Doublet Group distance statistics: 54440

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 2, 3, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.014, 0.027, 0.039, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.016, 0.032, 0.047, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.032 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.018, 0.036, 0.053, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.014, 0.031, 0.049, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.031 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.038, 0.065, 0.093, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.065 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.040, 0.074, 0.107, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.074 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.066, 0.144, 0.222, 0.279 max_d=0.279 avg_d=0.144 std_dev=0.078
C2'	A	0, 0.007, 0.118, 0.228, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.118 std_dev=0.111
O2'	A	0, 0.091, 0.233, 0.376, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.233 std_dev=0.142
C3'	A	0, 0.075, 0.236, 0.397, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.236 std_dev=0.161
O3'	A	0, 0.175, 0.383, 0.592, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.383 std_dev=0.208
C4'	A	0, 0.013, 0.230, 0.447, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.230 std_dev=0.217
C2	B	0, 0.231, 0.497, 0.764, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.497 std_dev=0.267
N1	B	0, 0.202, 0.469, 0.736, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.469 std_dev=0.267
O2	B	0, 0.301, 0.584, 0.867, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.584 std_dev=0.283
C1'	B	0, 0.208, 0.500, 0.793, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.500 std_dev=0.292
C2'	B	0, 0.211, 0.515, 0.819, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.515 std_dev=0.304
C6	B	0, 0.213, 0.531, 0.849, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.531 std_dev=0.318
N3	B	0, 0.174, 0.524, 0.874, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.524 std_dev=0.350
O4'	B	0, 0.201, 0.560, 0.918, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.560 std_dev=0.359
C4'	B	0, 0.199, 0.593, 0.988, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.593 std_dev=0.395
C5	B	0, 0.186, 0.582, 0.979, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.582 std_dev=0.396
C5'	A	0, 0.028, 0.445, 0.862, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.445 std_dev=0.417
C4	B	0, 0.132, 0.553, 0.975, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.553 std_dev=0.421
C3'	B	0, 0.140, 0.564, 0.987, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.564 std_dev=0.423
O2'	B	0, 0.223, 0.688, 1.152, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.688 std_dev=0.464
C5'	B	0, 0.172, 0.675, 1.177, 1.935 max_d=1.935 avg_d=0.675 std_dev=0.503
O4	B	0, 0.092, 0.629, 1.166, 2.090 max_d=2.090 avg_d=0.629 std_dev=0.537
O5'	B	0, 0.212, 0.750, 1.287, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.750 std_dev=0.538
O3'	B	0, 0.108, 0.749, 1.390, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.749 std_dev=0.641
O5'	A	0, 0.091, 0.807, 1.523, 2.283 max_d=2.283 avg_d=0.807 std_dev=0.716
P	A	0, 0.062, 0.801, 1.541, 2.555 max_d=2.555 avg_d=0.801 std_dev=0.740
OP2	A	0, 0.181, 0.966, 1.750, 2.814 max_d=2.814 avg_d=0.966 std_dev=0.785
