Doublet Group distance statistics: 54478

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N6	B	0, 0.000, 0.389, 0.777, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.389 std_dev=0.389
N1	B	0, 0.000, 0.395, 0.790, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.395 std_dev=0.395
C6	B	0, 0.000, 0.399, 0.797, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.399 std_dev=0.399
C2	B	0, 0.000, 0.425, 0.851, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.425 std_dev=0.425
N3	B	0, 0.000, 0.450, 0.899, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.450 std_dev=0.450
C5	B	0, 0.000, 0.462, 0.924, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.462 std_dev=0.462
C4	B	0, 0.000, 0.466, 0.932, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.466 std_dev=0.466
C3'	B	0, 0.000, 0.505, 1.010, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.505 std_dev=0.505
N9	B	0, 0.000, 0.544, 1.087, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.544 std_dev=0.544
N7	B	0, 0.000, 0.560, 1.121, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.560 std_dev=0.560
C8	B	0, 0.000, 0.601, 1.201, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.601 std_dev=0.601
C1'	B	0, 0.000, 0.615, 1.230, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.615 std_dev=0.615
C2'	B	0, 0.000, 0.631, 1.261, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.631 std_dev=0.631
O4'	A	0, 0.000, 0.646, 1.292, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.646 std_dev=0.646
C4'	B	0, 0.000, 0.675, 1.350, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.675 std_dev=0.675
C2'	A	0, 0.000, 0.705, 1.410, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.705 std_dev=0.705
O3'	B	0, 0.000, 0.831, 1.663, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.831 std_dev=0.831
O4'	B	0, 0.000, 0.858, 1.716, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.858 std_dev=0.858
O5'	A	0, 0.000, 0.934, 1.868, 1.868 max_d=1.868 avg_d=0.934 std_dev=0.934
C4'	A	0, 0.000, 1.017, 2.035, 2.035 max_d=2.035 avg_d=1.017 std_dev=1.017
O2'	A	0, 0.000, 1.018, 2.035, 2.035 max_d=2.035 avg_d=1.018 std_dev=1.018
O2'	B	0, 0.000, 1.047, 2.094, 2.094 max_d=2.094 avg_d=1.047 std_dev=1.047
C3'	A	0, 0.000, 1.052, 2.104, 2.104 max_d=2.104 avg_d=1.052 std_dev=1.052
P	A	0, 0.000, 1.124, 2.248, 2.248 max_d=2.248 avg_d=1.124 std_dev=1.124
OP2	A	0, 0.000, 1.183, 2.365, 2.365 max_d=2.365 avg_d=1.183 std_dev=1.183
C5'	A	0, 0.000, 1.288, 2.576, 2.576 max_d=2.576 avg_d=1.288 std_dev=1.288
C5'	B	0, 0.000, 1.323, 2.647, 2.647 max_d=2.647 avg_d=1.323 std_dev=1.323
O3'	A	0, 0.000, 1.458, 2.917, 2.917 max_d=2.917 avg_d=1.458 std_dev=1.458
O5'	B	0, 0.000, 1.487, 2.973, 2.973 max_d=2.973 avg_d=1.487 std_dev=1.487
OP1	A	0, 0.000, 1.701, 3.403, 3.403 max_d=3.403 avg_d=1.701 std_dev=1.701
P	B	0, 0.000, 2.174, 4.349, 4.349 max_d=4.349 avg_d=2.174 std_dev=2.174
OP2	B	0, 0.000, 2.283, 4.565, 4.565 max_d=4.565 avg_d=2.283 std_dev=2.283
OP1	B	0, 0.000, 2.588, 5.176, 5.176 max_d=5.176 avg_d=2.588 std_dev=2.588

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.00	0.10	0.10	0.10	0.11
C2	0.01	0.00	0.17	0.20	0.00	0.03	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.14	0.00	0.04	0.12	0.01
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.03	0.01	0.09	0.21	0.14	0.03	0.14	0.03	0.28	0.00	0.02	0.01	0.41	0.38	0.49	0.44
