Doublet Group distance statistics: 54463

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 3, 2, 3, 1, 4, 4, 5, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.011, 0.017, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.017, 0.025, 0.033, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.025 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.012, 0.021, 0.029, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.019, 0.028, 0.036, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.023, 0.032, 0.041, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.032 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N4	A	0, 0.028, 0.052, 0.076, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.052 std_dev=0.024
O2	A	0, 0.035, 0.062, 0.090, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.062 std_dev=0.027
C2'	A	0, 0.178, 0.298, 0.418, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.298 std_dev=0.120
O4'	A	0, 0.149, 0.293, 0.438, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.293 std_dev=0.144
O2'	A	0, 0.325, 0.470, 0.615, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.470 std_dev=0.145
C3'	A	0, 0.288, 0.485, 0.683, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.485 std_dev=0.197
C1'	B	0, 0.379, 0.583, 0.787, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.583 std_dev=0.204
C2'	B	0, 0.441, 0.655, 0.869, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.655 std_dev=0.214
C4'	A	0, 0.218, 0.434, 0.650, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.434 std_dev=0.216
N9	B	0, 0.339, 0.560, 0.781, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.560 std_dev=0.221
C8	B	0, 0.343, 0.586, 0.828, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.586 std_dev=0.243
O4'	B	0, 0.357, 0.604, 0.852, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.604 std_dev=0.247
C3'	B	0, 0.399, 0.653, 0.908, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.653 std_dev=0.254
N7	B	0, 0.442, 0.703, 0.964, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.703 std_dev=0.261
O3'	A	0, 0.475, 0.752, 1.029, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.752 std_dev=0.277
O5'	A	0, 0.154, 0.439, 0.724, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.439 std_dev=0.285
O2'	B	0, 0.505, 0.790, 1.075, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.790 std_dev=0.285
C4	B	0, 0.379, 0.669, 0.959, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.669 std_dev=0.290
O3'	B	0, 0.563, 0.856, 1.150, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.856 std_dev=0.293
P	A	0, 0.276, 0.573, 0.870, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.573 std_dev=0.297
C5	B	0, 0.419, 0.723, 1.028, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.723 std_dev=0.305
C4'	B	0, 0.387, 0.693, 0.999, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.693 std_dev=0.306
OP2	A	0, 0.388, 0.723, 1.058, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.723 std_dev=0.335
C5'	A	0, 0.433, 0.790, 1.148, 1.899 max_d=1.899 avg_d=0.790 std_dev=0.358
OP1	A	0, 0.605, 0.963, 1.321, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.963 std_dev=0.358
N3	B	0, 0.449, 0.812, 1.175, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.812 std_dev=0.363
C6	B	0, 0.503, 0.891, 1.278, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.891 std_dev=0.388
C5'	B	0, 0.457, 0.866, 1.275, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.866 std_dev=0.409
C2	B	0, 0.540, 0.965, 1.390, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.965 std_dev=0.425
N6	B	0, 0.583, 1.018, 1.453, 1.750 max_d=1.750 avg_d=1.018 std_dev=0.435
