Doublet Group distance statistics: 54469

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 3, 1, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.014, 0.029, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.022, 0.040, 0.059, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.040 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.013, 0.044, 0.076, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.044 std_dev=0.031
N4	A	0, 0.022, 0.065, 0.109, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.065 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.078, 0.173, 0.268, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.173 std_dev=0.095
C2'	A	0, 0.099, 0.226, 0.352, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.226 std_dev=0.127
C4'	A	0, 0.185, 0.329, 0.474, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.329 std_dev=0.145
O2'	A	0, 0.103, 0.283, 0.463, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.283 std_dev=0.180
C3'	A	0, 0.162, 0.343, 0.524, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.343 std_dev=0.181
N3	B	0, 0.307, 0.528, 0.749, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.528 std_dev=0.221
C2	B	0, 0.306, 0.529, 0.752, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.529 std_dev=0.223
O3'	A	0, 0.316, 0.589, 0.862, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.589 std_dev=0.273
N1	B	0, 0.272, 0.571, 0.871, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.571 std_dev=0.299
O5'	B	0, 0.305, 0.617, 0.929, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.617 std_dev=0.312
C4	B	0, 0.280, 0.593, 0.906, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.593 std_dev=0.313
C1'	B	0, 0.333, 0.686, 1.040, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.686 std_dev=0.354
O2'	B	0, 0.447, 0.810, 1.173, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.810 std_dev=0.363
N9	B	0, 0.302, 0.679, 1.056, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.679 std_dev=0.377
P	B	0, 0.455, 0.837, 1.219, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.837 std_dev=0.382
C2'	B	0, 0.327, 0.734, 1.142, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.734 std_dev=0.407
C6	B	0, 0.209, 0.621, 1.033, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.621 std_dev=0.412
C5	B	0, 0.242, 0.658, 1.073, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.658 std_dev=0.416
C5'	A	0, 0.144, 0.584, 1.025, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.584 std_dev=0.440
O4'	B	0, 0.319, 0.763, 1.207, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.763 std_dev=0.444
C8	B	0, 0.311, 0.806, 1.302, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.806 std_dev=0.496
OP1	B	0, 0.483, 0.986, 1.490, 2.055 max_d=2.055 avg_d=0.986 std_dev=0.503
N6	B	0, 0.192, 0.713, 1.233, 2.131 max_d=2.131 avg_d=0.713 std_dev=0.520
N7	B	0, 0.284, 0.805, 1.325, 2.196 max_d=2.196 avg_d=0.805 std_dev=0.520
C3'	B	0, 0.194, 0.732, 1.270, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.732 std_dev=0.538
C4'	B	0, 0.229, 0.775, 1.321, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.775 std_dev=0.546
O3'	B	0, 0.187, 0.798, 1.409, 2.137 max_d=2.137 avg_d=0.798 std_dev=0.611
C5'	B	0, 0.224, 0.878, 1.533, 2.294 max_d=2.294 avg_d=0.878 std_dev=0.654
O5'	A	0, 0.160, 0.835, 1.510, 2.253 max_d=2.253 avg_d=0.835 std_dev=0.675
OP2	A	0, 0.178, 0.870, 1.563, 2.548 max_d=2.548 avg_d=0.870 std_dev=0.693
P	A	0, 0.091, 0.789, 1.486, 2.416 max_d=2.416 avg_d=0.789 std_dev=0.698
