Doublet Group distance statistics: 54465

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 3, 2, 3, 3, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, -0.002, 0.013, 0.027, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.013 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.013, 0.034, 0.056, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.006, 0.035, 0.065, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.035 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.018, 0.129, 0.240, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.129 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.062, 0.177, 0.291, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.177 std_dev=0.115
O2'	A	0, 0.106, 0.251, 0.395, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.251 std_dev=0.144
C4'	A	0, 0.058, 0.225, 0.392, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.225 std_dev=0.167
C3'	A	0, 0.119, 0.295, 0.471, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.295 std_dev=0.176
C2'	B	0, 0.250, 0.503, 0.756, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.503 std_dev=0.253
C5	B	0, 0.444, 0.704, 0.964, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.704 std_dev=0.260
O3'	A	0, 0.204, 0.466, 0.727, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.466 std_dev=0.261
N7	B	0, 0.527, 0.789, 1.050, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.789 std_dev=0.262
C8	B	0, 0.512, 0.774, 1.037, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.774 std_dev=0.263
C4	B	0, 0.369, 0.632, 0.895, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.632 std_dev=0.263
N9	B	0, 0.409, 0.674, 0.938, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.674 std_dev=0.264
C2	B	0, 0.383, 0.658, 0.932, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.658 std_dev=0.274
C5'	A	0, 0.094, 0.376, 0.658, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.376 std_dev=0.282
N3	B	0, 0.311, 0.595, 0.880, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.595 std_dev=0.284
N1	B	0, 0.415, 0.711, 1.007, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.711 std_dev=0.296
C6	B	0, 0.423, 0.725, 1.028, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.725 std_dev=0.303
P	A	0, 0.205, 0.508, 0.812, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.508 std_dev=0.304
O5'	A	0, 0.162, 0.469, 0.777, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.469 std_dev=0.308
C1'	B	0, 0.374, 0.686, 0.998, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.686 std_dev=0.312
OP1	A	0, 0.284, 0.612, 0.941, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.612 std_dev=0.328
OP2	A	0, 0.250, 0.579, 0.908, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.579 std_dev=0.329
C3'	B	0, 0.240, 0.570, 0.899, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.570 std_dev=0.330
O2'	B	0, 0.337, 0.670, 1.003, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.670 std_dev=0.333
O3'	B	0, 0.234, 0.569, 0.904, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.569 std_dev=0.335
N6	B	0, 0.460, 0.812, 1.164, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.812 std_dev=0.352
O4'	B	0, 0.470, 0.883, 1.296, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.883 std_dev=0.413
C4'	B	0, 0.394, 0.886, 1.378, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.886 std_dev=0.492
C5'	B	0, 0.408, 1.177, 1.947, 2.670 max_d=2.670 avg_d=1.177 std_dev=0.770
O5'	B	0, 0.495, 1.280, 2.066, 2.408 max_d=2.408 avg_d=1.280 std_dev=0.786
OP2	B	0, 1.179, 2.132, 3.086, 4.341 max_d=4.341 avg_d=2.132 std_dev=0.954