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.31	0.00	0.31	0.01	0.27	0.20	0.26	0.33	0.13	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.04	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.31	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.17	0.01	0.14	0.11	0.33	0.14
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.18	0.06	0.00	0.09	0.12	0.18	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00
C5	0.00	0.01	0.09	0.31	0.00	0.16	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.23	0.11	0.20	0.18	0.32	0.19
C5'	0.08	0.14	0.21	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.05	0.11	0.01	0.21	0.02	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.14	0.27	0.00	0.18	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.34	0.17	0.15	0.15	0.12	0.16	0.11
N1	0.01	0.00	0.03	0.20	0.00	0.06	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00
N3	0.01	0.00	0.14	0.26	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.10	0.06	0.02	0.24	0.06
N4	0.01	0.00	0.03	0.33	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.21	0.00	0.18	0.15	0.41	0.18
O2	0.01	0.00	0.28	0.13	0.01	0.12	0.01	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.17	0.24	0.07	0.12	0.06	0.07
O2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.21	0.18	0.35	0.02	0.34	0.12	0.05	0.23	0.24	0.00	0.01	0.13	0.37	0.32	0.64	0.45
O3'	0.21	0.04	0.02	0.01	0.17	0.00	0.23	0.17	0.17	0.00	0.06	0.21	0.17	0.01	0.00	0.17	0.12	0.21	0.19	0.17
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.10	0.00	0.24	0.13	0.17	0.00	0.09	0.05	0.11	0.09
O5'	0.10	0.00	0.41	0.06	0.14	0.01	0.20	0.00	0.15	0.02	0.06	0.18	0.07	0.37	0.12	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.04	0.38	0.08	0.11	0.03	0.18	0.00	0.12	0.01	0.02	0.15	0.12	0.32	0.21	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.12	0.49	0.04	0.33	0.02	0.32	0.01	0.16	0.06	0.24	0.41	0.06	0.64	0.19	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.01	0.44	0.06	0.14	0.00	0.19	0.01	0.11	0.00	0.06	0.18	0.07	0.45	0.17	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.05	0.22	0.23	0.23	0.22	0.28	0.59	0.21	0.36	0.11	0.10	0.23	0.36	0.29	0.52	0.12	0.05	0.72	1.09	0.99	0.92
C2	0.12	0.07	0.05	0.28	0.12	0.30	0.20	0.63	0.15	0.25	0.02	0.03	0.19	0.28	0.16	0.26	0.17	0.18	0.81	1.17	1.15	1.02
C2'	0.04	0.02	0.05	0.55	0.06	0.62	0.17	1.03	0.18	0.17	0.09	0.05	0.24	0.23	0.06	0.23	0.44	0.41	1.08	1.50	1.24	1.27
C3'	0.24	0.02	0.24	0.14	0.23	0.19	0.36	0.49	0.28	0.49	0.11	0.02	0.36	0.51	0.33	0.41	0.07	0.03	0.47	0.77	0.55	0.60
C4	0.03	0.18	0.01	0.23	0.01	0.38	0.15	0.67	0.10	0.21	0.06	0.17	0.18	0.27	0.06	0.12	0.10	0.33	0.85	1.14	1.19	1.06
C4'	0.21	0.23	0.20	0.11	0.07	0.06	0.15	0.30	0.04	0.35	0.14	0.14	0.08	0.31	0.22	0.40	0.02	0.03	0.34	0.49	0.45	0.42
C5	0.03	0.12	0.10	0.20	0.07	0.39	0.20	0.72	0.14	0.30	0.01	0.12	0.20	0.33	0.14	0.23	0.03	0.33	0.88	1.14	1.11	1.05
C5'	0.04	0.42	0.05	0.16	0.11	0.11	0.01	0.25	0.13	0.21	0.31	0.35	0.07	0.17	0.05	0.19	0.07	0.06	0.24	0.24	0.27	0.25
C6	0.15	0.05	0.20	0.21	0.15	0.33	0.25	0.69	0.18	0.35	0.04	0.02	0.22	0.36	0.23	0.40	0.04	0.21	0.82	1.13	1.02	0.99
N1	0.18	0.03	0.16	0.25	0.17	0.28	0.25	0.64	0.18	0.32	0.06	0.02	0.21	0.33	0.23	0.40	0.12	0.15	0.79	1.14	1.07	0.98
N3	0.03	0.16	0.02	0.27	0.04	0.34	0.15	0.64	0.11	0.20	0.05	0.12	0.17	0.24	0.08	0.14	0.15	0.26	0.82	1.16	1.20	1.04
N4	0.12	0.22	0.07	0.20	0.09	0.39	0.06	0.64	0.04	0.11	0.12	0.23	0.14	0.20	0.05	0.01	0.08	0.40	0.81	1.09	1.20	1.04
