Doublet Group distance statistics: 54458

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 13, 20, 2, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.023 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.028, 0.053, 0.078, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.053 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.023, 0.061, 0.098, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.061 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.067, 0.161, 0.255, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.161 std_dev=0.094
C2'	A	0, 0.077, 0.186, 0.295, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.186 std_dev=0.109
C4'	A	0, 0.096, 0.254, 0.412, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.254 std_dev=0.158
C3'	A	0, 0.202, 0.363, 0.524, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.363 std_dev=0.161
C4	B	0, 0.423, 0.593, 0.763, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.593 std_dev=0.170
N9	B	0, 0.519, 0.705, 0.892, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.705 std_dev=0.186
O2'	A	0, 0.165, 0.362, 0.558, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.362 std_dev=0.196
C5	B	0, 0.854, 1.065, 1.276, 1.488 max_d=1.488 avg_d=1.065 std_dev=0.211
C1'	B	0, 0.353, 0.581, 0.809, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.581 std_dev=0.228
C2'	B	0, 0.355, 0.592, 0.829, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.592 std_dev=0.237
N3	B	0, 0.193, 0.440, 0.687, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.440 std_dev=0.247
O2'	B	0, 0.461, 0.710, 0.959, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.710 std_dev=0.249
O3'	A	0, 0.397, 0.658, 0.920, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.658 std_dev=0.262
C6	B	0, 0.860, 1.122, 1.385, 1.744 max_d=1.744 avg_d=1.122 std_dev=0.262
C3'	B	0, 0.315, 0.583, 0.850, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.583 std_dev=0.267
C8	B	0, 0.934, 1.209, 1.484, 1.553 max_d=1.553 avg_d=1.209 std_dev=0.275
C2	B	0, 0.193, 0.472, 0.751, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.472 std_dev=0.279
N1	B	0, 0.420, 0.713, 1.007, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.713 std_dev=0.293
C5'	A	0, 0.141, 0.440, 0.740, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.440 std_dev=0.299
O4'	B	0, 0.386, 0.691, 0.996, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.691 std_dev=0.305
N7	B	0, 1.162, 1.471, 1.780, 1.944 max_d=1.944 avg_d=1.471 std_dev=0.309
O3'	B	0, 0.276, 0.598, 0.920, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.598 std_dev=0.322
C4'	B	0, 0.313, 0.651, 0.989, 1.955 max_d=1.955 avg_d=0.651 std_dev=0.338
P	A	0, 0.239, 0.616, 0.994, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.616 std_dev=0.377
OP2	A	0, 0.349, 0.730, 1.112, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.730 std_dev=0.382
N6	B	0, 1.234, 1.623, 2.013, 2.576 max_d=2.576 avg_d=1.623 std_dev=0.389
O5'	A	0, 0.075, 0.490, 0.906, 2.327 max_d=2.327 avg_d=0.490 std_dev=0.416
C5'	B	0, 0.324, 0.782, 1.241, 2.441 max_d=2.441 avg_d=0.782 std_dev=0.458
OP1	A	0, 0.276, 0.779, 1.281, 2.233 max_d=2.233 avg_d=0.779 std_dev=0.503
O5'	B	0, 0.884, 1.410, 1.936, 2.511 max_d=2.511 avg_d=1.410 std_dev=0.526
P	B	0, 0.521, 1.244, 1.967, 3.338 max_d=3.338 avg_d=1.244 std_dev=0.723
OP2	B	0, 0.563, 1.316, 2.070, 4.065 max_d=4.065 avg_d=1.316 std_dev=0.753
OP1	B	0, 0.773, 1.867, 2.961, 4.220 max_d=4.220 avg_d=1.867 std_dev=1.094

