Doublet Group distance statistics: 54438

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 6, 12, 3, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.012, 0.018, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.001, 0.017, 0.033, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.017 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.020 std_dev=0.016
C2	A	0, -0.001, 0.016, 0.034, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.016 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.002, 0.042, 0.083, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.042 std_dev=0.041
N4	A	0, -0.003, 0.054, 0.112, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.054 std_dev=0.058
C2'	A	0, 0.058, 0.164, 0.269, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.164 std_dev=0.106
O4'	A	0, 0.032, 0.142, 0.252, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.142 std_dev=0.110
O2'	A	0, 0.085, 0.209, 0.333, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.209 std_dev=0.124
C4'	A	0, 0.082, 0.235, 0.388, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.235 std_dev=0.153
O5'	A	0, 0.176, 0.330, 0.484, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.330 std_dev=0.154
C3'	A	0, 0.094, 0.256, 0.418, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.256 std_dev=0.162
N1	B	0, 0.243, 0.416, 0.590, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.416 std_dev=0.173
C2	B	0, 0.350, 0.526, 0.702, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.526 std_dev=0.176
C2'	B	0, 0.261, 0.447, 0.633, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.447 std_dev=0.186
C1'	B	0, 0.290, 0.498, 0.707, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.498 std_dev=0.208
N3	B	0, 0.381, 0.591, 0.801, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.591 std_dev=0.210
C3'	B	0, 0.346, 0.558, 0.770, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.558 std_dev=0.212
O2	B	0, 0.534, 0.763, 0.992, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.763 std_dev=0.229
O3'	A	0, 0.163, 0.396, 0.629, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.396 std_dev=0.233
P	A	0, 0.293, 0.530, 0.766, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.530 std_dev=0.236
C5'	A	0, 0.173, 0.415, 0.657, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.415 std_dev=0.242
C6	B	0, 0.350, 0.594, 0.838, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.594 std_dev=0.244
O3'	B	0, 0.380, 0.631, 0.882, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.631 std_dev=0.251
C4	B	0, 0.255, 0.510, 0.765, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.510 std_dev=0.255
C5	B	0, 0.329, 0.599, 0.869, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.599 std_dev=0.270
O2'	B	0, 0.301, 0.587, 0.874, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.587 std_dev=0.287
O4	B	0, 0.340, 0.629, 0.918, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.629 std_dev=0.289
OP2	A	0, 0.410, 0.699, 0.989, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.699 std_dev=0.290
O4'	B	0, 0.339, 0.641, 0.943, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.641 std_dev=0.302
O5'	B	0, 0.637, 0.946, 1.255, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.946 std_dev=0.309
OP1	A	0, 0.296, 0.612, 0.929, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.612 std_dev=0.316
C4'	B	0, 0.413, 0.737, 1.061, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.737 std_dev=0.324
P	B	0, 1.030, 1.417, 1.803, 2.269 max_d=2.269 avg_d=1.417 std_dev=0.387
C5'	B	0, 0.572, 0.987, 1.401, 2.190 max_d=2.190 avg_d=0.987 std_dev=0.415
OP1	B	0, 1.129, 1.765, 2.401, 3.390 max_d=3.390 avg_d=1.765 std_dev=0.636
OP2	B	0, 2.265, 3.172, 4.080, 4.203 max_d=4.203 avg_d=3.172 std_dev=0.908

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.09	0.11	0.08
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.07	0.02	0.12	0.15	0.20	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.00	0.02	0.01	0.05	0.13	0.11	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.07	0.04	0.07	0.08	0.08	0.02	0.01	0.01	0.05	0.15	0.12	0.09
C4	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.09	0.02	0.15	0.21	0.26	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.08	0.04	0.02
C5	0.02	0.02	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.09	0.03	0.15	0.19	0.25	0.19
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.07	0.09	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.03	0.13	0.15	0.18	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.11	0.13	0.16	0.12
N3	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.09	0.02	0.14	0.19	0.24	0.18
N4	0.02	0.03	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.11	0.03	0.16	0.24	0.29	0.22
O2	0.02	0.01	0.08	0.08	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.09	0.10	0.03	0.10	0.13	0.18	0.12
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.06	0.04	0.04	0.13	0.10	0.06