P	B	0, 0.766, 1.975, 3.184, 4.139 max_d=4.139 avg_d=1.975 std_dev=1.209
OP1	B	0, 1.015, 2.679, 4.342, 5.884 max_d=5.884 avg_d=2.679 std_dev=1.663

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.08	0.08	0.17	0.09
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.02	0.12	0.16	0.24	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.06	0.04	0.10	0.00	0.02	0.01	0.05	0.11	0.10	0.06
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.11	0.06	0.09	0.10	0.11	0.02	0.01	0.01	0.07	0.14	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.13	0.04	0.17	0.25	0.32	0.20
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.05	0.07	0.02	0.00	0.01	0.08	0.04	0.02
C5	0.01	0.02	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.13	0.04	0.19	0.26	0.34	0.21
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.05	0.07	0.11	0.05	0.07	0.02	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.12	0.04	0.18	0.20	0.28	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.14	0.23	0.13
N3	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.13	0.03	0.14	0.21	0.28	0.17
N4	0.02	0.02	0.04	0.10	0.00	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.15	0.05	0.18	0.29	0.34	0.22
O2	0.02	0.01	0.10	0.11	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.10	0.14	0.03	0.10	0.13	0.22	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.07	0.03	0.07	0.04	0.02	0.06	0.04	0.10	0.00	0.04	0.05	0.04	0.13	0.07	0.05
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.13	0.02	0.13	0.02	0.12	0.07	0.13	0.15	0.14	0.04	0.00	0.02	0.10	0.22	0.18	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.09	0.08	0.16	0.11
O5'	0.08	0.12	0.05	0.07	0.17	0.01	0.19	0.01	0.18	0.12	0.14	0.18	0.10	0.04	0.10	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.16	0.11	0.14	0.25	0.08	0.26	0.09	0.20	0.14	0.21	0.29	0.13	0.13	0.22	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.24	0.10	0.10	0.32	0.04	0.34	0.02	0.28	0.23	0.28	0.34	0.22	0.07	0.18	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.06	0.07	0.20	0.02	0.21	0.02	0.17	0.13	0.17	0.22	0.13	0.05	0.14	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.26	0.24	0.18	0.24	0.19	0.29	0.25	0.34	0.26	0.33	0.21	0.39	0.30	0.23	0.37	0.16	0.22	0.43	0.99	0.50	0.54
C2	0.22	0.16	0.23	0.17	0.19	0.21	0.25	0.36	0.26	0.27	0.18	0.19	0.36	0.30	0.22	0.33	0.12	0.21	0.61	1.43	0.71	0.79
C2'	0.19	0.27	0.19	0.14	0.21	0.14	0.28	0.24	0.33	0.23	0.33	0.20	0.39	0.28	0.20	0.34	0.11	0.16	0.46	1.04	0.54	0.64
C3'	0.11	0.24	0.12	0.11	0.16	0.09	0.22	0.20	0.28	0.18	0.29	0.16	0.33	0.22	0.13	0.29	0.09	0.09	0.43	0.92	0.53	0.62
C4	0.27	0.28	0.24	0.23	0.24	0.32	0.23	0.53	0.14	0.33	0.19	0.27	0.19	0.33	0.28	0.27	0.14	0.30	0.77	1.73	0.92	1.00
C4'	0.14	0.27	0.14	0.11	0.18	0.12	0.23	0.14	0.29	0.17	0.30	0.20	0.32	0.21	0.14	0.31	0.12	0.12	0.31	0.67	0.40	0.41
C5	0.28	0.23	0.25	0.24	0.22	0.33	0.20	0.51	0.12	0.33	0.14	0.24	0.19	0.31	0.29	0.27	0.14	0.31	0.73	1.55	0.84	0.93
C5'	0.13	0.27	0.12	0.10	0.19	0.11	0.21	0.12	0.25	0.16	0.27	0.22	0.27	0.19	0.15	0.23	0.12	0.11	0.26	0.56	0.40	0.35
C6	0.25	0.14	0.24	0.20	0.19	0.25	0.22	0.39	0.21	0.29	0.15	0.16	0.28	0.29	0.25	0.29	0.12	0.25	0.59	1.26	0.67	0.74
N1	0.23	0.16	0.24	0.18	0.20	0.20	0.26	0.33	0.29	0.27	0.23	0.17	0.35	0.30	0.23	0.33	0.13	0.22	0.54	1.23	0.62	0.69
N3	0.24	0.24	0.23	0.19	0.20	0.26	0.23	0.45	0.18	0.29	0.12	0.23	0.29	0.31	0.24	0.29	0.12	0.25	0.71	1.64	0.85	0.93
N4	0.31	0.35	0.25	0.26	0.29	0.39	0.28	0.61	0.21	0.37	0.30	0.32	0.16	0.37	0.32	0.27	0.17	0.36	0.85	1.93	1.05	1.13
O2	0.23	0.19	0.24	0.17	0.20	0.19	0.26	0.33	0.30	0.26	0.24	0.20	0.40	0.30	0.22	0.36	0.14	0.21	0.58	1.39	0.68	0.75
