Doublet Group distance statistics: 54470

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N3	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.012, 0.035, 0.057, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.035 std_dev=0.022
O2'	A	0, 0.146, 0.319, 0.492, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.319 std_dev=0.173
C2'	A	0, 0.140, 0.320, 0.501, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.320 std_dev=0.180
O4'	A	0, 0.137, 0.325, 0.513, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.325 std_dev=0.188
C5	B	0, 0.273, 0.531, 0.788, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.531 std_dev=0.258
C6	B	0, 0.303, 0.580, 0.857, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.580 std_dev=0.277
C4'	A	0, 0.213, 0.506, 0.799, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.506 std_dev=0.293
C3'	A	0, 0.227, 0.529, 0.830, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.529 std_dev=0.302
C4	B	0, 0.223, 0.528, 0.834, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.528 std_dev=0.305
N7	B	0, 0.296, 0.619, 0.943, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.619 std_dev=0.323
N3	B	0, 0.237, 0.584, 0.932, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.584 std_dev=0.347
N1	B	0, 0.298, 0.649, 0.999, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.649 std_dev=0.350
N6	B	0, 0.309, 0.663, 1.018, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.663 std_dev=0.354
N9	B	0, 0.259, 0.621, 0.983, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.621 std_dev=0.362
C2'	B	0, 0.402, 0.787, 1.171, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.787 std_dev=0.384
C3'	B	0, 0.464, 0.852, 1.240, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.852 std_dev=0.388
C2	B	0, 0.225, 0.625, 1.026, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.625 std_dev=0.400
C8	B	0, 0.261, 0.667, 1.072, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.667 std_dev=0.406
C1'	B	0, 0.351, 0.759, 1.168, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.759 std_dev=0.409
O4'	B	0, 0.476, 0.889, 1.303, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.889 std_dev=0.414
O3'	A	0, 0.336, 0.752, 1.167, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.752 std_dev=0.415
C4'	B	0, 0.501, 0.939, 1.377, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.939 std_dev=0.438
C5'	A	0, 0.356, 0.868, 1.380, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.868 std_dev=0.512
O3'	B	0, 0.486, 1.001, 1.517, 1.759 max_d=1.759 avg_d=1.001 std_dev=0.516
O2'	B	0, 0.452, 0.974, 1.495, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.974 std_dev=0.522
P	A	0, 0.434, 1.059, 1.683, 2.037 max_d=2.037 avg_d=1.059 std_dev=0.625
OP1	A	0, 0.526, 1.162, 1.798, 2.126 max_d=2.126 avg_d=1.162 std_dev=0.636
C5'	B	0, 0.397, 1.046, 1.696, 2.041 max_d=2.041 avg_d=1.046 std_dev=0.650
OP2	A	0, 0.408, 1.075, 1.741, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.075 std_dev=0.666
O5'	A	0, 0.383, 1.083, 1.783, 2.124 max_d=2.124 avg_d=1.083 std_dev=0.700
O5'	B	0, 0.329, 1.033, 1.738, 2.133 max_d=2.133 avg_d=1.033 std_dev=0.705
P	B	0, 0.420, 1.247, 2.075, 2.372 max_d=2.372 avg_d=1.247 std_dev=0.827
OP1	B	0, 0.493, 1.412, 2.331, 2.609 max_d=2.609 avg_d=1.412 std_dev=0.919
OP2	B	0, 0.425, 1.380, 2.336, 2.712 max_d=2.712 avg_d=1.380 std_dev=0.955

