Doublet Group distance statistics: 54471

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 0, 2, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.010, 0.026, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.020 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.023, 0.061, 0.099, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.061 std_dev=0.038
N4	A	0, 0.027, 0.069, 0.111, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.069 std_dev=0.042
C2	B	0, 0.162, 0.318, 0.473, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.318 std_dev=0.156
N3	B	0, 0.149, 0.310, 0.472, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.310 std_dev=0.162
O2'	A	0, 0.086, 0.249, 0.413, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.249 std_dev=0.163
C2'	A	0, 0.027, 0.211, 0.396, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.211 std_dev=0.184
C4	B	0, 0.142, 0.329, 0.517, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.329 std_dev=0.188
O4'	A	0, -0.041, 0.183, 0.406, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.183 std_dev=0.223
N1	B	0, 0.094, 0.335, 0.575, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.335 std_dev=0.240
C5	B	0, 0.087, 0.334, 0.581, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.334 std_dev=0.247
N9	B	0, 0.157, 0.420, 0.683, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.420 std_dev=0.263
O2'	B	0, 0.238, 0.514, 0.790, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.514 std_dev=0.276
C6	B	0, 0.050, 0.335, 0.620, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.335 std_dev=0.285
C2'	B	0, 0.193, 0.490, 0.787, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.490 std_dev=0.297
C1'	B	0, 0.221, 0.532, 0.844, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.532 std_dev=0.311
C8	B	0, 0.124, 0.454, 0.783, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.454 std_dev=0.329
N7	B	0, 0.072, 0.407, 0.742, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.407 std_dev=0.335
C3'	A	0, -0.054, 0.312, 0.677, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.312 std_dev=0.366
C4'	A	0, -0.090, 0.296, 0.681, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.296 std_dev=0.385
N6	B	0, 0.000, 0.408, 0.817, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.408 std_dev=0.409
O3'	A	0, -0.117, 0.425, 0.967, 1.997 max_d=1.997 avg_d=0.425 std_dev=0.542
O4'	B	0, 0.253, 0.796, 1.339, 2.031 max_d=2.031 avg_d=0.796 std_dev=0.543
OP2	A	0, 0.260, 0.828, 1.396, 2.003 max_d=2.003 avg_d=0.828 std_dev=0.568
OP1	A	0, 0.368, 0.942, 1.517, 1.954 max_d=1.954 avg_d=0.942 std_dev=0.575
C3'	B	0, 0.150, 0.725, 1.300, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.725 std_dev=0.575
C5'	A	0, 0.011, 0.632, 1.253, 2.256 max_d=2.256 avg_d=0.632 std_dev=0.621
P	A	0, 0.250, 0.880, 1.510, 2.195 max_d=2.195 avg_d=0.880 std_dev=0.630
C4'	B	0, 0.202, 0.885, 1.568, 2.565 max_d=2.565 avg_d=0.885 std_dev=0.683
O3'	B	0, 0.116, 0.865, 1.615, 2.714 max_d=2.714 avg_d=0.865 std_dev=0.750
O5'	B	0, 0.114, 0.905, 1.696, 2.763 max_d=2.763 avg_d=0.905 std_dev=0.791
O5'	A	0, 0.228, 1.047, 1.866, 2.844 max_d=2.844 avg_d=1.047 std_dev=0.819
C5'	B	0, 0.146, 1.087, 2.029, 3.563 max_d=3.563 avg_d=1.087 std_dev=0.941
P	B	0, 0.738, 1.717, 2.696, 2.750 max_d=2.750 avg_d=1.717 std_dev=0.979
OP2	B	0, 0.867, 2.131, 3.395, 3.665 max_d=3.665 avg_d=2.131 std_dev=1.264
OP1	B	0, 1.215, 2.687, 4.159, 4.191 max_d=4.191 avg_d=2.687 std_dev=1.472

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.16	0.20	0.37	0.27
