Doublet Group distance statistics: 54432

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 7, 8, 11, 15, 14, 12, 9, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.019, 0.027, 0.034, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.026, 0.035, 0.043, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.015, 0.024, 0.032, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.016, 0.025, 0.035, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.025, 0.035, 0.044, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.035 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.029, 0.040, 0.052, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.040 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.078, 0.106, 0.134, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.106 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.026, 0.055, 0.084, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.055 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.117, 0.210, 0.302, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.210 std_dev=0.093
C2'	A	0, 0.125, 0.250, 0.375, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.250 std_dev=0.125
O2'	A	0, 0.149, 0.291, 0.434, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.291 std_dev=0.142
C5	B	0, 0.296, 0.477, 0.657, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.477 std_dev=0.181
C4'	A	0, 0.178, 0.366, 0.555, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.366 std_dev=0.189
C6	B	0, 0.339, 0.529, 0.720, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.529 std_dev=0.190
C3'	A	0, 0.191, 0.394, 0.597, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.394 std_dev=0.203
C4	B	0, 0.308, 0.514, 0.720, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.514 std_dev=0.206
C2'	B	0, 0.379, 0.586, 0.794, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.586 std_dev=0.207
N1	B	0, 0.423, 0.643, 0.863, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.643 std_dev=0.220
N3	B	0, 0.407, 0.642, 0.876, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.642 std_dev=0.234
O5'	A	0, 0.163, 0.407, 0.652, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.407 std_dev=0.244
C2	B	0, 0.456, 0.702, 0.949, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.702 std_dev=0.247
O4	B	0, 0.311, 0.563, 0.814, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.563 std_dev=0.251
O2'	B	0, 0.428, 0.703, 0.977, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.703 std_dev=0.274
C1'	B	0, 0.520, 0.806, 1.093, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.806 std_dev=0.286
C3'	B	0, 0.371, 0.660, 0.950, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.660 std_dev=0.290
O3'	A	0, 0.280, 0.583, 0.886, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.583 std_dev=0.303
O2	B	0, 0.529, 0.843, 1.156, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.843 std_dev=0.314
C5'	A	0, 0.259, 0.579, 0.899, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.579 std_dev=0.320
O3'	B	0, 0.381, 0.705, 1.028, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.705 std_dev=0.323
P	A	0, 0.300, 0.629, 0.957, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.629 std_dev=0.328
OP2	A	0, 0.344, 0.679, 1.013, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.679 std_dev=0.334
O4'	B	0, 0.611, 1.003, 1.394, 1.878 max_d=1.878 avg_d=1.003 std_dev=0.392
