Doublet Group distance statistics: 54462

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 6, 3, 2, 3, 4, 1, 3, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.016, 0.022, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.013, 0.021, 0.030, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.015, 0.027, 0.040, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.020, 0.038, 0.056, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.038 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.050, 0.087, 0.123, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.087 std_dev=0.037
N4	A	0, 0.018, 0.056, 0.095, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.056 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.070, 0.225, 0.379, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.225 std_dev=0.155
C2'	A	0, 0.087, 0.246, 0.406, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.246 std_dev=0.160
O2'	A	0, 0.118, 0.296, 0.473, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.296 std_dev=0.178
C4'	A	0, 0.108, 0.352, 0.596, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.352 std_dev=0.244
C3'	A	0, 0.105, 0.362, 0.619, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.362 std_dev=0.257
P	A	0, 0.223, 0.495, 0.766, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.495 std_dev=0.272
C4	B	0, 0.270, 0.586, 0.902, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.586 std_dev=0.316
N9	B	0, 0.315, 0.632, 0.949, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.632 std_dev=0.317
OP1	A	0, 0.373, 0.695, 1.016, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.695 std_dev=0.321
C5	B	0, 0.202, 0.531, 0.859, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.531 std_dev=0.328
C8	B	0, 0.303, 0.635, 0.967, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.635 std_dev=0.332
OP2	A	0, 0.399, 0.732, 1.064, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.732 std_dev=0.332
N7	B	0, 0.243, 0.587, 0.931, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.587 std_dev=0.344
O3'	A	0, 0.182, 0.540, 0.897, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.540 std_dev=0.358
C6	B	0, 0.161, 0.528, 0.894, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.528 std_dev=0.367
N3	B	0, 0.291, 0.663, 1.035, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.663 std_dev=0.372
C2'	B	0, 0.317, 0.693, 1.068, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.693 std_dev=0.376
C1'	B	0, 0.326, 0.707, 1.088, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.707 std_dev=0.381
N6	B	0, 0.183, 0.568, 0.953, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.568 std_dev=0.385
N1	B	0, 0.196, 0.599, 1.003, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.599 std_dev=0.404
C2	B	0, 0.250, 0.667, 1.084, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.667 std_dev=0.417
C5'	A	0, 0.190, 0.609, 1.029, 2.307 max_d=2.307 avg_d=0.609 std_dev=0.420
O5'	A	0, 0.218, 0.639, 1.060, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.639 std_dev=0.421
O2'	B	0, 0.359, 0.797, 1.234, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.797 std_dev=0.438
C3'	B	0, 0.257, 0.696, 1.136, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.696 std_dev=0.440
O3'	B	0, 0.317, 0.781, 1.244, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.781 std_dev=0.463
O4'	B	0, 0.310, 0.777, 1.245, 2.086 max_d=2.086 avg_d=0.777 std_dev=0.468
C4'	B	0, 0.299, 0.823, 1.348, 2.058 max_d=2.058 avg_d=0.823 std_dev=0.525
