Doublet Group distance statistics: 54392

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.002, 0.020, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.012, 0.031, 0.049, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.011, 0.033, 0.055, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.033 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.024 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.008, 0.034, 0.060, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.034 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.006, 0.034, 0.062, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.034 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.007, 0.035, 0.064, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.035 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.026, 0.062, 0.098, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.062 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.025, 0.107, 0.189, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.107 std_dev=0.082
C2'	A	0, 0.031, 0.147, 0.263, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.147 std_dev=0.116
C3'	A	0, 0.042, 0.191, 0.339, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.191 std_dev=0.148
C4'	A	0, 0.054, 0.210, 0.367, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.210 std_dev=0.156
O2'	A	0, 0.060, 0.226, 0.392, 0.398 max_d=0.398 avg_d=0.226 std_dev=0.166
C5'	A	0, 0.094, 0.327, 0.561, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.327 std_dev=0.234
O3'	A	0, 0.061, 0.296, 0.530, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.296 std_dev=0.234
OP2	A	0, 0.121, 0.409, 0.697, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.409 std_dev=0.288
P	A	0, 0.076, 0.376, 0.676, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.376 std_dev=0.300
OP1	A	0, 0.094, 0.406, 0.719, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.406 std_dev=0.313
N3	B	0, 0.082, 0.415, 0.748, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.415 std_dev=0.333
O5'	A	0, 0.201, 0.547, 0.894, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.547 std_dev=0.347
C2	B	0, 0.063, 0.422, 0.781, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.422 std_dev=0.359
C4	B	0, 0.103, 0.556, 1.008, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.556 std_dev=0.453
O2'	B	0, 0.172, 0.634, 1.097, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.634 std_dev=0.463
N1	B	0, 0.099, 0.563, 1.026, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.563 std_dev=0.463
C6	B	0, 0.117, 0.652, 1.187, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.652 std_dev=0.535
C5	B	0, 0.112, 0.651, 1.191, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.651 std_dev=0.539
N9	B	0, 0.116, 0.671, 1.226, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.671 std_dev=0.555
C2'	B	0, 0.155, 0.713, 1.272, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.713 std_dev=0.559
C1'	B	0, 0.094, 0.664, 1.234, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.664 std_dev=0.570
N6	B	0, 0.144, 0.789, 1.434, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.789 std_dev=0.645
O3'	B	0, 0.088, 0.741, 1.394, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.741 std_dev=0.653
C3'	B	0, 0.136, 0.800, 1.465, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.800 std_dev=0.664
O5'	B	0, 0.148, 0.813, 1.478, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.813 std_dev=0.665
N7	B	0, 0.116, 0.786, 1.457, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.786 std_dev=0.671
C8	B	0, 0.113, 0.792, 1.470, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.792 std_dev=0.678
O4'	B	0, 0.053, 0.741, 1.429, 1.862 max_d=1.862 avg_d=0.741 std_dev=0.688
C4'	B	0, 0.108, 0.850, 1.593, 2.031 max_d=2.031 avg_d=0.850 std_dev=0.743
P	B	0, 0.328, 1.151, 1.973, 2.088 max_d=2.088 avg_d=1.151 std_dev=0.822
