Doublet Group distance statistics: 54451

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O2	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
O5'	B	0, 0.000, 0.146, 0.293, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.146 std_dev=0.146
P	B	0, 0.000, 0.231, 0.461, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.231 std_dev=0.231
C2'	A	0, 0.000, 0.281, 0.561, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.281 std_dev=0.281
O4'	A	0, 0.000, 0.281, 0.562, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.281 std_dev=0.281
OP2	B	0, 0.000, 0.305, 0.611, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.305 std_dev=0.305
O2'	A	0, 0.000, 0.337, 0.674, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.337 std_dev=0.337
C4	B	0, 0.000, 0.347, 0.693, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.347 std_dev=0.347
C6	B	0, 0.000, 0.388, 0.777, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.388 std_dev=0.388
C5	B	0, 0.000, 0.390, 0.779, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.390 std_dev=0.390
OP2	A	0, 0.000, 0.397, 0.794, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.397 std_dev=0.397
O4	B	0, 0.000, 0.403, 0.806, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.403 std_dev=0.403
C4'	A	0, 0.000, 0.418, 0.836, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.418 std_dev=0.418
N3	B	0, 0.000, 0.434, 0.867, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.434 std_dev=0.434
C3'	A	0, 0.000, 0.456, 0.911, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.456 std_dev=0.456
N1	B	0, 0.000, 0.528, 1.056, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.528 std_dev=0.528
OP1	B	0, 0.000, 0.558, 1.115, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.558 std_dev=0.558
C2	B	0, 0.000, 0.587, 1.175, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.587 std_dev=0.587
O2'	B	0, 0.000, 0.624, 1.249, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.624 std_dev=0.624
C1'	B	0, 0.000, 0.643, 1.285, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.643 std_dev=0.643
P	A	0, 0.000, 0.680, 1.360, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.680 std_dev=0.680
O3'	A	0, 0.000, 0.682, 1.363, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.682 std_dev=0.682
C2'	B	0, 0.000, 0.693, 1.387, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.693 std_dev=0.693
O5'	A	0, 0.000, 0.711, 1.421, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.711 std_dev=0.711
C5'	A	0, 0.000, 0.733, 1.467, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.733 std_dev=0.733
O4'	B	0, 0.000, 0.794, 1.589, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.794 std_dev=0.794
O2	B	0, 0.000, 0.798, 1.595, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.798 std_dev=0.798
C3'	B	0, 0.000, 0.864, 1.728, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.864 std_dev=0.864
O3'	B	0, 0.000, 0.897, 1.794, 1.794 max_d=1.794 avg_d=0.897 std_dev=0.897
C4'	B	0, 0.000, 0.967, 1.933, 1.933 max_d=1.933 avg_d=0.967 std_dev=0.967
OP1	A	0, 0.000, 1.103, 2.207, 2.207 max_d=2.207 avg_d=1.103 std_dev=1.103
C5'	B	0, 0.000, 1.155, 2.309, 2.309 max_d=2.309 avg_d=1.155 std_dev=1.155

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.10	0.04
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.09	0.09	0.00	0.05
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.03	0.02	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.15	0.26	0.13
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.14	0.03	0.03	0.04	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.32	0.17
C4	0.02	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.12	0.07	0.06
C4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.00	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.17	0.14	0.08
C5	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.13	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02
C5'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.10	0.03	0.00	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.05	0.07	0.04	0.06
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01
N3	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.09	0.15	0.06	0.08
N4	0.02	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.16	0.12	0.08
O2	0.03	0.00	0.10	0.11	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.16	0.04	0.12	0.10	0.02	0.06
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.01	0.24	0.30	0.17
O3'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.14	0.02	0.06	0.04	0.16	0.02	0.00	0.01	0.05	0.31	0.47	0.28
O4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.01