C2	0.03	0.00	0.07	0.24	0.01	0.15	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.27	0.01	0.32	0.34	0.45	0.37
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.06	0.01	0.04	0.05	0.14	0.00	0.01	0.01	0.26	0.28	0.21	0.22
C3'	0.02	0.24	0.01	0.00	0.15	0.00	0.06	0.03	0.05	0.10	0.23	0.16	0.31	0.02	0.01	0.01	0.37	0.44	0.10	0.26
C4	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.16	0.00	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.18	0.05	0.47	0.49	0.55	0.49
C4'	0.00	0.15	0.01	0.00	0.16	0.00	0.11	0.00	0.07	0.08	0.18	0.17	0.14	0.07	0.02	0.00	0.02	0.12	0.35	0.14
C5	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.11	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.06	0.50	0.49	0.53	0.48
C5'	0.04	0.27	0.02	0.03	0.33	0.00	0.26	0.00	0.17	0.17	0.34	0.37	0.25	0.06	0.02	0.01	0.01	0.26	0.43	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.05	0.44	0.40	0.44	0.41
N1	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.10	0.02	0.32	0.31	0.41	0.34
N3	0.02	0.00	0.04	0.23	0.00	0.18	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.27	0.03	0.40	0.42	0.52	0.44
N4	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.17	0.01	0.37	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.20	0.06	0.50	0.55	0.60	0.53
O2	0.06	0.01	0.14	0.31	0.01	0.14	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.09	0.35	0.03	0.24	0.27	0.42	0.32
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.07	0.07	0.05	0.06	0.03	0.03	0.08	0.09	0.09	0.00	0.03	0.08	0.10	0.16	0.31	0.26
O3'	0.01	0.27	0.01	0.01	0.18	0.02	0.08	0.02	0.05	0.10	0.27	0.20	0.35	0.03	0.00	0.01	0.27	0.53	0.04	0.24
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.06	0.03	0.08	0.01	0.00	0.06	0.18	0.43	0.29
O5'	0.16	0.32	0.26	0.37	0.47	0.02	0.50	0.01	0.44	0.32	0.40	0.50	0.24	0.10	0.27	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.20	0.34	0.28	0.44	0.49	0.12	0.49	0.26	0.40	0.31	0.42	0.55	0.27	0.16	0.53	0.18	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	0.45	0.21	0.10	0.55	0.35	0.53	0.43	0.44	0.41	0.52	0.60	0.42	0.31	0.04	0.43	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.37	0.22	0.26	0.49	0.14	0.48	0.01	0.41	0.34	0.44	0.53	0.32	0.26	0.24	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.09	0.26	0.50	0.09	0.42	0.10	0.55	0.13	0.14	0.13	0.09	0.17	0.13	0.14	0.18	0.62	0.26	0.24	1.33	0.92	0.76
C2	0.13	0.14	0.23	0.46	0.12	0.40	0.15	0.57	0.19	0.14	0.17	0.13	0.25	0.17	0.12	0.17	0.58	0.22	0.20	1.26	0.99	0.79
C2'	0.15	0.14	0.22	0.41	0.10	0.36	0.08	0.48	0.12	0.09	0.14	0.14	0.15	0.08	0.11	0.19	0.55	0.22	0.15	1.36	0.91	0.75
C3'	0.18	0.10	0.22	0.29	0.07	0.29	0.05	0.39	0.06	0.11	0.09	0.10	0.09	0.09	0.11	0.33	0.45	0.19	0.08	1.40	0.87	0.73
C4	0.23	0.17	0.29	0.48	0.18	0.48	0.17	0.67	0.13	0.25	0.16	0.17	0.17	0.23	0.22	0.24	0.57	0.34	0.30	1.22	1.10	0.88
C4'	0.22	0.20	0.22	0.22	0.16	0.23	0.16	0.38	0.15	0.20	0.16	0.19	0.17	0.20	0.18	0.39	0.41	0.13	0.20	1.43	0.87	0.74
C5	0.27	0.18	0.31	0.50	0.19	0.52	0.12	0.70	0.12	0.21	0.18	0.20	0.16	0.15	0.23	0.28	0.57	0.38	0.28	1.27	1.11	0.90
C5'	0.43	0.23	0.51	0.22	0.25	0.28	0.20	0.30	0.16	0.27	0.15	0.30	0.19	0.25	0.30	0.75	0.32	0.31	0.16	1.47	0.85	0.75
C6	0.23	0.16	0.29	0.50	0.14	0.49	0.06	0.64	0.09	0.13	0.13	0.19	0.14	0.07	0.18	0.26	0.58	0.34	0.21	1.32	1.04	0.85
N1	0.16	0.12	0.25	0.48	0.10	0.42	0.08	0.57	0.11	0.11	0.12	0.14	0.16	0.10	0.12	0.19	0.59	0.26	0.19	1.30	0.98	0.79
N3	0.17	0.15	0.25	0.47	0.15	0.43	0.19	0.62	0.20	0.21	0.15	0.15	0.27	0.23	0.18	0.19	0.58	0.27	0.26	1.23	1.04	0.83
