Doublet Group distance statistics: 54456

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 7, 15, 16, 11, 10, 10, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.008 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.012, 0.024, 0.035, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.026 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.029, 0.058, 0.087, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.058 std_dev=0.029
N4	A	0, 0.033, 0.067, 0.101, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.067 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.026, 0.126, 0.225, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.126 std_dev=0.099
C4'	A	0, 0.080, 0.244, 0.408, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.244 std_dev=0.164
C2'	A	0, 0.010, 0.186, 0.362, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.186 std_dev=0.176
N3	B	0, 0.219, 0.398, 0.578, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.398 std_dev=0.180
C4	B	0, 0.150, 0.334, 0.518, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.334 std_dev=0.184
C2	B	0, 0.233, 0.426, 0.619, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.426 std_dev=0.193
C3'	A	0, 0.122, 0.320, 0.517, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.320 std_dev=0.198
C5	B	0, 0.144, 0.344, 0.544, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.344 std_dev=0.200
N1	B	0, 0.204, 0.411, 0.617, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.411 std_dev=0.206
C6	B	0, 0.167, 0.378, 0.588, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.378 std_dev=0.211
N9	B	0, 0.152, 0.369, 0.587, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.369 std_dev=0.217
C2'	B	0, 0.161, 0.391, 0.621, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.391 std_dev=0.230
N7	B	0, 0.183, 0.422, 0.662, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.422 std_dev=0.239
C8	B	0, 0.166, 0.419, 0.672, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.419 std_dev=0.253
N6	B	0, 0.204, 0.462, 0.720, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.462 std_dev=0.258
C1'	B	0, 0.168, 0.429, 0.689, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.429 std_dev=0.261
C5'	A	0, 0.073, 0.356, 0.639, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.356 std_dev=0.283
O2'	B	0, 0.203, 0.491, 0.779, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.491 std_dev=0.288
O2'	A	0, -0.047, 0.254, 0.555, 2.467 max_d=2.467 avg_d=0.254 std_dev=0.301
O3'	A	0, 0.225, 0.526, 0.828, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.526 std_dev=0.302
C3'	B	0, 0.127, 0.437, 0.748, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.437 std_dev=0.310
P	A	0, 0.096, 0.422, 0.749, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.422 std_dev=0.327
OP2	A	0, 0.169, 0.503, 0.836, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.503 std_dev=0.334
O3'	B	0, 0.114, 0.466, 0.818, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.466 std_dev=0.352
OP1	A	0, 0.121, 0.473, 0.825, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.473 std_dev=0.352
O4'	B	0, 0.177, 0.532, 0.887, 2.037 max_d=2.037 avg_d=0.532 std_dev=0.355
O5'	A	0, 0.022, 0.397, 0.773, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.397 std_dev=0.376
C4'	B	0, 0.131, 0.526, 0.920, 2.158 max_d=2.158 avg_d=0.526 std_dev=0.395
O5'	B	0, 0.180, 0.687, 1.194, 2.450 max_d=2.450 avg_d=0.687 std_dev=0.507
C5'	B	0, 0.106, 0.616, 1.127, 2.569 max_d=2.569 avg_d=0.616 std_dev=0.510
