Doublet Group distance statistics: 54434

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 11, 6, 11, 12, 13, 5, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.017 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.008, 0.039, 0.070, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.039 std_dev=0.031
N4	A	0, 0.017, 0.049, 0.081, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.049 std_dev=0.032
N1	B	0, 0.252, 0.455, 0.658, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.455 std_dev=0.203
C6	B	0, 0.235, 0.444, 0.654, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.444 std_dev=0.210
N3	B	0, 0.257, 0.473, 0.689, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.473 std_dev=0.216
C2'	A	0, 0.255, 0.480, 0.704, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.480 std_dev=0.224
C4	B	0, 0.205, 0.433, 0.661, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.433 std_dev=0.228
C2	B	0, 0.288, 0.522, 0.757, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.522 std_dev=0.234
O4'	A	0, 0.211, 0.447, 0.683, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.447 std_dev=0.236
C5	B	0, 0.218, 0.467, 0.717, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.467 std_dev=0.250
O2'	A	0, 0.289, 0.541, 0.793, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.541 std_dev=0.252
C1'	B	0, 0.286, 0.543, 0.799, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.543 std_dev=0.257
O4	B	0, 0.207, 0.492, 0.778, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.492 std_dev=0.286
C2'	B	0, 0.353, 0.651, 0.948, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.651 std_dev=0.297
O2	B	0, 0.377, 0.694, 1.010, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.694 std_dev=0.317
C3'	B	0, 0.630, 0.963, 1.296, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.963 std_dev=0.333
C4'	A	0, 0.337, 0.690, 1.043, 2.196 max_d=2.196 avg_d=0.690 std_dev=0.353
C3'	A	0, 0.398, 0.755, 1.113, 2.192 max_d=2.192 avg_d=0.755 std_dev=0.358
O4'	B	0, 0.483, 0.846, 1.209, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.846 std_dev=0.363
O3'	B	0, 0.732, 1.128, 1.524, 2.262 max_d=2.262 avg_d=1.128 std_dev=0.396
C4'	B	0, 0.645, 1.067, 1.489, 2.423 max_d=2.423 avg_d=1.067 std_dev=0.422
O2'	B	0, 0.213, 0.672, 1.130, 3.508 max_d=3.508 avg_d=0.672 std_dev=0.459
P	A	0, 0.424, 0.917, 1.409, 2.591 max_d=2.591 avg_d=0.917 std_dev=0.493
O5'	A	0, 0.615, 1.115, 1.616, 2.578 max_d=2.578 avg_d=1.115 std_dev=0.501
OP2	A	0, 0.313, 0.822, 1.330, 2.789 max_d=2.789 avg_d=0.822 std_dev=0.509
O3'	A	0, 0.627, 1.143, 1.660, 3.018 max_d=3.018 avg_d=1.143 std_dev=0.517
O5'	B	0, 0.776, 1.295, 1.815, 3.359 max_d=3.359 avg_d=1.295 std_dev=0.520
C5'	A	0, 0.607, 1.135, 1.664, 3.059 max_d=3.059 avg_d=1.135 std_dev=0.529
C5'	B	0, 0.894, 1.487, 2.080, 4.268 max_d=4.268 avg_d=1.487 std_dev=0.593
OP1	A	0, 0.209, 0.905, 1.601, 3.767 max_d=3.767 avg_d=0.905 std_dev=0.696
P	B	0, 0.407, 1.112, 1.817, 4.876 max_d=4.876 avg_d=1.112 std_dev=0.705
OP2	B	0, 0.597, 1.369, 2.141, 5.414 max_d=5.414 avg_d=1.369 std_dev=0.772
OP1	B	0, 0.148, 1.126, 2.105, 7.312 max_d=7.312 avg_d=1.126 std_dev=0.978

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.10	0.13	0.15	0.12
