Doublet Group distance statistics: 54430

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.021, 0.038, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.009, 0.032, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.010, 0.034, 0.059, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.011, 0.041, 0.070, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.041 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.014, 0.048, 0.083, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.048 std_dev=0.035
C4	A	0, 0.013, 0.049, 0.084, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.049 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.017, 0.059, 0.101, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.059 std_dev=0.042
O6	A	0, 0.014, 0.070, 0.125, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.070 std_dev=0.055
C8	A	0, 0.022, 0.078, 0.133, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.078 std_dev=0.056
O4'	A	0, -0.013, 0.162, 0.336, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.162 std_dev=0.175
C2'	A	0, 0.042, 0.250, 0.457, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.250 std_dev=0.208
N4	B	0, 0.064, 0.320, 0.576, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.320 std_dev=0.256
N3	B	0, 0.132, 0.459, 0.786, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.459 std_dev=0.327
C3'	A	0, 0.001, 0.335, 0.669, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.335 std_dev=0.334
C4	B	0, 0.053, 0.393, 0.733, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.393 std_dev=0.340
C4'	A	0, 0.026, 0.396, 0.766, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.396 std_dev=0.370
O2'	A	0, 0.163, 0.578, 0.993, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.578 std_dev=0.415
C2	B	0, 0.165, 0.677, 1.189, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.677 std_dev=0.512
O5'	A	0, 0.143, 0.661, 1.179, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.661 std_dev=0.518
C5	B	0, 0.144, 0.667, 1.191, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.667 std_dev=0.524
O3'	A	0, 0.084, 0.618, 1.151, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.618 std_dev=0.533
N1	B	0, 0.243, 0.851, 1.459, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.851 std_dev=0.608
C6	B	0, 0.242, 0.866, 1.489, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.866 std_dev=0.624
C5'	A	0, 0.060, 0.723, 1.385, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.723 std_dev=0.662
O2	B	0, 0.085, 0.776, 1.467, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.776 std_dev=0.691
P	A	0, 0.125, 0.900, 1.674, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.900 std_dev=0.775
C1'	B	0, 0.259, 1.040, 1.820, 1.880 max_d=1.880 avg_d=1.040 std_dev=0.780
OP2	A	0, 0.173, 1.088, 2.002, 2.237 max_d=2.237 avg_d=1.088 std_dev=0.914
O2'	B	0, 0.280, 1.211, 2.141, 2.264 max_d=2.264 avg_d=1.211 std_dev=0.931