N1	B	0, 0.553, 0.997, 1.441, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.997 std_dev=0.444
O5'	B	0, 0.438, 1.087, 1.735, 3.296 max_d=3.296 avg_d=1.087 std_dev=0.649
P	B	0, 0.614, 1.577, 2.541, 3.654 max_d=3.654 avg_d=1.577 std_dev=0.963
OP1	B	0, 0.740, 1.789, 2.837, 3.844 max_d=3.844 avg_d=1.789 std_dev=1.048
OP2	B	0, 0.470, 1.784, 3.099, 5.181 max_d=5.181 avg_d=1.784 std_dev=1.315

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.15	0.12	0.13	0.11
C2	0.02	0.00	0.05	0.10	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.27	0.25	0.30	0.26
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.00	0.02	0.01	0.16	0.20	0.09	0.12
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.09	0.07	0.12	0.12	0.10	0.02	0.01	0.02	0.20	0.27	0.09	0.16
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.13	0.03	0.36	0.39	0.45	0.39
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.10	0.05	0.07	0.11	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.10	0.15	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.12	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.12	0.03	0.37	0.40	0.44	0.40
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.23	0.01	0.25	0.00	0.21	0.13	0.18	0.26	0.08	0.05	0.03	0.02	0.01	0.16	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.10	0.03	0.33	0.31	0.32	0.31
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.26	0.23	0.25	0.23
N3	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.32	0.32	0.39	0.33
N4	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.11	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.15	0.03	0.37	0.44	0.51	0.43
O2	0.04	0.01	0.08	0.10	0.01	0.04	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.11	0.05	0.23	0.21	0.26	0.21
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.07	0.05	0.04	0.05	0.03	0.04	0.09	0.08	0.12	0.00	0.04	0.06	0.06	0.11	0.11	0.08
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.13	0.02	0.12	0.03	0.10	0.06	0.13	0.15	0.11	0.04	0.00	0.02	0.15	0.30	0.13	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.06	0.02	0.00	0.09	0.10	0.16	0.10
O5'	0.15	0.27	0.16	0.20	0.36	0.02	0.37	0.01	0.33	0.26	0.32	0.37	0.23	0.06	0.15	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.25	0.20	0.27	0.39	0.10	0.40	0.16	0.31	0.23	0.32	0.44	0.21	0.11	0.30	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.30	0.09	0.09	0.45	0.15	0.44	0.22	0.32	0.25	0.39	0.51	0.26	0.11	0.13	0.16	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.26	0.12	0.16	0.39	0.05	0.40	0.02	0.31	0.23	0.33	0.43	0.21	0.08	0.16	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.28	0.23	0.21	0.20	0.21	0.27	0.20	0.31	0.27	0.32	0.19	0.35	0.29	0.22	0.33	0.24	0.22	0.44	0.48	0.66	0.38
C2	0.22	0.15	0.25	0.24	0.14	0.22	0.20	0.23	0.25	0.20	0.21	0.16	0.33	0.23	0.17	0.33	0.28	0.20	0.55	0.54	0.90	0.56
C2'	0.20	0.25	0.19	0.16	0.19	0.16	0.25	0.17	0.29	0.26	0.29	0.18	0.34	0.28	0.20	0.30	0.20	0.17	0.49	0.59	0.69	0.45
C3'	0.17	0.26	0.16	0.14	0.17	0.14	0.23	0.16	0.26	0.24	0.27	0.20	0.29	0.26	0.18	0.28	0.19	0.14	0.50	0.65	0.62	0.46
C4	0.24	0.24	0.31	0.32	0.17	0.28	0.14	0.33	0.11	0.19	0.11	0.26	0.23	0.21	0.19	0.34	0.36	0.23	0.67	0.68	1.10	0.74
C4'	0.18	0.33	0.15	0.12	0.23	0.13	0.27	0.14	0.30	0.27	0.32	0.27	0.33	0.29	0.21	0.27	0.17	0.15	0.37	0.56	0.45	0.31
C5	0.23	0.18	0.31	0.33	0.13	0.29	0.14	0.34	0.14	0.21	0.10	0.21	0.25	0.24	0.17	0.35	0.37	0.22	0.66	0.66	1.04	0.71
C5'	0.21	0.33	0.22	0.12	0.24	0.15	0.27	0.12	0.29	0.26	0.31	0.30	0.32	0.29	0.21	0.37	0.17	0.17	0.35	0.60	0.35	0.31
C6	0.20	0.16	0.27	0.27	0.11	0.24	0.21	0.27	0.23	0.24	0.18	0.14	0.30	0.27	0.16	0.34	0.33	0.19	0.58	0.57	0.87	0.57