C5'	B	0, 0.193, 1.027, 1.861, 2.281 max_d=2.281 avg_d=1.027 std_dev=0.834
OP2	B	0, 0.370, 1.207, 2.044, 2.002 max_d=2.002 avg_d=1.207 std_dev=0.837
OP1	B	0, 0.441, 1.425, 2.409, 2.534 max_d=2.534 avg_d=1.425 std_dev=0.984

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.05	0.05
C2	0.04	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.03	0.07	0.03	0.07	0.12	0.09
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.10	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.11	0.12	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.10	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.13	0.16	0.08
C4	0.03	0.01	0.06	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.02	0.09	0.04	0.10	0.13	0.11
C4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.05	0.02
C5	0.03	0.01	0.05	0.05	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.07	0.02	0.12	0.03	0.14	0.18	0.15
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.00
C6	0.04	0.02	0.08	0.08	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.09	0.11	0.03	0.11	0.01	0.15	0.19	0.15
C8	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.13	0.02	0.14	0.19	0.14
N1	0.04	0.01	0.09	0.09	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.12	0.03	0.09	0.02	0.11	0.15	0.12
N2	0.03	0.01	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.02	0.07	0.03	0.06	0.11	0.09
N3	0.04	0.00	0.09	0.09	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.03	0.07	0.03	0.06	0.10	0.08
N7	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.14	0.02	0.17	0.22	0.17
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.09	0.04	0.09	0.12	0.10
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.06	0.02	0.09	0.03	0.11	0.13	0.11	0.04	0.02	0.00	0.04	0.02	0.02	0.10	0.13	0.11	0.04
O3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.11	0.02	0.12	0.13	0.10	0.04	0.03	0.04	0.00	0.01	0.09	0.11	0.17	0.21	0.12
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.04	0.08	0.06
O5'	0.04	0.07	0.02	0.05	0.09	0.01	0.12	0.00	0.11	0.13	0.09	0.07	0.07	0.14	0.09	0.02	0.09	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00
O6	0.05	0.03	0.08	0.08	0.04	0.03	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.10	0.11	0.04	0.12	0.00	0.17	0.21	0.16
OP1	0.06	0.07	0.11	0.13	0.10	0.10	0.14	0.08	0.15	0.14	0.11	0.06	0.06	0.17	0.09	0.13	0.17	0.04	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.12	0.12	0.16	0.13	0.05	0.18	0.02	0.19	0.19	0.15	0.11	0.10	0.22	0.12	0.11	0.21	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.05	0.08	0.11	0.02	0.15	0.00	0.15	0.14	0.12	0.09	0.08	0.17	0.10	0.04	0.12	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.10	0.14	0.15	0.09	0.18	0.08	0.18	0.09	0.14	0.11	0.07	0.09	0.10	0.13	0.14	0.15	0.20	0.19	0.19	0.22	0.19
C2	0.18	0.04	0.14	0.13	0.11	0.17	0.09	0.17	0.05	0.16	0.04	0.07	0.04	0.12	0.16	0.15	0.12	0.21	0.19	0.19	0.22	0.20
C2'	0.11	0.12	0.12	0.09	0.08	0.11	0.08	0.11	0.10	0.11	0.12	0.09	0.10	0.08	0.10	0.17	0.09	0.15	0.12	0.12	0.15	0.12
C3'	0.08	0.15	0.13	0.11	0.09	0.07	0.09	0.07	0.13	0.06	0.15	0.11	0.12	0.07	0.07	0.19	0.11	0.08	0.07	0.09	0.12	0.06
C4	0.15	0.08	0.14	0.12	0.08	0.14	0.07	0.15	0.08	0.11	0.09	0.07	0.07	0.08	0.12	0.15	0.11	0.17	0.17	0.17	0.21	0.18
C4'	0.10	0.12	0.11	0.09	0.07	0.10	0.07	0.10	0.10	0.08	0.12	0.08	0.10	0.06	0.08	0.14	0.08	0.12	0.12	0.12	0.16	0.11
C5	0.13	0.13	0.15	0.12	0.11	0.11	0.11	0.12	0.13	0.10	0.14	0.11	0.13	0.10	0.11	0.18	0.10	0.13	0.16	0.16	0.23	0.18
C5'	0.06	0.12	0.09	0.07	0.06	0.06	0.08	0.06	0.12	0.04	0.13	0.08	0.13	0.06	0.05	0.13	0.07	0.06	0.07	0.08	0.12	0.06
C6	0.14	0.12	0.17	0.15	0.12	0.13	0.11	0.14	0.12	0.11	0.12	0.12	0.11	0.11	0.12	0.20	0.13	0.13	0.18	0.17	0.25	0.20
C8	0.11	0.14	0.12	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.14	0.08	0.16	0.10	0.15	0.09	0.10	0.14	0.08	0.12	0.14	0.13	0.20	0.15
