Doublet Group distance statistics: 54439

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 2, 0, 3, 2, 1, 3, 2, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.013, 0.034, 0.054, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.014, 0.046, 0.077, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.046 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.036, 0.131, 0.227, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.131 std_dev=0.096
C2'	A	0, 0.038, 0.140, 0.242, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.140 std_dev=0.102
O2'	A	0, 0.090, 0.194, 0.298, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.194 std_dev=0.104
C4'	A	0, 0.093, 0.235, 0.377, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.235 std_dev=0.142
C3'	A	0, 0.084, 0.234, 0.384, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.234 std_dev=0.150
O3'	A	0, 0.143, 0.338, 0.532, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.338 std_dev=0.194
C6	B	0, 0.240, 0.503, 0.767, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.503 std_dev=0.263
C2'	B	0, 0.248, 0.517, 0.786, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.517 std_dev=0.269
N1	B	0, 0.204, 0.482, 0.761, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.482 std_dev=0.278
C5'	A	0, 0.175, 0.455, 0.735, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.455 std_dev=0.280
C1'	B	0, 0.264, 0.550, 0.836, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.550 std_dev=0.286
C3'	B	0, 0.264, 0.572, 0.879, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.572 std_dev=0.307
O5'	A	0, 0.164, 0.478, 0.791, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.478 std_dev=0.314
O4'	B	0, 0.301, 0.631, 0.960, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.631 std_dev=0.330
C5	B	0, 0.276, 0.614, 0.952, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.614 std_dev=0.338
O2'	B	0, 0.385, 0.751, 1.117, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.751 std_dev=0.366
O3'	B	0, 0.304, 0.674, 1.044, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.674 std_dev=0.370
C2	B	0, 0.193, 0.570, 0.947, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.570 std_dev=0.377
C4'	B	0, 0.318, 0.714, 1.110, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.714 std_dev=0.396
P	A	0, 0.256, 0.653, 1.051, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.653 std_dev=0.397
OP2	A	0, 0.320, 0.749, 1.179, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.749 std_dev=0.429
C4	B	0, 0.252, 0.681, 1.111, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.681 std_dev=0.430
O5'	B	0, 0.336, 0.775, 1.213, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.775 std_dev=0.438
N3	B	0, 0.205, 0.646, 1.087, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.646 std_dev=0.441
O2	B	0, 0.226, 0.672, 1.118, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.672 std_dev=0.446
OP1	A	0, 0.263, 0.792, 1.321, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.792 std_dev=0.529
O4	B	0, 0.289, 0.831, 1.372, 2.086 max_d=2.086 avg_d=0.831 std_dev=0.541
C5'	B	0, 0.323, 0.867, 1.411, 1.876 max_d=1.876 avg_d=0.867 std_dev=0.544
P	B	0, 0.356, 0.965, 1.575, 2.062 max_d=2.062 avg_d=0.965 std_dev=0.610
OP1	B	0, 0.406, 1.117, 1.829, 2.574 max_d=2.574 avg_d=1.117 std_dev=0.712
OP2	B	0, 0.234, 1.023, 1.812, 3.573 max_d=3.573 avg_d=1.023 std_dev=0.789

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.11	0.10	0.18	0.10
C2	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.08	0.02	0.26	0.27	0.36	0.27
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.05	0.08	0.00	0.02	0.01	0.14	0.16	0.11	0.11
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.03	0.07	0.05	0.08	0.08	0.11	0.02	0.01	0.02	0.18	0.21	0.08	0.14
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.34	0.39	0.49	0.39
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.08	0.04	0.04	0.03	0.00	0.02	0.08	0.14	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.34	0.38	0.46	0.38
C5'	0.03	0.12	0.02	0.03	0.19	0.01	0.20	0.00	0.17	0.11	0.16	0.21	0.08	0.05	0.05	0.02	0.01	0.10	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.28	0.28	0.34	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.23	0.22	0.29	0.22
N3	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.31	0.35	0.44	0.34
N4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.08	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.03	0.36	0.45	0.54	0.43
O2	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.12	0.03	0.22	0.23	0.32	0.23
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.07	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.07	0.08	0.09	0.00	0.05	0.04	0.08	0.13	0.11	0.07
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.09	0.03	0.09	0.05	0.08	0.05	0.09	0.10	0.12	0.05	0.00	0.02	0.17	0.25	0.11	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.08	0.08	0.19	0.09