N1	0.21	0.18	0.24	0.23	0.14	0.21	0.23	0.22	0.27	0.23	0.24	0.13	0.33	0.27	0.18	0.33	0.28	0.19	0.52	0.52	0.81	0.50
N3	0.23	0.20	0.28	0.28	0.15	0.24	0.16	0.28	0.17	0.18	0.11	0.22	0.29	0.21	0.18	0.34	0.32	0.20	0.61	0.61	1.03	0.66
N4	0.27	0.33	0.33	0.36	0.25	0.33	0.19	0.39	0.15	0.23	0.24	0.31	0.16	0.23	0.24	0.35	0.39	0.27	0.72	0.77	1.22	0.84
O2	0.24	0.17	0.24	0.22	0.16	0.21	0.22	0.21	0.28	0.21	0.26	0.16	0.36	0.24	0.19	0.33	0.26	0.22	0.52	0.51	0.86	0.51
O2'	0.26	0.31	0.23	0.21	0.22	0.23	0.28	0.21	0.33	0.27	0.35	0.23	0.38	0.29	0.23	0.35	0.24	0.24	0.39	0.54	0.57	0.33
O3'	0.17	0.26	0.16	0.13	0.18	0.13	0.23	0.15	0.25	0.24	0.27	0.21	0.29	0.26	0.18	0.27	0.17	0.14	0.48	0.70	0.57	0.45
O4'	0.20	0.34	0.19	0.19	0.24	0.20	0.29	0.19	0.33	0.28	0.35	0.26	0.35	0.31	0.22	0.31	0.24	0.19	0.39	0.47	0.53	0.31
O5'	0.22	0.39	0.23	0.09	0.28	0.07	0.25	0.10	0.28	0.22	0.35	0.36	0.26	0.22	0.23	0.26	0.03	0.15	0.48	0.59	0.52	0.42
OP1	0.06	0.26	0.11	0.04	0.13	0.12	0.13	0.24	0.17	0.16	0.23	0.22	0.18	0.16	0.07	0.17	0.02	0.08	0.29	0.53	0.38	0.30
OP2	0.11	0.32	0.12	0.08	0.23	0.14	0.25	0.27	0.29	0.22	0.33	0.27	0.30	0.24	0.17	0.11	0.02	0.12	0.58	0.73	0.68	0.60
P	0.06	0.26	0.11	0.02	0.14	0.07	0.14	0.17	0.18	0.14	0.24	0.23	0.18	0.14	0.08	0.13	0.02	0.03	0.40	0.55	0.43	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.18	0.30	0.31	0.13
C2	0.04	0.00	0.13	0.16	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.04	0.44	0.39	0.73	0.42
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.13	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.27	0.41	0.28	0.17
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.03	0.10	0.09	0.14	0.15	0.09	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.35	0.43	0.29	0.23
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.10	0.02	0.45	0.37	0.69	0.43
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.39	0.27	0.16
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.56	0.49	0.91	0.61
C5'	0.03	0.13	0.02	0.03	0.12	0.01	0.15	0.00	0.16	0.14	0.15	0.11	0.18	0.16	0.10	0.05	0.04	0.01	0.01	0.20	0.35	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.12	0.03	0.58	0.53	0.99	0.65
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.55	0.46	0.78	0.57
N1	0.04	0.00	0.10	0.14	0.02	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.17	0.03	0.52	0.47	0.89	0.56
N3	0.04	0.00	0.13	0.15	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.04	0.38	0.36	0.60	0.33
N6	0.03	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.11	0.03	0.63	0.64	1.12	0.76
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.09	0.03	0.61	0.58	0.99	0.71
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.40	0.32	0.57	0.35
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.08	0.04	0.11	0.12	0.07	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.51	0.18	0.20
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.02	0.08	0.04	0.12	0.10	0.17	0.17	0.11	0.09	0.04	0.04	0.00	0.02	0.27	0.52	0.22	0.23
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.30	0.31	0.17
O5'	0.18	0.44	0.27	0.35	0.45	0.01	0.56	0.01	0.58	0.55	0.52	0.38	0.63	0.61	0.40	0.07	0.27	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.30	0.39	0.41	0.43	0.37	0.39	0.49	0.20	0.53	0.46	0.47	0.36	0.64	0.58	0.32	0.51	0.52	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.73	0.28	0.29	0.69	0.27	0.91	0.35	0.99	0.78	0.89	0.60	1.12	0.99	0.57	0.18	0.22	0.31	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.42	0.17	0.23	0.43	0.16	0.61	0.01	0.65	0.57	0.56	0.33	0.76	0.71	0.35	0.20	0.23	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00