Doublet Group distance statistics: 54435

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 14, 18, 11, 3, 1, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.012, 0.017, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.014, 0.029, 0.043, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.029 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.028 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.035, 0.077, 0.118, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.077 std_dev=0.042
N4	A	0, 0.049, 0.099, 0.150, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.099 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.038, 0.108, 0.177, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.108 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.038, 0.109, 0.179, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.109 std_dev=0.071
O2'	A	0, 0.086, 0.163, 0.239, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.163 std_dev=0.076
C3'	A	0, 0.067, 0.184, 0.301, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.184 std_dev=0.117
C4'	A	0, 0.075, 0.196, 0.316, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.196 std_dev=0.121
O5'	A	0, 0.172, 0.334, 0.496, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.334 std_dev=0.162
N3	B	0, 0.161, 0.332, 0.503, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.332 std_dev=0.171
C4	B	0, 0.178, 0.359, 0.539, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.359 std_dev=0.180
C2	B	0, 0.138, 0.322, 0.507, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.322 std_dev=0.185
C5	B	0, 0.181, 0.374, 0.567, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.374 std_dev=0.193
N1	B	0, 0.136, 0.338, 0.539, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.338 std_dev=0.202
C6	B	0, 0.160, 0.369, 0.578, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.369 std_dev=0.209
O2	B	0, 0.175, 0.388, 0.601, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.388 std_dev=0.213
O4	B	0, 0.286, 0.502, 0.718, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.502 std_dev=0.216
O3'	A	0, 0.082, 0.303, 0.523, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.303 std_dev=0.220
C5'	A	0, 0.106, 0.326, 0.547, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.326 std_dev=0.221
P	A	0, 0.220, 0.477, 0.734, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.477 std_dev=0.257
C1'	B	0, 0.158, 0.417, 0.676, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.417 std_dev=0.259
C2'	B	0, 0.189, 0.455, 0.721, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.455 std_dev=0.266
C3'	B	0, 0.185, 0.464, 0.743, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.464 std_dev=0.279
OP2	A	0, 0.224, 0.513, 0.801, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.513 std_dev=0.288
O3'	B	0, 0.245, 0.544, 0.844, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.544 std_dev=0.299
O4'	B	0, 0.139, 0.452, 0.766, 1.874 max_d=1.874 avg_d=0.452 std_dev=0.313
O2'	B	0, 0.235, 0.578, 0.921, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.578 std_dev=0.343
OP1	A	0, 0.271, 0.615, 0.959, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.615 std_dev=0.344
C4'	B	0, 0.141, 0.489, 0.837, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.489 std_dev=0.348
O5'	B	0, 0.229, 0.603, 0.978, 1.961 max_d=1.961 avg_d=0.603 std_dev=0.375
C5'	B	0, 0.211, 0.604, 0.997, 2.032 max_d=2.032 avg_d=0.604 std_dev=0.393
P	B	0, 0.295, 0.849, 1.403, 2.614 max_d=2.614 avg_d=0.849 std_dev=0.554
OP1	B	0, 0.516, 1.154, 1.792, 3.673 max_d=3.673 avg_d=1.154 std_dev=0.638
OP2	B	0, 0.218, 0.899, 1.580, 3.260 max_d=3.260 avg_d=0.899 std_dev=0.681

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.07	0.09	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.09	0.02	0.10	0.12	0.15	0.12
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.09	0.00	0.03	0.01	0.08	0.12	0.09	0.08
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.07	0.05	0.08	0.09	0.09	0.02	0.01	0.01	0.13	0.15	0.09	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.13	0.03	0.14	0.17	0.21	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.04	0.05	0.03	0.00	0.02	0.06	0.07	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.03	0.15	0.17	0.20	0.16
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.06	0.09	0.12	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.03	0.12	0.13	0.15	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.10	0.13	0.10
N3	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.13	0.15	0.19	0.14
N4	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.15	0.03	0.15	0.19	0.22	0.17
O2	0.02	0.01	0.09	0.09	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.11	0.03	0.09	0.11	0.14	0.11
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.05	0.05	0.08	0.00	0.12	0.04	0.06	0.10	0.07	0.06
