Doublet Group distance statistics: 54448

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.001, 0.016, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.001, 0.016, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C2'	A	0, -0.001, 0.201, 0.402, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.201 std_dev=0.202
O2'	A	0, 0.007, 0.211, 0.415, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.211 std_dev=0.204
O4'	A	0, -0.003, 0.206, 0.416, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.206 std_dev=0.209
C6	B	0, 0.092, 0.332, 0.571, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.332 std_dev=0.239
C5	B	0, 0.101, 0.346, 0.591, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.346 std_dev=0.245
C4'	A	0, -0.008, 0.302, 0.611, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.302 std_dev=0.309
C3'	A	0, -0.004, 0.328, 0.659, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.328 std_dev=0.331
N1	B	0, 0.111, 0.475, 0.838, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.475 std_dev=0.364
C4	B	0, 0.061, 0.487, 0.913, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.487 std_dev=0.426
O3'	A	0, -0.002, 0.463, 0.929, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.463 std_dev=0.465
C2	B	0, 0.056, 0.570, 1.083, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.570 std_dev=0.514
N3	B	0, 0.035, 0.555, 1.075, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.555 std_dev=0.520
C5'	A	0, -0.007, 0.527, 1.061, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.527 std_dev=0.534
O5'	A	0, -0.015, 0.530, 1.075, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.530 std_dev=0.545
C1'	B	0, 0.059, 0.760, 1.460, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.760 std_dev=0.700
OP2	A	0, -0.070, 0.654, 1.379, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.654 std_dev=0.724
O4	B	0, -0.046, 0.704, 1.455, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.704 std_dev=0.751
O2'	B	0, 0.036, 0.792, 1.548, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.792 std_dev=0.756
O4'	B	0, 0.046, 0.848, 1.650, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.848 std_dev=0.802
O2	B	0, -0.030, 0.803, 1.637, 1.952 max_d=1.952 avg_d=0.803 std_dev=0.834
C5'	B	0, 0.035, 0.931, 1.826, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.931 std_dev=0.896
C2'	B	0, 0.000, 0.918, 1.836, 2.172 max_d=2.172 avg_d=0.918 std_dev=0.918
C4'	B	0, 0.005, 1.002, 1.999, 2.362 max_d=2.362 avg_d=1.002 std_dev=0.997
C3'	B	0, -0.015, 1.011, 2.036, 2.417 max_d=2.417 avg_d=1.011 std_dev=1.026
P	A	0, -0.147, 0.933, 2.013, 2.447 max_d=2.447 avg_d=0.933 std_dev=1.080
O3'	B	0, -0.138, 1.337, 2.812, 3.392 max_d=3.392 avg_d=1.337 std_dev=1.475
OP1	A	0, -0.307, 1.442, 3.190, 3.902 max_d=3.902 avg_d=1.442 std_dev=1.748
O5'	B	0, -0.220, 1.549, 3.318, 4.025 max_d=4.025 avg_d=1.549 std_dev=1.769
OP1	B	0, -0.224, 1.717, 3.657, 4.429 max_d=4.429 avg_d=1.717 std_dev=1.941
P	B	0, -0.459, 2.209, 4.876, 5.961 max_d=5.961 avg_d=2.209 std_dev=2.667
OP2	B	0, -0.766, 2.971, 6.708, 8.242 max_d=8.242 avg_d=2.971 std_dev=3.737