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.07	0.08	0.22	0.11
C2	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.04	0.15	0.14	0.23	0.15
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.02	0.06	0.06	0.12	0.00	0.02	0.01	0.09	0.12	0.22	0.07
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.13	0.01	0.13	0.02	0.12	0.08	0.12	0.14	0.12	0.02	0.01	0.02	0.14	0.17	0.24	0.11
C4	0.03	0.01	0.05	0.13	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.16	0.05	0.23	0.22	0.27	0.22
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.06	0.09	0.05	0.08	0.03	0.00	0.02	0.09	0.18	0.04
C5	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.18	0.06	0.25	0.23	0.26	0.23
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.15	0.08	0.11	0.16	0.06	0.08	0.05	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.15	0.06	0.21	0.18	0.23	0.18
N1	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.03	0.14	0.13	0.22	0.14
N3	0.03	0.01	0.06	0.12	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.19	0.18	0.25	0.19
N4	0.03	0.02	0.06	0.14	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.19	0.05	0.25	0.25	0.29	0.25
O2	0.04	0.01	0.12	0.12	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.14	0.06	0.12	0.12	0.23	0.13
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06	0.04	0.08	0.08	0.13	0.00	0.07	0.07	0.06	0.15	0.21	0.07
O3'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.16	0.03	0.18	0.05	0.15	0.08	0.14	0.19	0.14	0.07	0.00	0.03	0.17	0.26	0.30	0.19
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.05	0.06	0.07	0.03	0.00	0.09	0.11	0.24	0.14
O5'	0.07	0.15	0.09	0.14	0.23	0.02	0.25	0.01	0.21	0.14	0.19	0.25	0.12	0.06	0.17	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.14	0.12	0.17	0.22	0.09	0.23	0.08	0.18	0.13	0.18	0.25	0.12	0.15	0.26	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.23	0.22	0.24	0.27	0.18	0.26	0.13	0.23	0.22	0.25	0.29	0.23	0.21	0.30	0.24	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.15	0.07	0.11	0.22	0.04	0.23	0.02	0.18	0.14	0.19	0.25	0.13	0.07	0.19	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.31	0.21	0.22	0.26	0.21	0.28	0.25	0.29	0.29	0.30	0.27	0.31	0.30	0.26	0.26	0.23	0.22	0.36	0.66	0.52	0.44
C2	0.19	0.21	0.20	0.23	0.20	0.22	0.27	0.29	0.29	0.28	0.25	0.16	0.33	0.31	0.22	0.28	0.23	0.20	0.43	0.90	0.58	0.51
C2'	0.21	0.32	0.17	0.16	0.24	0.15	0.27	0.20	0.29	0.27	0.32	0.27	0.31	0.29	0.23	0.23	0.17	0.18	0.34	0.65	0.55	0.45
C3'	0.20	0.30	0.17	0.15	0.24	0.14	0.28	0.18	0.29	0.30	0.30	0.26	0.32	0.31	0.24	0.21	0.14	0.16	0.34	0.58	0.55	0.45
C4	0.22	0.21	0.24	0.28	0.16	0.30	0.22	0.40	0.19	0.31	0.20	0.17	0.26	0.32	0.23	0.28	0.26	0.28	0.57	1.14	0.67	0.66
C4'	0.23	0.28	0.20	0.17	0.23	0.16	0.26	0.17	0.26	0.30	0.27	0.25	0.28	0.29	0.25	0.22	0.17	0.20	0.26	0.46	0.46	0.36
C5	0.22	0.22	0.23	0.29	0.15	0.31	0.21	0.40	0.22	0.30	0.23	0.17	0.27	0.30	0.21	0.26	0.27	0.28	0.58	1.05	0.66	0.67
C5'	0.28	0.29	0.28	0.20	0.27	0.21	0.29	0.19	0.29	0.34	0.29	0.28	0.30	0.34	0.29	0.30	0.18	0.25	0.25	0.42	0.42	0.34
C6	0.20	0.24	0.21	0.27	0.19	0.26	0.24	0.33	0.24	0.29	0.24	0.20	0.27	0.30	0.22	0.25	0.26	0.23	0.49	0.86	0.60	0.58
N1	0.20	0.25	0.19	0.23	0.22	0.22	0.27	0.28	0.27	0.29	0.26	0.21	0.29	0.30	0.23	0.26	0.24	0.20	0.43	0.80	0.57	0.50
N3	0.20	0.17	0.22	0.25	0.18	0.25	0.26	0.35	0.24	0.30	0.18	0.15	0.32	0.33	0.23	0.29	0.24	0.23	0.49	1.06	0.63	0.58
N4	0.27	0.26	0.27	0.30	0.21	0.34	0.23	0.46	0.20	0.35	0.26	0.22	0.26	0.35	0.27	0.29	0.27	0.34	0.62	1.30	0.71	0.73
