Doublet Group distance statistics: 54467

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 3, 0, 2, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.012, 0.031, 0.049, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.031 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.021, 0.043, 0.065, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.043 std_dev=0.022
C2'	A	0, -0.001, 0.152, 0.304, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.152 std_dev=0.153
O4'	A	0, -0.020, 0.144, 0.309, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.144 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.021, 0.194, 0.367, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.194 std_dev=0.173
N6	B	0, 0.133, 0.359, 0.586, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.359 std_dev=0.227
C6	B	0, 0.115, 0.344, 0.572, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.344 std_dev=0.228
C5	B	0, 0.121, 0.357, 0.592, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.357 std_dev=0.235
C4	B	0, 0.152, 0.392, 0.633, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.392 std_dev=0.241
C4'	A	0, -0.005, 0.252, 0.508, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.252 std_dev=0.256
N3	B	0, 0.146, 0.404, 0.662, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.404 std_dev=0.258
C3'	A	0, 0.018, 0.278, 0.538, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.278 std_dev=0.260
N1	B	0, 0.137, 0.403, 0.668, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.403 std_dev=0.266
C2	B	0, 0.139, 0.421, 0.704, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.421 std_dev=0.282
N7	B	0, 0.137, 0.425, 0.713, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.425 std_dev=0.288
N9	B	0, 0.164, 0.462, 0.759, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.462 std_dev=0.297
C1'	B	0, 0.184, 0.525, 0.866, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.525 std_dev=0.341
O4'	B	0, 0.243, 0.588, 0.933, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.588 std_dev=0.345
C8	B	0, 0.140, 0.487, 0.834, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.487 std_dev=0.347
O3'	A	0, 0.061, 0.423, 0.784, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.423 std_dev=0.362
C4'	B	0, 0.222, 0.610, 0.998, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.610 std_dev=0.388
C2'	B	0, 0.128, 0.520, 0.913, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.520 std_dev=0.393
C3'	B	0, 0.177, 0.570, 0.962, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.570 std_dev=0.393
C5'	A	0, 0.010, 0.434, 0.858, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.434 std_dev=0.424
O5'	A	0, 0.117, 0.542, 0.967, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.542 std_dev=0.425
O2'	B	0, 0.151, 0.578, 1.004, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.578 std_dev=0.427
C5'	B	0, 0.304, 0.733, 1.162, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.733 std_dev=0.429
O3'	B	0, 0.192, 0.636, 1.081, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.636 std_dev=0.444
P	A	0, 0.173, 0.630, 1.086, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.630 std_dev=0.456
OP2	A	0, 0.267, 0.732, 1.197, 1.854 max_d=1.854 avg_d=0.732 std_dev=0.465
O5'	B	0, 0.333, 0.815, 1.297, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.815 std_dev=0.482
OP1	A	0, 0.172, 0.732, 1.292, 2.210 max_d=2.210 avg_d=0.732 std_dev=0.560
P	B	0, 0.318, 0.938, 1.559, 2.150 max_d=2.150 avg_d=0.938 std_dev=0.620
