Doublet Group distance statistics: 54419

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.000, 0.001, 0.002, 0.002 max_d=0.002 avg_d=0.001 std_dev=0.001
C2	A	0, 0.001, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.005, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N9	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.000, 0.004, 0.007, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C8	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N7	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N3	A	0, -0.001, 0.005, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.005 std_dev=0.006
N2	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.007
O6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.008
O4'	A	0, 0.036, 0.262, 0.488, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.262 std_dev=0.226
C2'	A	0, 0.013, 0.301, 0.589, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.301 std_dev=0.288
C4	B	0, 0.053, 0.393, 0.732, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.393 std_dev=0.340
N3	B	0, 0.110, 0.458, 0.806, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.458 std_dev=0.348
C5'	A	0, 0.133, 0.485, 0.838, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.485 std_dev=0.352
O5'	A	0, 0.135, 0.502, 0.869, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.502 std_dev=0.367
C4'	A	0, 0.027, 0.431, 0.835, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.431 std_dev=0.404
O4	B	0, 0.164, 0.570, 0.976, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.570 std_dev=0.406
C5	B	0, 0.154, 0.567, 0.980, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.567 std_dev=0.413
OP1	A	0, 0.129, 0.623, 1.118, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.623 std_dev=0.495
P	A	0, 0.071, 0.591, 1.112, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.591 std_dev=0.520
C3'	A	0, -0.062, 0.506, 1.075, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.506 std_dev=0.568
C2	B	0, 0.149, 0.721, 1.293, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.721 std_dev=0.572
O2'	A	0, -0.024, 0.607, 1.239, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.607 std_dev=0.632
O2	B	0, 0.142, 0.811, 1.479, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.811 std_dev=0.669
C6	B	0, 0.072, 0.822, 1.572, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.822 std_dev=0.750
N1	B	0, 0.046, 0.905, 1.765, 2.060 max_d=2.060 avg_d=0.905 std_dev=0.859
O3'	A	0, -0.322, 0.895, 2.111, 2.614 max_d=2.614 avg_d=0.895 std_dev=1.216
C1'	B	0, -0.142, 1.200, 2.541, 3.073 max_d=3.073 avg_d=1.200 std_dev=1.342
C2'	B	0, -0.121, 1.509, 3.140, 3.773 max_d=3.773 avg_d=1.509 std_dev=1.630
O2'	B	0, -0.193, 1.537, 3.267, 3.955 max_d=3.955 avg_d=1.537 std_dev=1.730
OP2	A	0, -0.334, 1.424, 3.182, 3.900 max_d=3.900 avg_d=1.424 std_dev=1.758
O4'	B	0, -0.378, 1.648, 3.674, 4.501 max_d=4.501 avg_d=1.648 std_dev=2.026
C3'	B	0, -0.294, 2.009, 4.312, 5.233 max_d=5.233 avg_d=2.009 std_dev=2.303
C4'	B	0, -0.456, 2.091, 4.639, 5.678 max_d=5.678 avg_d=2.091 std_dev=2.548
OP2	B	0, -0.304, 2.326, 4.956, 6.003 max_d=6.003 avg_d=2.326 std_dev=2.630
O5'	B	0, -0.250, 2.405, 5.060, 6.105 max_d=6.105 avg_d=2.405 std_dev=2.655
O3'	B	0, -0.470, 2.417, 5.304, 6.475 max_d=6.475 avg_d=2.417 std_dev=2.887
C5'	B	0, -0.331, 2.662, 5.655, 6.843 max_d=6.843 avg_d=2.662 std_dev=2.993
P	B	0, -0.626, 2.540, 5.705, 7.003 max_d=7.003 avg_d=2.540 std_dev=3.166
OP1	B	0, -1.112, 3.189, 7.490, 9.269 max_d=9.269 avg_d=3.189 std_dev=4.301

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.32	0.00	0.08	0.01	0.19	0.04	0.18
