Doublet Group distance statistics: 54394

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 32, 20, 7, 6, 1, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.011, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.008
O6	A	0, 0.010, 0.022, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.010, 0.027, 0.043, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C2'	A	0, 0.068, 0.124, 0.180, 0.248 max_d=0.248 avg_d=0.124 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.094, 0.152, 0.209, 0.258 max_d=0.258 avg_d=0.152 std_dev=0.057
C4'	A	0, 0.159, 0.239, 0.320, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.239 std_dev=0.080
C3'	A	0, 0.172, 0.255, 0.339, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.255 std_dev=0.083
O2'	A	0, 0.088, 0.172, 0.256, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.172 std_dev=0.084
C5'	A	0, 0.206, 0.329, 0.452, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.329 std_dev=0.123
O5'	A	0, 0.061, 0.185, 0.309, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.185 std_dev=0.124
O3'	A	0, 0.307, 0.447, 0.588, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.447 std_dev=0.140
C1'	B	0, 0.314, 0.481, 0.647, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.481 std_dev=0.167
N1	B	0, 0.148, 0.319, 0.490, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.319 std_dev=0.171
C2'	B	0, 0.365, 0.536, 0.707, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.536 std_dev=0.171
C6	B	0, 0.091, 0.273, 0.455, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.273 std_dev=0.182
C5	B	0, 0.079, 0.262, 0.446, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.262 std_dev=0.184
P	A	0, 0.252, 0.437, 0.622, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.437 std_dev=0.185
C4	B	0, 0.081, 0.271, 0.461, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.271 std_dev=0.190
C2	B	0, 0.110, 0.310, 0.511, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.310 std_dev=0.201
N4	B	0, 0.152, 0.356, 0.559, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.356 std_dev=0.204
N3	B	0, 0.082, 0.287, 0.493, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.287 std_dev=0.205
OP2	A	0, 0.306, 0.515, 0.723, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.515 std_dev=0.209
O2	B	0, 0.183, 0.411, 0.639, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.411 std_dev=0.228
OP1	A	0, 0.379, 0.633, 0.888, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.633 std_dev=0.255
O2'	B	0, 0.611, 0.874, 1.136, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.874 std_dev=0.262
O4'	B	0, 0.576, 0.862, 1.147, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.862 std_dev=0.285
P	B	0, 0.775, 1.127, 1.479, 1.827 max_d=1.827 avg_d=1.127 std_dev=0.352
O5'	B	0, 0.781, 1.157, 1.533, 1.854 max_d=1.854 avg_d=1.157 std_dev=0.376
C5'	B	0, 0.810, 1.281, 1.752, 2.230 max_d=2.230 avg_d=1.281 std_dev=0.471
OP2	B	0, 0.901, 1.372, 1.844, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.372 std_dev=0.472
C4'	B	0, 0.879, 1.359, 1.839, 2.144 max_d=2.144 avg_d=1.359 std_dev=0.480
C3'	B	0, 1.069, 1.670, 2.271, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.670 std_dev=0.601
OP1	B	0, 1.224, 2.078, 2.932, 3.507 max_d=3.507 avg_d=2.078 std_dev=0.854
O3'	B	0, 1.392, 2.378, 3.364, 3.440 max_d=3.440 avg_d=2.378 std_dev=0.986

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.06	0.07	0.04