OP1	B	0, 0.107, 1.295, 2.483, 4.410 max_d=4.410 avg_d=1.295 std_dev=1.188
OP2	B	0, 0.706, 1.990, 3.274, 3.767 max_d=3.767 avg_d=1.990 std_dev=1.284

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.08	0.17	0.10
C2	0.01	0.00	0.08	0.12	0.01	0.05	0.02	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.13	0.02	0.16	0.16	0.30	0.21
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.04	0.14	0.01	0.01	0.01	0.05	0.17	0.10	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.11	0.00	0.13	0.02	0.12	0.07	0.13	0.12	0.16	0.02	0.01	0.01	0.04	0.21	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.02	0.25	0.28	0.39	0.30
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.07	0.09	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.13	0.07	0.03
C5	0.01	0.02	0.06	0.13	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.03	0.26	0.27	0.36	0.29
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.17	0.01	0.18	0.00	0.15	0.09	0.13	0.19	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.11	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.03	0.22	0.19	0.27	0.21
N1	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.14	0.13	0.25	0.17
N3	0.01	0.00	0.06	0.13	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.21	0.23	0.36	0.27
N4	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.15	0.03	0.27	0.33	0.44	0.34
O2	0.03	0.01	0.14	0.16	0.01	0.07	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.19	0.03	0.13	0.12	0.28	0.19
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.08	0.06	0.13	0.00	0.03	0.05	0.04	0.17	0.07	0.03
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.14	0.02	0.15	0.02	0.14	0.06	0.14	0.15	0.19	0.03	0.00	0.01	0.05	0.30	0.12	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.05	0.04	0.19	0.12
O5'	0.07	0.16	0.05	0.04	0.25	0.01	0.26	0.01	0.22	0.14	0.21	0.27	0.13	0.04	0.05	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.16	0.17	0.21	0.28	0.13	0.27	0.11	0.19	0.13	0.23	0.33	0.12	0.17	0.30	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.30	0.10	0.07	0.39	0.07	0.36	0.02	0.27	0.25	0.36	0.44	0.28	0.07	0.12	0.19	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.21	0.05	0.06	0.30	0.03	0.29	0.01	0.21	0.17	0.27	0.34	0.19	0.03	0.11	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.21	0.32	0.30	0.18	0.30	0.11	0.32	0.14	0.24	0.23	0.20	0.19	0.16	0.25	0.36	0.28	0.30	0.31	0.64	0.47	0.41
C2	0.33	0.19	0.34	0.32	0.24	0.33	0.18	0.36	0.11	0.31	0.19	0.22	0.16	0.25	0.31	0.35	0.30	0.33	0.34	0.62	0.60	0.41
C2'	0.25	0.22	0.25	0.22	0.17	0.23	0.12	0.26	0.13	0.22	0.20	0.20	0.15	0.16	0.21	0.32	0.20	0.23	0.28	0.69	0.47	0.42
C3'	0.16	0.25	0.17	0.13	0.09	0.13	0.08	0.17	0.16	0.15	0.24	0.17	0.19	0.11	0.11	0.26	0.13	0.13	0.24	0.72	0.50	0.42
C4	0.36	0.15	0.36	0.34	0.25	0.37	0.21	0.39	0.11	0.39	0.15	0.20	0.17	0.32	0.34	0.36	0.33	0.37	0.38	0.60	0.69	0.42
C4'	0.14	0.33	0.16	0.16	0.14	0.15	0.15	0.19	0.25	0.10	0.33	0.24	0.26	0.10	0.09	0.27	0.20	0.12	0.22	0.66	0.43	0.38
C5	0.38	0.15	0.37	0.35	0.23	0.38	0.17	0.40	0.14	0.39	0.18	0.18	0.21	0.28	0.35	0.37	0.32	0.39	0.39	0.61	0.60	0.44
C5'	0.17	0.41	0.17	0.06	0.26	0.07	0.26	0.10	0.33	0.16	0.39	0.35	0.33	0.19	0.18	0.27	0.12	0.10	0.17	0.63	0.43	0.33
C6	0.38	0.18	0.38	0.34	0.22	0.37	0.15	0.38	0.17	0.34	0.22	0.19	0.22	0.22	0.33	0.39	0.30	0.38	0.37	0.63	0.52	0.43
N1	0.34	0.19	0.35	0.32	0.21	0.33	0.13	0.35	0.13	0.30	0.21	0.20	0.19	0.20	0.30	0.37	0.29	0.33	0.34	0.63	0.53	0.42
N3	0.34	0.18	0.34	0.33	0.26	0.35	0.22	0.37	0.14	0.35	0.18	0.22	0.17	0.30	0.33	0.35	0.31	0.34	0.36	0.61	0.68	0.41