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.04	0.05
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.05	0.21	0.03	0.02
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.24	0.05	0.03
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.11	0.01	0.00	0.00	0.04	0.28	0.06	0.08
C4	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.17	0.04	0.04
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02	0.05	0.04	0.10
C5'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.01	0.00
C6	0.00	0.00	0.05	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.03	0.02	0.01	0.07	0.13
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.03	0.06
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.07	0.24	0.06	0.02
N4	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.20	0.06	0.03
O2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.14	0.04	0.05	0.26	0.04	0.02
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.22	0.04	0.04
O3'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.07	0.01	0.08	0.04	0.14	0.00	0.00	0.01	0.04	0.40	0.05	0.15
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.04	0.10
O5'	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.07	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.21	0.24	0.28	0.17	0.05	0.05	0.09	0.01	0.11	0.24	0.20	0.26	0.22	0.40	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.02	0.04	0.01	0.07	0.03	0.06	0.06	0.04	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.02	0.03	0.08	0.04	0.01	0.10	0.00	0.13	0.06	0.02	0.03	0.02	0.04	0.15	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.42	0.37	0.49	0.90	0.07	0.57	0.06	0.32	0.16	0.32	0.20	0.51	0.07	1.07	0.15	0.36	0.03	0.02	0.07	0.11
C2	0.21	0.42	0.19	0.62	0.30	0.25	0.14	0.04	0.13	0.25	0.46	0.48	0.16	0.73	0.30	0.10	0.55	0.45	0.89	0.78
C2'	0.45	0.37	0.56	1.00	0.08	0.64	0.08	0.38	0.16	0.32	0.20	0.53	0.15	1.32	0.18	0.39	0.15	0.13	0.14	0.06
C3'	0.56	0.38	0.67	1.15	0.08	0.82	0.12	0.54	0.27	0.40	0.19	0.50	0.28	1.59	0.13	0.55	0.51	0.49	0.63	0.51
C4	0.12	0.23	0.20	0.31	0.42	0.07	0.31	0.18	0.18	0.15	0.36	0.20	0.39	0.43	0.50	0.17	0.82	0.55	1.29	1.01
C4'	0.64	0.37	0.76	1.14	0.04	0.88	0.13	0.59	0.31	0.44	0.14	0.49	0.36	1.53	0.14	0.64	0.60	0.53	0.92	0.63
C5	0.12	0.17	0.19	0.42	0.29	0.17	0.29	0.05	0.22	0.16	0.23	0.12	0.40	0.58	0.31	0.10	0.37	0.17	0.59	0.45
C5'	0.70	0.34	0.81	1.21	0.08	1.02	0.22	0.72	0.40	0.48	0.13	0.39	0.47	1.74	0.07	0.77	0.92	0.84	1.41	1.05
C6	0.21	0.21	0.14	0.70	0.18	0.41	0.19	0.23	0.22	0.23	0.19	0.19	0.26	0.87	0.14	0.22	0.06	0.01	0.14	0.15
N1	0.30	0.36	0.28	0.76	0.17	0.42	0.13	0.20	0.18	0.28	0.29	0.41	0.13	0.90	0.12	0.23	0.21	0.16	0.34	0.35
N3	0.09	0.35	0.06	0.43	0.44	0.07	0.23	0.13	0.13	0.18	0.47	0.36	0.28	0.53	0.53	0.11	0.82	0.64	1.35	1.09
N4	0.23	0.18	0.36	0.10	0.47	0.27	0.36	0.40	0.16	0.12	0.36	0.13	0.46	0.21	0.62	0.35	1.15	0.78	1.86	1.39
O2	0.27	0.49	0.28	0.67	0.26	0.28	0.08	0.05	0.09	0.28	0.51	0.61	0.08	0.77	0.24	0.12	0.57	0.52	0.96	0.85
O2'	0.45	0.35	0.59	0.98	0.14	0.64	0.12	0.37	0.10	0.29	0.14	0.55	0.18	1.27	0.31	0.38	0.13	0.08	0.17	0.03
O3'	0.60	0.39	0.72	1.19	0.07	0.88	0.10	0.59	0.26	0.41	0.18	0.53	0.37	1.71	0.17	0.59	0.63	0.61	0.80	0.67
O4'	0.58	0.38	0.67	1.01	0.04	0.75	0.11	0.48	0.27	0.42	0.14	0.50	0.19	1.21	0.13	0.55	0.32	0.25	0.57	0.28
O5'	0.63	0.32	0.65	1.20	0.17	0.99	0.30	0.72	0.44	0.47	0.18	0.31	0.33	1.80	0.08	0.73	0.98	0.91	1.32	1.09
OP1	1.09	0.60	1.10	1.57	0.33	1.54	0.51	1.19	0.73	0.80	0.37	0.62	1.07	2.52	0.17	1.24	1.72	1.76	2.41	2.07
OP2	0.52	0.29	0.36	0.95	0.32	0.96	0.47	0.83	0.54	0.45	0.24	0.19	0.22	1.66	0.27	0.71	1.45	1.38	1.67	1.64
P	0.93	0.53	0.87	1.45	0.41	1.39	0.59	1.11	0.75	0.74	0.38	0.46	0.68	2.27	0.30	1.11	1.60	1.53	2.06	1.82

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.00	0.00	0.40	0.62	0.06	0.52
C2	0.00	0.00	0.01	0.18	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.11	0.00	0.00	0.47	0.64	0.24	0.68
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.16	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.41	0.41	0.18
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.31	0.00	0.31	0.00	0.26	0.18	0.25	0.08	0.01	0.00	0.33	0.01	0.27	0.20	0.71	0.21
C4	0.00	0.00	0.02	0.31	0.00	0.13	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.06	0.00	0.00	0.64	0.69	0.81	0.98
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.13	0.00	0.13	0.00	0.11	0.08	0.10	0.04	0.27	0.00	0.14	0.00	0.01	0.36	0.45	0.06
C5	0.00	0.00	0.03	0.31	0.00	0.13	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.08	0.00	0.01	0.70	0.71	0.97	1.09
C5'	0.04	0.04	0.16	0.00	0.15	0.00	0.18	0.00	0.15	0.06	0.09	0.01	0.09	0.18	0.17	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00
C6	0.00	0.00	0.03	0.26	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.02	0.00	0.01	0.68	0.71	0.74	1.00
N1	0.00	0.00	0.01	0.18	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.10	0.00	0.00	0.54	0.67	0.32	0.75
N3	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43	0.02	0.00	0.00	0.54	0.66	0.50	0.81
O2	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.21	0.00	0.00	0.36	0.60	0.05	0.50
O2'	0.01	0.39	0.00	0.01	0.37	0.27	0.25	0.09	0.16	0.21	0.43	0.46	0.00	0.02	0.40	0.19	0.16	0.02	1.03	0.28
O3'	0.28	0.11	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.18	0.02	0.10	0.02	0.21	0.02	0.00	0.09	0.18	0.74	0.01	1.35	0.68
O4	0.00	0.00	0.01	0.33	0.00	0.14	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.09	0.00	0.01	0.64	0.68	0.94	1.03
O4'	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.18	0.01	0.00	0.48	0.66	0.07	0.61
O5'	0.40	0.47	0.19	0.27	0.64	0.01	0.70	0.00	0.68	0.54	0.54	0.36	0.16	0.74	0.64	0.48	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.62	0.64	0.41	0.20	0.69	0.36	0.71	0.03	0.71	0.67	0.66	0.60	0.02	0.01	0.68	0.66	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.24	0.41	0.71	0.81	0.45	0.97	0.11	0.74	0.32	0.50	0.05	1.03	1.35	0.94	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.52	0.68	0.18	0.21	0.98	0.06	1.09	0.00	1.00	0.75	0.81	0.50	0.28	0.68	1.03	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00