P	B	0, 0.237, 0.853, 1.469, 2.772 max_d=2.772 avg_d=0.853 std_dev=0.616
OP2	B	0, 0.276, 0.987, 1.697, 3.323 max_d=3.323 avg_d=0.987 std_dev=0.710
OP1	B	0, 0.246, 1.087, 1.927, 3.862 max_d=3.862 avg_d=1.087 std_dev=0.840

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.13	0.12	0.19	0.09
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.11	0.03	0.23	0.16	0.21	0.15
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.15	0.02	0.18	0.02	0.17	0.11	0.11	0.15	0.11	0.00	0.02	0.02	0.14	0.17	0.25	0.11
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.14	0.02	0.16	0.03	0.15	0.08	0.12	0.15	0.11	0.02	0.01	0.03	0.18	0.23	0.23	0.15
C4	0.02	0.01	0.15	0.14	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.18	0.04	0.31	0.24	0.26	0.23
C4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.06	0.09	0.04	0.09	0.05	0.01	0.02	0.11	0.22	0.04
C5	0.02	0.01	0.18	0.16	0.01	0.10	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.20	0.05	0.32	0.24	0.25	0.24
C5'	0.02	0.07	0.02	0.03	0.13	0.01	0.15	0.00	0.12	0.07	0.10	0.15	0.06	0.08	0.09	0.01	0.01	0.15	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.17	0.15	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.17	0.05	0.29	0.19	0.20	0.19
N1	0.01	0.01	0.11	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.02	0.22	0.15	0.20	0.14
N3	0.02	0.00	0.11	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.15	0.04	0.27	0.20	0.23	0.19
N4	0.02	0.01	0.15	0.15	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.22	0.21	0.04	0.33	0.27	0.29	0.27
O2	0.04	0.01	0.11	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.13	0.05	0.19	0.14	0.20	0.13
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.21	0.09	0.21	0.08	0.18	0.12	0.17	0.22	0.11	0.00	0.05	0.08	0.07	0.12	0.27	0.07
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.18	0.05	0.20	0.09	0.17	0.09	0.15	0.21	0.13	0.05	0.00	0.04	0.16	0.28	0.25	0.17
O4'	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.05	0.08	0.04	0.00	0.12	0.14	0.23	0.14
O5'	0.13	0.23	0.14	0.18	0.31	0.02	0.32	0.01	0.29	0.22	0.27	0.33	0.19	0.07	0.16	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.16	0.17	0.23	0.24	0.11	0.24	0.15	0.19	0.15	0.20	0.27	0.14	0.12	0.28	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.21	0.25	0.23	0.26	0.22	0.25	0.23	0.20	0.20	0.23	0.29	0.20	0.27	0.25	0.23	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.11	0.15	0.23	0.04	0.24	0.02	0.19	0.14	0.19	0.27	0.13	0.07	0.17	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.28	0.18	0.18	0.19	0.17	0.20	0.19	0.24	0.18	0.26	0.24	0.26	0.20	0.16	0.25	0.21	0.17	0.27	0.45	0.38	0.30
C2	0.16	0.23	0.17	0.18	0.15	0.17	0.18	0.22	0.20	0.18	0.20	0.21	0.26	0.21	0.15	0.22	0.20	0.16	0.33	0.53	0.49	0.38
C2'	0.16	0.30	0.15	0.14	0.18	0.13	0.19	0.16	0.23	0.17	0.27	0.25	0.25	0.19	0.15	0.24	0.16	0.14	0.27	0.49	0.41	0.31
C3'	0.13	0.26	0.13	0.14	0.15	0.13	0.17	0.17	0.20	0.18	0.24	0.22	0.23	0.19	0.13	0.23	0.18	0.12	0.29	0.52	0.43	0.34
C4	0.20	0.23	0.21	0.24	0.16	0.26	0.13	0.33	0.12	0.23	0.20	0.21	0.15	0.22	0.19	0.22	0.24	0.24	0.42	0.64	0.60	0.50
C4'	0.14	0.27	0.12	0.10	0.17	0.10	0.18	0.11	0.21	0.17	0.24	0.24	0.23	0.19	0.14	0.22	0.15	0.11	0.22	0.44	0.34	0.26
C5	0.22	0.20	0.23	0.27	0.16	0.29	0.13	0.35	0.14	0.21	0.18	0.20	0.18	0.19	0.19	0.24	0.26	0.26	0.42	0.62	0.55	0.47
C5'	0.24	0.28	0.24	0.15	0.22	0.18	0.22	0.15	0.23	0.23	0.25	0.27	0.24	0.24	0.22	0.35	0.17	0.21	0.22	0.44	0.36	0.26
C6	0.19	0.21	0.21	0.24	0.16	0.24	0.15	0.28	0.16	0.19	0.18	0.21	0.19	0.19	0.17	0.23	0.24	0.21	0.36	0.54	0.46	0.39
