Doublet Group distance statistics: 54404

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 4, 4, 11, 6, 3, 2, 2, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.032 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.005, 0.024, 0.042, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.030 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.010, 0.037, 0.063, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.037 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.008, 0.035, 0.063, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.035 std_dev=0.027
O2'	A	0, 0.042, 0.098, 0.155, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.098 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.013, 0.084, 0.155, 0.227 max_d=0.227 avg_d=0.084 std_dev=0.071
O4'	A	0, 0.001, 0.106, 0.211, 0.324 max_d=0.324 avg_d=0.106 std_dev=0.105
O2	B	0, 0.215, 0.362, 0.509, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.362 std_dev=0.147
C2	B	0, 0.238, 0.400, 0.561, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.400 std_dev=0.162
C1'	B	0, 0.236, 0.426, 0.616, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.426 std_dev=0.190
N3	B	0, 0.249, 0.445, 0.641, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.445 std_dev=0.196
C3'	A	0, 0.008, 0.208, 0.408, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.208 std_dev=0.200
N1	B	0, 0.230, 0.440, 0.649, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.440 std_dev=0.210
C4'	A	0, 0.001, 0.221, 0.441, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.221 std_dev=0.220
C2'	B	0, 0.196, 0.439, 0.682, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.439 std_dev=0.243
O4'	B	0, 0.222, 0.471, 0.720, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.471 std_dev=0.249
O3'	A	0, 0.016, 0.292, 0.568, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.292 std_dev=0.276
C4	B	0, 0.229, 0.529, 0.830, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.529 std_dev=0.300
C6	B	0, 0.209, 0.527, 0.845, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.527 std_dev=0.318
O2'	B	0, 0.149, 0.472, 0.794, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.472 std_dev=0.323
C3'	B	0, 0.158, 0.481, 0.804, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.481 std_dev=0.323
O5'	A	0, 0.043, 0.370, 0.697, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.370 std_dev=0.327
C4'	B	0, 0.195, 0.525, 0.856, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.525 std_dev=0.331
C5'	A	0, 0.016, 0.352, 0.689, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.352 std_dev=0.337
O4	B	0, 0.218, 0.568, 0.917, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.568 std_dev=0.349
C5	B	0, 0.209, 0.574, 0.939, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.574 std_dev=0.365
O5'	B	0, 0.196, 0.592, 0.988, 2.032 max_d=2.032 avg_d=0.592 std_dev=0.396
C5'	B	0, 0.204, 0.608, 1.012, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.608 std_dev=0.404
O3'	B	0, 0.096, 0.534, 0.972, 2.316 max_d=2.316 avg_d=0.534 std_dev=0.438
OP2	B	0, 0.170, 0.649, 1.129, 2.462 max_d=2.462 avg_d=0.649 std_dev=0.480
P	B	0, 0.196, 0.695, 1.195, 2.175 max_d=2.175 avg_d=0.695 std_dev=0.500
P	A	0, 0.030, 0.577, 1.123, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.577 std_dev=0.547
OP1	B	0, 0.159, 0.832, 1.505, 2.543 max_d=2.543 avg_d=0.832 std_dev=0.673
OP1	A	0, 0.059, 0.792, 1.526, 2.210 max_d=2.210 avg_d=0.792 std_dev=0.733
OP2	A	0, -0.032, 0.712, 1.456, 2.222 max_d=2.222 avg_d=0.712 std_dev=0.744

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.02	0.04	0.17	0.12
