Doublet Group distance statistics: 54472

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.016, 0.029, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.018, 0.034, 0.049, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.034 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.026, 0.052, 0.079, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.052 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.038, 0.069, 0.100, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.069 std_dev=0.031
N7	B	0, 0.265, 0.514, 0.764, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.514 std_dev=0.250
C5	B	0, 0.247, 0.515, 0.784, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.515 std_dev=0.268
C8	B	0, 0.255, 0.525, 0.794, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.525 std_dev=0.270
P	A	0, 0.362, 0.638, 0.914, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.638 std_dev=0.276
OP1	A	0, 0.370, 0.646, 0.923, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.646 std_dev=0.276
C6	B	0, 0.257, 0.539, 0.821, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.539 std_dev=0.282
C3'	B	0, 0.286, 0.575, 0.864, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.575 std_dev=0.289
C4'	B	0, 0.347, 0.637, 0.928, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.637 std_dev=0.290
N1	B	0, 0.233, 0.529, 0.826, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.529 std_dev=0.297
O3'	B	0, 0.329, 0.635, 0.941, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.635 std_dev=0.306
C4	B	0, 0.227, 0.535, 0.843, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.535 std_dev=0.308
N6	B	0, 0.304, 0.616, 0.928, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.616 std_dev=0.312
OP2	A	0, 0.369, 0.681, 0.993, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.681 std_dev=0.312
C2	B	0, 0.226, 0.541, 0.856, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.541 std_dev=0.315
N9	B	0, 0.243, 0.559, 0.875, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.559 std_dev=0.316
O4'	B	0, 0.298, 0.616, 0.933, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.616 std_dev=0.317
C5'	B	0, 0.353, 0.675, 0.997, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.675 std_dev=0.322
O5'	B	0, 0.324, 0.654, 0.985, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.654 std_dev=0.330
N3	B	0, 0.232, 0.571, 0.910, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.571 std_dev=0.339
C2'	B	0, 0.279, 0.620, 0.962, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.620 std_dev=0.342
C1'	B	0, 0.269, 0.620, 0.972, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.620 std_dev=0.352
O4'	A	0, 0.254, 0.624, 0.995, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.624 std_dev=0.370
O5'	A	0, 0.349, 0.751, 1.154, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.751 std_dev=0.402
O2'	B	0, 0.318, 0.734, 1.151, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.734 std_dev=0.416
C2'	A	0, 0.318, 0.754, 1.190, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.754 std_dev=0.436
P	B	0, 0.538, 1.026, 1.514, 1.568 max_d=1.568 avg_d=1.026 std_dev=0.488
C4'	A	0, 0.394, 0.960, 1.527, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.960 std_dev=0.566
OP2	B	0, 0.729, 1.309, 1.888, 1.960 max_d=1.960 avg_d=1.309 std_dev=0.579
OP1	B	0, 0.634, 1.225, 1.815, 1.758 max_d=1.758 avg_d=1.225 std_dev=0.591
C3'	A	0, 0.496, 1.120, 1.744, 1.606 max_d=1.606 avg_d=1.120 std_dev=0.624
