Doublet Group distance statistics: 54395

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 10, 14, 11, 7, 5, 4, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C5	A	0, -0.002, 0.020, 0.043, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.020 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.001, 0.024, 0.046, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.024 std_dev=0.023
C2	A	0, -0.008, 0.016, 0.040, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.016 std_dev=0.024
C1'	A	0, -0.002, 0.024, 0.051, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.024 std_dev=0.026
N1	A	0, -0.003, 0.023, 0.049, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.023 std_dev=0.026
C4	A	0, -0.006, 0.023, 0.052, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.023 std_dev=0.029
N2	A	0, -0.001, 0.035, 0.071, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.035 std_dev=0.036
O6	A	0, 0.003, 0.041, 0.080, 0.242 max_d=0.242 avg_d=0.041 std_dev=0.039
N9	A	0, 0.003, 0.042, 0.080, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.042 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.002, 0.049, 0.096, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.049 std_dev=0.047
C8	A	0, 0.006, 0.068, 0.131, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.068 std_dev=0.062
O4'	A	0, 0.012, 0.149, 0.286, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.149 std_dev=0.137
C2'	A	0, -0.023, 0.166, 0.356, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.166 std_dev=0.189
O2	B	0, 0.096, 0.312, 0.529, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.312 std_dev=0.217
C2	B	0, 0.082, 0.307, 0.532, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.307 std_dev=0.225
N3	B	0, 0.060, 0.304, 0.548, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.304 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.102, 0.363, 0.624, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.363 std_dev=0.261
C5	B	0, 0.110, 0.386, 0.661, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.386 std_dev=0.275
C4	B	0, 0.069, 0.346, 0.623, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.346 std_dev=0.277
C6	B	0, 0.118, 0.396, 0.674, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.396 std_dev=0.278
C4'	A	0, -0.029, 0.279, 0.587, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.279 std_dev=0.308
O2'	B	0, 0.118, 0.437, 0.757, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.437 std_dev=0.319
C1'	B	0, 0.109, 0.430, 0.751, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.430 std_dev=0.321
N4	B	0, 0.043, 0.389, 0.735, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.389 std_dev=0.346
O5'	B	0, 0.207, 0.564, 0.921, 2.406 max_d=2.406 avg_d=0.564 std_dev=0.357
C2'	B	0, 0.097, 0.458, 0.819, 2.272 max_d=2.272 avg_d=0.458 std_dev=0.361
P	B	0, 0.207, 0.569, 0.932, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.569 std_dev=0.363