O5'	0.11	0.26	0.14	0.18	0.34	0.02	0.34	0.01	0.28	0.23	0.31	0.36	0.22	0.08	0.17	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.10	0.27	0.16	0.21	0.39	0.08	0.38	0.10	0.28	0.22	0.35	0.45	0.23	0.13	0.25	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.36	0.11	0.08	0.49	0.14	0.46	0.18	0.34	0.29	0.44	0.54	0.32	0.11	0.11	0.19	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.27	0.11	0.14	0.39	0.02	0.38	0.01	0.29	0.22	0.34	0.43	0.23	0.07	0.16	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.25	0.16	0.13	0.36	0.13	0.33	0.21	0.27	0.23	0.32	0.23	0.28	0.12	0.41	0.17	0.20	0.32	0.38	0.26
C2	0.15	0.17	0.15	0.20	0.30	0.18	0.30	0.34	0.22	0.15	0.21	0.25	0.25	0.22	0.39	0.13	0.29	0.42	0.51	0.37
C2'	0.19	0.23	0.16	0.13	0.33	0.12	0.31	0.20	0.25	0.21	0.29	0.23	0.28	0.13	0.39	0.16	0.21	0.36	0.41	0.29
C3'	0.20	0.22	0.19	0.15	0.27	0.15	0.26	0.19	0.23	0.20	0.25	0.23	0.28	0.17	0.31	0.17	0.21	0.36	0.41	0.28
C4	0.19	0.23	0.22	0.31	0.20	0.32	0.26	0.50	0.21	0.18	0.20	0.32	0.24	0.33	0.26	0.21	0.40	0.54	0.62	0.50
C4'	0.22	0.26	0.20	0.12	0.29	0.14	0.27	0.13	0.25	0.23	0.29	0.28	0.30	0.10	0.32	0.19	0.16	0.30	0.35	0.22
C5	0.19	0.20	0.23	0.31	0.20	0.33	0.25	0.48	0.21	0.17	0.17	0.28	0.25	0.34	0.26	0.22	0.38	0.48	0.54	0.44
C5'	0.25	0.24	0.25	0.17	0.21	0.20	0.21	0.16	0.21	0.22	0.23	0.29	0.33	0.17	0.23	0.23	0.16	0.29	0.36	0.20
C6	0.16	0.16	0.19	0.24	0.28	0.23	0.29	0.36	0.23	0.16	0.20	0.22	0.24	0.26	0.32	0.16	0.28	0.38	0.44	0.34
N1	0.16	0.18	0.15	0.18	0.32	0.17	0.31	0.30	0.24	0.17	0.25	0.22	0.25	0.19	0.38	0.13	0.25	0.37	0.44	0.32
N3	0.16	0.19	0.18	0.25	0.25	0.25	0.28	0.43	0.21	0.15	0.18	0.30	0.24	0.28	0.33	0.16	0.36	0.50	0.58	0.45
N4	0.23	0.28	0.25	0.35	0.21	0.38	0.26	0.58	0.25	0.22	0.28	0.36	0.25	0.38	0.22	0.27	0.48	0.63	0.71	0.59
O2	0.16	0.18	0.14	0.16	0.33	0.15	0.31	0.30	0.22	0.16	0.24	0.25	0.27	0.18	0.42	0.13	0.26	0.41	0.49	0.35
O2'	0.22	0.27	0.18	0.11	0.38	0.13	0.33	0.16	0.26	0.23	0.34	0.27	0.32	0.11	0.45	0.19	0.18	0.32	0.38	0.25
O3'	0.20	0.22	0.20	0.16	0.26	0.16	0.25	0.19	0.22	0.20	0.25	0.24	0.28	0.19	0.31	0.18	0.22	0.37	0.42	0.28
O4'	0.22	0.27	0.18	0.14	0.34	0.14	0.32	0.18	0.28	0.25	0.32	0.26	0.28	0.11	0.37	0.19	0.18	0.30	0.34	0.23
O5'	0.14	0.18	0.15	0.07	0.22	0.06	0.22	0.10	0.19	0.16	0.21	0.21	0.22	0.01	0.25	0.09	0.18	0.31	0.40	0.26
OP1	0.04	0.11	0.07	0.02	0.20	0.06	0.23	0.13	0.19	0.08	0.15	0.17	0.13	0.02	0.25	0.04	0.27	0.32	0.50	0.29
OP2	0.16	0.27	0.17	0.08	0.38	0.10	0.38	0.19	0.32	0.25	0.33	0.25	0.14	0.03	0.43	0.09	0.23	0.35	0.47	0.32
P	0.05	0.12	0.08	0.02	0.21	0.05	0.23	0.10	0.19	0.11	0.16	0.14	0.09	0.01	0.25	0.01	0.21	0.30	0.42	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.22	0.17	0.23	0.16
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.09	0.01	0.02	0.29	0.17	0.39	0.22
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.06	0.02	0.05	0.11	0.00	0.02	0.05	0.01	0.12	0.18	0.17	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.13	0.02	0.12	0.06	0.09	0.11	0.02	0.01	0.12	0.01	0.10	0.21	0.20	0.10
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.11	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.02	0.38	0.25	0.60	0.34
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.12	0.06	0.08	0.04	0.05	0.02	0.12	0.00	0.02	0.13	0.13	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.13	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.03	0.41	0.27	0.64	0.37
C5'	0.05	0.16	0.03	0.02	0.27	0.01	0.29	0.00	0.25	0.16	0.22	0.11	0.05	0.05	0.29	0.02	0.01	0.19	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.12	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.03	0.39	0.23	0.52	0.31
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.30	0.18	0.38	0.23
N3	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.01	0.02	0.33	0.21	0.49	0.28
O2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.14	0.01	0.04	0.24	0.16	0.31	0.17
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.08	0.13	0.00	0.06	0.06	0.05	0.05	0.14	0.16	0.06
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.13	0.02	0.16	0.05	0.14	0.06	0.10	0.14	0.06	0.00	0.16	0.03	0.20	0.27	0.33	0.20
O4	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.12	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.03	0.39	0.28	0.66	0.37
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.00	0.23	0.22	0.21	0.20
O5'	0.22	0.29	0.12	0.10	0.38	0.02	0.41	0.01	0.39	0.30	0.33	0.24	0.05	0.20	0.39	0.23	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.17	0.17	0.18	0.21	0.25	0.13	0.27	0.19	0.23	0.18	0.21	0.16	0.14	0.27	0.28	0.22	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.23	0.39	0.17	0.20	0.60	0.13	0.64	0.16	0.52	0.38	0.49	0.31	0.16	0.33	0.66	0.21	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.16	0.22	0.08	0.10	0.34	0.02	0.37	0.02	0.31	0.23	0.28	0.17	0.06	0.20	0.37	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00