OP1	A	0, 0.266, 0.986, 1.706, 2.680 max_d=2.680 avg_d=0.986 std_dev=0.720
OP2	B	0, 0.497, 1.343, 2.188, 3.649 max_d=3.649 avg_d=1.343 std_dev=0.845

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.14	0.14	0.25	0.12
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.09	0.03	0.34	0.32	0.44	0.34
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.07	0.02	0.08	0.03	0.08	0.04	0.07	0.09	0.11	0.00	0.03	0.01	0.22	0.22	0.18	0.17
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.05	0.09	0.05	0.10	0.11	0.11	0.01	0.01	0.03	0.32	0.31	0.12	0.24
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.10	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.10	0.03	0.53	0.57	0.66	0.55
C4'	0.02	0.04	0.02	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.12	0.06	0.06	0.11	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.08	0.29	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.13	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.04	0.57	0.60	0.65	0.58
C5'	0.04	0.15	0.03	0.05	0.30	0.01	0.34	0.00	0.30	0.17	0.22	0.33	0.07	0.07	0.05	0.02	0.00	0.15	0.41	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.12	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.04	0.49	0.47	0.49	0.45
N1	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.34	0.31	0.38	0.31
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.03	0.44	0.45	0.56	0.45
N4	0.02	0.01	0.09	0.11	0.00	0.11	0.01	0.33	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.12	0.03	0.58	0.65	0.75	0.62
O2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.13	0.05	0.24	0.23	0.37	0.25
O2'	0.03	0.10	0.00	0.01	0.10	0.06	0.08	0.07	0.06	0.05	0.11	0.11	0.14	0.00	0.04	0.04	0.04	0.10	0.20	0.05
O3'	0.01	0.09	0.03	0.01	0.10	0.03	0.11	0.05	0.10	0.04	0.10	0.12	0.13	0.04	0.00	0.01	0.23	0.28	0.11	0.18
O4'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.05	0.07	0.26	0.07
O5'	0.14	0.34	0.22	0.32	0.53	0.02	0.57	0.00	0.49	0.34	0.44	0.58	0.24	0.04	0.23	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.14	0.32	0.22	0.31	0.57	0.08	0.60	0.15	0.47	0.31	0.45	0.65	0.23	0.10	0.28	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.44	0.18	0.12	0.66	0.29	0.65	0.41	0.49	0.38	0.56	0.75	0.37	0.20	0.11	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.34	0.17	0.24	0.55	0.03	0.58	0.01	0.45	0.31	0.45	0.62	0.25	0.05	0.18	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.16	0.09	0.15	0.19	0.11	0.27	0.21	0.28	0.27	0.21	0.15	0.33	0.31	0.20	0.18	0.22	0.12	0.33	0.29	0.43	0.32
C2	0.12	0.10	0.16	0.26	0.11	0.18	0.16	0.28	0.22	0.13	0.17	0.11	0.30	0.17	0.11	0.17	0.33	0.11	0.34	0.30	0.58	0.37
C2'	0.14	0.20	0.08	0.19	0.19	0.13	0.27	0.25	0.29	0.26	0.24	0.17	0.36	0.31	0.19	0.17	0.28	0.09	0.28	0.27	0.33	0.26
C3'	0.09	0.14	0.12	0.27	0.14	0.24	0.25	0.35	0.26	0.27	0.19	0.11	0.35	0.32	0.15	0.18	0.38	0.13	0.27	0.31	0.35	0.28
C4	0.20	0.11	0.28	0.38	0.16	0.32	0.22	0.41	0.29	0.19	0.20	0.14	0.45	0.24	0.18	0.27	0.47	0.21	0.37	0.39	0.70	0.42
C4'	0.08	0.16	0.09	0.18	0.14	0.16	0.23	0.23	0.24	0.25	0.18	0.14	0.30	0.29	0.15	0.18	0.25	0.09	0.29	0.36	0.36	0.31
C5	0.22	0.12	0.29	0.38	0.20	0.31	0.32	0.40	0.38	0.29	0.24	0.15	0.53	0.38	0.22	0.30	0.49	0.21	0.37	0.38	0.63	0.39
C5'	0.17	0.17	0.21	0.27	0.12	0.31	0.18	0.32	0.19	0.20	0.15	0.19	0.26	0.25	0.12	0.35	0.39	0.23	0.33	0.43	0.47	0.40
C6	0.19	0.11	0.23	0.29	0.21	0.23	0.34	0.32	0.37	0.32	0.23	0.13	0.48	0.41	0.22	0.27	0.40	0.16	0.34	0.32	0.54	0.35
N1	0.14	0.10	0.15	0.23	0.16	0.16	0.26	0.26	0.30	0.23	0.21	0.12	0.38	0.30	0.17	0.20	0.31	0.11	0.34	0.29	0.52	0.34