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.02	0.09	0.04	0.09	0.11	0.10	0.06	0.00	0.02	0.09	0.21	0.18	0.14
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.08	0.10	0.12	0.10
O5'	0.07	0.12	0.05	0.05	0.15	0.02	0.15	0.01	0.13	0.11	0.14	0.16	0.10	0.04	0.09	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.15	0.13	0.15	0.21	0.08	0.19	0.08	0.15	0.13	0.19	0.24	0.13	0.13	0.21	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.20	0.11	0.12	0.26	0.04	0.25	0.02	0.18	0.16	0.24	0.29	0.18	0.10	0.18	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.07	0.09	0.19	0.02	0.19	0.02	0.14	0.12	0.18	0.22	0.12	0.06	0.14	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.19	0.22	0.16	0.17	0.18	0.17	0.17	0.18	0.19	0.17	0.24	0.30	0.14	0.18	0.20	0.30	0.43	0.55	0.30
C2	0.22	0.24	0.21	0.16	0.20	0.18	0.22	0.21	0.21	0.21	0.22	0.28	0.25	0.14	0.21	0.20	0.33	0.44	0.75	0.34
C2'	0.18	0.18	0.17	0.10	0.17	0.11	0.17	0.12	0.16	0.16	0.17	0.23	0.26	0.08	0.19	0.14	0.28	0.46	0.55	0.30
C3'	0.11	0.11	0.11	0.07	0.14	0.07	0.15	0.11	0.14	0.10	0.13	0.16	0.21	0.06	0.16	0.08	0.26	0.50	0.45	0.29
C4	0.19	0.21	0.19	0.17	0.18	0.19	0.22	0.24	0.22	0.20	0.20	0.23	0.21	0.17	0.18	0.20	0.37	0.47	0.85	0.39
C4'	0.13	0.13	0.13	0.10	0.15	0.10	0.15	0.11	0.13	0.11	0.15	0.16	0.23	0.10	0.17	0.11	0.24	0.47	0.35	0.25
C5	0.19	0.18	0.20	0.18	0.13	0.19	0.17	0.23	0.19	0.18	0.16	0.21	0.22	0.17	0.13	0.20	0.35	0.43	0.75	0.36
C5'	0.14	0.19	0.13	0.11	0.19	0.10	0.18	0.10	0.17	0.15	0.20	0.22	0.19	0.09	0.20	0.12	0.21	0.50	0.24	0.23
C6	0.19	0.15	0.21	0.17	0.10	0.17	0.14	0.19	0.16	0.16	0.12	0.20	0.24	0.15	0.12	0.17	0.31	0.42	0.62	0.32
N1	0.21	0.19	0.21	0.16	0.15	0.17	0.18	0.19	0.18	0.18	0.16	0.24	0.26	0.14	0.16	0.18	0.31	0.43	0.64	0.31
N3	0.20	0.23	0.19	0.16	0.21	0.18	0.23	0.23	0.22	0.21	0.23	0.26	0.23	0.15	0.21	0.19	0.36	0.47	0.83	0.37
N4	0.20	0.22	0.18	0.18	0.23	0.21	0.26	0.27	0.25	0.21	0.23	0.23	0.20	0.18	0.24	0.23	0.39	0.51	0.95	0.43
O2	0.24	0.27	0.22	0.17	0.24	0.19	0.23	0.21	0.22	0.23	0.26	0.32	0.28	0.14	0.26	0.21	0.33	0.45	0.74	0.33
O2'	0.23	0.22	0.20	0.12	0.21	0.15	0.19	0.13	0.18	0.20	0.22	0.27	0.29	0.09	0.23	0.19	0.28	0.45	0.52	0.29
O3'	0.11	0.12	0.11	0.09	0.14	0.09	0.15	0.13	0.14	0.10	0.13	0.17	0.20	0.10	0.16	0.09	0.25	0.55	0.43	0.28
O4'	0.20	0.13	0.21	0.18	0.16	0.19	0.15	0.18	0.15	0.14	0.15	0.16	0.29	0.17	0.18	0.19	0.29	0.44	0.44	0.29
O5'	0.11	0.15	0.12	0.06	0.16	0.05	0.17	0.07	0.16	0.13	0.16	0.18	0.16	0.01	0.18	0.07	0.21	0.52	0.28	0.23
OP1	0.05	0.10	0.07	0.02	0.13	0.03	0.15	0.10	0.13	0.07	0.12	0.15	0.11	0.01	0.16	0.02	0.18	0.74	0.37	0.28
OP2	0.07	0.14	0.08	0.06	0.21	0.10	0.21	0.16	0.17	0.12	0.18	0.15	0.08	0.03	0.23	0.10	0.26	0.74	0.34	0.35
P	0.04	0.10	0.06	0.02	0.14	0.03	0.15	0.08	0.13	0.07	0.12	0.13	0.09	0.01	0.16	0.03	0.19	0.64	0.28	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.18	0.31	0.23	0.20
C2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01	0.02	0.28	0.49	0.45	0.26
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.10	0.00	0.02	0.06	0.01	0.14	0.22	0.13	0.12
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.11	0.05	0.07	0.09	0.02	0.01	0.10	0.01	0.15	0.28	0.12	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.02	0.36	0.69	0.69	0.35
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.11	0.05	0.06	0.04	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.16	0.23	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.12	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.03	0.37	0.71	0.68	0.36
C5'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.20	0.01	0.22	0.00	0.19	0.12	0.16	0.08	0.04	0.03	0.22	0.01	0.01	0.25	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.11	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.02	0.34	0.59	0.51	0.31
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.27	0.47	0.39	0.25
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.01	0.02	0.32	0.59	0.59	0.31
O2	0.02	0.01	0.10	0.09	0.01	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.12	0.02	0.03	0.24	0.42	0.39	0.24
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.07	0.12	0.00	0.04	0.06	0.04	0.03	0.16	0.14	0.07
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.10	0.01	0.12	0.03	0.11	0.05	0.08	0.12	0.04	0.00	0.11	0.01	0.15	0.45	0.26	0.16
O4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.10	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.03	0.37	0.74	0.77	0.37
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.17	0.34	0.24	0.23
O5'	0.18	0.28	0.14	0.15	0.36	0.01	0.37	0.01	0.34	0.27	0.32	0.24	0.03	0.15	0.37	0.17	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.31	0.49	0.22	0.28	0.69	0.16	0.71	0.25	0.59	0.47	0.59	0.42	0.16	0.45	0.74	0.34	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.45	0.13	0.12	0.69	0.23	0.68	0.36	0.51	0.39	0.59	0.39	0.14	0.26	0.77	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.26	0.12	0.13	0.35	0.06	0.36	0.01	0.31	0.25	0.31	0.24	0.07	0.16	0.37	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00