OP1	A	0, 0.453, 0.878, 1.302, 2.034 max_d=2.034 avg_d=0.878 std_dev=0.425
C4'	B	0, 0.557, 0.982, 1.408, 2.061 max_d=2.061 avg_d=0.982 std_dev=0.425
C5'	B	0, 0.678, 1.208, 1.737, 2.500 max_d=2.500 avg_d=1.208 std_dev=0.529
O5'	B	0, 0.531, 1.086, 1.641, 3.232 max_d=3.232 avg_d=1.086 std_dev=0.555
P	B	0, 0.713, 1.479, 2.244, 4.439 max_d=4.439 avg_d=1.479 std_dev=0.765
OP2	B	0, 0.711, 1.494, 2.276, 4.547 max_d=4.547 avg_d=1.494 std_dev=0.782
OP1	B	0, 0.856, 1.830, 2.804, 6.230 max_d=6.230 avg_d=1.830 std_dev=0.974

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.08	0.08	0.18	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.11	0.03	0.16	0.16	0.27	0.17
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.03	0.07	0.07	0.11	0.01	0.02	0.01	0.11	0.15	0.12	0.08
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.11	0.01	0.10	0.02	0.09	0.07	0.12	0.12	0.12	0.03	0.01	0.02	0.16	0.20	0.10	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.04	0.21	0.25	0.34	0.24
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.07	0.09	0.05	0.07	0.04	0.01	0.02	0.08	0.14	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.04	0.21	0.24	0.33	0.24
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.18	0.01	0.18	0.00	0.15	0.10	0.15	0.20	0.09	0.07	0.05	0.02	0.01	0.09	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.04	0.18	0.18	0.27	0.19
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.14	0.14	0.24	0.15
N3	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.19	0.21	0.31	0.21
N4	0.03	0.02	0.07	0.12	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.16	0.04	0.22	0.28	0.37	0.26
O2	0.04	0.01	0.11	0.12	0.02	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.14	0.05	0.14	0.14	0.25	0.15
O2'	0.02	0.07	0.01	0.03	0.06	0.07	0.05	0.07	0.04	0.04	0.08	0.07	0.10	0.00	0.07	0.06	0.07	0.14	0.13	0.07
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.14	0.04	0.13	0.05	0.10	0.07	0.14	0.16	0.14	0.07	0.00	0.03	0.17	0.26	0.16	0.17
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.06	0.03	0.00	0.08	0.07	0.19	0.11
O5'	0.08	0.16	0.11	0.16	0.21	0.02	0.21	0.01	0.18	0.14	0.19	0.22	0.14	0.07	0.17	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.16	0.15	0.20	0.25	0.08	0.24	0.09	0.18	0.14	0.21	0.28	0.14	0.14	0.26	0.07	0.02	0.00	0.04	0.01
OP2	0.18	0.27	0.12	0.10	0.34	0.14	0.33	0.17	0.27	0.24	0.31	0.37	0.25	0.13	0.16	0.19	0.02	0.04	0.00	0.01
P	0.09	0.17	0.08	0.12	0.24	0.03	0.24	0.02	0.19	0.15	0.21	0.26	0.15	0.07	0.17	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.21	0.18	0.14	0.19	0.15	0.16	0.17	0.15	0.16	0.21	0.30	0.29	0.15	0.22	0.17	0.31	0.39	0.37	0.30
C2	0.20	0.21	0.19	0.14	0.20	0.14	0.18	0.20	0.16	0.17	0.20	0.28	0.28	0.15	0.24	0.16	0.38	0.43	0.46	0.38
C2'	0.16	0.20	0.14	0.11	0.18	0.10	0.17	0.14	0.14	0.13	0.20	0.30	0.26	0.13	0.22	0.12	0.31	0.44	0.41	0.33
C3'	0.13	0.17	0.13	0.13	0.18	0.11	0.19	0.17	0.17	0.12	0.18	0.26	0.23	0.16	0.21	0.10	0.30	0.48	0.41	0.34
C4	0.18	0.19	0.19	0.17	0.18	0.17	0.20	0.26	0.18	0.17	0.18	0.24	0.25	0.19	0.21	0.16	0.44	0.51	0.55	0.46
C4'	0.14	0.19	0.13	0.10	0.17	0.10	0.16	0.11	0.14	0.13	0.19	0.27	0.23	0.12	0.19	0.11	0.24	0.40	0.31	0.25
C5	0.16	0.16	0.19	0.18	0.17	0.18	0.19	0.27	0.17	0.15	0.15	0.21	0.24	0.20	0.19	0.16	0.44	0.51	0.52	0.45
C5'	0.19	0.20	0.19	0.14	0.17	0.16	0.18	0.14	0.17	0.17	0.19	0.28	0.28	0.16	0.19	0.17	0.22	0.41	0.29	0.24