C5'	A	0, 0.457, 1.126, 1.796, 1.859 max_d=1.859 avg_d=1.126 std_dev=0.669
O2'	A	0, 0.575, 1.338, 2.100, 2.064 max_d=2.064 avg_d=1.338 std_dev=0.763
O3'	A	0, 0.747, 1.803, 2.859, 2.762 max_d=2.762 avg_d=1.803 std_dev=1.056

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.23	0.00	0.15	0.14	0.23	0.17
C2	0.01	0.00	0.12	0.16	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.07	0.08	0.10	0.20	0.13
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.10	0.17	0.13	0.03	0.10	0.05	0.22	0.00	0.01	0.01	0.36	0.42	0.46	0.39
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.28	0.00	0.32	0.02	0.28	0.17	0.22	0.31	0.12	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.08	0.05
C4	0.01	0.00	0.05	0.28	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.13	0.01	0.08	0.10	0.18	0.11
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.12	0.05	0.04	0.09	0.05	0.23	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04
C5	0.01	0.00	0.10	0.32	0.00	0.13	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.23	0.05	0.09	0.10	0.19	0.11
C5'	0.07	0.07	0.17	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.07	0.05	0.07	0.09	0.08	0.08	0.19	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00
C6	0.00	0.01	0.13	0.28	0.00	0.12	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.19	0.07	0.06	0.09	0.20	0.12
N1	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.01	0.08	0.10	0.21	0.14
N3	0.02	0.00	0.10	0.22	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.07	0.05	0.06	0.09	0.19	0.11
N4	0.02	0.01	0.05	0.31	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.17	0.02	0.10	0.11	0.19	0.11
O2	0.02	0.01	0.22	0.12	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.31	0.11	0.11	0.11	0.21	0.14
O2'	0.03	0.12	0.00	0.01	0.24	0.23	0.28	0.08	0.25	0.14	0.17	0.26	0.15	0.00	0.02	0.15	0.27	0.33	0.51	0.32
O3'	0.23	0.15	0.01	0.01	0.13	0.01	0.23	0.19	0.19	0.07	0.07	0.17	0.31	0.02	0.00	0.17	0.20	0.31	0.29	0.25
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.07	0.01	0.05	0.02	0.11	0.15	0.17	0.00	0.10	0.13	0.21	0.19
O5'	0.15	0.08	0.36	0.04	0.08	0.01	0.09	0.00	0.06	0.08	0.06	0.10	0.11	0.27	0.20	0.10	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.14	0.10	0.42	0.15	0.10	0.04	0.10	0.06	0.09	0.10	0.09	0.11	0.11	0.33	0.31	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.20	0.46	0.08	0.18	0.03	0.19	0.01	0.20	0.21	0.19	0.19	0.21	0.51	0.29	0.21	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.13	0.39	0.05	0.11	0.04	0.11	0.00	0.12	0.14	0.11	0.11	0.14	0.32	0.25	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.20	0.26	0.26	0.24	0.27	0.23	0.26	0.20	0.26	0.19	0.23	0.19	0.24	0.26	0.22	0.26	0.27	0.21	0.34	0.14	0.20
C2	0.17	0.14	0.16	0.20	0.18	0.19	0.19	0.19	0.17	0.22	0.15	0.15	0.18	0.22	0.20	0.12	0.19	0.18	0.18	0.25	0.18	0.17
C2'	0.28	0.19	0.27	0.29	0.22	0.29	0.21	0.29	0.18	0.27	0.17	0.21	0.17	0.24	0.26	0.23	0.29	0.28	0.26	0.38	0.28	0.28
C3'	0.16	0.17	0.15	0.07	0.16	0.09	0.19	0.07	0.21	0.16	0.19	0.16	0.24	0.19	0.15	0.21	0.08	0.12	0.13	0.23	0.23	0.16
C4	0.13	0.10	0.11	0.16	0.11	0.17	0.15	0.18	0.14	0.21	0.14	0.05	0.18	0.21	0.16	0.09	0.14	0.17	0.19	0.23	0.23	0.20
C4'	0.26	0.23	0.22	0.14	0.23	0.17	0.21	0.15	0.21	0.21	0.22	0.25	0.21	0.20	0.23	0.26	0.15	0.22	0.09	0.31	0.11	0.13
C5	0.14	0.15	0.10	0.16	0.13	0.18	0.17	0.20	0.18	0.22	0.19	0.10	0.21	0.21	0.17	0.06	0.14	0.18	0.20	0.25	0.19	0.20
C5'	0.33	0.29	0.32	0.16	0.30	0.19	0.28	0.11	0.28	0.27	0.28	0.31	0.28	0.27	0.30	0.40	0.08	0.27	0.05	0.31	0.11	0.11