C2'	B	0, 0.297, 1.233, 2.169, 2.266 max_d=2.266 avg_d=1.233 std_dev=0.936
OP1	A	0, 0.098, 1.046, 1.994, 2.295 max_d=2.295 avg_d=1.046 std_dev=0.948
O3'	B	0, 0.378, 1.913, 3.448, 3.758 max_d=3.758 avg_d=1.913 std_dev=1.535
C3'	B	0, 0.127, 1.882, 3.637, 4.224 max_d=4.224 avg_d=1.882 std_dev=1.755
O4'	B	0, 0.040, 1.959, 3.877, 4.564 max_d=4.564 avg_d=1.959 std_dev=1.918
C4'	B	0, -0.018, 2.231, 4.479, 5.309 max_d=5.309 avg_d=2.231 std_dev=2.249
C5'	B	0, -0.463, 3.149, 6.760, 8.205 max_d=8.205 avg_d=3.149 std_dev=3.611
O5'	B	0, -0.769, 3.406, 7.582, 9.287 max_d=9.287 avg_d=3.406 std_dev=4.176
P	B	0, -0.616, 4.612, 9.840, 11.923 max_d=11.923 avg_d=4.612 std_dev=5.228
OP1	B	0, -0.629, 4.705, 10.038, 12.163 max_d=12.163 avg_d=4.705 std_dev=5.334
OP2	B	0, -0.578, 5.239, 11.055, 13.351 max_d=13.351 avg_d=5.239 std_dev=5.817

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.29	0.03	0.31	0.33	0.31
C2	0.01	0.00	0.18	0.02	0.00	0.05	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.16	0.08	0.26	0.00	0.27	0.29	0.25
C2'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.10	0.01	0.11	0.05	0.15	0.04	0.18	0.20	0.14	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.21	0.17	0.24	0.27	0.23
C3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.01	0.14	0.03	0.10	0.27	0.04	0.07	0.02	0.23	0.14	0.03	0.01	0.01	0.11	0.11	0.22	0.07	0.12
C4	0.01	0.00	0.10	0.09	0.00	0.10	0.00	0.36	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.27	0.01	0.05	0.27	0.01	0.29	0.33	0.29
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.17	0.25	0.11	0.02	0.02	0.25	0.13	0.11	0.01	0.00	0.01	0.20	0.13	0.10	0.02
C5	0.01	0.00	0.11	0.14	0.00	0.18	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.27	0.10	0.05	0.26	0.01	0.28	0.31	0.28
C5'	0.09	0.32	0.05	0.03	0.36	0.00	0.50	0.00	0.51	0.51	0.43	0.26	0.26	0.58	0.33	0.11	0.02	0.02	0.01	0.57	0.28	0.32	0.02
C6	0.02	0.00	0.15	0.10	0.01	0.17	0.00	0.51	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.37	0.03	0.07	0.25	0.00	0.26	0.29	0.25
C8	0.01	0.00	0.04	0.27	0.00	0.25	0.00	0.51	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.30	0.02	0.27	0.01	0.32	0.37	0.34
N1	0.01	0.00	0.18	0.04	0.00	0.11	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.44	0.08	0.09	0.25	0.00	0.26	0.28	0.24
N2	0.01	0.00	0.20	0.07	0.00	0.02	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.50	0.25	0.09	0.26	0.00	0.26	0.28	0.24
N3	0.01	0.00	0.14	0.02	0.00	0.02	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.14	0.07	0.27	0.01	0.29	0.31	0.28
N7	0.01	0.00	0.05	0.23	0.01	0.25	0.00	0.58	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.26	0.02	0.25	0.01	0.29	0.33	0.30
N9	0.00	0.00	0.02	0.14	0.00	0.13	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.10	0.01	0.29	0.01	0.32	0.35	0.32
O2'	0.01	0.45	0.00	0.03	0.27	0.11	0.27	0.11	0.37	0.04	0.44	0.50	0.37	0.15	0.10	0.00	0.05	0.17	0.03	0.38	0.16	0.09	0.02