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.26	0.20	0.26	0.09
C2	0.02	0.00	0.15	0.18	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.20	0.06	0.52	0.38	0.21	0.30
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.03	0.11	0.01	0.12	0.04	0.26	0.00	0.01	0.01	0.31	0.38	0.13	0.16
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.03	0.11	0.05	0.17	0.09	0.26	0.01	0.00	0.01	0.38	0.53	0.10	0.26
C4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.75	0.56	0.42	0.53
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.08	0.03	0.02	0.00	0.02	0.19	0.41	0.08
C5	0.01	0.00	0.08	0.06	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.05	0.79	0.58	0.41	0.55
C5'	0.02	0.10	0.03	0.03	0.14	0.01	0.13	0.00	0.11	0.08	0.13	0.15	0.09	0.03	0.05	0.01	0.01	0.30	0.49	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.13	0.06	0.70	0.47	0.23	0.41
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.52	0.36	0.18	0.26
N3	0.01	0.00	0.12	0.17	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.20	0.04	0.64	0.48	0.32	0.43
N4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01	0.79	0.62	0.52	0.60
O2	0.02	0.01	0.26	0.26	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.31	0.08	0.40	0.31	0.18	0.22
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.03	0.03	0.06	0.03	0.08	0.02	0.08	0.04	0.19	0.00	0.03	0.03	0.05	0.20	0.26	0.08
O3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.09	0.02	0.08	0.05	0.13	0.04	0.20	0.10	0.31	0.03	0.00	0.02	0.24	0.58	0.10	0.25
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.03	0.02	0.00	0.07	0.06	0.45	0.17
O5'	0.26	0.52	0.31	0.38	0.75	0.02	0.79	0.01	0.70	0.52	0.64	0.79	0.40	0.05	0.24	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.38	0.38	0.53	0.56	0.19	0.58	0.30	0.47	0.36	0.48	0.62	0.31	0.20	0.58	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.21	0.13	0.10	0.42	0.41	0.41	0.49	0.23	0.18	0.32	0.52	0.18	0.26	0.10	0.45	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.30	0.16	0.26	0.53	0.08	0.55	0.01	0.41	0.26	0.43	0.60	0.22	0.08	0.25	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.43	0.47	0.42	0.30	0.30	0.33	0.23	0.30	0.27	0.43	0.45	0.38	0.24	0.33	0.39	0.46	0.21	0.40	0.36	0.25	0.48	0.40
C2	0.22	0.36	0.23	0.19	0.17	0.16	0.14	0.14	0.26	0.28	0.39	0.26	0.26	0.24	0.20	0.27	0.21	0.18	0.16	0.32	0.27	0.21
C2'	0.37	0.53	0.35	0.21	0.33	0.22	0.28	0.19	0.32	0.41	0.49	0.43	0.27	0.35	0.35	0.41	0.14	0.32	0.28	0.36	0.45	0.32
C3'	0.20	0.49	0.23	0.13	0.17	0.12	0.15	0.12	0.26	0.31	0.45	0.34	0.23	0.25	0.18	0.31	0.20	0.15	0.25	0.42	0.50	0.30
C4	0.20	0.30	0.27	0.33	0.16	0.28	0.15	0.30	0.23	0.25	0.31	0.23	0.23	0.20	0.17	0.27	0.41	0.21	0.28	0.47	0.28	0.25
C4'	0.21	0.56	0.23	0.17	0.18	0.18	0.16	0.23	0.31	0.28	0.51	0.40	0.29	0.20	0.16	0.33	0.13	0.19	0.38	0.29	0.58	0.40
C5	0.26	0.34	0.31	0.34	0.21	0.28	0.20	0.25	0.26	0.35	0.34	0.28	0.24	0.29	0.23	0.32	0.43	0.26	0.23	0.40	0.42	0.28
C5'	0.31	0.67	0.39	0.18	0.36	0.17	0.28	0.14	0.39	0.26	0.58	0.58	0.33	0.20	0.25	0.56	0.25	0.19	0.36	0.28	0.65	0.40
C6	0.32	0.39	0.33	0.28	0.25	0.26	0.23	0.21	0.27	0.45	0.38	0.31	0.24	0.35	0.31	0.34	0.31	0.32	0.29	0.30	0.52	0.36
N1	0.31	0.41	0.31	0.22	0.24	0.22	0.21	0.18	0.28	0.40	0.42	0.31	0.24	0.32	0.30	0.34	0.20	0.29	0.24	0.27	0.41	0.31
N3	0.17	0.30	0.22	0.26	0.14	0.22	0.12	0.24	0.23	0.24	0.33	0.21	0.24	0.19	0.15	0.23	0.32	0.16	0.24	0.42	0.26	0.22