C6	0.16	0.17	0.19	0.16	0.17	0.16	0.18	0.23	0.16	0.14	0.17	0.24	0.25	0.18	0.20	0.15	0.38	0.46	0.45	0.39
N1	0.18	0.20	0.19	0.14	0.18	0.14	0.17	0.19	0.15	0.16	0.19	0.27	0.28	0.15	0.22	0.15	0.36	0.42	0.43	0.35
N3	0.19	0.21	0.19	0.15	0.19	0.15	0.19	0.23	0.17	0.17	0.20	0.27	0.27	0.17	0.23	0.15	0.41	0.47	0.51	0.42
N4	0.18	0.21	0.20	0.19	0.20	0.19	0.22	0.29	0.20	0.18	0.21	0.24	0.24	0.21	0.22	0.18	0.47	0.56	0.60	0.51
O2	0.21	0.22	0.19	0.14	0.21	0.15	0.19	0.18	0.17	0.18	0.22	0.30	0.30	0.14	0.26	0.18	0.36	0.41	0.45	0.35
O2'	0.21	0.24	0.18	0.13	0.19	0.15	0.15	0.15	0.14	0.17	0.23	0.34	0.30	0.14	0.23	0.18	0.27	0.39	0.37	0.28
O3'	0.13	0.18	0.13	0.15	0.18	0.13	0.21	0.20	0.18	0.13	0.18	0.27	0.22	0.18	0.22	0.12	0.29	0.51	0.44	0.35
O4'	0.16	0.20	0.16	0.14	0.18	0.14	0.16	0.15	0.14	0.14	0.21	0.28	0.27	0.16	0.21	0.14	0.28	0.37	0.32	0.26
O5'	0.15	0.19	0.16	0.08	0.21	0.07	0.22	0.11	0.19	0.16	0.20	0.26	0.23	0.03	0.23	0.10	0.26	0.47	0.35	0.31
OP1	0.05	0.12	0.08	0.03	0.16	0.07	0.19	0.16	0.16	0.07	0.13	0.19	0.14	0.03	0.19	0.05	0.21	0.51	0.35	0.29
OP2	0.10	0.18	0.12	0.06	0.24	0.13	0.25	0.26	0.21	0.14	0.21	0.21	0.13	0.03	0.27	0.10	0.32	0.61	0.41	0.41
P	0.05	0.12	0.08	0.02	0.16	0.05	0.19	0.14	0.16	0.08	0.13	0.18	0.12	0.01	0.19	0.03	0.22	0.49	0.32	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.15	0.13	0.18	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.02	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.03	0.27	0.22	0.29	0.21
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.05	0.12	0.01	0.02	0.06	0.01	0.17	0.23	0.15	0.11
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.01	0.11	0.03	0.11	0.05	0.08	0.11	0.03	0.01	0.10	0.02	0.20	0.31	0.16	0.16
C4	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.04	0.38	0.35	0.43	0.33
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.05	0.06	0.03	0.09	0.00	0.02	0.13	0.19	0.05
C5	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.01	0.04	0.39	0.35	0.42	0.33
C5'	0.03	0.10	0.02	0.03	0.17	0.01	0.18	0.00	0.16	0.10	0.14	0.08	0.05	0.04	0.19	0.01	0.01	0.18	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.01	0.04	0.35	0.28	0.32	0.26
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.27	0.21	0.25	0.19
N3	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.02	0.03	0.33	0.29	0.36	0.27
O2	0.04	0.01	0.12	0.11	0.02	0.05	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.14	0.03	0.05	0.23	0.19	0.25	0.17
O2'	0.02	0.07	0.01	0.03	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.03	0.07	0.12	0.00	0.05	0.07	0.04	0.07	0.19	0.15	0.07
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.11	0.03	0.14	0.04	0.13	0.05	0.09	0.14	0.05	0.00	0.13	0.02	0.17	0.39	0.24	0.21
O4	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.13	0.00	0.04	0.39	0.38	0.48	0.36
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.04	0.00	0.10	0.11	0.23	0.13
O5'	0.15	0.27	0.17	0.20	0.38	0.02	0.39	0.01	0.35	0.27	0.33	0.23	0.07	0.17	0.39	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.22	0.23	0.31	0.35	0.13	0.35	0.18	0.28	0.21	0.29	0.19	0.19	0.39	0.38	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.29	0.15	0.16	0.43	0.19	0.42	0.25	0.32	0.25	0.36	0.25	0.15	0.24	0.48	0.23	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.21	0.11	0.16	0.33	0.05	0.33	0.02	0.26	0.19	0.27	0.17	0.07	0.21	0.36	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00