C2	0.02	0.00	0.07	0.12	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.15	0.02	0.21	0.01	0.19	0.41	0.29
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.08	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.20	0.08	0.06
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.14	0.06	0.14	0.12	0.10	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.07	0.15	0.26	0.16	0.15
C4	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.21	0.02	0.20	0.39	0.29
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.07	0.07	0.03	0.03	0.09	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.10	0.12	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.02	0.27	0.02	0.33	0.51	0.39
C5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.16	0.14	0.13	0.08	0.07	0.17	0.08	0.04	0.03	0.01	0.01	0.19	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.16	0.02	0.29	0.00	0.38	0.56	0.43
C8	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.03	0.24	0.02	0.29	0.44	0.36
N1	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.17	0.02	0.26	0.01	0.30	0.50	0.37
N2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.03	0.20	0.01	0.16	0.38	0.26
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.18	0.02	0.13	0.34	0.24
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.29	0.03	0.40	0.57	0.44
N9	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.18	0.02	0.15	0.32	0.25
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.01	0.05	0.07	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.25	0.07	0.07
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.10	0.01	0.12	0.03	0.16	0.06	0.17	0.16	0.11	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.13	0.18	0.45	0.32	0.30
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.04	0.05	0.18	0.14
O5'	0.08	0.21	0.03	0.07	0.21	0.02	0.27	0.01	0.29	0.24	0.26	0.20	0.18	0.29	0.18	0.03	0.13	0.09	0.00	0.32	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.15	0.02	0.10	0.02	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.18	0.04	0.32	0.00	0.47	0.64	0.49
OP1	0.04	0.19	0.20	0.26	0.20	0.12	0.33	0.05	0.38	0.29	0.30	0.16	0.13	0.40	0.15	0.25	0.45	0.05	0.01	0.47	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.41	0.08	0.16	0.39	0.03	0.51	0.01	0.56	0.44	0.50	0.38	0.34	0.57	0.32	0.07	0.32	0.18	0.01	0.64	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.29	0.06	0.15	0.29	0.02	0.39	0.01	0.43	0.36	0.37	0.26	0.24	0.44	0.25	0.07	0.30	0.14	0.00	0.49	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.09	0.28	0.31	0.10	0.28	0.12	0.28	0.14	0.13	0.09	0.08	0.34	0.38	0.11	0.21	0.27	0.30	0.25	0.26
C2	0.17	0.09	0.25	0.25	0.10	0.23	0.11	0.22	0.13	0.12	0.09	0.08	0.31	0.30	0.11	0.18	0.22	0.23	0.21	0.21
C2'	0.19	0.12	0.27	0.31	0.13	0.29	0.11	0.28	0.12	0.13	0.14	0.13	0.36	0.40	0.15	0.21	0.24	0.27	0.22	0.24
C3'	0.21	0.19	0.27	0.30	0.22	0.30	0.19	0.29	0.17	0.17	0.22	0.20	0.38	0.39	0.25	0.23	0.23	0.25	0.21	0.23
C4	0.17	0.08	0.24	0.26	0.09	0.23	0.10	0.22	0.11	0.11	0.09	0.08	0.31	0.31	0.12	0.18	0.21	0.23	0.21	0.20
C4'	0.17	0.10	0.27	0.31	0.12	0.27	0.09	0.27	0.10	0.11	0.13	0.12	0.34	0.39	0.15	0.19	0.25	0.28	0.23	0.24
C5	0.15	0.09	0.21	0.22	0.10	0.19	0.09	0.18	0.10	0.10	0.10	0.08	0.29	0.25	0.13	0.15	0.17	0.18	0.17	0.16
C5'	0.18	0.16	0.26	0.29	0.19	0.27	0.15	0.26	0.13	0.14	0.20	0.17	0.35	0.37	0.23	0.20	0.22	0.25	0.20	0.22
C6	0.15	0.09	0.19	0.19	0.11	0.17	0.10	0.16	0.10	0.11	0.10	0.09	0.28	0.21	0.13	0.14	0.15	0.16	0.16	0.14
C8	0.16	0.08	0.23	0.24	0.10	0.21	0.09	0.20	0.10	0.10	0.10	0.08	0.31	0.29	0.14	0.16	0.19	0.21	0.19	0.18
N1	0.15	0.08	0.21	0.20	0.09	0.18	0.09	0.17	0.10	0.11	0.09	0.08	0.28	0.23	0.11	0.15	0.17	0.17	0.17	0.16
