Doublet Group distance statistics: 54468

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 5, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.017 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.007, 0.042, 0.077, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.042 std_dev=0.035
N4	A	0, 0.015, 0.057, 0.099, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.057 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.014, 0.133, 0.253, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.133 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.037, 0.188, 0.338, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.188 std_dev=0.151
C4'	A	0, 0.055, 0.234, 0.413, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.234 std_dev=0.179
C6	B	0, 0.296, 0.476, 0.657, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.476 std_dev=0.180
N1	B	0, 0.274, 0.456, 0.638, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.456 std_dev=0.182
C2	B	0, 0.308, 0.496, 0.684, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.496 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.267, 0.462, 0.656, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.462 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.261, 0.458, 0.655, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.458 std_dev=0.197
C4	B	0, 0.179, 0.378, 0.577, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.378 std_dev=0.199
N6	B	0, 0.407, 0.630, 0.852, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.630 std_dev=0.222
C3'	A	0, 0.104, 0.329, 0.554, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.329 std_dev=0.225
O2'	A	0, 0.049, 0.275, 0.500, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.275 std_dev=0.225
C2'	B	0, 0.183, 0.420, 0.657, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.420 std_dev=0.237
N9	B	0, 0.189, 0.432, 0.676, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.432 std_dev=0.243
P	A	0, 0.164, 0.415, 0.667, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.415 std_dev=0.252
N7	B	0, 0.372, 0.627, 0.882, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.627 std_dev=0.255
C3'	B	0, 0.172, 0.428, 0.684, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.428 std_dev=0.256
C8	B	0, 0.330, 0.588, 0.845, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.588 std_dev=0.257
C1'	B	0, 0.243, 0.501, 0.760, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.501 std_dev=0.259
OP1	A	0, 0.144, 0.410, 0.676, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.410 std_dev=0.266
O3'	B	0, 0.131, 0.421, 0.711, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.421 std_dev=0.290
O4'	B	0, 0.383, 0.673, 0.963, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.673 std_dev=0.290
O2'	B	0, 0.280, 0.575, 0.869, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.575 std_dev=0.295
C4'	B	0, 0.298, 0.603, 0.908, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.603 std_dev=0.305
O3'	A	0, 0.197, 0.542, 0.888, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.542 std_dev=0.346
C5'	A	0, 0.036, 0.387, 0.738, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.387 std_dev=0.351
C5'	B	0, 0.407, 0.789, 1.170, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.789 std_dev=0.381
OP2	A	0, 0.157, 0.543, 0.930, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.543 std_dev=0.386
O5'	A	0, 0.019, 0.501, 0.983, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.501 std_dev=0.482
O5'	B	0, 0.352, 0.889, 1.425, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.889 std_dev=0.537
P	B	0, 0.486, 1.104, 1.723, 1.946 max_d=1.946 avg_d=1.104 std_dev=0.618
