Doublet Group distance statistics: 54405

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 4, 4, 9, 10, 10, 8, 2, 3, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.006, 0.011, 0.015, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.008, 0.015, 0.023, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.015, 0.035, 0.056, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.035 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.021, 0.042, 0.064, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.042 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.097, 0.210, 0.323, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.210 std_dev=0.113
C2'	A	0, 0.111, 0.236, 0.362, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.236 std_dev=0.126
C4'	A	0, 0.171, 0.335, 0.499, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.335 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.146, 0.353, 0.559, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.353 std_dev=0.206
C3'	A	0, 0.167, 0.378, 0.590, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.378 std_dev=0.211
O2	B	0, 0.111, 0.389, 0.667, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.389 std_dev=0.278
C5'	A	0, 0.237, 0.529, 0.822, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.529 std_dev=0.293
C2	B	0, 0.128, 0.450, 0.773, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.450 std_dev=0.322
N3	B	0, 0.182, 0.510, 0.838, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.510 std_dev=0.328
O3'	A	0, 0.251, 0.595, 0.939, 1.930 max_d=1.930 avg_d=0.595 std_dev=0.344
N1	B	0, 0.234, 0.601, 0.968, 1.969 max_d=1.969 avg_d=0.601 std_dev=0.367
C1'	B	0, 0.148, 0.529, 0.909, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.529 std_dev=0.380
C4	B	0, 0.323, 0.715, 1.106, 2.195 max_d=2.195 avg_d=0.715 std_dev=0.392
O4'	B	0, 0.152, 0.556, 0.961, 2.191 max_d=2.191 avg_d=0.556 std_dev=0.404
C6	B	0, 0.452, 0.869, 1.285, 2.539 max_d=2.539 avg_d=0.869 std_dev=0.417
N4	B	0, 0.337, 0.755, 1.172, 2.304 max_d=2.304 avg_d=0.755 std_dev=0.417
C2'	B	0, 0.158, 0.578, 0.999, 2.231 max_d=2.231 avg_d=0.578 std_dev=0.421
C5	B	0, 0.490, 0.932, 1.374, 2.694 max_d=2.694 avg_d=0.932 std_dev=0.442
C4'	B	0, 0.123, 0.593, 1.063, 2.424 max_d=2.424 avg_d=0.593 std_dev=0.470
C3'	B	0, 0.160, 0.648, 1.136, 2.413 max_d=2.413 avg_d=0.648 std_dev=0.488
O2'	B	0, 0.040, 0.537, 1.033, 2.811 max_d=2.811 avg_d=0.537 std_dev=0.496
O5'	A	0, 0.131, 0.637, 1.144, 3.536 max_d=3.536 avg_d=0.637 std_dev=0.506
O5'	B	0, 0.245, 0.755, 1.265, 2.534 max_d=2.534 avg_d=0.755 std_dev=0.510
C5'	B	0, 0.176, 0.696, 1.216, 2.595 max_d=2.595 avg_d=0.696 std_dev=0.520
O3'	B	0, 0.122, 0.693, 1.263, 2.779 max_d=2.779 avg_d=0.693 std_dev=0.571
P	B	0, 0.332, 0.922, 1.511, 3.077 max_d=3.077 avg_d=0.922 std_dev=0.589
OP1	B	0, 0.354, 0.984, 1.615, 3.311 max_d=3.311 avg_d=0.984 std_dev=0.630
OP2	B	0, 0.397, 1.038, 1.679, 3.443 max_d=3.443 avg_d=1.038 std_dev=0.641
P	A	0, 0.195, 0.853, 1.511, 4.582 max_d=4.582 avg_d=0.853 std_dev=0.658
OP2	A	0, 0.143, 0.943, 1.743, 5.631 max_d=5.631 avg_d=0.943 std_dev=0.800
OP1	A	0, 0.043, 0.930, 1.818, 6.560 max_d=6.560 avg_d=0.930 std_dev=0.887

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.06	0.09	0.07
C2	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.08	0.04	0.16	0.12	0.25	0.15
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.13	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.08	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.06	0.07	0.10	0.10	0.02	0.00	0.01	0.12	0.21	0.07	0.11
C4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.09	0.02	0.24	0.19	0.41	0.24
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.04	0.08	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.03	0.26	0.22	0.40	0.26
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.09	0.12	0.05	0.07	0.04	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.04	0.22	0.18	0.30	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.15	0.11	0.22	0.14
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.08	0.03	0.21	0.16	0.34	0.20
N4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.11	0.03	0.27	0.22	0.47	0.27
O2	0.02	0.00	0.13	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.16	0.05	0.13	0.12	0.20	0.12
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.10	0.08	0.06	0.07	0.05	0.05	0.14	0.10	0.20	0.00	0.04	0.07	0.11	0.15	0.12	0.09
O3'	0.03	0.08	0.01	0.00	0.09	0.01	0.15	0.04	0.14	0.04	0.08	0.11	0.16	0.04	0.00	0.02	0.10	0.27	0.12	0.12
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.02	0.00	0.04	0.05	0.07	0.07