N2	0.19	0.10	0.27	0.28	0.11	0.25	0.13	0.24	0.15	0.14	0.11	0.10	0.32	0.32	0.12	0.20	0.24	0.25	0.24	0.24
N3	0.18	0.09	0.26	0.28	0.10	0.25	0.11	0.25	0.13	0.13	0.09	0.08	0.32	0.33	0.11	0.19	0.24	0.25	0.23	0.23
N7	0.15	0.09	0.21	0.21	0.11	0.19	0.10	0.17	0.10	0.10	0.11	0.08	0.29	0.25	0.15	0.15	0.17	0.18	0.16	0.15
N9	0.17	0.08	0.25	0.27	0.09	0.24	0.10	0.23	0.11	0.11	0.09	0.08	0.32	0.32	0.12	0.18	0.22	0.24	0.21	0.21
O2'	0.24	0.12	0.34	0.37	0.11	0.35	0.14	0.35	0.17	0.17	0.11	0.12	0.39	0.46	0.11	0.27	0.33	0.36	0.30	0.32
O3'	0.24	0.24	0.29	0.33	0.27	0.34	0.24	0.33	0.22	0.22	0.27	0.24	0.40	0.43	0.31	0.27	0.27	0.29	0.24	0.28
O4'	0.19	0.09	0.29	0.32	0.10	0.28	0.12	0.28	0.15	0.13	0.09	0.07	0.33	0.39	0.12	0.21	0.28	0.32	0.27	0.27
O5'	0.26	0.30	0.27	0.28	0.35	0.30	0.31	0.28	0.27	0.27	0.35	0.30	0.39	0.35	0.40	0.27	0.23	0.22	0.22	0.24
O6	0.15	0.11	0.17	0.16	0.13	0.15	0.12	0.14	0.11	0.12	0.12	0.12	0.26	0.18	0.15	0.14	0.14	0.14	0.15	0.13
OP1	0.28	0.37	0.29	0.30	0.50	0.31	0.43	0.29	0.35	0.32	0.47	0.34	0.40	0.37	0.59	0.28	0.24	0.24	0.25	0.26
OP2	0.46	0.58	0.44	0.43	0.71	0.45	0.65	0.44	0.57	0.53	0.67	0.53	0.53	0.45	0.78	0.46	0.42	0.40	0.47	0.46
P	0.33	0.43	0.32	0.31	0.53	0.34	0.47	0.32	0.40	0.38	0.51	0.40	0.43	0.37	0.59	0.33	0.28	0.26	0.31	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.03	0.06	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.03	0.02	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.06	0.02	0.02	0.13	0.11	0.13	0.09
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.06	0.02	0.04	0.07	0.00	0.01	0.07	0.01	0.03	0.05	0.07	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.17	0.00	0.19	0.01	0.17	0.09	0.12	0.05	0.02	0.01	0.18	0.01	0.03	0.08	0.05	0.03
C4	0.02	0.01	0.06	0.17	0.00	0.11	0.01	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.19	0.01	0.04	0.26	0.24	0.29	0.21
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.11	0.05	0.06	0.03	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.02	0.02	0.07	0.19	0.01	0.13	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.22	0.02	0.04	0.29	0.24	0.30	0.22
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.18	0.00	0.20	0.00	0.16	0.08	0.12	0.03	0.06	0.02	0.20	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.17	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.18	0.03	0.03	0.23	0.17	0.19	0.14
N1	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.03	0.01	0.13	0.09	0.11	0.08
N3	0.01	0.00	0.04	0.12	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.12	0.01	0.02	0.19	0.17	0.21	0.15
O2	0.03	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.07	0.02	0.04	0.07	0.06	0.10	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.06	0.03	0.06	0.03	0.03	0.09	0.17	0.00	0.04	0.06	0.05	0.03	0.09	0.05	0.03
O3'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.19	0.01	0.22	0.02	0.18	0.08	0.12	0.07	0.04	0.00	0.21	0.01	0.04	0.15	0.05	0.07
O4	0.03	0.02	0.07	0.18	0.01	0.13	0.02	0.20	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.21	0.00	0.05	0.29	0.28	0.34	0.25
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.04	0.06	0.08	0.08
O5'	0.03	0.13	0.03	0.03	0.26	0.01	0.29	0.01	0.23	0.13	0.19	0.07	0.03	0.04	0.29	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.11	0.05	0.08	0.24	0.04	0.24	0.03	0.17	0.09	0.17	0.06	0.09	0.15	0.28	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.13	0.07	0.05	0.29	0.03	0.30	0.01	0.19	0.11	0.21	0.10	0.05	0.05	0.34	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.09	0.04	0.03	0.21	0.02	0.22	0.01	0.14	0.08	0.15	0.06	0.03	0.07	0.25	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00