OP1	B	0, 0.583, 1.435, 2.288, 3.015 max_d=3.015 avg_d=1.435 std_dev=0.852
OP2	B	0, 0.442, 1.460, 2.478, 4.450 max_d=4.450 avg_d=1.460 std_dev=1.018

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.16	0.10	0.40	0.11
C2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.12	0.03	0.31	0.15	0.34	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.07	0.04	0.08	0.09	0.12	0.00	0.02	0.01	0.23	0.21	0.31	0.08
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.15	0.00	0.15	0.03	0.13	0.09	0.14	0.16	0.13	0.02	0.01	0.01	0.31	0.30	0.25	0.15
C4	0.02	0.01	0.08	0.15	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.18	0.02	0.42	0.21	0.29	0.20
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.06	0.08	0.10	0.06	0.07	0.03	0.00	0.02	0.11	0.38	0.07
C5	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.18	0.03	0.44	0.21	0.29	0.21
C5'	0.02	0.10	0.02	0.03	0.15	0.01	0.15	0.00	0.13	0.09	0.13	0.17	0.09	0.07	0.05	0.01	0.01	0.18	0.36	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.03	0.39	0.17	0.34	0.15
N1	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.02	0.30	0.14	0.36	0.12
N3	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.16	0.02	0.37	0.18	0.31	0.17
N4	0.03	0.02	0.09	0.16	0.00	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.06	0.21	0.03	0.44	0.23	0.28	0.23
O2	0.04	0.01	0.12	0.13	0.02	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.11	0.14	0.05	0.26	0.14	0.36	0.12
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.07	0.05	0.07	0.05	0.02	0.06	0.06	0.11	0.00	0.05	0.05	0.11	0.17	0.33	0.07
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.18	0.03	0.18	0.05	0.15	0.09	0.16	0.21	0.14	0.05	0.00	0.02	0.27	0.37	0.20	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.00	0.13	0.10	0.47	0.19
O5'	0.16	0.31	0.23	0.31	0.42	0.02	0.44	0.01	0.39	0.30	0.37	0.44	0.26	0.11	0.27	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.15	0.21	0.30	0.21	0.11	0.21	0.18	0.17	0.14	0.18	0.23	0.14	0.17	0.37	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.34	0.31	0.25	0.29	0.38	0.29	0.36	0.34	0.36	0.31	0.28	0.36	0.33	0.20	0.47	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.08	0.15	0.20	0.07	0.21	0.02	0.15	0.12	0.17	0.23	0.12	0.07	0.19	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.28	0.09	0.19	0.10	0.22	0.13	0.40	0.13	0.22	0.21	0.23	0.17	0.23	0.12	0.18	0.16	0.16	0.25	0.49	0.76	0.38
C2	0.13	0.26	0.12	0.16	0.10	0.24	0.11	0.45	0.09	0.25	0.22	0.20	0.12	0.27	0.14	0.17	0.13	0.24	0.37	0.59	0.87	0.47
C2'	0.09	0.31	0.09	0.17	0.12	0.19	0.16	0.39	0.18	0.22	0.25	0.25	0.23	0.25	0.11	0.21	0.16	0.13	0.27	0.48	0.76	0.35
C3'	0.15	0.30	0.20	0.21	0.10	0.22	0.12	0.38	0.13	0.24	0.22	0.25	0.19	0.25	0.12	0.31	0.23	0.15	0.32	0.46	0.69	0.29
C4	0.19	0.26	0.18	0.18	0.16	0.28	0.15	0.48	0.20	0.24	0.26	0.21	0.22	0.22	0.17	0.19	0.16	0.33	0.45	0.65	0.99	0.55
C4'	0.20	0.33	0.21	0.18	0.17	0.18	0.15	0.34	0.16	0.22	0.25	0.31	0.17	0.22	0.16	0.33	0.18	0.14	0.22	0.40	0.62	0.24
C5	0.17	0.24	0.18	0.18	0.14	0.28	0.13	0.49	0.18	0.22	0.23	0.21	0.19	0.21	0.13	0.20	0.16	0.31	0.40	0.59	0.95	0.50
C5'	0.33	0.36	0.39	0.27	0.26	0.27	0.21	0.36	0.20	0.30	0.27	0.36	0.20	0.28	0.27	0.51	0.28	0.27	0.30	0.38	0.54	0.18
C6	0.12	0.25	0.14	0.16	0.11	0.26	0.10	0.47	0.13	0.22	0.21	0.22	0.13	0.22	0.10	0.19	0.13	0.24	0.31	0.53	0.84	0.42
N1	0.10	0.26	0.11	0.17	0.09	0.24	0.10	0.44	0.10	0.23	0.21	0.22	0.12	0.24	0.11	0.17	0.13	0.21	0.31	0.54	0.83	0.42
N3	0.17	0.26	0.15	0.16	0.14	0.26	0.13	0.47	0.16	0.26	0.26	0.21	0.16	0.25	0.17	0.18	0.13	0.29	0.43	0.64	0.94	0.53
N4	0.23	0.26	0.21	0.20	0.19	0.30	0.20	0.48	0.26	0.25	0.29	0.22	0.31	0.23	0.20	0.21	0.19	0.37	0.50	0.69	1.04	0.61