O2	0.20	0.24	0.20	0.22	0.22	0.20	0.29	0.27	0.33	0.27	0.31	0.18	0.38	0.31	0.22	0.29	0.23	0.20	0.38	0.85	0.56	0.46
O2'	0.27	0.36	0.23	0.21	0.28	0.21	0.29	0.22	0.31	0.30	0.35	0.31	0.33	0.30	0.28	0.27	0.19	0.25	0.33	0.60	0.53	0.42
O3'	0.20	0.30	0.18	0.16	0.23	0.15	0.28	0.19	0.30	0.31	0.30	0.25	0.33	0.33	0.24	0.22	0.16	0.17	0.34	0.56	0.58	0.46
O4'	0.23	0.28	0.21	0.22	0.23	0.20	0.25	0.23	0.26	0.29	0.27	0.25	0.26	0.28	0.25	0.23	0.25	0.21	0.31	0.53	0.47	0.39
O5'	0.20	0.28	0.21	0.09	0.22	0.08	0.25	0.10	0.26	0.29	0.26	0.25	0.28	0.30	0.22	0.31	0.02	0.13	0.28	0.49	0.44	0.40
OP1	0.06	0.20	0.10	0.03	0.13	0.09	0.19	0.19	0.20	0.23	0.20	0.17	0.25	0.26	0.12	0.16	0.02	0.07	0.24	0.54	0.50	0.42
OP2	0.13	0.29	0.16	0.09	0.23	0.14	0.29	0.28	0.31	0.31	0.30	0.26	0.34	0.34	0.20	0.18	0.03	0.13	0.39	0.66	0.55	0.57
P	0.06	0.21	0.10	0.02	0.14	0.06	0.20	0.15	0.21	0.24	0.20	0.18	0.24	0.26	0.13	0.15	0.01	0.03	0.26	0.48	0.44	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.30	0.32	0.17
C2	0.03	0.00	0.14	0.12	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.21	0.15	0.05	0.25	0.64	0.57	0.26
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.08	0.07	0.11	0.13	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.13	0.25	0.31	0.17
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.11	0.17	0.10	0.11	0.12	0.15	0.08	0.02	0.01	0.01	0.16	0.24	0.28	0.20
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.08	0.03	0.27	0.59	0.54	0.27
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.14	0.07	0.04	0.12	0.14	0.07	0.07	0.02	0.00	0.02	0.20	0.25	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.10	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.12	0.03	0.34	0.74	0.67	0.35
C5'	0.05	0.16	0.03	0.02	0.18	0.01	0.24	0.00	0.24	0.26	0.20	0.13	0.28	0.29	0.16	0.07	0.04	0.02	0.01	0.33	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.04	0.34	0.80	0.72	0.37
C8	0.01	0.02	0.07	0.17	0.01	0.14	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.19	0.04	0.35	0.61	0.58	0.34
N1	0.02	0.00	0.11	0.10	0.01	0.07	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.13	0.04	0.30	0.75	0.66	0.32
N3	0.03	0.00	0.13	0.11	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.14	0.04	0.22	0.54	0.50	0.23
N6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.12	0.01	0.28	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.15	0.04	0.38	0.89	0.81	0.42
N7	0.01	0.02	0.06	0.15	0.01	0.14	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.18	0.03	0.39	0.77	0.72	0.40
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.25	0.49	0.46	0.24
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.11	0.07	0.09	0.07	0.12	0.05	0.18	0.19	0.11	0.04	0.03	0.00	0.05	0.08	0.06	0.18	0.27	0.12
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.08	0.02	0.12	0.04	0.12	0.19	0.13	0.14	0.15	0.18	0.08	0.05	0.00	0.03	0.20	0.33	0.34	0.26
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.02	0.08	0.03	0.00	0.15	0.27	0.30	0.19
O5'	0.15	0.25	0.13	0.16	0.27	0.02	0.34	0.01	0.34	0.35	0.30	0.22	0.38	0.39	0.25	0.06	0.20	0.15	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.30	0.64	0.25	0.24	0.59	0.20	0.74	0.33	0.80	0.61	0.75	0.54	0.89	0.77	0.49	0.18	0.33	0.27	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.57	0.31	0.28	0.54	0.25	0.67	0.34	0.72	0.58	0.66	0.50	0.81	0.72	0.46	0.27	0.34	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.26	0.17	0.20	0.27	0.07	0.35	0.02	0.37	0.34	0.32	0.23	0.42	0.40	0.24	0.12	0.26	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00