N3	0.16	0.08	0.22	0.32	0.12	0.25	0.14	0.35	0.20	0.13	0.15	0.12	0.32	0.15	0.14	0.22	0.40	0.16	0.36	0.34	0.67	0.41
N4	0.24	0.14	0.32	0.44	0.19	0.38	0.21	0.48	0.27	0.22	0.21	0.17	0.44	0.24	0.22	0.30	0.53	0.27	0.40	0.46	0.78	0.47
O2	0.11	0.16	0.13	0.22	0.12	0.15	0.14	0.24	0.19	0.12	0.20	0.14	0.22	0.14	0.11	0.13	0.28	0.10	0.33	0.28	0.56	0.36
O2'	0.22	0.25	0.12	0.13	0.23	0.11	0.28	0.18	0.30	0.27	0.27	0.23	0.34	0.31	0.23	0.23	0.18	0.17	0.31	0.31	0.32	0.28
O3'	0.09	0.17	0.09	0.23	0.15	0.20	0.25	0.33	0.27	0.26	0.21	0.15	0.35	0.32	0.15	0.18	0.33	0.10	0.31	0.37	0.44	0.35
O4'	0.11	0.15	0.08	0.16	0.14	0.11	0.25	0.21	0.24	0.27	0.18	0.12	0.30	0.31	0.17	0.18	0.20	0.08	0.31	0.30	0.39	0.30
O5'	0.23	0.17	0.28	0.08	0.13	0.08	0.18	0.17	0.19	0.22	0.16	0.17	0.25	0.24	0.16	0.46	0.02	0.14	0.35	0.34	0.37	0.31
OP1	0.08	0.14	0.14	0.02	0.06	0.07	0.09	0.21	0.11	0.15	0.13	0.12	0.15	0.15	0.06	0.23	0.02	0.03	0.49	0.41	0.82	0.56
OP2	0.13	0.26	0.19	0.08	0.21	0.21	0.21	0.43	0.22	0.22	0.25	0.24	0.23	0.24	0.18	0.21	0.02	0.15	0.34	0.38	0.38	0.29
P	0.08	0.13	0.15	0.01	0.05	0.08	0.09	0.23	0.11	0.15	0.12	0.11	0.15	0.15	0.06	0.23	0.00	0.02	0.38	0.33	0.46	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.26	0.19	0.37	0.20
C2	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.17	0.04	0.36	0.22	0.69	0.42
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.07	0.06	0.09	0.11	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.28	0.14	0.17
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.03	0.12	0.10	0.14	0.13	0.13	0.10	0.06	0.02	0.00	0.01	0.30	0.30	0.11	0.23
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.02	0.42	0.24	0.76	0.47
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.06	0.04	0.10	0.09	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.25	0.21	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.02	0.52	0.37	1.01	0.63
C5'	0.03	0.11	0.03	0.03	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.17	0.14	0.09	0.20	0.19	0.11	0.05	0.04	0.01	0.01	0.11	0.34	0.02
C6	0.02	0.00	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.51	0.38	1.04	0.64
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.59	0.39	1.03	0.67
N1	0.02	0.00	0.09	0.14	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.16	0.03	0.44	0.29	0.88	0.54
N3	0.03	0.00	0.11	0.13	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.15	0.04	0.33	0.20	0.58	0.35
N6	0.02	0.00	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.15	0.03	0.55	0.48	1.20	0.74
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.61	0.49	1.19	0.76
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.43	0.22	0.71	0.45
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.09	0.09	0.07	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.08	0.43	0.21	0.20
O3'	0.01	0.17	0.02	0.00	0.10	0.01	0.11	0.04	0.14	0.11	0.16	0.15	0.15	0.11	0.06	0.04	0.00	0.01	0.36	0.39	0.40	0.37
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.26	0.20	0.37	0.19
O5'	0.26	0.36	0.22	0.30	0.42	0.01	0.52	0.01	0.51	0.59	0.44	0.33	0.55	0.61	0.43	0.08	0.36	0.26	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.19	0.22	0.28	0.30	0.24	0.25	0.37	0.11	0.38	0.39	0.29	0.20	0.48	0.49	0.22	0.43	0.39	0.20	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.69	0.14	0.11	0.76	0.21	1.01	0.34	1.04	1.03	0.88	0.58	1.20	1.19	0.71	0.21	0.40	0.37	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.42	0.17	0.23	0.47	0.09	0.63	0.02	0.64	0.67	0.54	0.35	0.74	0.76	0.45	0.20	0.37	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00