C6	0.20	0.17	0.16	0.21	0.19	0.21	0.21	0.22	0.20	0.24	0.19	0.16	0.21	0.23	0.22	0.10	0.19	0.21	0.20	0.29	0.16	0.19
N1	0.21	0.17	0.19	0.22	0.21	0.22	0.21	0.22	0.19	0.24	0.17	0.18	0.19	0.23	0.23	0.14	0.21	0.22	0.19	0.29	0.15	0.18
N3	0.14	0.08	0.13	0.17	0.14	0.17	0.18	0.18	0.15	0.22	0.11	0.08	0.17	0.22	0.17	0.11	0.16	0.17	0.18	0.23	0.22	0.18
N4	0.13	0.11	0.12	0.14	0.09	0.17	0.12	0.19	0.09	0.21	0.13	0.06	0.16	0.21	0.15	0.12	0.12	0.18	0.21	0.25	0.29	0.24
O2	0.18	0.14	0.18	0.21	0.19	0.19	0.20	0.19	0.18	0.22	0.15	0.16	0.18	0.22	0.20	0.14	0.21	0.18	0.17	0.25	0.17	0.16
O2'	0.30	0.28	0.28	0.26	0.28	0.27	0.29	0.27	0.26	0.32	0.23	0.31	0.28	0.33	0.29	0.32	0.23	0.29	0.26	0.43	0.37	0.32
O3'	0.23	0.36	0.18	0.09	0.27	0.08	0.24	0.14	0.26	0.19	0.31	0.35	0.26	0.20	0.22	0.26	0.18	0.15	0.22	0.36	0.32	0.27
O4'	0.26	0.23	0.25	0.29	0.25	0.28	0.23	0.29	0.22	0.25	0.22	0.24	0.22	0.24	0.26	0.20	0.32	0.26	0.24	0.41	0.15	0.26
O5'	0.19	0.20	0.21	0.07	0.20	0.06	0.22	0.05	0.23	0.19	0.22	0.19	0.25	0.21	0.19	0.25	0.01	0.12	0.10	0.28	0.15	0.13
OP1	0.04	0.11	0.09	0.02	0.10	0.09	0.16	0.21	0.18	0.15	0.15	0.08	0.22	0.19	0.09	0.16	0.01	0.05	0.25	0.52	0.33	0.35
OP2	0.08	0.18	0.05	0.06	0.18	0.13	0.25	0.21	0.27	0.21	0.24	0.15	0.30	0.26	0.16	0.06	0.01	0.13	0.28	0.33	0.30	0.28
P	0.05	0.11	0.09	0.01	0.12	0.05	0.17	0.13	0.19	0.15	0.16	0.08	0.22	0.19	0.10	0.13	0.00	0.02	0.18	0.36	0.22	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.21	0.10
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.12	0.13	0.33	0.20
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.12	0.16	0.06
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.06	0.05	0.09	0.10	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.17	0.09	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.12	0.13	0.31	0.19
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.03	0.02	0.05	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.13	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.16	0.20	0.36	0.24
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.05	0.12	0.12	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.12	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.17	0.22	0.38	0.26
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.17	0.18	0.32	0.22
N1	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.15	0.18	0.37	0.23
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.10	0.10	0.30	0.17
N6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.18	0.27	0.40	0.29
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.02	0.19	0.24	0.38	0.26
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.11	0.11	0.28	0.16
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.05	0.05	0.03	0.06	0.07	0.05	0.04	0.01	0.00	0.03	0.04	0.03	0.17	0.13	0.03
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.02	0.10	0.04	0.10	0.11	0.08	0.05	0.12	0.13	0.06	0.03	0.00	0.01	0.05	0.28	0.11	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.04	0.18	0.09
O5'	0.05	0.12	0.04	0.03	0.12	0.01	0.16	0.01	0.17	0.17	0.15	0.10	0.18	0.19	0.11	0.03	0.05	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.13	0.12	0.17	0.13	0.13	0.20	0.12	0.22	0.18	0.18	0.10	0.27	0.24	0.11	0.17	0.28	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.33	0.16	0.09	0.31	0.08	0.36	0.03	0.38	0.32	0.37	0.30	0.40	0.38	0.28	0.13	0.11	0.18	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.20	0.06	0.04	0.19	0.02	0.24	0.02	0.26	0.22	0.23	0.17	0.29	0.26	0.16	0.03	0.11	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00