O2	0.14	0.05	0.03	0.30	0.12	0.28	0.18	0.61	0.14	0.23	0.02	0.00	0.17	0.25	0.16	0.25	0.20	0.14	0.79	1.17	1.16	1.01
O2'	0.03	0.05	0.01	0.56	0.04	0.66	0.09	1.18	0.12	0.05	0.10	0.02	0.15	0.10	0.02	0.38	0.40	0.47	1.31	1.89	1.63	1.61
O3'	0.24	0.22	0.26	0.03	0.12	0.07	0.23	0.35	0.11	0.45	0.11	0.12	0.18	0.43	0.28	0.43	0.10	0.02	0.36	0.62	0.47	0.48
O4'	0.37	0.15	0.32	0.02	0.17	0.06	0.20	0.22	0.07	0.40	0.09	0.02	0.08	0.34	0.32	0.61	0.08	0.16	0.35	0.56	0.57	0.47
O5'	0.16	0.17	0.21	0.08	0.10	0.14	0.23	0.33	0.13	0.43	0.05	0.14	0.20	0.41	0.24	0.29	0.02	0.03	0.23	0.32	0.19	0.26
OP1	0.04	0.34	0.02	0.00	0.07	0.08	0.08	0.02	0.01	0.30	0.20	0.32	0.07	0.29	0.07	0.07	0.01	0.06	0.18	0.42	0.38	0.30
OP2	0.09	0.01	0.21	0.03	0.22	0.30	0.42	0.46	0.35	0.59	0.16	0.03	0.46	0.63	0.32	0.12	0.02	0.13	0.06	0.12	0.24	0.03
P	0.05	0.21	0.13	0.01	0.04	0.15	0.19	0.21	0.11	0.40	0.07	0.20	0.19	0.39	0.18	0.08	0.01	0.07	0.01	0.08	0.17	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.06	0.24	0.13
C2	0.04	0.00	0.24	0.31	0.00	0.14	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.34	0.01	0.44	0.59	0.75	0.55
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.12	0.02	0.05	0.01	0.10	0.11	0.18	0.26	0.08	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.16	0.07
C3'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.08	0.25	0.22	0.30	0.03	0.19	0.07	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.06
C4	0.02	0.00	0.12	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.13	0.02	0.26	0.33	0.50	0.34
C4'	0.01	0.14	0.02	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.06	0.11	0.11	0.13	0.05	0.07	0.02	0.09	0.02	0.00	0.03	0.05	0.07	0.02
C5	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.02	0.03	0.19	0.29	0.46	0.29
C5'	0.00	0.25	0.01	0.00	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.14	0.22	0.22	0.11	0.08	0.01	0.08	0.04	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.10	0.03	0.28	0.44	0.60	0.41
C8	0.02	0.00	0.11	0.25	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.20	0.01	0.12	0.07	0.07	0.02
N1	0.02	0.00	0.18	0.22	0.00	0.11	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.24	0.02	0.40	0.57	0.74	0.53
N3	0.04	0.00	0.26	0.30	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.33	0.01	0.40	0.49	0.65	0.47
N6	0.00	0.00	0.08	0.03	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.04	0.04	0.24	0.42	0.57	0.39
N7	0.01	0.00	0.06	0.19	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.16	0.02	0.02	0.06	0.20	0.08
N9	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.01	0.09	0.11	0.28	0.16
O2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.10	0.09	0.08	0.08	0.11	0.01	0.14	0.15	0.11	0.04	0.05	0.00	0.06	0.06	0.00	0.11	0.10	0.01
O3'	0.05	0.34	0.01	0.00	0.13	0.02	0.02	0.04	0.10	0.20	0.24	0.33	0.04	0.16	0.02	0.06	0.00	0.03	0.13	0.28	0.17	0.18
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.13	0.08	0.24	0.15
O5'	0.10	0.44	0.07	0.04	0.26	0.03	0.19	0.00	0.28	0.12	0.40	0.40	0.24	0.02	0.09	0.00	0.13	0.13	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.06	0.59	0.01	0.10	0.33	0.05	0.29	0.04	0.44	0.07	0.57	0.49	0.42	0.06	0.11	0.11	0.28	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.75	0.16	0.03	0.50	0.07	0.46	0.02	0.60	0.07	0.74	0.65	0.57	0.20	0.28	0.10	0.17	0.24	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.55	0.07	0.06	0.34	0.02	0.29	0.01	0.41	0.02	0.53	0.47	0.39	0.08	0.16	0.01	0.18	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00