Doublet Group distance statistics: 54466

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 2, 2, 1, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.005, 0.008, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.019, 0.048, 0.077, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.048 std_dev=0.029
N4	A	0, 0.017, 0.056, 0.095, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.056 std_dev=0.039
N3	B	0, 0.185, 0.321, 0.457, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.321 std_dev=0.136
O4'	A	0, 0.032, 0.188, 0.344, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.188 std_dev=0.156
O2'	A	0, 0.198, 0.356, 0.513, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.356 std_dev=0.158
C2'	A	0, 0.094, 0.253, 0.412, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.253 std_dev=0.159
C4	B	0, 0.174, 0.346, 0.517, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.346 std_dev=0.171
C2	B	0, 0.215, 0.401, 0.586, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.401 std_dev=0.186
N9	B	0, 0.206, 0.416, 0.627, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.416 std_dev=0.211
C4'	A	0, 0.132, 0.354, 0.577, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.354 std_dev=0.223
C1'	B	0, 0.230, 0.457, 0.685, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.457 std_dev=0.228
C5	B	0, 0.199, 0.430, 0.661, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.430 std_dev=0.231
C3'	A	0, 0.153, 0.386, 0.619, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.386 std_dev=0.233
C2'	B	0, 0.201, 0.440, 0.679, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.440 std_dev=0.239
N1	B	0, 0.239, 0.486, 0.732, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.486 std_dev=0.246
O4'	B	0, 0.327, 0.582, 0.838, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.582 std_dev=0.256
C6	B	0, 0.230, 0.491, 0.752, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.491 std_dev=0.261
O2'	B	0, 0.233, 0.502, 0.770, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.502 std_dev=0.269
C8	B	0, 0.227, 0.515, 0.803, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.515 std_dev=0.288
C3'	B	0, 0.278, 0.570, 0.863, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.570 std_dev=0.292
O3'	A	0, 0.212, 0.515, 0.818, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.515 std_dev=0.303
N7	B	0, 0.202, 0.514, 0.825, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.514 std_dev=0.312
O3'	B	0, 0.338, 0.668, 0.998, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.668 std_dev=0.330
C4'	B	0, 0.299, 0.643, 0.987, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.643 std_dev=0.344
N6	B	0, 0.261, 0.615, 0.969, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.615 std_dev=0.354
OP2	A	0, 0.496, 0.911, 1.325, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.911 std_dev=0.415
P	A	0, 0.319, 0.736, 1.153, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.736 std_dev=0.417
C5'	A	0, 0.316, 0.760, 1.205, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.760 std_dev=0.444
C5'	B	0, 0.406, 0.865, 1.323, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.865 std_dev=0.458
O5'	A	0, 0.431, 0.906, 1.380, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.906 std_dev=0.474
OP1	A	0, 0.307, 0.817, 1.327, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.817 std_dev=0.510
O5'	B	0, 0.988, 1.685, 2.381, 2.418 max_d=2.418 avg_d=1.685 std_dev=0.696
OP2	B	0, 0.846, 1.669, 2.492, 2.833 max_d=2.833 avg_d=1.669 std_dev=0.823
P	B	0, 1.032, 1.924, 2.816, 2.739 max_d=2.739 avg_d=1.924 std_dev=0.892