O5'	0.06	0.16	0.08	0.12	0.24	0.01	0.26	0.01	0.22	0.15	0.21	0.27	0.13	0.11	0.10	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.06	0.12	0.14	0.21	0.19	0.08	0.22	0.11	0.18	0.11	0.16	0.22	0.12	0.15	0.27	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.25	0.08	0.07	0.41	0.09	0.40	0.12	0.30	0.22	0.34	0.47	0.20	0.12	0.12	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.15	0.08	0.11	0.24	0.02	0.26	0.01	0.21	0.14	0.20	0.27	0.12	0.09	0.12	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.11	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.11	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.18	0.22	0.12	0.13	0.12	0.12	0.10
C2	0.08	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.08	0.08	0.11	0.08	0.13	0.24	0.09	0.10	0.11	0.14	0.11
C2'	0.13	0.14	0.12	0.12	0.16	0.14	0.16	0.16	0.15	0.14	0.15	0.17	0.13	0.16	0.21	0.15	0.19	0.16	0.16	0.15
C3'	0.24	0.26	0.23	0.24	0.29	0.25	0.29	0.27	0.27	0.26	0.28	0.31	0.25	0.27	0.27	0.26	0.30	0.27	0.28	0.26
C4	0.08	0.08	0.09	0.09	0.12	0.09	0.11	0.09	0.09	0.08	0.10	0.14	0.09	0.12	0.23	0.09	0.10	0.12	0.15	0.12
C4'	0.18	0.19	0.19	0.18	0.20	0.18	0.20	0.19	0.20	0.19	0.19	0.20	0.19	0.26	0.23	0.19	0.21	0.19	0.20	0.18
C5	0.12	0.11	0.12	0.10	0.09	0.11	0.09	0.11	0.09	0.10	0.09	0.11	0.14	0.19	0.21	0.12	0.11	0.11	0.13	0.10
C5'	0.24	0.24	0.26	0.25	0.25	0.24	0.25	0.24	0.25	0.24	0.24	0.25	0.24	0.33	0.28	0.23	0.26	0.24	0.24	0.22
C6	0.12	0.12	0.12	0.11	0.10	0.12	0.10	0.12	0.11	0.11	0.11	0.10	0.14	0.20	0.21	0.13	0.13	0.11	0.12	0.10
N1	0.10	0.10	0.10	0.09	0.09	0.10	0.09	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10	0.11	0.17	0.22	0.11	0.11	0.11	0.12	0.10
N3	0.08	0.08	0.10	0.10	0.11	0.09	0.11	0.09	0.09	0.08	0.10	0.13	0.08	0.11	0.25	0.09	0.11	0.12	0.16	0.13
N4	0.08	0.11	0.10	0.10	0.17	0.09	0.15	0.10	0.12	0.10	0.15	0.19	0.08	0.11	0.23	0.10	0.12	0.14	0.19	0.15
O2	0.08	0.08	0.10	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.08	0.08	0.11	0.08	0.12	0.26	0.09	0.10	0.12	0.14	0.11
O2'	0.12	0.11	0.12	0.11	0.14	0.12	0.14	0.14	0.13	0.12	0.12	0.16	0.11	0.17	0.22	0.13	0.17	0.15	0.16	0.14
O3'	0.29	0.31	0.27	0.29	0.37	0.31	0.37	0.35	0.35	0.32	0.34	0.40	0.27	0.28	0.30	0.32	0.38	0.36	0.38	0.36
O4'	0.13	0.12	0.13	0.11	0.11	0.12	0.12	0.12	0.12	0.12	0.11	0.11	0.13	0.22	0.21	0.13	0.13	0.13	0.13	0.11
O5'	0.33	0.33	0.34	0.29	0.33	0.31	0.33	0.29	0.34	0.33	0.33	0.33	0.32	0.46	0.38	0.33	0.26	0.32	0.33	0.31
OP1	0.26	0.26	0.24	0.17	0.33	0.23	0.33	0.23	0.31	0.28	0.28	0.37	0.24	0.37	0.24	0.28	0.20	0.29	0.32	0.30
OP2	0.53	0.53	0.53	0.45	0.56	0.50	0.56	0.48	0.55	0.54	0.53	0.57	0.50	0.66	0.53	0.54	0.43	0.51	0.52	0.51
P	0.32	0.31	0.32	0.25	0.35	0.29	0.35	0.28	0.34	0.33	0.32	0.37	0.30	0.45	0.33	0.33	0.24	0.32	0.34	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.00	0.06	0.09	0.14	0.09
C2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.13	0.03	0.09	0.09	0.12	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.02	0.06	0.05	0.10	0.00	0.03	0.01	0.11	0.14	0.21	0.15
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.07	0.09	0.07	0.02	0.01	0.01	0.04	0.15	0.09	0.07
C4	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.06	0.02	0.14	0.10	0.11	0.09
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.04	0.09	0.01	0.00	0.01	0.09	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.05	0.03	0.15	0.10	0.11	0.09
C5'	0.02	0.04	0.05	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.06	0.09	0.05	0.05	0.07	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.04	0.12	0.10	0.12	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.09	0.09	0.13	0.08
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.11	0.03	0.11	0.10	0.11	0.08
N4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.06	0.03	0.15	0.11	0.11	0.10
O2	0.02	0.00	0.10	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.19	0.05	0.08	0.10	0.13	0.09
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.14	0.09	0.14	0.05	0.12	0.08	0.12	0.15	0.09	0.00	0.06	0.06	0.09	0.13	0.23	0.13
O3'	0.10	0.13	0.03	0.01	0.06	0.01	0.05	0.07	0.05	0.06	0.11	0.06	0.19	0.06	0.00	0.05	0.10	0.27	0.14	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.06	0.05	0.00	0.06	0.08	0.12	0.09
O5'	0.06	0.09	0.11	0.04	0.14	0.01	0.15	0.01	0.12	0.09	0.11	0.15	0.08	0.09	0.10	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.09	0.14	0.15	0.10	0.09	0.10	0.07	0.10	0.09	0.10	0.11	0.10	0.13	0.27	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.12	0.21	0.09	0.11	0.05	0.11	0.02	0.12	0.13	0.11	0.11	0.13	0.23	0.14	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.08	0.15	0.07	0.09	0.03	0.09	0.01	0.08	0.08	0.08	0.10	0.09	0.13	0.14	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00