Doublet Group distance statistics: 54460

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 5, 4, 6, 9, 3, 5, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.027, 0.035, 0.042, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.035 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.018, 0.026, 0.034, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.026 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.024, 0.034, 0.044, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.019, 0.031, 0.042, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.031 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.018, 0.030, 0.043, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.030 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.018 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.042, 0.072, 0.101, 0.181 max_d=0.181 avg_d=0.072 std_dev=0.029
N4	A	0, 0.033, 0.064, 0.095, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.064 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.574, 0.749, 0.923, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.749 std_dev=0.175
O2'	A	0, 0.395, 0.577, 0.759, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.577 std_dev=0.182
O4'	A	0, 0.627, 0.816, 1.005, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.816 std_dev=0.189
C5	B	0, 0.311, 0.508, 0.704, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.508 std_dev=0.197
C6	B	0, 0.380, 0.600, 0.820, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.600 std_dev=0.220
N7	B	0, 0.378, 0.637, 0.896, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.637 std_dev=0.259
C4	B	0, 0.425, 0.692, 0.959, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.692 std_dev=0.267
C2'	B	0, 0.405, 0.676, 0.947, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.676 std_dev=0.271
N1	B	0, 0.523, 0.801, 1.080, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.801 std_dev=0.278
C4'	A	0, 1.084, 1.366, 1.648, 1.704 max_d=1.704 avg_d=1.366 std_dev=0.282
C3'	A	0, 1.042, 1.338, 1.633, 1.685 max_d=1.685 avg_d=1.338 std_dev=0.295
C2	B	0, 0.588, 0.894, 1.199, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.894 std_dev=0.305
N6	B	0, 0.444, 0.760, 1.075, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.760 std_dev=0.316
N3	B	0, 0.568, 0.888, 1.208, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.888 std_dev=0.320
C8	B	0, 0.498, 0.832, 1.166, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.832 std_dev=0.334
N9	B	0, 0.543, 0.882, 1.221, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.882 std_dev=0.339
O5'	A	0, 1.061, 1.412, 1.762, 1.961 max_d=1.961 avg_d=1.412 std_dev=0.351
O3'	B	0, 0.895, 1.247, 1.599, 1.916 max_d=1.916 avg_d=1.247 std_dev=0.352
C3'	B	0, 0.817, 1.178, 1.538, 1.857 max_d=1.857 avg_d=1.178 std_dev=0.361
P	A	0, 0.741, 1.111, 1.481, 1.897 max_d=1.897 avg_d=1.111 std_dev=0.370
OP1	A	0, 0.601, 0.994, 1.388, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.994 std_dev=0.393
OP2	A	0, 0.966, 1.378, 1.791, 2.199 max_d=2.199 avg_d=1.378 std_dev=0.413
O3'	A	0, 1.394, 1.811, 2.228, 2.320 max_d=2.320 avg_d=1.811 std_dev=0.417
O2'	B	0, 0.802, 1.233, 1.664, 1.878 max_d=1.878 avg_d=1.233 std_dev=0.431
C5'	A	0, 1.876, 2.340, 2.805, 2.862 max_d=2.862 avg_d=2.340 std_dev=0.465
C1'	B	0, 0.828, 1.302, 1.775, 2.116 max_d=2.116 avg_d=1.302 std_dev=0.474
C4'	B	0, 1.427, 2.091, 2.754, 3.092 max_d=3.092 avg_d=2.091 std_dev=0.663
O4'	B	0, 1.369, 2.042, 2.715, 3.064 max_d=3.064 avg_d=2.042 std_dev=0.673