O3'	0.03	0.16	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.02	0.03	0.30	0.08	0.25	0.14	0.26	0.10	0.05	0.00	0.01	0.19	0.07	0.26	0.23	0.20
O4'	0.00	0.08	0.02	0.01	0.05	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.09	0.09	0.07	0.02	0.01	0.17	0.01	0.00	0.30	0.07	0.32	0.31	0.31
O5'	0.29	0.26	0.21	0.11	0.27	0.01	0.26	0.01	0.25	0.27	0.25	0.26	0.27	0.25	0.29	0.03	0.19	0.30	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.00	0.17	0.11	0.01	0.20	0.01	0.57	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.38	0.07	0.07	0.23	0.00	0.24	0.27	0.23
OP1	0.31	0.27	0.24	0.22	0.29	0.13	0.28	0.28	0.26	0.32	0.26	0.26	0.29	0.29	0.32	0.16	0.26	0.32	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.29	0.27	0.07	0.33	0.10	0.31	0.32	0.29	0.37	0.28	0.28	0.31	0.33	0.35	0.09	0.23	0.31	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01
P	0.31	0.25	0.23	0.12	0.29	0.02	0.28	0.02	0.25	0.34	0.24	0.24	0.28	0.30	0.32	0.02	0.20	0.31	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.31	0.18	0.61	0.09	0.55	0.02	0.73	0.06	0.20	0.29	0.04	0.43	0.28	0.54	0.40	0.24	1.50	0.53	0.65
C2	0.39	0.38	0.49	1.26	0.10	1.27	0.14	1.87	0.25	0.35	0.24	0.11	0.48	0.16	1.09	0.91	1.21	0.36	1.27	1.06
C2'	0.08	0.16	0.15	0.30	0.08	0.39	0.19	0.57	0.10	0.05	0.12	0.19	0.30	0.53	0.19	0.34	0.43	1.71	0.68	0.83
C3'	0.03	0.15	0.18	0.25	0.10	0.30	0.27	0.46	0.20	0.03	0.13	0.16	0.31	0.54	0.15	0.25	0.58	1.99	0.90	1.06
C4	0.33	0.38	0.38	1.04	0.11	1.00	0.07	1.45	0.17	0.30	0.30	0.06	0.50	0.21	0.91	0.71	0.66	0.42	0.61	0.41
C4'	0.02	0.15	0.09	0.29	0.05	0.19	0.24	0.26	0.18	0.02	0.16	0.08	0.28	0.40	0.26	0.09	0.78	2.26	1.22	1.34
C5	0.36	0.38	0.45	1.19	0.12	1.17	0.10	1.74	0.20	0.31	0.28	0.04	0.50	0.18	1.07	0.81	1.04	0.09	1.11	0.84
C5'	0.12	0.31	0.11	0.51	0.09	0.36	0.13	0.44	0.08	0.12	0.33	0.07	0.48	0.25	0.52	0.21	0.58	2.14	1.05	1.17
C6	0.40	0.37	0.53	1.38	0.12	1.39	0.14	2.09	0.25	0.35	0.25	0.05	0.49	0.14	1.24	0.95	1.51	0.59	1.73	1.41
C8	0.29	0.36	0.33	0.95	0.11	0.89	0.04	1.29	0.13	0.26	0.30	0.03	0.50	0.23	0.86	0.62	0.46	0.77	0.35	0.14
N1	0.42	0.37	0.56	1.42	0.11	1.44	0.16	2.17	0.27	0.36	0.22	0.08	0.47	0.13	1.26	1.00	1.62	0.77	1.83	1.53
N2	0.42	0.35	0.53	1.34	0.08	1.38	0.17	2.01	0.29	0.37	0.15	0.14	0.45	0.15	1.12	1.00	1.39	0.66	1.45	1.28
N3	0.34	0.38	0.38	1.03	0.09	1.01	0.09	1.44	0.19	0.31	0.29	0.12	0.49	0.21	0.88	0.73	0.66	0.34	0.60	0.43
N7	0.33	0.37	0.41	1.12	0.12	1.08	0.07	1.60	0.17	0.29	0.29	0.02	0.51	0.20	1.02	0.74	0.86	0.28	0.89	0.62
N9	0.28	0.36	0.29	0.86	0.11	0.81	0.03	1.14	0.12	0.26	0.30	0.04	0.48	0.24	0.77	0.58	0.28	0.92	0.12	0.09
O2'	0.22	0.15	0.51	0.18	0.31	0.07	0.39	0.09	0.34	0.24	0.17	0.36	0.06	0.82	0.30	0.07	0.97	2.20	1.25	1.38
O3'	0.32	0.14	0.60	0.30	0.36	0.21	0.58	0.21	0.53	0.33	0.13	0.38	0.07	0.88	0.34	0.19	1.07	2.54	1.43	1.60
O4'	0.25	0.36	0.29	0.66	0.21	0.48	0.09	0.57	0.13	0.25	0.36	0.17	0.46	0.23	0.65	0.32	0.40	1.78	0.82	0.91