O2	0.12	0.24	0.11	0.17	0.10	0.23	0.16	0.44	0.12	0.26	0.20	0.18	0.19	0.30	0.14	0.16	0.14	0.22	0.37	0.60	0.85	0.46
O2'	0.14	0.37	0.10	0.19	0.18	0.18	0.21	0.36	0.25	0.22	0.32	0.29	0.30	0.25	0.15	0.21	0.20	0.14	0.24	0.48	0.74	0.35
O3'	0.18	0.34	0.23	0.23	0.11	0.23	0.12	0.39	0.14	0.24	0.25	0.28	0.20	0.24	0.13	0.35	0.28	0.16	0.33	0.49	0.68	0.30
O4'	0.12	0.32	0.10	0.19	0.15	0.19	0.15	0.36	0.17	0.19	0.25	0.28	0.18	0.20	0.12	0.22	0.18	0.11	0.19	0.45	0.67	0.32
O5'	0.23	0.37	0.29	0.10	0.26	0.07	0.25	0.21	0.27	0.27	0.32	0.37	0.29	0.29	0.22	0.45	0.02	0.13	0.37	0.50	0.45	0.30
OP1	0.07	0.25	0.13	0.02	0.12	0.14	0.12	0.29	0.14	0.18	0.21	0.22	0.15	0.18	0.08	0.21	0.03	0.09	0.24	0.68	0.52	0.33
OP2	0.15	0.37	0.19	0.08	0.27	0.24	0.28	0.46	0.31	0.28	0.35	0.34	0.31	0.30	0.21	0.19	0.02	0.21	0.40	0.60	0.57	0.35
P	0.08	0.25	0.15	0.02	0.13	0.12	0.13	0.27	0.14	0.19	0.20	0.23	0.15	0.19	0.10	0.22	0.00	0.06	0.28	0.57	0.49	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.24	0.37	0.38	0.23
C2	0.04	0.00	0.14	0.12	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.18	0.04	0.34	0.57	0.53	0.37
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.09	0.06	0.12	0.14	0.08	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.20	0.38	0.39	0.22
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.14	0.10	0.12	0.08	0.12	0.05	0.01	0.01	0.02	0.22	0.44	0.37	0.25
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.06	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.02	0.36	0.58	0.50	0.37
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.09	0.15	0.07	0.06	0.12	0.14	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.24	0.28	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.10	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.42	0.69	0.57	0.43
C5'	0.07	0.18	0.04	0.02	0.21	0.01	0.29	0.00	0.29	0.33	0.24	0.15	0.34	0.35	0.21	0.05	0.07	0.02	0.01	0.33	0.34	0.02
C6	0.02	0.00	0.09	0.07	0.01	0.09	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.08	0.02	0.42	0.71	0.60	0.45
C8	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.15	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.15	0.04	0.46	0.68	0.52	0.42
N1	0.03	0.00	0.12	0.10	0.01	0.07	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.13	0.03	0.38	0.65	0.57	0.41
N3	0.04	0.00	0.14	0.12	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.16	0.04	0.32	0.52	0.49	0.33
N6	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.12	0.01	0.34	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.09	0.03	0.45	0.78	0.65	0.49
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.14	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.47	0.77	0.60	0.48
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.07	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.36	0.53	0.46	0.34
O2'	0.02	0.20	0.00	0.01	0.11	0.05	0.09	0.05	0.13	0.04	0.17	0.18	0.11	0.04	0.03	0.00	0.06	0.07	0.09	0.31	0.35	0.14
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.07	0.02	0.07	0.07	0.08	0.15	0.13	0.16	0.09	0.14	0.05	0.06	0.00	0.03	0.21	0.56	0.42	0.30
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.07	0.03	0.00	0.24	0.31	0.40	0.23
O5'	0.24	0.34	0.20	0.22	0.36	0.02	0.42	0.01	0.42	0.46	0.38	0.32	0.45	0.47	0.36	0.09	0.21	0.24	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.37	0.57	0.38	0.44	0.58	0.24	0.69	0.33	0.71	0.68	0.65	0.52	0.78	0.77	0.53	0.31	0.56	0.31	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.38	0.53	0.39	0.37	0.50	0.28	0.57	0.34	0.60	0.52	0.57	0.49	0.65	0.60	0.46	0.35	0.42	0.40	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.37	0.22	0.25	0.37	0.05	0.43	0.02	0.45	0.42	0.41	0.33	0.49	0.48	0.34	0.14	0.30	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00