O5'	B	0, 1.520, 2.242, 2.964, 3.525 max_d=3.525 avg_d=2.242 std_dev=0.722
C5'	B	0, 2.034, 2.975, 3.916, 4.225 max_d=4.225 avg_d=2.975 std_dev=0.941
P	B	0, 1.380, 2.606, 3.831, 6.008 max_d=6.008 avg_d=2.606 std_dev=1.226
OP2	B	0, 1.463, 2.722, 3.980, 7.629 max_d=7.629 avg_d=2.722 std_dev=1.259
OP1	B	0, 1.776, 3.397, 5.019, 7.750 max_d=7.750 avg_d=3.397 std_dev=1.621

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.00	0.07	0.07	0.14	0.10
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.12	0.13	0.24	0.16
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.07	0.06	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.08	0.11	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.09	0.05	0.09	0.10	0.10	0.02	0.01	0.02	0.07	0.10	0.12	0.07
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.17	0.21	0.30	0.23
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05	0.03	0.00	0.01	0.08	0.06	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.04	0.18	0.22	0.30	0.23
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.12	0.07	0.08	0.12	0.05	0.05	0.05	0.01	0.01	0.09	0.04	0.02
C6	0.01	0.02	0.05	0.09	0.02	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.11	0.04	0.16	0.17	0.24	0.19
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.12	0.12	0.21	0.15
N3	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.14	0.17	0.28	0.20
N4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.04	0.18	0.25	0.33	0.25
O2	0.03	0.01	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.03	0.10	0.10	0.22	0.14
O2'	0.03	0.07	0.01	0.02	0.05	0.05	0.03	0.05	0.03	0.03	0.07	0.06	0.11	0.00	0.08	0.05	0.05	0.08	0.10	0.06
O3'	0.03	0.10	0.04	0.01	0.12	0.03	0.12	0.05	0.11	0.06	0.12	0.14	0.14	0.08	0.00	0.02	0.10	0.17	0.16	0.10
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.00	0.07	0.10	0.14	0.12
O5'	0.07	0.12	0.06	0.07	0.17	0.01	0.18	0.01	0.16	0.12	0.14	0.18	0.10	0.05	0.10	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.13	0.08	0.10	0.21	0.08	0.22	0.09	0.17	0.12	0.17	0.25	0.10	0.08	0.17	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.24	0.11	0.12	0.30	0.06	0.30	0.04	0.24	0.21	0.28	0.33	0.22	0.10	0.16	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.16	0.06	0.07	0.23	0.04	0.23	0.02	0.19	0.15	0.20	0.25	0.14	0.06	0.10	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.26	0.18	0.21	0.16	0.20	0.17	0.32	0.20	0.20	0.24	0.21	0.22	0.20	0.17	0.25	0.22	0.16	0.54	0.62	0.76	0.59
C2	0.18	0.19	0.16	0.26	0.15	0.29	0.19	0.47	0.16	0.26	0.16	0.16	0.21	0.27	0.19	0.18	0.23	0.23	0.74	0.84	1.08	0.87
C2'	0.18	0.27	0.17	0.16	0.15	0.16	0.17	0.31	0.19	0.20	0.24	0.22	0.23	0.21	0.16	0.27	0.16	0.14	0.56	0.68	0.78	0.62
C3'	0.19	0.28	0.19	0.12	0.15	0.12	0.16	0.26	0.17	0.22	0.23	0.24	0.19	0.21	0.17	0.29	0.12	0.12	0.50	0.66	0.64	0.54
C4	0.28	0.21	0.23	0.34	0.19	0.46	0.18	0.65	0.19	0.33	0.23	0.19	0.24	0.29	0.27	0.20	0.28	0.41	0.88	1.04	1.27	1.07
C4'	0.22	0.32	0.20	0.10	0.19	0.11	0.17	0.19	0.20	0.22	0.27	0.28	0.20	0.20	0.19	0.32	0.14	0.14	0.39	0.54	0.48	0.39
C5	0.29	0.23	0.24	0.36	0.20	0.46	0.17	0.63	0.19	0.27	0.21	0.23	0.23	0.23	0.25	0.22	0.29	0.41	0.83	0.92	1.07	0.94
C5'	0.25	0.33	0.26	0.09	0.22	0.11	0.20	0.13	0.21	0.26	0.27	0.31	0.20	0.23	0.23	0.35	0.09	0.17	0.32	0.52	0.32	0.31
C6	0.21	0.23	0.20	0.30	0.17	0.35	0.13	0.50	0.14	0.21	0.19	0.23	0.16	0.19	0.19	0.18	0.25	0.29	0.68	0.75	0.87	0.74
N1	0.17	0.21	0.16	0.25	0.14	0.27	0.15	0.43	0.14	0.21	0.18	0.18	0.17	0.21	0.17	0.19	0.22	0.21	0.65	0.73	0.91	0.74
