=1.328
C5'	A	0, 0.983, 2.325, 3.667, 3.110 max_d=3.110 avg_d=2.325 std_dev=1.342
O5'	A	0, 1.028, 2.431, 3.835, 3.248 max_d=3.248 avg_d=2.431 std_dev=1.404
O5'	B	0, 1.152, 2.780, 4.408, 3.938 max_d=3.938 avg_d=2.780 std_dev=1.628
P	B	0, 1.232, 2.947, 4.662, 4.111 max_d=4.111 avg_d=2.947 std_dev=1.715
OP1	B	0, 1.296, 3.082, 4.867, 4.236 max_d=4.236 avg_d=3.082 std_dev=1.785
OP2	B	0, 1.330, 3.165, 5.000, 4.362 max_d=4.362 avg_d=3.165 std_dev=1.835
P	A	0, 1.380, 3.265, 5.151, 4.384 max_d=4.384 avg_d=3.265 std_dev=1.886
OP1	A	0, 2.061, 4.879, 7.696, 6.566 max_d=6.566 avg_d=4.879 std_dev=2.817

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.17	0.00	0.01	0.02	0.18	0.03	0.03
C2	0.03	0.00	0.20	0.10	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.16	0.15	0.13	0.12	0.03	0.53	0.08	0.17
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.10	0.02	0.04	0.10	0.07	0.14	0.15	0.25	0.21	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.05	0.03	0.24	0.16
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.10	0.08	0.10	0.11	0.09	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.03	0.11	0.06	0.02	0.03
C4	0.01	0.01	0.10	0.08	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.06	0.12	0.01	0.49	0.08	0.16
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.10	0.02	0.10	0.06	0.09	0.03	0.10	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.12	0.02
C5	0.01	0.02	0.04	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.10	0.03	0.16	0.01	0.61	0.12	0.23
C5'	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.08	0.14	0.03	0.06	0.03	0.14	0.05	0.03	0.07	0.02	0.01	0.11	0.12	0.15	0.01
C6	0.00	0.02	0.07	0.10	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.10	0.05	0.18	0.01	0.67	0.14	0.25
C8	0.03	0.01	0.14	0.08	0.00	0.10	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.27	0.10	0.10	0.14	0.03	0.48	0.10	0.19
N1	0.02	0.01	0.15	0.10	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.13	0.09	0.15	0.02	0.63	0.11	0.22
N2	0.04	0.00	0.25	0.11	0.01	0.10	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.26	0.18	0.16	0.10	0.03	0.50	0.07	0.15
N3	0.04	0.00	0.21	0.09	0.01	0.06	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.16	0.13	0.10	0.03	0.45	0.06	0.13
N7	0.03	0.02	0.10	0.10	0.00	0.09	0.00	0.14	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.25	0.09	0.07	0.18	0.04	0.62	0.14	0.25
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.12	0.01	0.09	0.02	0.39	0.06	0.12
O2'	0.01	0.16	0.01	0.02	0.02	0.10	0.13	0.03	0.08	0.27	0.05	0.26	0.18	0.25	0.10	0.00	0.05	0.07	0.16	0.14	0.11	0.31	0.20
O3'	0.17	0.15	0.01	0.00	0.13	0.02	0.10	0.07	0.10	0.10	0.13	0.18	0.16	0.09	0.12	0.05	0.00	0.12	0.09	0.10	0.11	0.07	0.10
O4'	0.00	0.13	0.02	0.01	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.10	0.09	0.16	0.13	0.07	0.01	0.07	0.12	0.00	0.04	0.04	0.13	0.16	0.06
O5'	0.01	0.12	0.16	0.03	0.12	0.02	0.16	0.01	0.18	0.14	0.15	0.10	0.10	0.18	0.09	0.16	0.09	0.04	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00