C2	0.00	0.00	0.18	0.05	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.41	0.20	0.07	0.01	0.26	0.38	0.06
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.00	0.04	0.18	0.08	0.10	0.14	0.21	0.17	0.05	0.01	0.00	0.06	0.02	0.36	0.05	0.52	0.48	0.62
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.14	0.00	0.23	0.02	0.21	0.30	0.13	0.01	0.03	0.31	0.17	0.00	0.01	0.02	0.05	0.25	0.11	0.41	0.33
C4	0.00	0.00	0.09	0.14	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.22	0.11	0.03	0.01	0.26	0.44	0.06
C4'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.14	0.09	0.19	0.13	0.11	0.04	0.26	0.04	0.00	0.02	0.01	0.19	0.38	0.12
C5	0.00	0.00	0.04	0.23	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.05	0.07	0.06	0.01	0.30	0.74	0.15
C5'	0.05	0.18	0.18	0.02	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.07	0.15	0.23	0.17	0.04	0.04	0.09	0.19	0.01	0.00	0.07	0.31	0.45	0.02
C6	0.00	0.01	0.08	0.21	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.11	0.11	0.05	0.00	0.31	0.81	0.18
C8	0.00	0.00	0.10	0.30	0.00	0.14	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.15	0.08	0.11	0.01	0.28	0.71	0.14
N1	0.00	0.00	0.14	0.13	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.27	0.16	0.04	0.01	0.29	0.61	0.11
N2	0.00	0.00	0.21	0.01	0.01	0.19	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.54	0.23	0.10	0.01	0.25	0.26	0.07
N3	0.00	0.00	0.17	0.03	0.00	0.13	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.43	0.19	0.07	0.01	0.24	0.25	0.07
N7	0.00	0.00	0.05	0.31	0.00	0.11	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.33	0.15	0.03	0.12	0.01	0.31	0.93	0.22
N9	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.12	0.02	0.01	0.01	0.25	0.36	0.05
O2'	0.03	0.11	0.00	0.00	0.07	0.26	0.20	0.09	0.16	0.34	0.05	0.21	0.13	0.33	0.15	0.00	0.10	0.18	0.26	0.22	0.48	0.53	0.60
O3'	0.32	0.41	0.06	0.01	0.22	0.04	0.05	0.19	0.11	0.15	0.27	0.54	0.43	0.15	0.12	0.10	0.00	0.22	0.26	0.03	0.56	0.24	0.10
O4'	0.00	0.20	0.02	0.02	0.11	0.00	0.07	0.01	0.11	0.08	0.16	0.23	0.19	0.03	0.02	0.18	0.22	0.00	0.07	0.09	0.10	0.03	0.08
O5'	0.08	0.07	0.36	0.05	0.03	0.02	0.06	0.00	0.05	0.11	0.04	0.10	0.07	0.12	0.01	0.26	0.26	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.25	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.03	0.09	0.08	0.00	0.33	0.99	0.25
OP1	0.19	0.26	0.52	0.11	0.26	0.19	0.30	0.31	0.31	0.28	0.29	0.25	0.24	0.31	0.25	0.48	0.56	0.10	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.38	0.48	0.41	0.44	0.38	0.74	0.45	0.81	0.71	0.61	0.26	0.25	0.93	0.36	0.53	0.24	0.03	0.01	0.99	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.06	0.62	0.33	0.06	0.12	0.15	0.02	0.18	0.14	0.11	0.07	0.07	0.22	0.05	0.60	0.10	0.08	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.56	0.46	0.36	0.45	0.03	0.72	0.11	0.77	0.29	0.44	0.28	0.57	0.43	0.39	0.27	0.81	1.10	1.59	1.06	1.42
C2	0.20	0.14	0.18	0.24	0.22	0.15	0.18	0.19	0.12	0.13	0.14	0.25	0.09	0.35	0.32	0.37	0.43	0.78	0.30	0.67
C2'	0.67	0.63	0.54	0.59	0.36	0.76	0.34	0.76	0.47	0.60	0.53	0.70	0.58	0.54	0.17	0.83	1.17	1.54	1.14	1.42
C3'	0.25	0.25	0.19	0.27	0.14	0.41	0.13	0.48	0.04	0.17	0.19	0.35	0.21	0.26	0.28	0.42	0.82	1.32	0.90	1.13
C4	0.41	0.32	0.07	0.09	0.13	0.44	0.11	0.46	0.16	0.29	0.14	0.46	0.21	0.05	0.32	0.64	0.77	1.23	0.66	1.07
C4'	0.41	0.26	0.33	0.56	0.07	0.78	0.04	0.96	0.19	0.29	0.12	0.34	0.32	0.56	0.28	0.73	1.24	1.96	1.42	1.68
C5	0.38	0.27	0.02	0.07	0.14	0.40	0.12	0.43	0.13	0.25	0.11	0.41	0.14	0.17	0.31	0.63	0.74	1.23	0.63	1.06
C5'	0.52	0.29	0.42	0.71	0.06	0.99	0.06	1.23	0.25	0.36	0.11	0.37	0.41	0.71	0.29	0.91	1.46	2.33	1.66	1.95
C6	0.27	0.18	0.17	0.22	0.19	0.25	0.16	0.28	0.11	0.16	0.11	0.30	0.08	0.38	0.32	0.51	0.56	1.02	0.45	0.87