N4	0.26	0.17	0.30	0.49	0.19	0.51	0.19	0.71	0.13	0.30	0.17	0.16	0.16	0.29	0.25	0.25	0.57	0.37	0.37	1.17	1.12	0.91
O2	0.10	0.15	0.20	0.43	0.11	0.35	0.17	0.51	0.24	0.12	0.23	0.11	0.31	0.17	0.09	0.15	0.57	0.17	0.18	1.25	0.93	0.74
O2'	0.28	0.15	0.36	0.53	0.17	0.48	0.14	0.58	0.16	0.20	0.18	0.18	0.20	0.15	0.22	0.32	0.67	0.35	0.33	1.34	0.90	0.75
O3'	0.20	0.10	0.22	0.23	0.05	0.25	0.05	0.34	0.06	0.14	0.11	0.06	0.09	0.10	0.13	0.36	0.37	0.17	0.12	1.43	0.86	0.73
O4'	0.11	0.24	0.12	0.40	0.14	0.34	0.17	0.48	0.20	0.17	0.22	0.19	0.22	0.19	0.12	0.20	0.59	0.15	0.24	1.35	0.86	0.73
O5'	0.43	0.41	0.51	0.19	0.42	0.09	0.42	0.23	0.42	0.42	0.42	0.40	0.42	0.42	0.43	0.56	0.03	0.23	0.18	1.41	0.71	0.72
OP1	0.12	0.17	0.08	0.12	0.11	0.42	0.12	0.63	0.14	0.18	0.17	0.14	0.16	0.16	0.12	0.14	0.02	0.34	0.62	1.29	0.85	0.79
OP2	0.09	0.21	0.09	0.08	0.16	0.28	0.16	0.49	0.18	0.16	0.20	0.20	0.19	0.17	0.12	0.12	0.02	0.22	0.20	1.48	0.83	0.81
P	0.06	0.14	0.18	0.02	0.05	0.21	0.08	0.39	0.12	0.12	0.14	0.11	0.14	0.12	0.05	0.21	0.01	0.11	0.24	1.37	0.71	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.60	0.35	0.20
C2	0.02	0.00	0.14	0.23	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.30	0.03	0.26	0.84	0.49	0.38
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.03	0.06	0.08	0.10	0.14	0.05	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.18	0.97	0.43	0.39
C3'	0.02	0.23	0.00	0.00	0.14	0.00	0.10	0.04	0.13	0.10	0.19	0.22	0.11	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.23	1.08	0.44	0.49
C4	0.01	0.00	0.07	0.14	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.16	0.02	0.29	0.73	0.44	0.32
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.10	0.08	0.11	0.10	0.10	0.08	0.05	0.07	0.03	0.00	0.01	0.53	0.27	0.13
C5	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.12	0.02	0.36	0.68	0.47	0.36
C5'	0.04	0.21	0.03	0.04	0.18	0.01	0.21	0.00	0.23	0.17	0.23	0.18	0.25	0.21	0.13	0.07	0.06	0.01	0.01	0.29	0.28	0.02
C6	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.10	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.18	0.03	0.36	0.73	0.51	0.40
C8	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.02	0.39	0.50	0.36	0.26
N1	0.02	0.00	0.10	0.19	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.26	0.03	0.31	0.81	0.52	0.41
N3	0.02	0.00	0.14	0.22	0.00	0.10	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.27	0.02	0.23	0.81	0.46	0.33
N6	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.10	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.16	0.03	0.39	0.67	0.52	0.43
N7	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.02	0.41	0.53	0.42	0.34
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.28	0.63	0.38	0.26
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.04	0.07	0.05	0.07	0.06	0.05	0.08	0.08	0.06	0.05	0.02	0.00	0.05	0.05	0.02	0.84	0.37	0.27
O3'	0.01	0.30	0.02	0.01	0.16	0.03	0.12	0.06	0.18	0.11	0.26	0.27	0.16	0.09	0.05	0.05	0.00	0.02	0.21	1.25	0.50	0.58
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.13	0.32	0.40	0.24
O5'	0.16	0.26	0.18	0.23	0.29	0.01	0.36	0.01	0.36	0.39	0.31	0.23	0.39	0.41	0.28	0.02	0.21	0.13	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.60	0.84	0.97	1.08	0.73	0.53	0.68	0.29	0.73	0.50	0.81	0.81	0.67	0.53	0.63	0.84	1.25	0.32	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.49	0.43	0.44	0.44	0.27	0.47	0.28	0.51	0.36	0.52	0.46	0.52	0.42	0.38	0.37	0.50	0.40	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.38	0.39	0.49	0.32	0.13	0.36	0.02	0.40	0.26	0.41	0.33	0.43	0.34	0.26	0.27	0.58	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00