O5'	0.05	0.09	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.09	0.03	0.12	0.01	0.05	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.09	0.15	0.17	0.12	0.17	0.01	0.09	0.07	0.01	0.15	0.16	0.10	0.24	0.31	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.00	0.26	0.32	0.07	0.14	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.12	0.02	0.30	0.47	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.05	0.13	0.17	0.06	0.08	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.08	0.06	0.17	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.12	0.05	0.09	0.02	0.15	0.08	0.33	0.04	0.05	0.10	0.21	0.13	0.04	0.08	0.09	0.03	0.09	0.08	0.16
C2	0.03	0.03	0.04	0.04	0.11	0.14	0.18	0.33	0.12	0.04	0.00	0.09	0.23	0.05	0.16	0.06	0.01	0.11	0.02	0.14
C2'	0.00	0.11	0.01	0.04	0.01	0.13	0.08	0.33	0.06	0.02	0.10	0.19	0.20	0.09	0.05	0.07	0.09	0.12	0.13	0.20
C3'	0.07	0.05	0.05	0.01	0.07	0.06	0.14	0.28	0.13	0.04	0.03	0.14	0.27	0.17	0.09	0.00	0.22	0.17	0.24	0.29
C4	0.01	0.04	0.07	0.06	0.06	0.20	0.14	0.40	0.11	0.01	0.03	0.09	0.27	0.00	0.09	0.13	0.03	0.09	0.02	0.13
C4'	0.08	0.02	0.01	0.00	0.11	0.05	0.16	0.25	0.13	0.06	0.01	0.12	0.19	0.16	0.14	0.02	0.22	0.15	0.22	0.29
C5	0.09	0.14	0.00	0.12	0.03	0.27	0.04	0.47	0.01	0.09	0.11	0.18	0.24	0.04	0.01	0.22	0.00	0.04	0.07	0.13
C5'	0.17	0.07	0.07	0.07	0.17	0.03	0.22	0.18	0.21	0.14	0.10	0.02	0.27	0.24	0.19	0.10	0.34	0.19	0.30	0.36
C6	0.11	0.19	0.05	0.13	0.05	0.25	0.02	0.44	0.02	0.12	0.16	0.24	0.19	0.03	0.00	0.20	0.01	0.04	0.08	0.14
N1	0.03	0.11	0.02	0.09	0.03	0.18	0.10	0.37	0.05	0.04	0.09	0.18	0.19	0.02	0.08	0.12	0.01	0.08	0.06	0.15
N3	0.03	0.01	0.08	0.03	0.11	0.15	0.20	0.34	0.15	0.05	0.01	0.06	0.26	0.04	0.15	0.07	0.03	0.12	0.00	0.13
N4	0.02	0.01	0.12	0.03	0.07	0.19	0.15	0.38	0.13	0.04	0.00	0.05	0.30	0.00	0.09	0.12	0.04	0.10	0.01	0.12
O2	0.06	0.01	0.05	0.03	0.15	0.11	0.20	0.30	0.14	0.07	0.04	0.05	0.23	0.07	0.22	0.02	0.02	0.12	0.00	0.13
O2'	0.00	0.11	0.02	0.04	0.02	0.11	0.05	0.31	0.03	0.03	0.10	0.19	0.16	0.10	0.01	0.06	0.07	0.11	0.11	0.18
O3'	0.09	0.05	0.07	0.05	0.04	0.04	0.13	0.26	0.12	0.05	0.05	0.14	0.28	0.21	0.06	0.01	0.26	0.19	0.28	0.32
O4'	0.01	0.07	0.06	0.08	0.10	0.11	0.14	0.29	0.09	0.00	0.01	0.17	0.11	0.06	0.15	0.04	0.11	0.10	0.13	0.21
O5'	0.11	0.00	0.06	0.03	0.09	0.05	0.15	0.27	0.15	0.07	0.01	0.08	0.33	0.20	0.11	0.02	0.31	0.14	0.28	0.32
OP1	0.06	0.04	0.02	0.09	0.14	0.17	0.15	0.44	0.12	0.06	0.08	0.02	0.25	0.12	0.19	0.06	0.20	0.05	0.13	0.16
OP2	0.25	0.22	0.29	0.43	0.01	0.52	0.01	0.74	0.07	0.20	0.13	0.31	0.01	0.29	0.07	0.39	0.00	0.24	0.06	0.01
P	0.04	0.08	0.09	0.16	0.06	0.24	0.10	0.46	0.06	0.03	0.03	0.17	0.16	0.01	0.11	0.14	0.21	0.02	0.20	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.02	0.00	0.07	0.07	0.06	0.15
C2	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.00	0.06	0.03	0.11	0.03	0.15
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.03	0.10	0.01	0.02	0.11	0.00	0.00	0.04	0.01	0.37	0.22	0.31	0.38
C3'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.32	0.09	0.18	0.25
C4	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.07	0.00	0.01	0.09	0.11	0.03	0.09
C4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.00	0.09	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.07	0.12	0.00
C5	0.00	0.00	0.09	0.02	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.04	0.01	0.06	0.12	0.11	0.02	0.09
C5'	0.03	0.07	0.03	0.02	0.14	0.00	0.14	0.00	0.11	0.07	0.11	0.02	0.03	0.01	0.15	0.00	0.00	0.05	0.25	0.00
C6	0.01	0.00	0.10	0.03	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.03	0.01	0.08	0.07	0.12	0.02	0.13
N1	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.11	0.04	0.15
N3	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00	0.03	0.03	0.10	0.01	0.12
O2	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.13	0.01	0.13	0.09	0.12	0.06	0.18
O2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.13	0.02	0.18	0.03	0.17	0.05	0.04	0.16	0.00	0.03	0.14	0.00	0.41	0.24	0.44	0.44
O3'	0.03	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.03	0.04	0.08	0.13	0.03	0.00	0.07	0.01	0.20	0.05	0.12	0.14
O4	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.07	0.00	0.02	0.11	0.10	0.05	0.07
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.03	0.13	0.00	0.01	0.02	0.00	0.13	0.04	0.13	0.02
O5'	0.07	0.03	0.37	0.32	0.09	0.01	0.12	0.00	0.07	0.01	0.03	0.09	0.41	0.20	0.11	0.13	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.11	0.22	0.09	0.11	0.07	0.11	0.05	0.12	0.11	0.10	0.12	0.24	0.05	0.10	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.03	0.31	0.18	0.03	0.12	0.02	0.25	0.02	0.04	0.01	0.06	0.44	0.12	0.05	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.15	0.15	0.38	0.25	0.09	0.00	0.09	0.00	0.13	0.15	0.12	0.18	0.44	0.14	0.07	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00