N4	0.23	0.26	0.30	0.40	0.17	0.37	0.15	0.42	0.21	0.22	0.27	0.22	0.23	0.15	0.19	0.30	0.49	0.28	0.42	0.59	0.37	0.37
O2	0.23	0.38	0.24	0.16	0.18	0.14	0.15	0.11	0.27	0.25	0.41	0.28	0.31	0.22	0.20	0.30	0.15	0.19	0.15	0.29	0.25	0.20
O2'	0.51	0.58	0.50	0.35	0.43	0.37	0.34	0.31	0.34	0.46	0.51	0.53	0.27	0.38	0.46	0.58	0.26	0.45	0.37	0.31	0.47	0.38
O3'	0.19	0.49	0.21	0.12	0.17	0.10	0.16	0.12	0.26	0.31	0.45	0.34	0.24	0.25	0.18	0.31	0.20	0.13	0.25	0.49	0.51	0.30
O4'	0.31	0.56	0.34	0.32	0.16	0.32	0.16	0.35	0.34	0.33	0.54	0.37	0.33	0.21	0.22	0.39	0.25	0.32	0.45	0.27	0.57	0.47
O5'	0.16	0.59	0.12	0.11	0.40	0.10	0.46	0.15	0.53	0.42	0.59	0.50	0.57	0.48	0.29	0.16	0.01	0.14	0.13	0.54	0.17	0.25
OP1	0.02	0.52	0.07	0.01	0.26	0.10	0.26	0.17	0.37	0.24	0.48	0.43	0.38	0.25	0.12	0.07	0.01	0.06	0.23	0.29	0.29	0.16
OP2	0.10	0.32	0.11	0.08	0.12	0.09	0.07	0.15	0.13	0.25	0.25	0.28	0.13	0.21	0.08	0.08	0.01	0.10	0.20	0.48	0.29	0.17
P	0.02	0.42	0.04	0.01	0.21	0.05	0.22	0.08	0.29	0.26	0.39	0.36	0.31	0.25	0.10	0.07	0.00	0.02	0.14	0.37	0.20	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.12	0.07	0.15
C2	0.03	0.00	0.19	0.23	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.31	0.06	0.16	0.23	0.18	0.20
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.02	0.08	0.10	0.14	0.20	0.06	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.07	0.13	0.12
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.12	0.00	0.10	0.02	0.13	0.18	0.19	0.22	0.13	0.15	0.06	0.02	0.00	0.01	0.09	0.12	0.14	0.08
C4	0.02	0.01	0.10	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.15	0.03	0.14	0.16	0.14	0.19
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.07	0.07	0.07	0.09	0.04	0.04	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.18	0.19	0.19	0.22
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.13	0.12	0.09	0.14	0.14	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.18	0.04	0.20	0.23	0.22	0.23
C8	0.01	0.01	0.10	0.18	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.20	0.03	0.19	0.19	0.15	0.24
N1	0.03	0.00	0.14	0.19	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.26	0.06	0.19	0.25	0.21	0.22
N3	0.03	0.01	0.20	0.22	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.28	0.06	0.14	0.18	0.14	0.17
N6	0.03	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.18	0.04	0.22	0.25	0.26	0.25
N7	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.03	0.21	0.20	0.21	0.25
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.11	0.13	0.10	0.18
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.09	0.04	0.06	0.04	0.09	0.07	0.14	0.18	0.07	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.06	0.09	0.09	0.08
O3'	0.02	0.31	0.02	0.00	0.15	0.02	0.13	0.03	0.18	0.20	0.26	0.28	0.18	0.17	0.06	0.04	0.00	0.02	0.11	0.21	0.15	0.07
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.18	0.08	0.15
O5'	0.06	0.16	0.07	0.09	0.14	0.02	0.18	0.01	0.20	0.19	0.19	0.14	0.22	0.21	0.11	0.06	0.11	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.12	0.23	0.07	0.12	0.16	0.07	0.19	0.08	0.23	0.19	0.25	0.18	0.25	0.20	0.13	0.09	0.21	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.18	0.13	0.14	0.14	0.03	0.19	0.01	0.22	0.15	0.21	0.14	0.26	0.21	0.10	0.09	0.15	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.20	0.12	0.08	0.19	0.05	0.22	0.01	0.23	0.24	0.22	0.17	0.25	0.25	0.18	0.08	0.07	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00