O2'	0.24	0.33	0.22	0.14	0.26	0.16	0.31	0.19	0.37	0.25	0.38	0.26	0.43	0.30	0.23	0.39	0.13	0.21	0.38	0.93	0.45	0.53
O3'	0.11	0.26	0.10	0.10	0.17	0.08	0.23	0.18	0.29	0.17	0.31	0.18	0.35	0.22	0.13	0.28	0.10	0.07	0.41	0.87	0.54	0.62
O4'	0.20	0.27	0.21	0.18	0.20	0.19	0.26	0.21	0.31	0.22	0.31	0.19	0.34	0.25	0.19	0.36	0.18	0.19	0.34	0.74	0.41	0.41
O5'	0.15	0.25	0.18	0.08	0.19	0.06	0.23	0.13	0.26	0.20	0.27	0.21	0.28	0.22	0.17	0.25	0.01	0.10	0.36	0.68	0.47	0.50
OP1	0.04	0.22	0.08	0.03	0.16	0.07	0.23	0.15	0.27	0.19	0.26	0.17	0.32	0.25	0.11	0.14	0.02	0.04	0.18	0.83	0.47	0.37
OP2	0.18	0.40	0.19	0.08	0.36	0.13	0.42	0.25	0.46	0.33	0.45	0.35	0.49	0.40	0.28	0.15	0.03	0.13	0.31	0.77	0.59	0.56
P	0.07	0.24	0.10	0.02	0.19	0.06	0.24	0.13	0.28	0.20	0.27	0.20	0.31	0.24	0.14	0.13	0.01	0.03	0.24	0.66	0.46	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.50	0.25	0.13
C2	0.05	0.00	0.12	0.14	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.15	0.18	0.04	0.48	1.12	0.60	0.44
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.08	0.06	0.10	0.11	0.08	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.21	0.35	0.23	0.13
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.10	0.10	0.12	0.14	0.09	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.24	0.34	0.24	0.20
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.07	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.44	0.98	0.53	0.34
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.09	0.08	0.10	0.11	0.06	0.06	0.02	0.01	0.01	0.27	0.23	0.10
C5	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.09	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.12	0.04	0.52	1.22	0.70	0.47
C5'	0.05	0.19	0.02	0.02	0.18	0.01	0.24	0.00	0.25	0.23	0.23	0.16	0.28	0.27	0.16	0.06	0.04	0.02	0.01	0.36	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.09	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.15	0.04	0.56	1.36	0.78	0.55
C8	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.11	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.11	0.06	0.43	0.97	0.54	0.32
N1	0.04	0.01	0.10	0.12	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.17	0.04	0.55	1.30	0.72	0.53
N3	0.05	0.00	0.11	0.14	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.14	0.16	0.04	0.42	0.94	0.48	0.35
N6	0.02	0.02	0.08	0.09	0.01	0.10	0.02	0.28	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.11	0.16	0.05	0.58	1.49	0.88	0.63
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.11	0.01	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.13	0.05	0.52	1.23	0.73	0.47
N9	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.36	0.79	0.41	0.21
O2'	0.01	0.15	0.01	0.02	0.08	0.06	0.08	0.06	0.11	0.02	0.14	0.14	0.11	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.09	0.29	0.15	0.14
O3'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.04	0.15	0.11	0.17	0.16	0.16	0.13	0.06	0.04	0.00	0.02	0.19	0.48	0.30	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.04	0.05	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.09	0.49	0.30	0.27
O5'	0.18	0.48	0.21	0.24	0.44	0.01	0.52	0.01	0.56	0.43	0.55	0.42	0.58	0.52	0.36	0.09	0.19	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.50	1.12	0.35	0.34	0.98	0.27	1.22	0.36	1.36	0.97	1.30	0.94	1.49	1.23	0.79	0.29	0.48	0.49	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.60	0.23	0.24	0.53	0.23	0.70	0.40	0.78	0.54	0.72	0.48	0.88	0.73	0.41	0.15	0.30	0.30	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.44	0.13	0.20	0.34	0.10	0.47	0.01	0.55	0.32	0.53	0.35	0.63	0.47	0.21	0.14	0.22	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00