N4	0.36	0.15	0.35	0.35	0.25	0.38	0.22	0.41	0.12	0.40	0.14	0.20	0.15	0.34	0.34	0.35	0.35	0.38	0.40	0.59	0.78	0.42
O2	0.31	0.21	0.32	0.31	0.23	0.32	0.18	0.34	0.11	0.29	0.19	0.22	0.14	0.23	0.29	0.33	0.30	0.31	0.33	0.62	0.60	0.40
O2'	0.29	0.24	0.29	0.25	0.21	0.26	0.16	0.27	0.15	0.24	0.22	0.24	0.17	0.18	0.25	0.35	0.24	0.27	0.29	0.69	0.46	0.42
O3'	0.13	0.27	0.14	0.08	0.09	0.08	0.08	0.13	0.16	0.14	0.25	0.19	0.17	0.10	0.09	0.24	0.07	0.09	0.24	0.75	0.54	0.42
O4'	0.22	0.33	0.26	0.28	0.11	0.27	0.14	0.29	0.26	0.13	0.34	0.20	0.28	0.09	0.13	0.33	0.30	0.22	0.28	0.62	0.42	0.39
O5'	0.22	0.41	0.25	0.10	0.32	0.06	0.32	0.07	0.37	0.25	0.41	0.37	0.38	0.28	0.25	0.27	0.01	0.14	0.22	0.68	0.51	0.37
OP1	0.07	0.35	0.13	0.02	0.19	0.11	0.19	0.22	0.26	0.12	0.33	0.29	0.27	0.15	0.10	0.18	0.02	0.06	0.18	0.84	0.59	0.39
OP2	0.11	0.24	0.07	0.09	0.17	0.18	0.20	0.28	0.23	0.21	0.25	0.20	0.26	0.22	0.14	0.06	0.02	0.16	0.28	0.89	0.65	0.48
P	0.06	0.28	0.11	0.01	0.16	0.07	0.18	0.15	0.23	0.14	0.27	0.23	0.25	0.16	0.09	0.13	0.01	0.03	0.18	0.74	0.54	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.15	0.30	0.07
C2	0.02	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.10	0.20	0.03	0.13	0.20	0.46	0.13
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.10	0.12	0.08	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.21	0.14	0.09
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.11	0.09	0.14	0.14	0.11	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.09	0.28	0.19	0.13
C4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.11	0.14	0.50	0.11
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.06	0.06	0.05	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.13	0.07	0.03
C5	0.01	0.02	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.13	0.14	0.64	0.13
C5'	0.03	0.08	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.08	0.08	0.07	0.09	0.09	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.11	0.14	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.13	0.16	0.63	0.14
C8	0.01	0.02	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.03	0.17	0.12	0.68	0.15
N1	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.18	0.02	0.13	0.19	0.55	0.14
N3	0.02	0.00	0.12	0.14	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.03	0.11	0.18	0.41	0.11
N6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.15	0.02	0.14	0.17	0.71	0.15
N7	0.01	0.02	0.06	0.08	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.16	0.13	0.77	0.16
N9	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.11	0.12	0.48	0.10
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.05	0.07	0.04	0.09	0.09	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.04	0.05	0.22	0.10	0.08
O3'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.11	0.02	0.11	0.03	0.14	0.10	0.18	0.17	0.15	0.10	0.05	0.02	0.00	0.02	0.12	0.44	0.39	0.20
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.22	0.26	0.11
O5'	0.07	0.13	0.05	0.09	0.11	0.02	0.13	0.01	0.13	0.17	0.13	0.11	0.14	0.16	0.11	0.05	0.12	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.15	0.20	0.21	0.28	0.14	0.13	0.14	0.11	0.16	0.12	0.19	0.18	0.17	0.13	0.12	0.22	0.44	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.46	0.14	0.19	0.50	0.07	0.64	0.14	0.63	0.68	0.55	0.41	0.71	0.77	0.48	0.10	0.39	0.26	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.13	0.09	0.13	0.11	0.03	0.13	0.02	0.14	0.15	0.14	0.11	0.15	0.16	0.10	0.08	0.20	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00