OP1	B	0, 1.267, 2.345, 3.423, 3.541 max_d=3.541 avg_d=2.345 std_dev=1.078

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.11	0.32	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.12	0.01	0.06	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.23	0.15	0.39	0.16
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.04	0.05	0.02	0.06	0.05	0.10	0.00	0.03	0.00	0.21	0.23	0.22	0.10
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.10	0.00	0.07	0.05	0.06	0.06	0.13	0.11	0.15	0.01	0.00	0.03	0.31	0.33	0.16	0.19
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.12	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.03	0.32	0.27	0.45	0.27
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.12	0.07	0.09	0.13	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.11	0.35	0.04
C5	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.13	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.34	0.28	0.44	0.28
C5'	0.04	0.20	0.04	0.05	0.32	0.01	0.33	0.00	0.28	0.19	0.27	0.35	0.13	0.04	0.06	0.01	0.01	0.17	0.43	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.12	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.04	0.30	0.21	0.40	0.22
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.22	0.14	0.37	0.15
N3	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.09	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.13	0.02	0.27	0.21	0.43	0.22
N4	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.13	0.00	0.35	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.13	0.03	0.34	0.31	0.46	0.30
O2	0.02	0.00	0.10	0.15	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.03	0.18	0.12	0.37	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.08	0.04	0.06	0.04	0.04	0.05	0.10	0.09	0.11	0.00	0.06	0.04	0.04	0.16	0.28	0.04
O3'	0.02	0.11	0.03	0.00	0.11	0.02	0.08	0.06	0.07	0.05	0.13	0.13	0.14	0.06	0.00	0.01	0.22	0.34	0.17	0.18
O4'	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.05	0.08	0.35	0.10
O5'	0.11	0.23	0.21	0.31	0.32	0.02	0.34	0.01	0.30	0.22	0.27	0.34	0.18	0.04	0.22	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.15	0.23	0.33	0.27	0.11	0.28	0.17	0.21	0.14	0.21	0.31	0.12	0.16	0.34	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.39	0.22	0.16	0.45	0.35	0.44	0.43	0.40	0.37	0.43	0.46	0.37	0.28	0.17	0.35	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.16	0.10	0.19	0.27	0.04	0.28	0.01	0.22	0.15	0.22	0.30	0.11	0.04	0.18	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.18	0.15	0.14	0.10	0.14	0.08	0.15	0.12	0.14	0.18	0.14	0.13	0.10	0.14	0.21	0.15	0.16	0.41	0.44	0.42	0.45
C2	0.19	0.13	0.16	0.17	0.16	0.17	0.14	0.23	0.13	0.19	0.15	0.14	0.14	0.16	0.19	0.19	0.16	0.18	0.51	0.59	0.43	0.59
C2'	0.14	0.19	0.11	0.16	0.10	0.12	0.08	0.16	0.11	0.12	0.17	0.15	0.12	0.09	0.12	0.16	0.21	0.12	0.38	0.45	0.46	0.44
C3'	0.10	0.19	0.13	0.24	0.09	0.21	0.09	0.26	0.12	0.11	0.17	0.15	0.12	0.11	0.09	0.11	0.32	0.14	0.36	0.51	0.50	0.41
C4	0.22	0.11	0.21	0.25	0.15	0.25	0.14	0.35	0.10	0.23	0.14	0.12	0.14	0.19	0.21	0.20	0.25	0.22	0.60	0.72	0.47	0.71
C4'	0.10	0.26	0.12	0.17	0.14	0.15	0.12	0.16	0.17	0.11	0.23	0.22	0.16	0.11	0.10	0.11	0.21	0.12	0.30	0.42	0.47	0.35
C5	0.22	0.11	0.23	0.27	0.13	0.26	0.11	0.34	0.14	0.21	0.16	0.10	0.20	0.15	0.20	0.23	0.27	0.22	0.57	0.63	0.49	0.67
C5'	0.24	0.28	0.27	0.29	0.19	0.32	0.14	0.28	0.16	0.14	0.22	0.29	0.15	0.13	0.17	0.35	0.36	0.27	0.26	0.48	0.51	0.30
C6	0.21	0.14	0.22	0.22	0.12	0.22	0.10	0.26	0.13	0.18	0.16	0.12	0.17	0.13	0.18	0.23	0.22	0.20	0.51	0.53	0.47	0.57