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02	0.08	0.01	0.12	0.14	0.10
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.13	0.08	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.02	0.04	0.08	0.15	0.08	0.08
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.10	0.12	0.09
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.09	0.01	0.11	0.14	0.11
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.10	0.01	0.12	0.16	0.13
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.08	0.01	0.08	0.11	0.10
N1	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.09	0.01	0.13	0.16	0.12
N2	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.08	0.01	0.13	0.14	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01	0.08	0.01	0.11	0.12	0.09
N7	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.02	0.10	0.01	0.11	0.15	0.12
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.10	0.07
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.06	0.02	0.07	0.09	0.07	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.05	0.06	0.12	0.07	0.05
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.03	0.09	0.06	0.09	0.09	0.07	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.06	0.10	0.21	0.11	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.08	0.07
O5'	0.04	0.08	0.04	0.04	0.08	0.01	0.09	0.01	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.10	0.06	0.05	0.06	0.05	0.00	0.11	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.11	0.00	0.14	0.18	0.14
OP1	0.06	0.12	0.13	0.15	0.10	0.06	0.11	0.05	0.12	0.08	0.13	0.13	0.11	0.11	0.07	0.12	0.21	0.06	0.02	0.14	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.14	0.08	0.08	0.12	0.03	0.14	0.02	0.16	0.11	0.16	0.14	0.12	0.15	0.10	0.07	0.11	0.08	0.02	0.18	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.06	0.08	0.09	0.02	0.11	0.01	0.13	0.10	0.12	0.10	0.09	0.12	0.07	0.05	0.11	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.09	0.12	0.31	0.13	0.23	0.10	0.22	0.09	0.08	0.13	0.16	0.10	0.12	0.59	0.19	0.25	0.23	0.28	0.26
C2	0.08	0.10	0.15	0.21	0.12	0.14	0.10	0.14	0.09	0.08	0.13	0.14	0.10	0.15	0.40	0.14	0.20	0.20	0.26	0.23
C2'	0.10	0.10	0.10	0.38	0.13	0.28	0.11	0.26	0.10	0.08	0.14	0.16	0.11	0.16	0.70	0.21	0.28	0.29	0.28	0.29
C3'	0.08	0.11	0.11	0.37	0.16	0.28	0.14	0.26	0.11	0.08	0.16	0.20	0.12	0.16	0.70	0.21	0.27	0.31	0.25	0.27
C4	0.09	0.09	0.14	0.23	0.13	0.18	0.10	0.18	0.08	0.07	0.13	0.16	0.10	0.14	0.45	0.17	0.21	0.21	0.25	0.24
C4'	0.09	0.09	0.11	0.35	0.14	0.26	0.11	0.24	0.09	0.08	0.13	0.17	0.10	0.14	0.66	0.20	0.27	0.27	0.27	0.27
C5	0.10	0.10	0.17	0.18	0.14	0.16	0.11	0.16	0.08	0.08	0.13	0.17	0.12	0.17	0.36	0.17	0.20	0.21	0.24	0.22
C5'	0.10	0.08	0.10	0.34	0.14	0.28	0.13	0.26	0.11	0.08	0.13	0.18	0.09	0.12	0.66	0.22	0.27	0.29	0.26	0.28
C6	0.10	0.11	0.18	0.15	0.14	0.14	0.11	0.14	0.08	0.08	0.14	0.17	0.14	0.20	0.27	0.15	0.19	0.21	0.25	0.21
C8	0.10	0.10	0.15	0.22	0.14	0.20	0.11	0.19	0.08	0.08	0.13	0.18	0.12	0.14	0.45	0.19	0.21	0.22	0.25	0.24
N1	0.09	0.09	0.18	0.15	0.13	0.12	0.10	0.13	0.08	0.07	0.13	0.15	0.11	0.20	0.28	0.13	0.18	0.20	0.24	0.21
N2	0.09	0.12	0.13	0.23	0.13	0.12	0.11	0.13	0.10	0.10	0.14	0.14	0.14	0.14	0.43	0.12	0.21	0.19	0.28	0.23
N3	0.09	0.10	0.13	0.26	0.12	0.17	0.10	0.17	0.09	0.08	0.13	0.15	0.10	0.13	0.49	0.16	0.23	0.21	0.27	0.24
N7	0.10	0.11	0.17	0.18	0.14	0.18	0.11	0.17	0.09	0.08	0.14	0.18	0.13	0.17	0.37	0.18	0.20	0.22	0.25	0.23