O4'	B	0, 0.086, 0.512, 0.938, 2.168 max_d=2.168 avg_d=0.512 std_dev=0.426
C3'	A	0, -0.159, 0.268, 0.695, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.268 std_dev=0.427
O5'	A	0, -0.006, 0.426, 0.857, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.426 std_dev=0.432
P	A	0, 0.001, 0.468, 0.934, 2.700 max_d=2.700 avg_d=0.468 std_dev=0.467
C5'	B	0, 0.158, 0.628, 1.098, 2.679 max_d=2.679 avg_d=0.628 std_dev=0.470
OP1	B	0, 0.224, 0.699, 1.174, 2.797 max_d=2.797 avg_d=0.699 std_dev=0.475
OP1	A	0, 0.019, 0.507, 0.996, 3.347 max_d=3.347 avg_d=0.507 std_dev=0.488
C5'	A	0, -0.048, 0.446, 0.940, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.446 std_dev=0.494
O2'	A	0, -0.110, 0.394, 0.898, 2.189 max_d=2.189 avg_d=0.394 std_dev=0.504
C4'	B	0, 0.067, 0.588, 1.109, 3.084 max_d=3.084 avg_d=0.588 std_dev=0.521
C3'	B	0, 0.005, 0.581, 1.158, 3.774 max_d=3.774 avg_d=0.581 std_dev=0.577
OP2	B	0, 0.107, 0.736, 1.364, 3.795 max_d=3.795 avg_d=0.736 std_dev=0.628
O3'	A	0, -0.257, 0.538, 1.333, 3.366 max_d=3.366 avg_d=0.538 std_dev=0.795
OP2	A	0, -0.193, 0.650, 1.494, 5.529 max_d=5.529 avg_d=0.650 std_dev=0.843
O3'	B	0, -0.168, 0.683, 1.533, 5.453 max_d=5.453 avg_d=0.683 std_dev=0.850

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.08	0.04	0.01	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.25	0.00	0.18	0.04	0.38	0.27	0.19
C2	0.05	0.00	0.10	0.08	0.02	0.09	0.01	0.28	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.24	0.42	0.10	0.29	0.03	0.49	0.45	0.33
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.07	0.10	0.07	0.10	0.09	0.13	0.10	0.09	0.04	0.01	0.08	0.02	0.27	0.08	0.44	0.21	0.25
C3'	0.03	0.08	0.01	0.00	0.07	0.01	0.13	0.05	0.12	0.19	0.08	0.11	0.08	0.19	0.10	0.02	0.02	0.01	0.21	0.14	0.31	0.23	0.21
C4	0.03	0.02	0.05	0.07	0.00	0.09	0.01	0.27	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.27	0.06	0.28	0.02	0.48	0.40	0.31
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.12	0.13	0.10	0.10	0.08	0.14	0.07	0.14	0.03	0.01	0.03	0.13	0.21	0.20	0.05
C5	0.03	0.01	0.07	0.13	0.01	0.12	0.00	0.32	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.24	0.20	0.04	0.32	0.02	0.52	0.46	0.36
C5'	0.08	0.28	0.10	0.05	0.27	0.01	0.32	0.00	0.35	0.25	0.32	0.27	0.25	0.32	0.21	0.06	0.14	0.02	0.01	0.37	0.19	0.21	0.02
C6	0.04	0.02	0.07	0.12	0.01	0.12	0.01	0.35	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.26	0.24	0.06	0.34	0.01	0.53	0.52	0.39
C8	0.01	0.02	0.10	0.19	0.01	0.13	0.01	0.25	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.24	0.13	0.06	0.30	0.03	0.49	0.33	0.29
N1	0.05	0.01	0.09	0.08	0.03	0.10	0.02	0.32	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.25	0.35	0.07	0.32	0.02	0.52	0.50	0.37
N2	0.06	0.01	0.13	0.11	0.02	0.10	0.02	0.27	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.26	0.51	0.12	0.28	0.04	0.48	0.46	0.33
N3	0.05	0.01	0.10	0.08	0.01	0.08	0.01	0.25	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.22	0.42	0.10	0.26	0.02	0.46	0.41	0.30