N1	0.13	0.04	0.15	0.13	0.07	0.12	0.05	0.13	0.04	0.09	0.04	0.05	0.03	0.07	0.11	0.19	0.11	0.14	0.17	0.17	0.23	0.19
N2	0.27	0.11	0.17	0.18	0.19	0.25	0.17	0.24	0.12	0.25	0.10	0.15	0.12	0.21	0.24	0.14	0.18	0.30	0.24	0.24	0.24	0.25
N3	0.19	0.04	0.14	0.15	0.10	0.20	0.08	0.19	0.03	0.16	0.04	0.05	0.03	0.12	0.16	0.13	0.15	0.23	0.20	0.20	0.22	0.21
N7	0.13	0.17	0.15	0.12	0.13	0.10	0.15	0.11	0.18	0.11	0.19	0.14	0.18	0.13	0.12	0.17	0.09	0.12	0.15	0.15	0.23	0.17
N9	0.14	0.11	0.13	0.13	0.09	0.15	0.08	0.15	0.10	0.11	0.12	0.08	0.10	0.08	0.12	0.14	0.12	0.17	0.17	0.17	0.21	0.18
O2'	0.18	0.11	0.15	0.15	0.11	0.21	0.11	0.20	0.10	0.18	0.11	0.09	0.10	0.14	0.16	0.17	0.15	0.24	0.21	0.20	0.23	0.21
O3'	0.11	0.17	0.17	0.15	0.12	0.10	0.12	0.10	0.15	0.08	0.17	0.14	0.14	0.09	0.09	0.23	0.17	0.08	0.09	0.12	0.12	0.08
O4'	0.16	0.10	0.14	0.14	0.09	0.17	0.08	0.17	0.10	0.13	0.12	0.08	0.10	0.09	0.13	0.15	0.14	0.18	0.19	0.18	0.23	0.19
O5'	0.07	0.14	0.10	0.09	0.09	0.07	0.11	0.06	0.15	0.07	0.16	0.10	0.16	0.10	0.06	0.13	0.09	0.06	0.06	0.07	0.11	0.06
O6	0.19	0.19	0.21	0.19	0.19	0.18	0.18	0.18	0.19	0.17	0.18	0.19	0.17	0.18	0.18	0.23	0.17	0.18	0.22	0.22	0.30	0.24
OP1	0.09	0.20	0.11	0.10	0.14	0.08	0.17	0.08	0.22	0.12	0.23	0.15	0.24	0.16	0.10	0.14	0.10	0.07	0.08	0.11	0.10	0.08
OP2	0.06	0.21	0.08	0.06	0.13	0.03	0.17	0.03	0.23	0.11	0.25	0.15	0.26	0.15	0.09	0.13	0.06	0.02	0.03	0.04	0.11	0.04
P	0.06	0.17	0.09	0.08	0.11	0.05	0.14	0.04	0.19	0.09	0.20	0.12	0.21	0.13	0.07	0.13	0.08	0.04	0.05	0.06	0.10	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.05	0.04
C2	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.04	0.09	0.13	0.14	0.13
C2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.07	0.03	0.02	0.07	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.13	0.11
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.08	0.03	0.02	0.07	0.07	0.03	0.00	0.00	0.01	0.09	0.05	0.12	0.10
C4	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.09	0.12	0.12	0.11
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.07	0.05	0.01	0.10	0.07	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01
C5	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.05	0.00	0.11	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.13	0.18	0.15	0.15
C5'	0.02	0.07	0.03	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.12	0.12	0.10	0.05	0.16	0.13	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.07	0.02	0.12	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.06	0.14	0.21	0.17	0.18
C8	0.03	0.02	0.07	0.08	0.01	0.07	0.01	0.12	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.15	0.17	0.13	0.14
N1	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.03	0.06	0.12	0.18	0.17	0.17
N3	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03	0.07	0.10	0.12	0.11
N6	0.06	0.01	0.07	0.07	0.04	0.10	0.04	0.16	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.06	0.04	0.05	0.08	0.19	0.26	0.22	0.23
N7	0.02	0.02	0.06	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.15	0.20	0.15	0.17
N9	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.10	0.10	0.09
O2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.19	0.15
O3'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.03	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.05	0.13	0.08
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.05	0.06	0.03	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.07	0.05
O5'	0.05	0.09	0.07	0.09	0.09	0.01	0.13	0.00	0.14	0.15	0.12	0.07	0.19	0.15	0.09	0.10	0.09	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.13	0.06	0.05	0.12	0.05	0.18	0.05	0.21	0.17	0.18	0.10	0.26	0.20	0.10	0.08	0.05	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.14	0.13	0.12	0.12	0.01	0.15	0.01	0.17	0.13	0.17	0.12	0.22	0.15	0.10	0.19	0.13	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.13	0.11	0.10	0.11	0.01	0.15	0.01	0.18	0.14	0.17	0.11	0.23	0.17	0.09	0.15	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00