O6	0.02	0.03	0.05	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.14	0.10	0.04	0.20	0.00	0.73	0.17	0.28
OP1	0.18	0.53	0.03	0.06	0.49	0.03	0.61	0.12	0.67	0.48	0.63	0.50	0.45	0.62	0.39	0.11	0.11	0.13	0.01	0.73	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.08	0.24	0.02	0.08	0.12	0.12	0.15	0.14	0.10	0.11	0.07	0.06	0.14	0.06	0.31	0.07	0.16	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.17	0.16	0.03	0.16	0.02	0.23	0.01	0.25	0.19	0.22	0.15	0.13	0.25	0.12	0.20	0.10	0.06	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.19	0.19	0.25	0.08	0.29	0.12	0.31	0.19	0.06	0.23	0.24	0.10	0.08	0.05	0.24	0.35	0.17	0.34	0.23	0.30	0.41	0.32
C2	0.14	0.14	0.20	0.26	0.02	0.30	0.04	0.31	0.10	0.08	0.15	0.22	0.07	0.03	0.07	0.26	0.33	0.20	0.33	0.11	0.27	0.43	0.32
C2'	0.32	0.12	0.39	0.47	0.13	0.52	0.12	0.55	0.16	0.21	0.18	0.18	0.09	0.15	0.22	0.47	0.57	0.40	0.61	0.20	0.57	0.64	0.58
C3'	0.26	0.10	0.30	0.35	0.13	0.40	0.12	0.42	0.13	0.19	0.13	0.12	0.10	0.14	0.19	0.34	0.42	0.31	0.49	0.16	0.44	0.54	0.47
C4	0.13	0.17	0.20	0.25	0.05	0.28	0.09	0.29	0.16	0.05	0.20	0.23	0.07	0.05	0.06	0.26	0.33	0.18	0.29	0.19	0.25	0.38	0.28
C4'	0.11	0.13	0.15	0.19	0.05	0.24	0.08	0.27	0.14	0.06	0.16	0.17	0.06	0.06	0.06	0.19	0.26	0.16	0.33	0.17	0.28	0.40	0.32
C5	0.14	0.17	0.21	0.25	0.08	0.25	0.11	0.26	0.18	0.08	0.21	0.23	0.08	0.08	0.08	0.27	0.32	0.17	0.23	0.21	0.21	0.32	0.22
C5'	0.18	0.05	0.20	0.23	0.08	0.29	0.06	0.30	0.07	0.12	0.08	0.08	0.06	0.08	0.13	0.24	0.27	0.22	0.36	0.09	0.29	0.44	0.35
C6	0.15	0.16	0.23	0.26	0.08	0.25	0.09	0.26	0.15	0.09	0.18	0.23	0.08	0.07	0.10	0.28	0.32	0.18	0.20	0.17	0.21	0.31	0.20
C8	0.12	0.18	0.20	0.25	0.09	0.25	0.14	0.26	0.22	0.08	0.24	0.23	0.09	0.11	0.07	0.26	0.33	0.16	0.24	0.26	0.22	0.32	0.23
N1	0.15	0.14	0.22	0.25	0.02	0.27	0.04	0.27	0.10	0.07	0.15	0.22	0.06	0.02	0.08	0.28	0.31	0.19	0.25	0.12	0.22	0.36	0.25
N2	0.16	0.15	0.20	0.27	0.08	0.33	0.08	0.36	0.09	0.13	0.14	0.21	0.10	0.10	0.11	0.25	0.34	0.23	0.40	0.09	0.32	0.49	0.39
N3	0.13	0.16	0.19	0.26	0.03	0.30	0.05	0.32	0.12	0.06	0.17	0.23	0.07	0.02	0.06	0.25	0.34	0.20	0.35	0.14	0.29	0.43	0.34
N7	0.13	0.18	0.21	0.25	0.10	0.24	0.15	0.25	0.22	0.09	0.24	0.23	0.10	0.12	0.09	0.27	0.32	0.16	0.20	0.26	0.20	0.29	0.19
N9	0.12	0.17	0.19	0.25	0.06	0.28	0.11	0.29	0.18	0.05	0.21	0.23	0.08	0.07	0.05	0.26	0.34	0.17	0.30	0.22	0.26	0.38	0.29
O2'	0.20	0.32	0.31	0.43	0.15	0.47	0.22	0.51	0.35	0.13	0.39	0.39	0.17	0.17	0.11	0.41	0.59	0.29	0.57	0.41	0.57	0.56	0.53
O3'	0.03	0.25	0.06	0.10	0.15	0.16	0.19	0.20	0.26	0.10	0.28	0.29	0.17	0.15	0.09	0.09	0.18	0.07	0.29	0.29	0.24	0.33	0.26
O4'	0.04	0.19	0.07	0.13	0.10	0.17	0.13	0.20	0.19	0.04	0.22	0.23	0.12	0.09	0.04	0.12	0.20	0.08	0.23	0.22	0.18	0.31	0.22
O5'	0.36	0.15	0.37	0.39	0.23	0.45	0.20	0.46	0.15	0.28	0.13	0.13	0.22	0.23	0.29	0.41	0.43	0.39	0.50	0.14	0.44	0.58	0.49
O6	0.20	0.17	0.28	0.31	0.13	0.28	0.13	0.30	0.17	0.14	0.19	0.23	0.13	0.13	0.16	0.31	0.35	0.21	0.19	0.19	0.23	0.28	0.19