N1	0.19	0.14	0.17	0.17	0.12	0.17	0.09	0.21	0.10	0.16	0.15	0.12	0.13	0.12	0.17	0.20	0.17	0.17	0.48	0.52	0.44	0.54
N3	0.21	0.13	0.18	0.21	0.18	0.21	0.17	0.30	0.13	0.22	0.14	0.15	0.14	0.20	0.21	0.19	0.20	0.20	0.57	0.69	0.45	0.67
N4	0.22	0.12	0.22	0.28	0.16	0.29	0.15	0.41	0.12	0.26	0.16	0.12	0.16	0.22	0.22	0.21	0.29	0.24	0.65	0.83	0.49	0.79
O2	0.19	0.16	0.14	0.14	0.16	0.14	0.16	0.20	0.16	0.18	0.18	0.16	0.18	0.16	0.18	0.19	0.14	0.17	0.49	0.58	0.41	0.56
O2'	0.20	0.20	0.15	0.12	0.14	0.13	0.10	0.13	0.13	0.14	0.18	0.18	0.13	0.10	0.16	0.21	0.16	0.18	0.35	0.39	0.43	0.39
O3'	0.09	0.20	0.12	0.22	0.10	0.20	0.09	0.25	0.12	0.12	0.18	0.16	0.12	0.11	0.09	0.09	0.31	0.13	0.33	0.53	0.51	0.38
O4'	0.10	0.26	0.11	0.13	0.12	0.11	0.13	0.13	0.19	0.11	0.25	0.20	0.19	0.11	0.08	0.15	0.16	0.10	0.36	0.40	0.42	0.39
O5'	0.14	0.27	0.18	0.06	0.19	0.05	0.25	0.09	0.31	0.16	0.31	0.22	0.35	0.24	0.13	0.36	0.02	0.09	0.31	0.56	0.55	0.36
OP1	0.04	0.22	0.07	0.02	0.11	0.05	0.12	0.12	0.17	0.10	0.21	0.18	0.18	0.11	0.05	0.12	0.02	0.02	0.25	0.70	0.68	0.27
OP2	0.14	0.22	0.21	0.05	0.18	0.13	0.18	0.29	0.19	0.17	0.21	0.20	0.19	0.18	0.15	0.22	0.01	0.08	0.41	0.79	0.57	0.45
P	0.07	0.17	0.11	0.01	0.09	0.04	0.11	0.13	0.15	0.10	0.18	0.14	0.17	0.12	0.05	0.17	0.00	0.02	0.28	0.62	0.59	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.29	0.19	0.13
C2	0.01	0.00	0.12	0.14	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.18	0.03	0.35	0.55	0.35	0.36
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.04	0.10	0.11	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.19	0.22	0.30	0.20
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.11	0.08	0.13	0.12	0.11	0.08	0.05	0.01	0.00	0.01	0.23	0.28	0.39	0.24
C4	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.02	0.36	0.55	0.32	0.35
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.09	0.05	0.04	0.08	0.09	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.11	0.30	0.04
C5	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01	0.46	0.70	0.42	0.46
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.10	0.00	0.15	0.00	0.15	0.17	0.12	0.06	0.18	0.19	0.10	0.03	0.03	0.01	0.01	0.14	0.36	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.14	0.02	0.47	0.74	0.47	0.50
C8	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.46	0.66	0.34	0.42
N1	0.01	0.00	0.10	0.13	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.17	0.02	0.42	0.66	0.43	0.44
N3	0.02	0.00	0.11	0.12	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.15	0.03	0.30	0.47	0.29	0.30
N6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.52	0.83	0.55	0.56
N7	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.52	0.78	0.46	0.51
N9	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.33	0.49	0.26	0.29
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03	0.10	0.11	0.06	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.11	0.34	0.10
O3'	0.01	0.18	0.02	0.00	0.10	0.01	0.10	0.03	0.14	0.09	0.17	0.15	0.14	0.09	0.05	0.03	0.00	0.01	0.17	0.39	0.59	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.25	0.22	0.07
O5'	0.16	0.35	0.19	0.23	0.36	0.02	0.46	0.01	0.47	0.46	0.42	0.30	0.52	0.52	0.33	0.04	0.17	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.29	0.55	0.22	0.28	0.55	0.11	0.70	0.14	0.74	0.66	0.66	0.47	0.83	0.78	0.49	0.11	0.39	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.35	0.30	0.39	0.32	0.30	0.42	0.36	0.47	0.34	0.43	0.29	0.55	0.46	0.26	0.34	0.59	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.36	0.20	0.24	0.35	0.04	0.46	0.01	0.50	0.42	0.44	0.30	0.56	0.51	0.29	0.10	0.22	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00