Doublet Group distance statistics: 54409

back

Distances from reference structure (by RMSD)

6, 14, 12, 8, 6, 4, 2, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.010, 0.033, 0.057, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.033 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.007, 0.040, 0.074, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.040 std_dev=0.034
O4'	A	0, -0.014, 0.091, 0.196, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.091 std_dev=0.105
C2'	A	0, -0.010, 0.103, 0.217, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.103 std_dev=0.114
N4	B	0, 0.099, 0.265, 0.430, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.265 std_dev=0.165
C4	B	0, 0.095, 0.271, 0.447, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.271 std_dev=0.176
C4'	A	0, -0.038, 0.146, 0.330, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.146 std_dev=0.184
C5	B	0, 0.076, 0.276, 0.477, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.276 std_dev=0.201
C3'	A	0, -0.047, 0.163, 0.373, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.163 std_dev=0.210
N3	B	0, 0.093, 0.320, 0.547, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.320 std_dev=0.227
O5'	A	0, 0.006, 0.244, 0.482, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.244 std_dev=0.238
O2'	A	0, -0.065, 0.173, 0.412, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.173 std_dev=0.238
O3'	B	0, 0.111, 0.361, 0.611, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.361 std_dev=0.250
P	A	0, 0.030, 0.286, 0.542, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.286 std_dev=0.256
C5'	A	0, -0.028, 0.231, 0.491, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.231 std_dev=0.260
OP2	A	0, 0.058, 0.318, 0.578, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.318 std_dev=0.260
C2	B	0, 0.080, 0.348, 0.616, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.348 std_dev=0.268
C6	B	0, 0.044, 0.314, 0.584, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.314 std_dev=0.270
N1	B	0, 0.049, 0.336, 0.623, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.336 std_dev=0.287
OP1	A	0, 0.050, 0.347, 0.645, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.347 std_dev=0.298
C3'	B	0, 0.045, 0.357, 0.670, 1.981 max_d=1.981 avg_d=0.357 std_dev=0.313
O4'	B	0, 0.061, 0.388, 0.714, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.388 std_dev=0.326
O2	B	0, 0.083, 0.413, 0.743, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.413 std_dev=0.330
C5'	B	0, 0.053, 0.388, 0.724, 2.442 max_d=2.442 avg_d=0.388 std_dev=0.335
C4'	B	0, 0.044, 0.381, 0.718, 2.229 max_d=2.229 avg_d=0.381 std_dev=0.337
C1'	B	0, 0.026, 0.386, 0.746, 2.234 max_d=2.234 avg_d=0.386 std_dev=0.360
O3'	A	0, -0.136, 0.250, 0.637, 2.461 max_d=2.461 avg_d=0.250 std_dev=0.387
C2'	B	0, -0.026, 0.400, 0.827, 2.836 max_d=2.836 avg_d=0.400 std_dev=0.427
O2'	B	0, -0.067, 0.478, 1.023, 3.584 max_d=3.584 avg_d=0.478 std_dev=0.545
O5'	B	0, -0.131, 0.459, 1.049, 4.131 max_d=4.131 avg_d=0.459 std_dev=0.590
P	B	0, -0.138, 0.485, 1.107, 3.984 max_d=3.984 avg_d=0.485 std_dev=0.623
OP2	B	0, -0.195, 0.524, 1.243, 4.406 max_d=4.406 avg_d=0.524 std_dev=0.719
OP1	B	0, -0.355, 0.601, 1.557, 6.198 max_d=6.198 avg_d=0.601 std_dev=0.956

