Doublet Group distance statistics: 54420

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.005, 0.022, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.007, 0.028, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.009, 0.034, 0.058, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.011, 0.039, 0.066, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.039 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.018, 0.063, 0.107, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.063 std_dev=0.044
O4'	A	0, 0.188, 0.649, 1.109, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.649 std_dev=0.460
C2	B	0, 0.157, 0.631, 1.104, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.631 std_dev=0.473
OP1	A	0, 0.186, 0.662, 1.138, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.662 std_dev=0.476
N3	B	0, 0.181, 0.666, 1.151, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.666 std_dev=0.485
C5	B	0, 0.187, 0.681, 1.175, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.681 std_dev=0.494
O2	B	0, 0.166, 0.660, 1.155, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.660 std_dev=0.495
C6	B	0, 0.161, 0.660, 1.160, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.660 std_dev=0.500
C4	B	0, 0.201, 0.712, 1.224, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.712 std_dev=0.512
N1	B	0, 0.156, 0.671, 1.185, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.671 std_dev=0.515
C2'	A	0, 0.213, 0.732, 1.251, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.732 std_dev=0.519
P	A	0, 0.196, 0.758, 1.320, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.758 std_dev=0.562
O4	B	0, 0.237, 0.825, 1.412, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.825 std_dev=0.588
C1'	B	0, 0.169, 0.768, 1.366, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.768 std_dev=0.599
O4'	B	0, 0.217, 0.910, 1.603, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.910 std_dev=0.693
OP2	A	0, 0.196, 0.895, 1.594, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.895 std_dev=0.699
C4'	A	0, 0.330, 1.139, 1.948, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.139 std_dev=0.809
C2'	B	0, 0.268, 1.078, 1.888, 1.951 max_d=1.951 avg_d=1.078 std_dev=0.810
O2'	B	0, 0.283, 1.117, 1.951, 2.003 max_d=2.003 avg_d=1.117 std_dev=0.834
C3'	A	0, 0.357, 1.222, 2.086, 1.870 max_d=1.870 avg_d=1.222 std_dev=0.864
O3'	B	0, 0.290, 1.155, 2.021, 2.084 max_d=2.084 avg_d=1.155 std_dev=0.866
O2'	A	0, 0.361, 1.235, 2.110, 1.906 max_d=1.906 avg_d=1.235 std_dev=0.874
O5'	A	0, 0.263, 1.162, 2.060, 2.188 max_d=2.188 avg_d=1.162 std_dev=0.898
C4'	B	0, 0.321, 1.260, 2.199, 2.253 max_d=2.253 avg_d=1.260 std_dev=0.939
C3'	B	0, 0.332, 1.301, 2.269, 2.323 max_d=2.323 avg_d=1.301 std_dev=0.968
C5'	A	0, 0.398, 1.407, 2.416, 2.319 max_d=2.319 avg_d=1.407 std_dev=1.009
O5'	B	0, 0.306, 1.331, 2.356, 2.493 max_d=2.493 avg_d=1.331 std_dev=1.025
C5'	B	0, 0.382, 1.499, 2.617, 2.683 max_d=2.683 avg_d=1.499 std_dev=1.118
O3'	A	0, 0.555, 1.897, 3.240, 2.888 max_d=2.888 avg_d=1.897 std_dev=1.342
P	B	0, 0.472, 1.870, 3.268, 3.359 max_d=3.359 avg_d=1.870 std_dev=1.398
OP1	B	0, 0.566, 2.012, 3.459, 3.337 max_d=3.337 avg_d=2.012 std_dev=1.447
OP2	B	0, 0.958, 3.414, 5.870, 5.673 max_d=5.673 avg_d=3.414 std_dev=2.456

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.00	0.19	0.02	0.05	0.51	0.09
C2	0.01	0.00	0.20	0.19	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.09	0.34	0.01	0.10	0.38	0.10