O5'	B	0, 0.277, 0.855, 1.432, 2.536 max_d=2.536 avg_d=0.855 std_dev=0.577
C5'	B	0, 0.280, 0.928, 1.576, 2.518 max_d=2.518 avg_d=0.928 std_dev=0.648
P	B	0, 0.346, 1.022, 1.698, 3.387 max_d=3.387 avg_d=1.022 std_dev=0.676
OP2	B	0, 0.361, 1.054, 1.747, 3.358 max_d=3.358 avg_d=1.054 std_dev=0.693
OP1	B	0, 0.503, 1.277, 2.052, 3.774 max_d=3.774 avg_d=1.277 std_dev=0.775

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.15	0.13	0.22	0.11
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.29	0.23	0.26	0.20
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.03	0.06	0.03	0.07	0.07	0.12	0.00	0.02	0.01	0.17	0.22	0.16	0.11
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.10	0.09	0.14	0.02	0.01	0.01	0.21	0.30	0.15	0.14
C4	0.03	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.38	0.31	0.33	0.30
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.06	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.02	0.13	0.23	0.06
C5	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.04	0.40	0.30	0.31	0.30
C5'	0.03	0.10	0.03	0.02	0.15	0.01	0.15	0.00	0.13	0.09	0.13	0.16	0.09	0.04	0.04	0.02	0.01	0.17	0.26	0.02
C6	0.02	0.02	0.06	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.04	0.37	0.24	0.24	0.22
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.28	0.20	0.23	0.17
N3	0.03	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.34	0.27	0.30	0.26
N4	0.03	0.01	0.07	0.09	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.12	0.04	0.40	0.34	0.37	0.33
O2	0.04	0.01	0.12	0.14	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.16	0.05	0.24	0.20	0.26	0.18
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.04	0.03	0.08	0.08	0.10	0.00	0.04	0.05	0.07	0.16	0.18	0.07
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.04	0.10	0.05	0.12	0.12	0.16	0.04	0.00	0.02	0.16	0.35	0.19	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.09	0.10	0.29	0.16
O5'	0.15	0.29	0.17	0.21	0.38	0.02	0.40	0.01	0.37	0.28	0.34	0.40	0.24	0.07	0.16	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.23	0.22	0.30	0.31	0.13	0.30	0.17	0.24	0.20	0.27	0.34	0.20	0.16	0.35	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.26	0.16	0.15	0.33	0.23	0.31	0.26	0.24	0.23	0.30	0.37	0.26	0.18	0.19	0.29	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.20	0.11	0.14	0.30	0.06	0.30	0.02	0.22	0.17	0.26	0.33	0.18	0.07	0.16	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.43	0.26	0.25	0.22	0.28	0.19	0.38	0.20	0.30	0.33	0.38	0.25	0.32	0.22	0.31	0.23	0.26	0.27	0.56	0.38	0.28
C2	0.19	0.47	0.20	0.18	0.24	0.24	0.17	0.37	0.27	0.25	0.44	0.39	0.22	0.25	0.18	0.22	0.17	0.23	0.35	0.63	0.49	0.42
C2'	0.22	0.44	0.24	0.19	0.22	0.22	0.19	0.35	0.21	0.29	0.34	0.39	0.24	0.31	0.21	0.32	0.16	0.22	0.30	0.63	0.39	0.32
C3'	0.19	0.38	0.24	0.13	0.19	0.15	0.17	0.31	0.19	0.26	0.30	0.34	0.22	0.27	0.17	0.35	0.14	0.16	0.30	0.66	0.37	0.32
C4	0.19	0.44	0.20	0.22	0.29	0.28	0.28	0.42	0.38	0.19	0.45	0.37	0.37	0.17	0.20	0.20	0.24	0.27	0.44	0.67	0.58	0.53
C4'	0.22	0.37	0.26	0.17	0.22	0.18	0.23	0.32	0.25	0.27	0.30	0.34	0.28	0.29	0.21	0.38	0.18	0.17	0.23	0.58	0.32	0.23
C5	0.21	0.41	0.23	0.24	0.29	0.30	0.26	0.43	0.33	0.19	0.40	0.37	0.30	0.17	0.21	0.22	0.25	0.29	0.41	0.65	0.49	0.47
C5'	0.29	0.39	0.36	0.14	0.29	0.12	0.27	0.26	0.29	0.29	0.34	0.38	0.29	0.29	0.27	0.49	0.18	0.17	0.20	0.60	0.32	0.25
C6	0.19	0.41	0.21	0.20	0.24	0.27	0.18	0.41	0.26	0.22	0.36	0.36	0.22	0.19	0.17	0.22	0.19	0.26	0.33	0.61	0.42	0.36
