Doublet Group distance statistics: 54411

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N4	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.024 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.005, 0.024, 0.044, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.024 std_dev=0.019
O2'	A	0, 0.009, 0.129, 0.249, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.129 std_dev=0.120
C2'	A	0, -0.026, 0.113, 0.252, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.113 std_dev=0.139
O4'	A	0, -0.018, 0.128, 0.275, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.128 std_dev=0.147
C4'	A	0, -0.065, 0.167, 0.400, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.167 std_dev=0.233
C3'	A	0, -0.058, 0.181, 0.419, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.181 std_dev=0.238
O5'	A	0, 0.100, 0.350, 0.599, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.350 std_dev=0.250
O3'	A	0, -0.050, 0.272, 0.593, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.272 std_dev=0.321
P	A	0, 0.094, 0.445, 0.796, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.445 std_dev=0.351
C5'	A	0, -0.066, 0.291, 0.649, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.291 std_dev=0.357
OP2	A	0, 0.110, 0.498, 0.886, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.498 std_dev=0.388
OP1	A	0, 0.085, 0.527, 0.968, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.527 std_dev=0.441
O2	B	0, 0.070, 0.552, 1.033, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.552 std_dev=0.481
N3	B	0, 0.118, 0.609, 1.099, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.609 std_dev=0.490
C2	B	0, 0.097, 0.588, 1.078, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.588 std_dev=0.491
N1	B	0, 0.136, 0.650, 1.165, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.650 std_dev=0.515
C4	B	0, 0.165, 0.682, 1.199, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.682 std_dev=0.517
C1'	B	0, 0.106, 0.626, 1.147, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.626 std_dev=0.520
C2'	B	0, 0.122, 0.645, 1.168, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.645 std_dev=0.523
N4	B	0, 0.180, 0.712, 1.245, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.712 std_dev=0.532
C6	B	0, 0.207, 0.754, 1.300, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.754 std_dev=0.547
C5	B	0, 0.219, 0.767, 1.316, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.767 std_dev=0.549
O2'	B	0, 0.106, 0.788, 1.471, 1.758 max_d=1.758 avg_d=0.788 std_dev=0.683
O4'	B	0, 0.071, 0.817, 1.564, 1.862 max_d=1.862 avg_d=0.817 std_dev=0.746
C4'	B	0, 0.054, 0.826, 1.599, 1.844 max_d=1.844 avg_d=0.826 std_dev=0.773
C3'	B	0, 0.110, 0.915, 1.719, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.915 std_dev=0.804
O3'	B	0, 0.159, 1.147, 2.134, 2.206 max_d=2.206 avg_d=1.147 std_dev=0.987
C5'	B	0, 0.041, 1.186, 2.331, 2.597 max_d=2.597 avg_d=1.186 std_dev=1.145
O5'	B	0, 0.087, 1.306, 2.526, 2.529 max_d=2.529 avg_d=1.306 std_dev=1.219
P	B	0, 0.138, 1.476, 2.814, 2.825 max_d=2.825 avg_d=1.476 std_dev=1.338
OP2	B	0, 0.149, 1.612, 3.075, 3.078 max_d=3.078 avg_d=1.612 std_dev=1.463
OP1	B	0, 0.175, 1.691, 3.207, 3.374 max_d=3.374 avg_d=1.691 std_dev=1.516

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.03	0.02
C2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.02	0.08	0.08	0.08	0.07
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.04	0.14	0.01	0.02	0.01	0.05	0.14	0.13	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.09	0.07	0.13	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.13	0.09
C4	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04	0.10	0.11	0.11	0.11
C4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.05	0.05	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.06	0.09	0.10	0.09	0.10
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.00	0.04	0.03	0.05	0.07	0.04	0.05	0.03	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.07	0.07	0.07	0.04	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.05
N3	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.09	0.10	0.11	0.09
N4	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.05	0.11	0.13	0.14	0.13
O2	0.04	0.00	0.14	0.13	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.15	0.01	0.07	0.08	0.08	0.07
O2'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.03	0.01	0.06	0.03	0.11	0.00	0.01	0.05	0.03	0.11	0.10	0.05
O3'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.07	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.10	0.08	0.15	0.01	0.00	0.02	0.04	0.21	0.16	0.12
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.03	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.04	0.05	0.07