N7	0.02	0.02	0.09	0.19	0.01	0.14	0.01	0.32	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.27	0.15	0.06	0.33	0.03	0.53	0.45	0.36
N9	0.01	0.03	0.04	0.10	0.01	0.07	0.02	0.21	0.03	0.00	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.15	0.18	0.02	0.25	0.03	0.45	0.31	0.26
O2'	0.02	0.24	0.01	0.02	0.19	0.14	0.24	0.06	0.26	0.24	0.25	0.26	0.22	0.27	0.15	0.00	0.09	0.11	0.23	0.29	0.44	0.19	0.23
O3'	0.25	0.42	0.08	0.02	0.27	0.03	0.20	0.14	0.24	0.13	0.35	0.51	0.42	0.15	0.18	0.09	0.00	0.14	0.29	0.22	0.37	0.41	0.36
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.07	0.12	0.10	0.06	0.02	0.11	0.14	0.00	0.18	0.06	0.30	0.38	0.22
O5'	0.18	0.29	0.27	0.21	0.28	0.03	0.32	0.01	0.34	0.30	0.32	0.28	0.26	0.33	0.25	0.23	0.29	0.18	0.00	0.36	0.03	0.02	0.01
O6	0.04	0.03	0.08	0.14	0.02	0.13	0.02	0.37	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.29	0.22	0.06	0.36	0.00	0.55	0.57	0.41
OP1	0.38	0.49	0.44	0.31	0.48	0.21	0.52	0.19	0.53	0.49	0.52	0.48	0.46	0.53	0.45	0.44	0.37	0.30	0.03	0.55	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.45	0.21	0.23	0.40	0.20	0.46	0.21	0.52	0.33	0.50	0.46	0.41	0.45	0.31	0.19	0.41	0.38	0.02	0.57	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.33	0.25	0.21	0.31	0.05	0.36	0.02	0.39	0.29	0.37	0.33	0.30	0.36	0.26	0.23	0.36	0.22	0.01	0.41	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.12	0.19	0.20	0.18	0.19	0.16	0.14	0.14	0.11	0.16	0.21	0.11	0.13	0.26	0.15	0.12	0.36	0.13	0.17
C2	0.10	0.09	0.15	0.14	0.14	0.13	0.14	0.09	0.11	0.09	0.13	0.16	0.08	0.13	0.21	0.11	0.13	0.37	0.12	0.17
C2'	0.18	0.15	0.26	0.27	0.18	0.26	0.17	0.22	0.16	0.15	0.18	0.21	0.15	0.21	0.29	0.20	0.17	0.34	0.20	0.19
C3'	0.14	0.12	0.16	0.15	0.13	0.17	0.14	0.13	0.14	0.12	0.13	0.14	0.14	0.11	0.19	0.16	0.14	0.38	0.14	0.21
C4	0.10	0.11	0.17	0.16	0.17	0.14	0.15	0.10	0.12	0.10	0.16	0.20	0.10	0.12	0.21	0.11	0.12	0.39	0.13	0.18
C4'	0.17	0.11	0.19	0.23	0.14	0.22	0.15	0.17	0.15	0.13	0.12	0.17	0.12	0.18	0.30	0.19	0.18	0.39	0.16	0.23
C5	0.10	0.13	0.17	0.15	0.18	0.12	0.16	0.10	0.13	0.12	0.18	0.21	0.13	0.13	0.20	0.11	0.15	0.43	0.18	0.20
C5'	0.36	0.31	0.37	0.40	0.30	0.39	0.31	0.35	0.32	0.33	0.30	0.31	0.32	0.37	0.46	0.37	0.33	0.42	0.31	0.33
C6	0.12	0.14	0.16	0.15	0.17	0.12	0.16	0.12	0.14	0.13	0.17	0.19	0.14	0.15	0.22	0.12	0.17	0.43	0.20	0.21
C8	0.11	0.14	0.18	0.17	0.20	0.14	0.17	0.10	0.14	0.11	0.19	0.24	0.13	0.13	0.21	0.11	0.13	0.42	0.16	0.19
N1	0.10	0.11	0.16	0.14	0.15	0.11	0.14	0.11	0.12	0.10	0.14	0.16	0.11	0.16	0.22	0.11	0.16	0.41	0.17	0.20
N2	0.11	0.11	0.15	0.14	0.15	0.14	0.15	0.10	0.13	0.11	0.14	0.17	0.11	0.14	0.21	0.14	0.13	0.34	0.10	0.17
N3	0.12	0.09	0.17	0.17	0.14	0.16	0.14	0.11	0.12	0.09	0.13	0.17	0.08	0.12	0.23	0.14	0.11	0.35	0.11	0.16
N7	0.11	0.15	0.17	0.16	0.20	0.12	0.18	0.10	0.15	0.13	0.19	0.24	0.14	0.13	0.20	0.11	0.15	0.44	0.20	0.21
N9	0.11	0.12	0.18	0.18	0.18	0.16	0.16	0.11	0.13	0.10	0.17	0.22	0.11	0.12	0.23	0.12	0.12	0.39	0.13	0.18