N3	0.22	0.20	0.19	0.30	0.17	0.37	0.20	0.57	0.15	0.31	0.20	0.16	0.20	0.31	0.23	0.17	0.25	0.32	0.83	0.98	1.24	1.01
N4	0.34	0.23	0.26	0.37	0.23	0.53	0.22	0.73	0.25	0.38	0.27	0.21	0.33	0.32	0.31	0.24	0.31	0.50	0.95	1.20	1.43	1.22
O2	0.18	0.20	0.17	0.23	0.17	0.24	0.23	0.42	0.23	0.25	0.19	0.18	0.30	0.29	0.19	0.22	0.21	0.19	0.71	0.81	1.08	0.84
O2'	0.23	0.31	0.22	0.18	0.19	0.17	0.20	0.28	0.24	0.20	0.29	0.26	0.28	0.20	0.19	0.34	0.19	0.18	0.51	0.64	0.74	0.57
O3'	0.20	0.30	0.20	0.10	0.16	0.11	0.16	0.23	0.18	0.23	0.25	0.26	0.20	0.22	0.18	0.32	0.10	0.13	0.48	0.67	0.60	0.52
O4'	0.21	0.32	0.19	0.19	0.18	0.17	0.18	0.25	0.21	0.20	0.28	0.26	0.21	0.19	0.18	0.28	0.23	0.16	0.42	0.52	0.57	0.43
O5'	0.20	0.29	0.23	0.08	0.20	0.06	0.20	0.19	0.20	0.27	0.24	0.27	0.21	0.25	0.21	0.27	0.01	0.11	0.37	0.55	0.37	0.36
OP1	0.06	0.25	0.11	0.02	0.10	0.12	0.11	0.24	0.12	0.22	0.18	0.23	0.15	0.22	0.08	0.16	0.02	0.07	0.15	0.55	0.31	0.28
OP2	0.11	0.23	0.10	0.07	0.19	0.20	0.27	0.36	0.27	0.34	0.23	0.20	0.32	0.37	0.20	0.07	0.02	0.16	0.27	0.63	0.35	0.37
P	0.06	0.21	0.11	0.01	0.09	0.10	0.14	0.22	0.13	0.24	0.16	0.19	0.17	0.24	0.11	0.13	0.01	0.05	0.22	0.52	0.25	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.20	0.21	0.34	0.14
C2	0.03	0.00	0.14	0.18	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.21	0.03	0.40	0.34	0.65	0.41
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.03	0.03	0.05	0.09	0.10	0.15	0.05	0.07	0.02	0.00	0.03	0.02	0.20	0.32	0.20	0.12
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.09	0.17	0.14	0.18	0.09	0.14	0.06	0.02	0.01	0.02	0.24	0.36	0.14	0.16
C4	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.40	0.29	0.62	0.38
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.10	0.07	0.08	0.08	0.09	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.25	0.24	0.10
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.48	0.39	0.77	0.51
C5'	0.04	0.15	0.03	0.03	0.13	0.01	0.16	0.00	0.17	0.18	0.17	0.13	0.20	0.19	0.11	0.06	0.06	0.02	0.01	0.15	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.49	0.44	0.82	0.55
C8	0.01	0.01	0.09	0.17	0.00	0.10	0.02	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.18	0.04	0.48	0.33	0.67	0.45
N1	0.02	0.00	0.10	0.14	0.02	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.02	0.46	0.40	0.76	0.49
N3	0.02	0.01	0.15	0.18	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.03	0.36	0.29	0.56	0.34
N6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.20	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.11	0.04	0.52	0.52	0.91	0.62
N7	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.16	0.03	0.52	0.44	0.82	0.56
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.36	0.22	0.52	0.31
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.06	0.04	0.06	0.07	0.06	0.11	0.13	0.06	0.04	0.03	0.00	0.04	0.07	0.08	0.43	0.20	0.16
O3'	0.02	0.21	0.03	0.01	0.09	0.03	0.09	0.06	0.10	0.18	0.16	0.20	0.11	0.16	0.06	0.04	0.00	0.02	0.20	0.48	0.19	0.24
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.16	0.20	0.36	0.17
O5'	0.20	0.40	0.20	0.24	0.40	0.02	0.48	0.01	0.49	0.48	0.46	0.36	0.52	0.52	0.36	0.08	0.20	0.16	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.21	0.34	0.32	0.36	0.29	0.25	0.39	0.15	0.44	0.33	0.40	0.29	0.52	0.44	0.22	0.43	0.48	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.65	0.20	0.14	0.62	0.24	0.77	0.25	0.82	0.67	0.76	0.56	0.91	0.82	0.52	0.20	0.19	0.36	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.41	0.12	0.16	0.38	0.10	0.51	0.02	0.55	0.45	0.49	0.34	0.62	0.56	0.31	0.16	0.24	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00