C8	0.51	0.38	0.19	0.24	0.05	0.63	0.07	0.68	0.21	0.37	0.19	0.53	0.30	0.13	0.28	0.80	1.01	1.57	0.94	1.36
N1	0.18	0.12	0.25	0.32	0.22	0.14	0.18	0.20	0.12	0.12	0.14	0.21	0.12	0.47	0.32	0.38	0.42	0.81	0.30	0.69
N2	0.05	0.12	0.32	0.39	0.25	0.11	0.21	0.22	0.15	0.10	0.23	0.05	0.18	0.49	0.30	0.17	0.22	0.49	0.15	0.42
N3	0.33	0.27	0.02	0.06	0.17	0.32	0.14	0.32	0.14	0.24	0.11	0.41	0.16	0.10	0.34	0.52	0.63	1.00	0.49	0.88
N7	0.45	0.32	0.07	0.10	0.10	0.52	0.09	0.56	0.16	0.30	0.14	0.47	0.21	0.06	0.29	0.73	0.89	1.44	0.80	1.24
N9	0.50	0.40	0.21	0.26	0.06	0.60	0.08	0.64	0.22	0.37	0.20	0.53	0.32	0.17	0.30	0.76	0.97	1.48	0.89	1.29
O2'	0.91	0.84	0.79	0.82	0.64	0.96	0.67	0.93	0.78	0.86	0.74	0.85	0.83	0.76	0.40	1.04	1.41	1.65	1.33	1.60
O3'	0.51	0.50	0.52	0.40	0.70	0.33	0.77	0.27	0.68	0.57	0.55	0.41	0.54	0.39	0.76	0.37	0.23	0.63	0.32	0.45
O4'	0.50	0.30	0.33	0.54	0.11	0.84	0.08	1.00	0.23	0.35	0.08	0.39	0.36	0.51	0.38	0.86	1.26	1.97	1.34	1.69
O5'	0.56	0.36	0.40	0.62	0.10	0.94	0.01	1.12	0.22	0.38	0.16	0.48	0.44	0.59	0.34	0.92	1.35	2.16	1.45	1.80
O6	0.24	0.15	0.24	0.30	0.20	0.22	0.17	0.26	0.11	0.14	0.12	0.26	0.10	0.48	0.32	0.49	0.53	1.01	0.42	0.85
OP1	0.68	0.38	0.52	0.79	0.06	1.16	0.11	1.42	0.33	0.46	0.13	0.49	0.56	0.78	0.34	1.11	1.65	2.60	1.79	2.14
OP2	0.34	0.28	0.22	0.35	0.30	0.61	0.38	0.71	0.15	0.15	0.11	0.53	0.30	0.34	0.51	0.61	0.81	1.54	0.79	1.16
P	0.54	0.32	0.39	0.59	0.22	0.93	0.19	1.10	0.12	0.32	0.07	0.51	0.47	0.57	0.50	0.91	1.26	2.10	1.29	1.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.13	0.30	0.11	0.21
C2	0.02	0.00	0.19	0.19	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.21	0.00	0.11	0.32	0.53	0.15	0.47
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.04	0.21	0.01	0.13	0.35	0.00	0.03	0.01	0.00	0.25	0.30	0.05	0.25
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.04	0.16	0.03	0.16	0.29	0.01	0.00	0.07	0.00	0.34	0.30	0.06	0.25
C4	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.38	0.42	0.16	0.42
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.09	0.00	0.01	0.19	0.28	0.05
C5	0.00	0.00	0.16	0.10	0.00	0.09	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.15	0.00	0.15	0.33	0.25	0.04	0.27
C5'	0.05	0.10	0.04	0.04	0.21	0.01	0.26	0.00	0.24	0.13	0.15	0.06	0.02	0.05	0.22	0.02	0.00	0.23	0.42	0.01
C6	0.01	0.00	0.21	0.16	0.00	0.08	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.20	0.00	0.19	0.29	0.22	0.07	0.21
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.27	0.37	0.04	0.32
N3	0.01	0.00	0.13	0.16	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.19	0.00	0.07	0.37	0.54	0.20	0.51
O2	0.03	0.00	0.35	0.29	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.35	0.00	0.20	0.31	0.62	0.18	0.52
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.04	0.01	0.14	0.02	0.16	0.03	0.07	0.25	0.00	0.03	0.03	0.01	0.06	0.17	0.14	0.10
O3'	0.02	0.21	0.03	0.00	0.05	0.01	0.15	0.05	0.20	0.02	0.19	0.35	0.03	0.00	0.07	0.00	0.28	0.21	0.09	0.16
O4	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.40	0.44	0.22	0.45
O4'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.15	0.02	0.19	0.03	0.07	0.20	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.26	0.25	0.11
O5'	0.13	0.32	0.25	0.34	0.38	0.01	0.33	0.00	0.29	0.27	0.37	0.31	0.06	0.28	0.40	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.30	0.53	0.30	0.30	0.42	0.19	0.25	0.23	0.22	0.37	0.54	0.62	0.17	0.21	0.44	0.26	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.15	0.05	0.06	0.16	0.28	0.04	0.42	0.07	0.04	0.20	0.18	0.14	0.09	0.22	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.47	0.25	0.25	0.42	0.05	0.27	0.01	0.21	0.32	0.51	0.52	0.10	0.16	0.45	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00