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.06	0.18	0.14	0.27	0.16
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.02	0.08	0.05	0.09	0.03	0.09	0.07	0.16	0.01	0.03	0.01	0.18	0.23	0.21	0.16
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.15	0.00	0.15	0.02	0.13	0.09	0.14	0.16	0.14	0.02	0.01	0.01	0.18	0.25	0.17	0.15
C4	0.02	0.01	0.06	0.15	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.18	0.03	0.26	0.23	0.38	0.25
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.04	0.07	0.05	0.09	0.03	0.00	0.02	0.13	0.09	0.06
C5	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.05	0.27	0.25	0.37	0.27
C5'	0.04	0.08	0.05	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.10	0.13	0.08	0.05	0.05	0.01	0.01	0.13	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.06	0.24	0.19	0.28	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.18	0.14	0.23	0.16
N3	0.02	0.00	0.09	0.14	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.05	0.22	0.18	0.33	0.20
N4	0.02	0.01	0.07	0.16	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.21	0.03	0.27	0.27	0.42	0.28
O2	0.03	0.01	0.16	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.12	0.17	0.09	0.16	0.13	0.24	0.14
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.09	0.09	0.11	0.05	0.10	0.05	0.08	0.10	0.12	0.00	0.05	0.06	0.10	0.20	0.18	0.12
O3'	0.02	0.14	0.03	0.01	0.18	0.03	0.18	0.05	0.15	0.09	0.17	0.21	0.17	0.05	0.00	0.02	0.18	0.34	0.22	0.20
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.09	0.06	0.02	0.00	0.09	0.17	0.17	0.17
O5'	0.10	0.18	0.18	0.18	0.26	0.02	0.27	0.01	0.24	0.18	0.22	0.27	0.16	0.10	0.18	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.14	0.23	0.25	0.23	0.13	0.25	0.13	0.19	0.14	0.18	0.27	0.13	0.20	0.34	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.27	0.21	0.17	0.38	0.09	0.37	0.14	0.28	0.23	0.33	0.42	0.24	0.18	0.22	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.16	0.16	0.15	0.25	0.06	0.27	0.01	0.21	0.16	0.20	0.28	0.14	0.12	0.20	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.26	0.28	0.28	0.22	0.27	0.22	0.29	0.21	0.22	0.24	0.36	0.29	0.31	0.24	0.27	0.24	0.36	0.33	0.26
C2	0.19	0.23	0.24	0.25	0.25	0.22	0.26	0.27	0.23	0.20	0.24	0.32	0.23	0.25	0.28	0.22	0.30	0.41	0.45	0.34
C2'	0.18	0.24	0.23	0.21	0.21	0.19	0.22	0.22	0.19	0.17	0.23	0.36	0.24	0.23	0.24	0.20	0.27	0.42	0.36	0.31
C3'	0.14	0.19	0.20	0.16	0.19	0.12	0.22	0.18	0.19	0.14	0.18	0.29	0.20	0.16	0.22	0.12	0.29	0.45	0.36	0.33
C4	0.16	0.16	0.17	0.24	0.18	0.22	0.26	0.32	0.23	0.15	0.15	0.26	0.24	0.21	0.21	0.19	0.41	0.53	0.59	0.45
C4'	0.16	0.20	0.21	0.15	0.17	0.15	0.18	0.18	0.16	0.15	0.18	0.29	0.25	0.20	0.19	0.15	0.21	0.37	0.28	0.24
C5	0.19	0.18	0.19	0.26	0.17	0.25	0.24	0.35	0.23	0.16	0.16	0.27	0.28	0.23	0.19	0.22	0.40	0.52	0.53	0.44
C5'	0.25	0.24	0.29	0.16	0.21	0.17	0.23	0.16	0.23	0.23	0.22	0.30	0.36	0.15	0.21	0.20	0.24	0.43	0.30	0.28
C6	0.21	0.21	0.23	0.28	0.18	0.26	0.22	0.32	0.22	0.19	0.18	0.30	0.24	0.25	0.19	0.23	0.33	0.44	0.42	0.35
N1	0.21	0.24	0.25	0.27	0.21	0.24	0.23	0.28	0.22	0.20	0.22	0.34	0.23	0.26	0.23	0.23	0.28	0.39	0.39	0.31
N3	0.17	0.19	0.20	0.23	0.24	0.21	0.28	0.29	0.24	0.17	0.19	0.28	0.22	0.22	0.27	0.20	0.36	0.47	0.54	0.40