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.05	0.11	0.09	0.09	0.15	0.25	0.20	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.24	0.07	0.29	0.70	0.35
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.20	0.00	0.25	0.00	0.26	0.23	0.23	0.16	0.15	0.27	0.18	0.02	0.00	0.02	0.13	0.29	0.09	0.48	0.21
C4	0.01	0.00	0.11	0.20	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.02	0.05	0.38	0.02	0.10	0.39	0.10
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.07	0.14	0.03	0.03	0.02	0.13	0.06	0.21	0.02	0.00	0.01	0.09	0.21	0.37	0.07
C5	0.01	0.00	0.05	0.25	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.12	0.02	0.48	0.02	0.14	0.31	0.16
C5'	0.04	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.09	0.16	0.04	0.03	0.02	0.16	0.07	0.10	0.11	0.01	0.00	0.13	0.33	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.26	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.12	0.04	0.49	0.01	0.14	0.28	0.18
C8	0.01	0.01	0.09	0.23	0.01	0.14	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.15	0.07	0.50	0.02	0.13	0.35	0.15
N1	0.01	0.00	0.15	0.23	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.05	0.07	0.42	0.01	0.12	0.32	0.14
N2	0.03	0.00	0.25	0.16	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.10	0.30	0.01	0.10	0.40	0.09
N3	0.01	0.00	0.20	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.09	0.30	0.02	0.09	0.42	0.08
N7	0.01	0.00	0.04	0.27	0.00	0.13	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.19	0.04	0.54	0.02	0.16	0.27	0.20
N9	0.00	0.00	0.02	0.18	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.03	0.01	0.36	0.02	0.09	0.43	0.08
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.11	0.21	0.20	0.10	0.19	0.24	0.11	0.08	0.03	0.26	0.13	0.00	0.01	0.15	0.15	0.22	0.22	0.72	0.31
O3'	0.17	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.11	0.12	0.15	0.05	0.09	0.09	0.19	0.03	0.01	0.00	0.12	0.18	0.17	0.09	0.47	0.20
O4'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.07	0.10	0.09	0.04	0.01	0.15	0.12	0.00	0.21	0.04	0.23	0.42	0.12
O5'	0.19	0.34	0.24	0.13	0.38	0.01	0.48	0.00	0.49	0.50	0.42	0.30	0.30	0.54	0.36	0.15	0.18	0.21	0.00	0.54	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.29	0.02	0.09	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.22	0.17	0.04	0.54	0.00	0.17	0.22	0.22
OP1	0.05	0.10	0.29	0.09	0.10	0.21	0.14	0.33	0.14	0.13	0.12	0.10	0.09	0.16	0.09	0.22	0.09	0.23	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.51	0.38	0.70	0.48	0.39	0.37	0.31	0.20	0.28	0.35	0.32	0.40	0.42	0.27	0.43	0.72	0.47	0.42	0.02	0.22	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.10	0.35	0.21	0.10	0.07	0.16	0.01	0.18	0.15	0.14	0.09	0.08	0.20	0.08	0.31	0.20	0.12	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.05	0.16	0.12	0.19	0.06	0.22	0.09	0.17	0.10	0.09	0.06	0.17	0.11	0.25	0.03	0.17	0.47	0.10	0.11
C2	0.13	0.19	0.17	0.11	0.30	0.06	0.28	0.09	0.23	0.19	0.27	0.12	0.17	0.12	0.32	0.06	0.15	0.31	0.23	0.13
C2'	0.14	0.16	0.04	0.08	0.03	0.12	0.07	0.10	0.04	0.10	0.12	0.25	0.05	0.11	0.08	0.15	0.09	0.60	0.13	0.17
C3'	0.21	0.14	0.31	0.29	0.36	0.27	0.46	0.36	0.40	0.26	0.18	0.05	0.26	0.21	0.41	0.22	0.47	0.20	0.47	0.39
C4	0.11	0.14	0.18	0.12	0.29	0.05	0.27	0.08	0.22	0.16	0.22	0.06	0.19	0.13	0.33	0.04	0.15	0.39	0.19	0.11
C4'	0.26	0.19	0.32	0.31	0.38	0.31	0.46	0.38	0.41	0.29	0.22	0.08	0.27	0.27	0.43	0.28	0.46	0.27	0.33	0.33
C5	0.11	0.15	0.18	0.11	0.29	0.04	0.27	0.06	0.21	0.16	0.23	0.07	0.20	0.13	0.34	0.03	0.13	0.39	0.24	0.12
C5'	0.26	0.19	0.32	0.31	0.37	0.31	0.46	0.38	0.41	0.29	0.22	0.09	0.27	0.27	0.42	0.28	0.46	0.29	0.32	0.33