OP1	0.92	0.81	0.89	0.89	0.87	0.94	0.84	0.95	0.79	0.89	0.77	0.78	0.86	0.86	0.90	0.91	0.87	0.94	0.97	0.76	0.89	1.10	0.98
OP2	0.28	0.08	0.31	0.34	0.15	0.37	0.10	0.37	0.08	0.18	0.07	0.07	0.15	0.13	0.20	0.37	0.39	0.31	0.36	0.10	0.33	0.45	0.36
P	0.45	0.28	0.45	0.45	0.35	0.51	0.32	0.52	0.26	0.39	0.24	0.25	0.34	0.34	0.40	0.49	0.47	0.48	0.54	0.24	0.48	0.64	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.02	0.14	0.15	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.05	0.02	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.08	0.03	0.22	0.01	0.18	0.07	0.14
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.08	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.11	0.17	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.06	0.11	0.07	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.03	0.10	0.19	0.06
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.23	0.02	0.18	0.08	0.14
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.03	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.13	0.21	0.02
C5	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.29	0.02	0.20	0.08	0.19
C5'	0.03	0.12	0.02	0.03	0.10	0.01	0.12	0.00	0.13	0.08	0.13	0.12	0.11	0.10	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.14	0.12	0.24	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.30	0.01	0.20	0.09	0.20
C8	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.30	0.02	0.20	0.09	0.19
N1	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.03	0.26	0.00	0.19	0.07	0.17
N2	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.06	0.02	0.12	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.12	0.03	0.19	0.02	0.18	0.07	0.12
N3	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.07	0.02	0.19	0.01	0.17	0.08	0.11
N7	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.03	0.33	0.02	0.22	0.11	0.22
N9	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.02	0.17	0.10	0.12
O2'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.03	0.07	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.09	0.20	0.05
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.12	0.07	0.06	0.01	0.02	0.00	0.02	0.12	0.01	0.05	0.21	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.03	0.14	0.18	0.03
O5'	0.11	0.22	0.07	0.11	0.23	0.02	0.29	0.00	0.30	0.30	0.26	0.19	0.19	0.33	0.22	0.04	0.12	0.10	0.00	0.32	0.01	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.14	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.32	0.00	0.22	0.12	0.22
OP1	0.14	0.18	0.11	0.10	0.18	0.13	0.20	0.12	0.20	0.20	0.19	0.18	0.17	0.22	0.17	0.09	0.05	0.14	0.01	0.22	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.07	0.17	0.19	0.08	0.21	0.08	0.24	0.09	0.09	0.07	0.07	0.08	0.11	0.10	0.20	0.21	0.18	0.03	0.12	0.00	0.00	0.01
P	0.05	0.14	0.05	0.06	0.14	0.02	0.19	0.01	0.20	0.19	0.17	0.12	0.11	0.22	0.12	0.05	0.08	0.03	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00