P	B	0, 0.163, 1.030, 1.897, 2.559 max_d=2.559 avg_d=1.030 std_dev=0.867
OP1	A	0, 0.225, 1.124, 2.022, 3.473 max_d=3.473 avg_d=1.124 std_dev=0.898
OP2	B	0, 0.027, 1.156, 2.285, 3.749 max_d=3.749 avg_d=1.156 std_dev=1.129
OP1	B	0, 0.059, 1.246, 2.432, 4.342 max_d=4.342 avg_d=1.246 std_dev=1.186

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.15	0.30	0.25	0.17
C2	0.03	0.00	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.10	0.10	0.04	0.33	0.35	0.45	0.31
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.04	0.07	0.03	0.04	0.06	0.10	0.00	0.03	0.01	0.15	0.30	0.22	0.15
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.15	0.01	0.15	0.04	0.13	0.08	0.13	0.16	0.10	0.02	0.01	0.01	0.20	0.26	0.23	0.14
C4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.15	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.06	0.53	0.54	0.68	0.52
C4'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.15	0.00	0.18	0.01	0.15	0.08	0.11	0.17	0.06	0.05	0.03	0.01	0.03	0.27	0.23	0.10
C5	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.18	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.07	0.58	0.58	0.69	0.56
C5'	0.06	0.18	0.04	0.04	0.33	0.01	0.36	0.00	0.30	0.18	0.26	0.37	0.11	0.06	0.06	0.03	0.01	0.18	0.34	0.02
C6	0.02	0.00	0.07	0.13	0.01	0.15	0.01	0.30	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.07	0.50	0.47	0.54	0.44
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.04	0.33	0.35	0.40	0.30
N3	0.02	0.00	0.04	0.13	0.00	0.11	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.14	0.04	0.43	0.44	0.57	0.42
N4	0.02	0.02	0.06	0.16	0.01	0.17	0.01	0.37	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.20	0.06	0.58	0.61	0.77	0.59
O2	0.05	0.00	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.17	0.12	0.06	0.23	0.30	0.36	0.22
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.06	0.06	0.04	0.10	0.08	0.17	0.00	0.06	0.07	0.08	0.41	0.16	0.18
O3'	0.01	0.10	0.03	0.01	0.17	0.03	0.18	0.06	0.15	0.08	0.14	0.20	0.12	0.06	0.00	0.02	0.17	0.22	0.26	0.11
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.03	0.07	0.04	0.04	0.06	0.06	0.07	0.02	0.00	0.10	0.30	0.23	0.15
O5'	0.15	0.33	0.15	0.20	0.53	0.03	0.58	0.01	0.50	0.33	0.43	0.58	0.23	0.08	0.17	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.30	0.35	0.30	0.26	0.54	0.27	0.58	0.18	0.47	0.35	0.44	0.61	0.30	0.41	0.22	0.30	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.25	0.45	0.22	0.23	0.68	0.23	0.69	0.34	0.54	0.40	0.57	0.77	0.36	0.16	0.26	0.23	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.31	0.15	0.14	0.52	0.10	0.56	0.02	0.44	0.30	0.42	0.59	0.22	0.18	0.11	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.19	0.27	0.30	0.22	0.27	0.17	0.25	0.16	0.14	0.26	0.24	0.30	0.37	0.27	0.21	0.24	0.31	0.41	0.25
C2	0.21	0.17	0.28	0.30	0.20	0.25	0.16	0.25	0.17	0.16	0.23	0.23	0.29	0.35	0.27	0.19	0.26	0.47	0.36	0.28
C2'	0.20	0.18	0.25	0.28	0.22	0.27	0.17	0.24	0.15	0.14	0.25	0.25	0.31	0.37	0.28	0.20	0.23	0.30	0.48	0.26
C3'	0.18	0.20	0.22	0.23	0.21	0.23	0.16	0.21	0.14	0.12	0.25	0.29	0.30	0.33	0.25	0.18	0.23	0.31	0.54	0.28
C4	0.19	0.22	0.29	0.35	0.31	0.28	0.18	0.31	0.18	0.16	0.33	0.26	0.29	0.44	0.44	0.19	0.32	0.67	0.43	0.37
C4'	0.18	0.27	0.20	0.21	0.22	0.22	0.17	0.22	0.14	0.14	0.29	0.37	0.31	0.31	0.25	0.18	0.23	0.30	0.49	0.27
C5	0.20	0.24	0.32	0.36	0.39	0.29	0.25	0.30	0.20	0.17	0.37	0.25	0.33	0.46	0.50	0.20	0.29	0.59	0.49	0.35