O5'	0.04	0.08	0.05	0.03	0.10	0.01	0.09	0.01	0.07	0.06	0.09	0.11	0.07	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.08	0.14	0.16	0.11	0.07	0.10	0.04	0.07	0.07	0.10	0.13	0.08	0.11	0.21	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.08	0.13	0.13	0.11	0.03	0.09	0.02	0.04	0.04	0.11	0.14	0.08	0.10	0.16	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.07	0.07	0.09	0.11	0.01	0.10	0.02	0.07	0.05	0.09	0.13	0.07	0.05	0.12	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.13	0.33	0.61	0.15	0.46	0.26	0.59	0.28	0.22	0.10	0.10	0.10	0.35	0.71	0.30	0.46	0.20	0.26	0.24
C2	0.23	0.09	0.34	0.64	0.08	0.48	0.23	0.61	0.27	0.19	0.06	0.12	0.07	0.31	0.75	0.28	0.46	0.17	0.27	0.23
C2'	0.24	0.16	0.33	0.59	0.16	0.47	0.26	0.64	0.28	0.22	0.14	0.13	0.13	0.35	0.67	0.33	0.54	0.33	0.32	0.35
C3'	0.22	0.14	0.32	0.59	0.14	0.44	0.22	0.61	0.24	0.20	0.12	0.12	0.12	0.35	0.70	0.29	0.49	0.25	0.28	0.29
C4	0.16	0.09	0.35	0.67	0.18	0.44	0.08	0.57	0.13	0.09	0.17	0.31	0.09	0.33	0.87	0.19	0.34	0.06	0.26	0.12
C4'	0.24	0.14	0.35	0.62	0.15	0.45	0.25	0.58	0.27	0.21	0.10	0.10	0.10	0.35	0.75	0.29	0.44	0.17	0.24	0.22
C5	0.17	0.09	0.37	0.66	0.14	0.43	0.10	0.55	0.14	0.11	0.14	0.25	0.09	0.36	0.88	0.19	0.33	0.08	0.26	0.12
C5'	0.24	0.13	0.37	0.66	0.13	0.46	0.23	0.58	0.26	0.21	0.10	0.09	0.10	0.37	0.83	0.28	0.41	0.12	0.24	0.18
C6	0.20	0.09	0.37	0.66	0.10	0.45	0.15	0.57	0.20	0.15	0.10	0.17	0.08	0.36	0.84	0.23	0.38	0.05	0.26	0.16
N1	0.22	0.10	0.35	0.64	0.09	0.46	0.21	0.59	0.25	0.18	0.08	0.11	0.08	0.34	0.77	0.27	0.43	0.13	0.26	0.21
N3	0.19	0.06	0.34	0.66	0.11	0.47	0.13	0.61	0.20	0.14	0.12	0.27	0.06	0.31	0.80	0.24	0.41	0.09	0.26	0.18
N4	0.11	0.14	0.34	0.67	0.26	0.41	0.16	0.54	0.07	0.07	0.23	0.38	0.13	0.32	0.91	0.14	0.26	0.18	0.26	0.11
O2	0.26	0.14	0.32	0.62	0.16	0.49	0.33	0.63	0.33	0.25	0.09	0.06	0.10	0.28	0.67	0.33	0.51	0.27	0.29	0.29
O2'	0.29	0.21	0.33	0.58	0.24	0.50	0.33	0.66	0.34	0.28	0.18	0.20	0.17	0.36	0.63	0.38	0.60	0.43	0.35	0.42
O3'	0.21	0.15	0.30	0.56	0.15	0.43	0.22	0.61	0.23	0.19	0.13	0.13	0.13	0.34	0.65	0.28	0.50	0.28	0.31	0.32
O4'	0.24	0.13	0.35	0.62	0.14	0.45	0.25	0.56	0.28	0.22	0.10	0.09	0.10	0.36	0.76	0.28	0.41	0.12	0.23	0.17
O5'	0.27	0.16	0.42	0.70	0.15	0.49	0.23	0.60	0.27	0.23	0.13	0.13	0.14	0.41	0.89	0.31	0.42	0.12	0.23	0.19
OP1	0.26	0.16	0.40	0.66	0.15	0.46	0.21	0.56	0.25	0.21	0.13	0.14	0.14	0.41	0.87	0.31	0.39	0.14	0.19	0.16
OP2	0.25	0.16	0.41	0.65	0.16	0.44	0.18	0.53	0.22	0.20	0.16	0.20	0.15	0.42	0.88	0.30	0.36	0.14	0.17	0.14
P	0.24	0.14	0.39	0.64	0.14	0.44	0.19	0.53	0.22	0.19	0.14	0.17	0.13	0.41	0.87	0.28	0.35	0.12	0.19	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.04	0.07	0.15	0.15
C2	0.02	0.00	0.14	0.06	0.00	0.01	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.34	0.11	0.05	0.05	0.02	0.22	0.13
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.09	0.02	0.12	0.03	0.13	0.06	0.12	0.09	0.24	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.13	0.11
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.19	0.00	0.29	0.02	0.29	0.12	0.09	0.21	0.16	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.08	0.05
C4	0.02	0.00	0.09	0.19	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.17	0.05	0.07	0.15	0.35	0.23
C4'	0.03	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.12	0.04	0.03	0.10	0.07	0.17	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.05
C5	0.02	0.00	0.12	0.29	0.00	0.13	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.32	0.07	0.08	0.25	0.38	0.29
C5'	0.03	0.10	0.03	0.02	0.21	0.01	0.25	0.00	0.21	0.12	0.16	0.24	0.05	0.13	0.04	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.13	0.29	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.30	0.08	0.07	0.23	0.32	0.27
N1	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.06	0.04	0.02	0.10	0.23	0.18
N3	0.02	0.00	0.12	0.09	0.00	0.03	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.03	0.05	0.06	0.05	0.28	0.16
N4	0.02	0.01	0.09	0.21	0.00	0.10	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.29	0.21	0.05	0.08	0.16	0.39	0.24
O2	0.03	0.00	0.24	0.16	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.45	0.31	0.07	0.08	0.08	0.16	0.09
O2'	0.01	0.34	0.00	0.01	0.28	0.17	0.18	0.13	0.13	0.16	0.35	0.29	0.45	0.00	0.06	0.15	0.22	0.26	0.18	0.14
O3'	0.07	0.11	0.02	0.01	0.17	0.01	0.32	0.04	0.30	0.06	0.03	0.21	0.31	0.06	0.00	0.03	0.06	0.07	0.20	0.08
O4'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.04	0.05	0.05	0.07	0.15	0.03	0.00	0.04	0.06	0.16	0.15
O5'	0.04	0.05	0.01	0.04	0.07	0.02	0.08	0.01	0.07	0.02	0.06	0.08	0.08	0.22	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.02	0.03	0.03	0.15	0.04	0.25	0.01	0.23	0.10	0.05	0.16	0.08	0.26	0.07	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.22	0.13	0.08	0.35	0.05	0.38	0.06	0.32	0.23	0.28	0.39	0.16	0.18	0.20	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.13	0.11	0.05	0.23	0.05	0.29	0.02	0.27	0.18	0.16	0.24	0.09	0.14	0.08	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00