O3'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.13	0.03	0.14	0.04	0.12	0.07	0.11	0.15	0.11	0.12	0.00	0.02	0.17	0.21	0.19	0.18
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.06	0.07	0.11	0.08
O5'	0.05	0.10	0.08	0.13	0.14	0.02	0.15	0.01	0.12	0.09	0.13	0.15	0.09	0.06	0.17	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.12	0.12	0.15	0.17	0.06	0.17	0.07	0.13	0.10	0.15	0.19	0.11	0.10	0.21	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.15	0.09	0.09	0.21	0.07	0.20	0.11	0.15	0.13	0.19	0.22	0.14	0.07	0.19	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.08	0.11	0.16	0.03	0.16	0.02	0.12	0.10	0.14	0.17	0.11	0.06	0.18	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.18	0.16	0.13	0.17	0.13	0.15	0.16	0.16	0.15	0.19	0.24	0.26	0.15	0.20	0.15	0.24	0.34	0.36	0.27
C2	0.16	0.13	0.15	0.14	0.17	0.13	0.16	0.21	0.15	0.13	0.15	0.18	0.23	0.14	0.21	0.13	0.29	0.39	0.45	0.35
C2'	0.16	0.16	0.15	0.11	0.15	0.10	0.14	0.15	0.15	0.13	0.17	0.23	0.27	0.13	0.18	0.12	0.26	0.42	0.43	0.32
C3'	0.16	0.15	0.16	0.11	0.13	0.11	0.14	0.16	0.15	0.12	0.15	0.23	0.27	0.14	0.16	0.12	0.27	0.46	0.43	0.34
C4	0.13	0.12	0.14	0.14	0.13	0.16	0.15	0.27	0.14	0.12	0.11	0.17	0.19	0.14	0.16	0.12	0.34	0.45	0.52	0.43
C4'	0.18	0.18	0.16	0.09	0.14	0.11	0.13	0.11	0.15	0.14	0.17	0.26	0.29	0.12	0.16	0.14	0.20	0.35	0.31	0.23
C5	0.14	0.12	0.15	0.15	0.13	0.16	0.16	0.27	0.16	0.13	0.12	0.16	0.19	0.14	0.15	0.13	0.34	0.44	0.49	0.41
C5'	0.20	0.20	0.20	0.10	0.16	0.13	0.16	0.10	0.17	0.17	0.18	0.27	0.31	0.12	0.17	0.16	0.18	0.35	0.27	0.21
C6	0.14	0.13	0.15	0.14	0.14	0.14	0.15	0.22	0.16	0.13	0.14	0.17	0.22	0.14	0.16	0.12	0.29	0.40	0.42	0.35
N1	0.15	0.14	0.15	0.13	0.16	0.13	0.16	0.19	0.15	0.13	0.16	0.18	0.23	0.14	0.19	0.13	0.27	0.38	0.41	0.32
N3	0.14	0.13	0.14	0.14	0.15	0.14	0.16	0.24	0.14	0.12	0.13	0.18	0.21	0.14	0.20	0.12	0.32	0.42	0.49	0.40
N4	0.14	0.17	0.14	0.15	0.14	0.18	0.15	0.30	0.14	0.14	0.17	0.21	0.17	0.15	0.16	0.15	0.37	0.49	0.56	0.48
O2	0.18	0.16	0.16	0.14	0.19	0.14	0.17	0.20	0.16	0.15	0.18	0.19	0.25	0.15	0.24	0.15	0.28	0.38	0.44	0.34
O2'	0.19	0.19	0.16	0.11	0.17	0.12	0.15	0.14	0.15	0.15	0.20	0.27	0.28	0.13	0.20	0.15	0.23	0.38	0.39	0.28
O3'	0.17	0.16	0.17	0.15	0.16	0.15	0.17	0.20	0.17	0.14	0.16	0.24	0.28	0.18	0.19	0.14	0.31	0.54	0.48	0.40
O4'	0.19	0.19	0.16	0.14	0.15	0.14	0.14	0.15	0.16	0.16	0.19	0.26	0.27	0.16	0.17	0.16	0.20	0.30	0.29	0.21
O5'	0.17	0.19	0.19	0.07	0.17	0.06	0.17	0.10	0.17	0.16	0.19	0.25	0.26	0.02	0.19	0.11	0.23	0.43	0.35	0.29
OP1	0.05	0.11	0.09	0.02	0.14	0.07	0.16	0.15	0.14	0.07	0.12	0.18	0.15	0.03	0.17	0.05	0.19	0.47	0.36	0.30
OP2	0.08	0.14	0.09	0.06	0.21	0.14	0.23	0.26	0.21	0.13	0.17	0.16	0.11	0.03	0.23	0.11	0.30	0.57	0.49	0.43
P	0.05	0.11	0.09	0.02	0.14	0.06	0.16	0.14	0.15	0.08	0.12	0.17	0.14	0.01	0.16	0.03	0.21	0.45	0.35	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.08	0.24	0.15
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.02	0.03	0.16	0.15	0.23	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.05	0.11	0.00	0.01	0.05	0.01	0.10	0.14	0.11	0.08
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.04	0.07	0.11	0.02	0.01	0.10	0.01	0.14	0.22	0.09	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.01	0.04	0.23	0.23	0.26	0.24
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.04	0.06	0.02	0.09	0.00	0.01	0.07	0.15	0.08
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.05	0.24	0.23	0.24	0.23
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.17	0.01	0.19	0.00	0.16	0.10	0.13	0.07	0.06	0.03	0.19	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.04	0.20	0.17	0.21	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.14	0.12	0.22	0.14
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.01	0.03	0.21	0.20	0.25	0.21
O2	0.03	0.01	0.11	0.11	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.02	0.05	0.14	0.13	0.25	0.17
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.04	0.03	0.08	0.12	0.00	0.04	0.06	0.04	0.06	0.12	0.16	0.11
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.09	0.02	0.12	0.03	0.11	0.04	0.08	0.13	0.04	0.00	0.11	0.02	0.15	0.32	0.17	0.17
O4	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.04	0.25	0.26	0.29	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.04	0.00	0.07	0.12	0.32	0.22
O5'	0.06	0.16	0.10	0.14	0.23	0.01	0.24	0.01	0.20	0.14	0.21	0.14	0.06	0.15	0.25	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.15	0.14	0.22	0.23	0.07	0.23	0.09	0.17	0.12	0.20	0.13	0.12	0.32	0.26	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.23	0.11	0.09	0.26	0.15	0.24	0.13	0.21	0.22	0.25	0.25	0.16	0.17	0.29	0.32	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.17	0.08	0.11	0.24	0.08	0.23	0.02	0.17	0.14	0.21	0.17	0.11	0.17	0.27	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00