N1	0.19	0.44	0.20	0.20	0.22	0.25	0.15	0.39	0.22	0.26	0.38	0.38	0.20	0.26	0.17	0.24	0.17	0.24	0.31	0.60	0.43	0.35
N3	0.17	0.47	0.18	0.18	0.26	0.25	0.22	0.39	0.35	0.20	0.47	0.38	0.33	0.17	0.17	0.19	0.20	0.23	0.40	0.66	0.55	0.49
N4	0.23	0.44	0.23	0.27	0.32	0.32	0.34	0.45	0.43	0.23	0.47	0.37	0.45	0.25	0.24	0.22	0.29	0.31	0.49	0.69	0.66	0.61
O2	0.22	0.50	0.22	0.19	0.25	0.23	0.19	0.36	0.25	0.28	0.45	0.41	0.21	0.30	0.21	0.27	0.18	0.24	0.34	0.62	0.48	0.40
O2'	0.26	0.46	0.27	0.24	0.26	0.26	0.25	0.36	0.26	0.31	0.35	0.41	0.32	0.34	0.25	0.36	0.22	0.26	0.27	0.61	0.38	0.29
O3'	0.20	0.39	0.25	0.12	0.19	0.13	0.18	0.30	0.20	0.26	0.30	0.34	0.24	0.28	0.18	0.38	0.14	0.14	0.30	0.69	0.38	0.33
O4'	0.23	0.39	0.25	0.27	0.22	0.27	0.23	0.38	0.26	0.29	0.32	0.35	0.29	0.31	0.21	0.32	0.27	0.23	0.24	0.51	0.32	0.21
O5'	0.26	0.40	0.28	0.13	0.34	0.10	0.37	0.15	0.39	0.36	0.40	0.37	0.41	0.39	0.31	0.28	0.02	0.17	0.34	0.75	0.37	0.41
OP1	0.09	0.26	0.15	0.03	0.17	0.13	0.21	0.23	0.25	0.18	0.26	0.22	0.28	0.22	0.12	0.20	0.03	0.09	0.20	0.75	0.37	0.39
OP2	0.11	0.31	0.08	0.09	0.23	0.22	0.26	0.34	0.31	0.21	0.33	0.27	0.34	0.26	0.16	0.08	0.03	0.19	0.26	0.83	0.42	0.46
P	0.06	0.25	0.11	0.02	0.17	0.10	0.21	0.19	0.24	0.19	0.26	0.21	0.27	0.23	0.12	0.14	0.01	0.05	0.21	0.74	0.34	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.22	0.31	0.11
C2	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.09	0.17	0.03	0.28	0.46	0.37	0.23
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.08	0.08	0.11	0.06	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.40	0.23	0.13
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.06	0.02	0.01	0.01	0.21	0.48	0.21	0.21
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.28	0.38	0.34	0.20
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.05	0.08	0.09	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.20	0.25	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.34	0.41	0.37	0.26
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.15	0.13	0.09	0.17	0.17	0.09	0.06	0.03	0.01	0.01	0.12	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.03	0.36	0.47	0.40	0.29
C8	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.14	0.04	0.33	0.29	0.32	0.20
N1	0.02	0.00	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.16	0.02	0.33	0.49	0.40	0.28
N3	0.03	0.00	0.11	0.13	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.15	0.03	0.24	0.41	0.34	0.19
N6	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.16	0.03	0.39	0.49	0.43	0.34
N7	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.37	0.37	0.36	0.27
N9	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.25	0.29	0.31	0.15
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.04	0.06	0.04	0.06	0.06	0.05	0.08	0.09	0.06	0.05	0.02	0.00	0.05	0.06	0.08	0.38	0.25	0.12
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.03	0.14	0.14	0.16	0.15	0.16	0.15	0.06	0.05	0.00	0.02	0.22	0.60	0.25	0.29
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.12	0.12	0.37	0.18
O5'	0.12	0.28	0.15	0.21	0.28	0.02	0.34	0.01	0.36	0.33	0.33	0.24	0.39	0.37	0.25	0.08	0.22	0.12	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	0.46	0.40	0.48	0.38	0.20	0.41	0.12	0.47	0.29	0.49	0.41	0.49	0.37	0.29	0.38	0.60	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.31	0.37	0.23	0.21	0.34	0.25	0.37	0.22	0.40	0.32	0.40	0.34	0.43	0.36	0.31	0.25	0.25	0.37	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.23	0.13	0.21	0.20	0.06	0.26	0.02	0.29	0.20	0.28	0.19	0.34	0.27	0.15	0.12	0.29	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00