N1	0.16	0.23	0.18	0.19	0.16	0.18	0.18	0.22	0.20	0.18	0.21	0.22	0.23	0.20	0.15	0.23	0.21	0.16	0.32	0.50	0.44	0.35
N3	0.17	0.24	0.18	0.20	0.15	0.20	0.16	0.26	0.14	0.21	0.18	0.21	0.21	0.23	0.17	0.22	0.21	0.18	0.37	0.59	0.56	0.45
N4	0.22	0.26	0.23	0.27	0.19	0.30	0.16	0.38	0.16	0.27	0.25	0.22	0.17	0.25	0.22	0.23	0.27	0.28	0.47	0.72	0.69	0.57
O2	0.17	0.24	0.17	0.16	0.16	0.15	0.20	0.19	0.25	0.18	0.24	0.21	0.31	0.22	0.15	0.24	0.19	0.15	0.31	0.50	0.47	0.36
O2'	0.21	0.33	0.18	0.16	0.21	0.17	0.21	0.17	0.26	0.18	0.31	0.29	0.29	0.20	0.18	0.28	0.18	0.19	0.25	0.46	0.37	0.28
O3'	0.13	0.27	0.12	0.13	0.15	0.12	0.17	0.17	0.20	0.18	0.25	0.22	0.23	0.20	0.13	0.21	0.17	0.11	0.29	0.57	0.47	0.37
O4'	0.14	0.27	0.14	0.18	0.17	0.15	0.19	0.18	0.22	0.18	0.25	0.23	0.24	0.19	0.14	0.21	0.23	0.13	0.25	0.42	0.33	0.26
O5'	0.16	0.25	0.18	0.08	0.19	0.07	0.21	0.09	0.23	0.21	0.25	0.23	0.25	0.22	0.17	0.28	0.02	0.10	0.26	0.49	0.39	0.31
OP1	0.05	0.18	0.08	0.03	0.10	0.09	0.12	0.18	0.14	0.16	0.16	0.16	0.16	0.17	0.07	0.16	0.03	0.07	0.27	0.59	0.49	0.40
OP2	0.12	0.24	0.15	0.07	0.20	0.14	0.23	0.27	0.25	0.25	0.25	0.21	0.27	0.27	0.17	0.19	0.02	0.13	0.37	0.65	0.56	0.49
P	0.05	0.16	0.09	0.02	0.10	0.05	0.13	0.13	0.14	0.16	0.16	0.14	0.16	0.17	0.08	0.15	0.01	0.03	0.26	0.52	0.42	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.08	0.17	0.21	0.15
C2	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.04	0.19	0.36	0.36	0.25
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.21	0.13	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.08	0.10	0.10	0.10	0.09	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.16	0.26	0.16	0.14
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.19	0.34	0.33	0.24
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.04	0.06	0.06	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.12	0.14	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.24	0.41	0.40	0.29
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.12	0.09	0.06	0.12	0.13	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.13	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.25	0.45	0.43	0.31
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.23	0.35	0.34	0.26
N1	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03	0.22	0.42	0.41	0.29
N3	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.17	0.31	0.32	0.22
N6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.11	0.02	0.27	0.50	0.48	0.34
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.12	0.03	0.26	0.43	0.42	0.31
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.17	0.28	0.28	0.21
O2'	0.03	0.11	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.04	0.09	0.10	0.05	0.03	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.19	0.13	0.07
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.04	0.11	0.12	0.13	0.13	0.11	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.18	0.38	0.27	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.15	0.25	0.19
O5'	0.08	0.19	0.11	0.16	0.19	0.02	0.24	0.01	0.25	0.23	0.22	0.17	0.27	0.26	0.17	0.05	0.18	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.17	0.36	0.21	0.26	0.34	0.12	0.41	0.13	0.45	0.35	0.42	0.31	0.50	0.43	0.28	0.19	0.38	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.36	0.13	0.16	0.33	0.14	0.40	0.16	0.43	0.34	0.41	0.32	0.48	0.42	0.28	0.13	0.27	0.25	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.25	0.09	0.14	0.24	0.05	0.29	0.02	0.31	0.26	0.29	0.22	0.34	0.31	0.21	0.07	0.22	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00