O2'	0.28	0.29	0.37	0.37	0.31	0.34	0.31	0.35	0.30	0.29	0.31	0.32	0.29	0.35	0.36	0.29	0.33	0.43	0.36	0.35
O3'	0.47	0.47	0.45	0.43	0.46	0.43	0.49	0.46	0.50	0.49	0.46	0.44	0.47	0.50	0.43	0.46	0.56	0.77	0.51	0.62
O4'	0.18	0.09	0.21	0.28	0.15	0.25	0.14	0.19	0.13	0.12	0.13	0.19	0.11	0.22	0.36	0.20	0.17	0.38	0.16	0.21
O5'	0.28	0.27	0.29	0.32	0.31	0.30	0.31	0.28	0.30	0.28	0.29	0.32	0.26	0.32	0.37	0.29	0.30	0.51	0.22	0.34
O6	0.15	0.16	0.17	0.16	0.18	0.14	0.17	0.16	0.15	0.15	0.18	0.19	0.17	0.17	0.25	0.16	0.20	0.46	0.24	0.23
OP1	0.41	0.43	0.38	0.40	0.46	0.40	0.44	0.39	0.42	0.42	0.45	0.48	0.43	0.44	0.46	0.42	0.42	0.65	0.30	0.46
OP2	0.45	0.48	0.42	0.45	0.56	0.43	0.56	0.46	0.52	0.49	0.52	0.60	0.45	0.48	0.50	0.45	0.53	0.79	0.43	0.60
P	0.31	0.30	0.30	0.34	0.33	0.31	0.33	0.30	0.31	0.30	0.31	0.36	0.29	0.35	0.40	0.31	0.33	0.57	0.21	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.14	0.00	0.10	0.27	0.07	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.13	0.04	0.12	0.36	0.15	0.11
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.09	0.06	0.02	0.05	0.04	0.10	0.00	0.02	0.01	0.19	0.30	0.16	0.21
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.12	0.01	0.13	0.02	0.12	0.07	0.09	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.05	0.13	0.09	0.05
C4	0.02	0.01	0.04	0.12	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.09	0.03	0.15	0.44	0.26	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.03	0.04	0.05	0.10	0.03	0.00	0.01	0.12	0.08	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.03	0.16	0.45	0.27	0.15
C5'	0.04	0.07	0.09	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.07	0.09	0.12	0.06	0.04	0.08	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.04	0.15	0.39	0.19	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.12	0.34	0.13	0.10
N3	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.11	0.04	0.13	0.41	0.21	0.13
N4	0.02	0.02	0.04	0.13	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.14	0.10	0.03	0.15	0.46	0.30	0.16
O2	0.03	0.01	0.10	0.08	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.13	0.20	0.06	0.11	0.33	0.12	0.10
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.13	0.10	0.13	0.04	0.11	0.07	0.12	0.14	0.13	0.00	0.04	0.07	0.16	0.27	0.16	0.20
O3'	0.14	0.13	0.02	0.01	0.09	0.03	0.10	0.08	0.08	0.08	0.11	0.10	0.20	0.04	0.00	0.11	0.11	0.18	0.15	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.06	0.07	0.11	0.00	0.07	0.21	0.06	0.08
O5'	0.10	0.12	0.19	0.05	0.15	0.01	0.16	0.01	0.15	0.12	0.13	0.15	0.11	0.16	0.11	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.27	0.36	0.30	0.13	0.44	0.12	0.45	0.08	0.39	0.34	0.41	0.46	0.33	0.27	0.18	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.15	0.16	0.09	0.26	0.08	0.27	0.13	0.19	0.13	0.21	0.30	0.12	0.16	0.15	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.11	0.21	0.05	0.14	0.03	0.15	0.02	0.12	0.10	0.13	0.16	0.10	0.20	0.11	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00