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.06	0.09	0.15	0.09
C2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.13	0.04	0.09	0.09	0.12	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.11	0.14	0.21	0.15
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.07	0.09	0.07	0.02	0.01	0.01	0.03	0.15	0.08	0.06
C4	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.06	0.03	0.14	0.10	0.11	0.08
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.04	0.09	0.02	0.00	0.01	0.09	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.05	0.03	0.15	0.10	0.11	0.09
C5'	0.02	0.05	0.05	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.06	0.09	0.05	0.05	0.07	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.05	0.03	0.12	0.10	0.12	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.09	0.09	0.13	0.08
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.11	0.04	0.11	0.10	0.12	0.08
N4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.07	0.04	0.15	0.10	0.11	0.09
O2	0.02	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.20	0.06	0.08	0.10	0.13	0.09
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.14	0.09	0.15	0.05	0.13	0.08	0.12	0.15	0.08	0.00	0.06	0.06	0.09	0.12	0.23	0.13
O3'	0.11	0.13	0.02	0.01	0.06	0.02	0.05	0.07	0.05	0.06	0.11	0.07	0.20	0.06	0.00	0.06	0.10	0.27	0.13	0.14
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.06	0.06	0.00	0.06	0.08	0.13	0.09
O5'	0.06	0.09	0.11	0.03	0.14	0.01	0.15	0.01	0.12	0.09	0.11	0.15	0.08	0.09	0.10	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.09	0.14	0.15	0.10	0.09	0.10	0.07	0.10	0.09	0.10	0.10	0.10	0.12	0.27	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.12	0.21	0.08	0.11	0.05	0.11	0.02	0.12	0.13	0.12	0.11	0.13	0.23	0.13	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.08	0.15	0.06	0.08	0.03	0.09	0.01	0.08	0.08	0.08	0.09	0.09	0.13	0.14	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.09	0.17	0.06	0.08	0.11	0.12	0.17	0.14	0.12	0.08	0.08	0.09	0.27	0.06	0.11	0.30	0.25	0.61	0.31
C2	0.14	0.11	0.18	0.06	0.10	0.11	0.13	0.17	0.15	0.14	0.10	0.10	0.11	0.27	0.07	0.12	0.30	0.26	0.58	0.31
C2'	0.16	0.14	0.20	0.08	0.14	0.14	0.17	0.21	0.17	0.16	0.13	0.13	0.14	0.28	0.09	0.14	0.29	0.21	0.60	0.30
C3'	0.20	0.17	0.23	0.10	0.15	0.19	0.19	0.26	0.21	0.19	0.15	0.13	0.17	0.31	0.10	0.19	0.28	0.17	0.58	0.26
C4	0.21	0.16	0.26	0.10	0.12	0.17	0.15	0.23	0.20	0.19	0.13	0.12	0.17	0.32	0.08	0.18	0.35	0.36	0.64	0.38
C4'	0.14	0.11	0.18	0.06	0.10	0.13	0.13	0.21	0.15	0.14	0.10	0.09	0.11	0.27	0.06	0.14	0.30	0.25	0.62	0.31
C5	0.21	0.15	0.26	0.11	0.12	0.18	0.15	0.24	0.19	0.19	0.12	0.11	0.16	0.33	0.09	0.18	0.37	0.38	0.67	0.39
C5'	0.15	0.11	0.20	0.09	0.09	0.15	0.13	0.22	0.16	0.14	0.10	0.10	0.11	0.28	0.10	0.15	0.31	0.28	0.62	0.32
C6	0.18	0.13	0.24	0.09	0.10	0.16	0.14	0.22	0.18	0.17	0.11	0.10	0.13	0.32	0.08	0.16	0.35	0.33	0.65	0.37
N1	0.15	0.11	0.20	0.07	0.09	0.13	0.13	0.19	0.16	0.14	0.09	0.09	0.11	0.29	0.07	0.13	0.32	0.28	0.62	0.33
N3	0.17	0.14	0.21	0.07	0.11	0.13	0.14	0.18	0.17	0.16	0.12	0.12	0.14	0.28	0.07	0.14	0.31	0.29	0.59	0.33
N4	0.24	0.19	0.29	0.13	0.14	0.21	0.15	0.26	0.22	0.22	0.16	0.13	0.21	0.34	0.10	0.22	0.39	0.42	0.66	0.41
O2	0.12	0.09	0.14	0.08	0.09	0.09	0.12	0.14	0.13	0.11	0.08	0.08	0.09	0.24	0.07	0.11	0.28	0.23	0.54	0.29
O2'	0.18	0.13	0.18	0.16	0.13	0.20	0.18	0.26	0.20	0.17	0.11	0.11	0.12	0.27	0.16	0.20	0.41	0.35	0.70	0.43
O3'	0.29	0.29	0.30	0.20	0.27	0.27	0.27	0.31	0.29	0.29	0.29	0.26	0.30	0.37	0.19	0.28	0.38	0.23	0.66	0.35
O4'	0.12	0.09	0.16	0.06	0.08	0.10	0.10	0.17	0.13	0.11	0.09	0.10	0.09	0.26	0.08	0.11	0.32	0.29	0.63	0.34
O5'	0.20	0.14	0.26	0.15	0.12	0.20	0.16	0.27	0.19	0.18	0.12	0.11	0.14	0.33	0.16	0.19	0.31	0.28	0.61	0.31
OP1	0.20	0.16	0.26	0.13	0.13	0.21	0.16	0.29	0.19	0.18	0.14	0.13	0.16	0.32	0.11	0.20	0.39	0.39	0.69	0.41
OP2	0.24	0.20	0.29	0.15	0.17	0.24	0.18	0.30	0.22	0.22	0.18	0.17	0.20	0.35	0.11	0.23	0.43	0.44	0.71	0.44
P	0.20	0.15	0.25	0.11	0.13	0.20	0.15	0.27	0.19	0.18	0.13	0.13	0.15	0.32	0.10	0.19	0.39	0.40	0.68	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.00	0.07	0.08	0.08	0.05
C2	0.01	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.10	0.05	0.17	0.16	0.26	0.15
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.06	0.01	0.05	0.03	0.11	0.00	0.02	0.01	0.12	0.17	0.10	0.11
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.01	0.13	0.07	0.10	0.13	0.09	0.02	0.00	0.01	0.15	0.25	0.07	0.12
C4	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.07	0.02	0.26	0.23	0.41	0.25
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.05	0.10	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.03	0.27	0.24	0.40	0.26
C5'	0.04	0.08	0.08	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.08	0.06	0.09	0.10	0.08	0.05	0.08	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.05	0.23	0.19	0.29	0.20
N1	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.16	0.14	0.21	0.13
N3	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.04	0.22	0.20	0.34	0.20
N4	0.01	0.01	0.03	0.13	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.09	0.02	0.28	0.26	0.47	0.28
O2	0.02	0.00	0.11	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.19	0.08	0.14	0.15	0.21	0.12
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.10	0.10	0.11	0.05	0.10	0.06	0.09	0.11	0.12	0.00	0.03	0.08	0.07	0.12	0.09	0.07
O3'	0.10	0.10	0.02	0.00	0.07	0.01	0.11	0.08	0.10	0.05	0.08	0.09	0.19	0.03	0.00	0.08	0.11	0.29	0.16	0.11
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.08	0.08	0.08	0.00	0.11	0.13	0.05	0.08
O5'	0.07	0.17	0.12	0.15	0.26	0.01	0.27	0.01	0.23	0.16	0.22	0.28	0.14	0.07	0.11	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.16	0.17	0.25	0.23	0.08	0.24	0.11	0.19	0.14	0.20	0.26	0.15	0.12	0.29	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.26	0.10	0.07	0.41	0.09	0.40	0.12	0.29	0.21	0.34	0.47	0.21	0.09	0.16	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.15	0.11	0.12	0.25	0.02	0.26	0.01	0.20	0.13	0.20	0.28	0.12	0.07	0.11	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00