C6	0.11	0.17	0.17	0.10	0.29	0.04	0.27	0.05	0.21	0.16	0.25	0.10	0.19	0.12	0.34	0.04	0.11	0.35	0.28	0.13
C8	0.09	0.10	0.18	0.12	0.24	0.04	0.25	0.06	0.19	0.13	0.16	0.03	0.20	0.12	0.30	0.02	0.15	0.45	0.18	0.11
N1	0.12	0.19	0.17	0.10	0.30	0.05	0.27	0.07	0.22	0.18	0.27	0.12	0.17	0.12	0.33	0.06	0.12	0.31	0.28	0.14
N2	0.13	0.21	0.15	0.11	0.27	0.07	0.26	0.10	0.22	0.19	0.26	0.15	0.13	0.12	0.28	0.08	0.14	0.26	0.24	0.13
N3	0.12	0.17	0.18	0.13	0.30	0.07	0.29	0.10	0.24	0.18	0.26	0.07	0.18	0.13	0.33	0.06	0.17	0.35	0.18	0.12
N7	0.10	0.13	0.18	0.11	0.27	0.03	0.26	0.05	0.20	0.15	0.20	0.05	0.20	0.13	0.32	0.02	0.13	0.43	0.23	0.12
N9	0.09	0.10	0.18	0.12	0.25	0.05	0.26	0.08	0.20	0.14	0.17	0.03	0.19	0.12	0.31	0.03	0.16	0.44	0.15	0.11
O2'	0.24	0.27	0.13	0.15	0.31	0.22	0.27	0.23	0.26	0.25	0.30	0.25	0.07	0.13	0.32	0.27	0.21	0.85	0.26	0.37
O3'	0.60	0.50	0.69	0.69	0.70	0.69	0.83	0.80	0.79	0.64	0.52	0.35	0.60	0.59	0.70	0.64	0.90	0.29	0.98	0.82
O4'	0.21	0.19	0.28	0.25	0.34	0.22	0.38	0.25	0.33	0.25	0.22	0.11	0.26	0.24	0.39	0.20	0.32	0.36	0.08	0.14
O5'	0.17	0.18	0.26	0.22	0.30	0.18	0.38	0.25	0.32	0.21	0.20	0.21	0.24	0.19	0.36	0.15	0.37	0.34	0.29	0.28
O6	0.10	0.17	0.16	0.09	0.29	0.04	0.26	0.05	0.21	0.16	0.25	0.10	0.19	0.12	0.34	0.04	0.10	0.34	0.31	0.14
OP1	0.13	0.13	0.20	0.17	0.21	0.14	0.26	0.14	0.22	0.15	0.15	0.14	0.20	0.14	0.24	0.14	0.23	0.48	0.09	0.08
OP2	0.52	0.49	0.60	0.56	0.60	0.50	0.63	0.54	0.59	0.54	0.52	0.43	0.62	0.55	0.63	0.48	0.61	0.61	0.53	0.56
P	0.12	0.08	0.23	0.19	0.24	0.12	0.30	0.18	0.25	0.15	0.11	0.04	0.25	0.17	0.28	0.08	0.28	0.46	0.19	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.00	0.05	0.24	0.23	0.14
C2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.04	0.05	0.48	0.31	0.21
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.17	0.10	0.08
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.05	0.03
C4	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.70	0.32	0.26
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.20	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.72	0.30	0.26
C5'	0.03	0.06	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.00	0.03	0.05	0.06	0.07	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.27	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.59	0.28	0.24
N1	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.45	0.28	0.20
N3	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.04	0.60	0.33	0.24
O2	0.03	0.00	0.07	0.05	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.10	0.01	0.08	0.06	0.39	0.30	0.19
O2'	0.03	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.02	0.03	0.08	0.18	0.19	0.09
O3'	0.05	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.06	0.10	0.04	0.00	0.03	0.03	0.05	0.14	0.05	0.03
O4	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.76	0.33	0.27
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.03	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.04	0.33	0.08
O5'	0.05	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.06	0.08	0.05	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.24	0.48	0.17	0.09	0.70	0.16	0.72	0.27	0.59	0.45	0.60	0.39	0.18	0.14	0.76	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.31	0.10	0.05	0.32	0.20	0.30	0.22	0.28	0.28	0.33	0.30	0.19	0.05	0.33	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.21	0.08	0.03	0.26	0.01	0.26	0.01	0.24	0.20	0.24	0.19	0.09	0.03	0.27	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00