C5'	0.24	0.27	0.28	0.17	0.21	0.22	0.18	0.17	0.14	0.16	0.26	0.38	0.46	0.26	0.23	0.20	0.20	0.34	0.54	0.29
C6	0.18	0.22	0.29	0.31	0.34	0.25	0.23	0.23	0.17	0.15	0.34	0.24	0.32	0.39	0.40	0.18	0.24	0.44	0.49	0.29
N1	0.18	0.17	0.26	0.29	0.24	0.24	0.16	0.23	0.15	0.13	0.27	0.21	0.29	0.35	0.30	0.18	0.23	0.39	0.42	0.26
N3	0.19	0.19	0.28	0.32	0.21	0.26	0.16	0.28	0.17	0.15	0.25	0.26	0.28	0.39	0.31	0.18	0.30	0.60	0.38	0.34
N4	0.20	0.24	0.31	0.39	0.32	0.32	0.20	0.37	0.20	0.18	0.34	0.28	0.30	0.48	0.48	0.21	0.39	0.81	0.46	0.46
O2	0.24	0.18	0.29	0.30	0.19	0.28	0.18	0.26	0.19	0.19	0.20	0.24	0.32	0.35	0.25	0.23	0.26	0.44	0.33	0.27
O2'	0.23	0.20	0.28	0.32	0.23	0.31	0.16	0.30	0.16	0.15	0.27	0.27	0.35	0.41	0.28	0.25	0.24	0.29	0.40	0.24
O3'	0.18	0.23	0.20	0.21	0.21	0.23	0.16	0.20	0.14	0.13	0.26	0.33	0.31	0.30	0.25	0.18	0.22	0.31	0.56	0.29
O4'	0.18	0.25	0.22	0.28	0.25	0.25	0.18	0.24	0.15	0.14	0.30	0.33	0.29	0.35	0.28	0.18	0.24	0.28	0.45	0.26
O5'	0.22	0.23	0.28	0.11	0.20	0.10	0.26	0.16	0.23	0.18	0.19	0.35	0.41	0.03	0.22	0.15	0.26	0.37	0.47	0.33
OP1	0.21	0.16	0.24	0.06	0.15	0.06	0.18	0.14	0.16	0.14	0.13	0.24	0.41	0.02	0.18	0.12	0.23	0.50	0.49	0.33
OP2	0.20	0.41	0.19	0.15	0.48	0.22	0.43	0.38	0.36	0.33	0.47	0.43	0.16	0.02	0.52	0.23	0.47	0.56	0.74	0.51
P	0.08	0.17	0.14	0.02	0.20	0.06	0.20	0.17	0.15	0.09	0.19	0.24	0.24	0.01	0.22	0.03	0.25	0.40	0.48	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.09	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.01	0.04	0.09	0.21	0.12	0.10
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.07	0.13	0.00	0.03	0.06	0.01	0.06	0.16	0.14	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.01	0.13	0.02	0.12	0.06	0.10	0.12	0.02	0.01	0.12	0.01	0.09	0.20	0.19	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.04	0.16	0.35	0.22	0.19
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.09	0.00	0.02	0.12	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.01	0.04	0.18	0.37	0.23	0.20
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.07	0.10	0.05	0.04	0.04	0.16	0.01	0.01	0.15	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.04	0.14	0.29	0.17	0.15
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.02	0.08	0.19	0.12	0.09
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.01	0.04	0.12	0.28	0.17	0.14
O2	0.03	0.01	0.13	0.12	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.15	0.02	0.05	0.08	0.17	0.10	0.08
O2'	0.03	0.09	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.08	0.15	0.00	0.07	0.05	0.05	0.05	0.16	0.10	0.06
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.14	0.02	0.15	0.04	0.12	0.06	0.12	0.15	0.07	0.00	0.15	0.02	0.13	0.33	0.28	0.20
O4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.00	0.04	0.18	0.40	0.26	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.04	0.00	0.07	0.05	0.15	0.10
O5'	0.04	0.09	0.06	0.09	0.16	0.02	0.18	0.01	0.14	0.08	0.12	0.08	0.05	0.13	0.18	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.21	0.16	0.20	0.35	0.12	0.37	0.15	0.29	0.19	0.28	0.17	0.16	0.33	0.40	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.12	0.14	0.19	0.22	0.04	0.23	0.07	0.17	0.12	0.17	0.10	0.10	0.28	0.26	0.15	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.10	0.07	0.12	0.19	0.02	0.20	0.01	0.15	0.09	0.14	0.08	0.06	0.20	0.22	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00