O5'	0.09	0.08	0.12	0.31	0.13	0.17	0.24	0.29	0.20	0.10	0.08	0.15	0.17	0.46	0.31	0.02	0.70	2.21	1.13	1.26
O6	0.42	0.36	0.57	1.48	0.12	1.50	0.15	2.29	0.26	0.35	0.23	0.04	0.47	0.12	1.35	1.01	1.81	0.92	2.16	1.76
OP1	0.10	0.09	0.13	0.30	0.11	0.10	0.22	0.15	0.19	0.10	0.10	0.12	0.17	0.43	0.35	0.06	0.85	2.44	1.38	1.47
OP2	0.09	0.09	0.07	0.58	0.11	0.41	0.19	0.64	0.15	0.09	0.08	0.13	0.17	0.35	0.56	0.19	0.35	1.76	0.60	0.80
P	0.06	0.06	0.01	0.44	0.07	0.24	0.18	0.36	0.15	0.05	0.06	0.09	0.15	0.34	0.45	0.08	0.64	2.14	1.07	1.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.17	0.01	0.51	0.28	0.55	0.39
C2	0.04	0.00	0.03	0.44	0.00	0.44	0.00	0.67	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.42	0.25	0.33	0.08	0.45	0.16	0.13
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.10	0.03	0.15	0.09	0.14	0.05	0.04	0.12	0.13	0.00	0.03	0.02	0.33	0.05	0.35	0.28
C3'	0.02	0.44	0.00	0.00	0.37	0.00	0.18	0.00	0.09	0.21	0.48	0.42	0.51	0.00	0.02	0.02	0.05	0.33	0.07	0.11
C4	0.01	0.00	0.10	0.37	0.00	0.13	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.33	0.05	0.77	1.58	1.04	1.06
C4'	0.02	0.44	0.03	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.28	0.06	0.38	0.15	0.74	0.21	0.03	0.01	0.00	0.48	0.17	0.15
C5	0.01	0.00	0.15	0.18	0.00	0.18	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.22	0.29	1.35	2.14	1.71	1.70
C5'	0.05	0.67	0.09	0.00	0.13	0.01	0.42	0.00	0.56	0.04	0.60	0.16	1.23	0.14	0.15	0.03	0.01	0.20	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.09	0.00	0.28	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.10	0.37	1.41	1.85	1.64	1.61
N1	0.01	0.01	0.05	0.21	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.12	0.12	0.03	0.69	0.89	0.79	0.73
N3	0.03	0.00	0.04	0.48	0.00	0.38	0.00	0.60	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.38	0.33	0.21	0.21	0.85	0.34	0.38
N4	0.01	0.00	0.12	0.42	0.00	0.15	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.39	0.06	0.76	1.77	1.10	1.14
O2	0.06	0.00	0.13	0.51	0.00	0.74	0.01	1.23	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.67	0.24	0.65	0.59	0.32	0.63	0.62
O2'	0.02	0.42	0.00	0.00	0.19	0.21	0.15	0.14	0.20	0.12	0.38	0.21	0.67	0.00	0.12	0.15	0.12	0.59	0.16	0.21
O3'	0.17	0.25	0.03	0.02	0.33	0.03	0.22	0.15	0.10	0.12	0.33	0.39	0.24	0.12	0.00	0.12	0.58	1.09	0.54	0.62
O4'	0.01	0.33	0.02	0.02	0.05	0.01	0.29	0.03	0.37	0.03	0.21	0.06	0.65	0.15	0.12	0.00	0.48	0.10	0.54	0.26
O5'	0.51	0.08	0.33	0.05	0.77	0.00	1.35	0.01	1.41	0.69	0.21	0.76	0.59	0.12	0.58	0.48	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.28	0.45	0.05	0.33	1.58	0.48	2.14	0.20	1.85	0.89	0.85	1.77	0.32	0.59	1.09	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.55	0.16	0.35	0.07	1.04	0.17	1.71	0.28	1.64	0.79	0.34	1.10	0.63	0.16	0.54	0.54	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.39	0.13	0.28	0.11	1.06	0.15	1.70	0.01	1.61	0.73	0.38	1.14	0.62	0.21	0.62	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00