N9	0.10	0.09	0.14	0.26	0.13	0.20	0.10	0.20	0.08	0.08	0.13	0.16	0.10	0.13	0.51	0.19	0.23	0.22	0.26	0.25
O2'	0.15	0.12	0.12	0.47	0.13	0.33	0.13	0.32	0.13	0.12	0.13	0.15	0.13	0.18	0.79	0.25	0.36	0.34	0.37	0.35
O3'	0.08	0.13	0.11	0.42	0.18	0.31	0.16	0.29	0.13	0.10	0.18	0.22	0.14	0.21	0.77	0.20	0.29	0.35	0.25	0.28
O4'	0.10	0.09	0.12	0.31	0.13	0.23	0.10	0.22	0.09	0.08	0.13	0.16	0.10	0.12	0.59	0.19	0.25	0.23	0.28	0.26
O5'	0.12	0.08	0.10	0.33	0.15	0.30	0.15	0.29	0.13	0.10	0.13	0.19	0.08	0.11	0.64	0.26	0.28	0.31	0.25	0.30
O6	0.12	0.13	0.20	0.17	0.15	0.13	0.13	0.14	0.10	0.11	0.15	0.19	0.17	0.23	0.19	0.15	0.19	0.23	0.27	0.21
OP1	0.22	0.11	0.11	0.45	0.16	0.45	0.19	0.44	0.20	0.17	0.12	0.19	0.10	0.14	0.77	0.38	0.40	0.47	0.32	0.42
OP2	0.17	0.11	0.12	0.30	0.19	0.34	0.20	0.34	0.18	0.14	0.15	0.23	0.10	0.13	0.59	0.31	0.30	0.37	0.24	0.32
P	0.14	0.09	0.10	0.32	0.17	0.33	0.17	0.33	0.16	0.12	0.14	0.21	0.08	0.11	0.63	0.29	0.29	0.35	0.24	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.08	0.00	0.15	0.17	0.19	0.18
C2	0.02	0.00	0.09	0.20	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.21	0.16	0.02	0.16	0.22	0.20	0.17
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.03	0.05	0.11	0.07	0.02	0.08	0.04	0.17	0.00	0.07	0.01	0.27	0.21	0.39	0.30
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.28	0.00	0.27	0.02	0.23	0.17	0.25	0.30	0.16	0.02	0.01	0.02	0.09	0.25	0.19	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.28	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.27	0.02	0.23	0.29	0.32	0.21
C4'	0.01	0.07	0.03	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.06	0.08	0.10	0.06	0.26	0.06	0.00	0.01	0.12	0.09	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.27	0.00	0.11	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.27	0.03	0.26	0.30	0.37	0.23
C5'	0.04	0.06	0.11	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.13	0.07	0.09	0.13	0.05	0.14	0.16	0.01	0.01	0.13	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.23	0.01	0.10	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.21	0.03	0.24	0.26	0.30	0.22
N1	0.01	0.01	0.02	0.17	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.13	0.01	0.17	0.21	0.21	0.19
N3	0.02	0.00	0.08	0.25	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.22	0.02	0.19	0.26	0.25	0.18
N4	0.02	0.01	0.04	0.30	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.30	0.03	0.25	0.32	0.36	0.22
O2	0.03	0.00	0.17	0.16	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.16	0.03	0.13	0.19	0.18	0.16
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.24	0.26	0.20	0.14	0.15	0.14	0.24	0.26	0.20	0.00	0.09	0.18	0.15	0.19	0.40	0.19
O3'	0.08	0.16	0.07	0.01	0.27	0.06	0.27	0.16	0.21	0.13	0.22	0.30	0.16	0.09	0.00	0.05	0.26	0.53	0.37	0.33
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.18	0.05	0.00	0.13	0.15	0.17	0.13
O5'	0.15	0.16	0.27	0.09	0.23	0.01	0.26	0.01	0.24	0.17	0.19	0.25	0.13	0.15	0.26	0.13	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.17	0.22	0.21	0.25	0.29	0.12	0.30	0.13	0.26	0.21	0.26	0.32	0.19	0.19	0.53	0.15	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.20	0.39	0.19	0.32	0.09	0.37	0.07	0.30	0.21	0.25	0.36	0.18	0.40	0.37	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.17	0.30	0.10	0.21	0.02	0.23	0.01	0.22	0.19	0.18	0.22	0.16	0.19	0.33	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00