N4	0.16	0.17	0.16	0.23	0.17	0.23	0.27	0.35	0.23	0.14	0.17	0.25	0.28	0.20	0.20	0.20	0.46	0.61	0.70	0.53
O2	0.22	0.26	0.26	0.25	0.29	0.23	0.28	0.27	0.24	0.22	0.27	0.33	0.26	0.26	0.32	0.24	0.29	0.39	0.43	0.31
O2'	0.24	0.28	0.28	0.23	0.23	0.25	0.22	0.25	0.20	0.21	0.26	0.40	0.33	0.27	0.25	0.27	0.23	0.38	0.33	0.26
O3'	0.15	0.19	0.21	0.16	0.20	0.14	0.24	0.18	0.21	0.14	0.19	0.30	0.23	0.16	0.24	0.13	0.31	0.50	0.39	0.36
O4'	0.19	0.22	0.25	0.27	0.19	0.26	0.18	0.28	0.17	0.18	0.20	0.30	0.27	0.34	0.20	0.23	0.23	0.35	0.30	0.26
O5'	0.20	0.21	0.27	0.11	0.28	0.06	0.32	0.12	0.29	0.22	0.23	0.23	0.29	0.02	0.29	0.12	0.30	0.45	0.32	0.32
OP1	0.11	0.10	0.09	0.09	0.18	0.16	0.21	0.23	0.16	0.08	0.13	0.16	0.14	0.02	0.22	0.14	0.24	0.50	0.49	0.36
OP2	0.10	0.25	0.12	0.06	0.38	0.16	0.38	0.32	0.30	0.21	0.32	0.25	0.22	0.02	0.42	0.12	0.38	0.58	0.44	0.44
P	0.08	0.13	0.10	0.01	0.22	0.08	0.25	0.17	0.21	0.11	0.17	0.17	0.14	0.01	0.25	0.05	0.25	0.47	0.36	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.10	0.02	0.00	0.11	0.12	0.27	0.13
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.02	0.05	0.23	0.23	0.37	0.21
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.05	0.08	0.02	0.06	0.14	0.00	0.02	0.04	0.01	0.18	0.22	0.18	0.15
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.14	0.00	0.16	0.03	0.15	0.08	0.11	0.11	0.02	0.01	0.15	0.01	0.21	0.28	0.13	0.17
C4	0.02	0.01	0.04	0.14	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.01	0.02	0.34	0.35	0.55	0.33
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.12	0.04	0.04	0.07	0.10	0.02	0.09	0.00	0.02	0.12	0.22	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.12	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.14	0.01	0.05	0.36	0.37	0.55	0.35
C5'	0.02	0.07	0.05	0.03	0.16	0.01	0.19	0.00	0.17	0.08	0.11	0.08	0.07	0.07	0.17	0.01	0.01	0.15	0.24	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.12	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.13	0.01	0.06	0.31	0.29	0.44	0.28
N1	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.06	0.02	0.01	0.22	0.21	0.35	0.20
N3	0.02	0.00	0.06	0.11	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.01	0.04	0.28	0.29	0.46	0.27
O2	0.04	0.01	0.14	0.11	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.19	0.02	0.10	0.20	0.21	0.33	0.18
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.12	0.10	0.15	0.07	0.13	0.07	0.09	0.12	0.00	0.05	0.13	0.08	0.10	0.20	0.20	0.10
O3'	0.10	0.11	0.02	0.01	0.10	0.02	0.14	0.07	0.13	0.06	0.09	0.19	0.05	0.00	0.12	0.06	0.21	0.41	0.25	0.25
O4	0.02	0.02	0.04	0.15	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02	0.13	0.12	0.00	0.03	0.35	0.39	0.60	0.36
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.10	0.08	0.06	0.03	0.00	0.10	0.12	0.34	0.17
O5'	0.11	0.23	0.18	0.21	0.34	0.02	0.36	0.01	0.31	0.22	0.28	0.20	0.10	0.21	0.35	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.23	0.22	0.28	0.35	0.12	0.37	0.15	0.29	0.21	0.29	0.21	0.20	0.41	0.39	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.37	0.18	0.13	0.55	0.22	0.55	0.24	0.44	0.35	0.46	0.33	0.20	0.25	0.60	0.34	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.21	0.15	0.17	0.33	0.04	0.35	0.02	0.28	0.20	0.27	0.18	0.10	0.25	0.36	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00